MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 13915

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014323	GC	3	6	354	359	0 %	0 %	50 %	50 %	300309347
2	NC_014323	GC	3	6	1007	1012	0 %	0 %	50 %	50 %	300309347
3	NC_014323	CA	3	6	2087	2092	50 %	0 %	0 %	50 %	300309348
4	NC_014323	CG	3	6	2227	2232	0 %	0 %	50 %	50 %	300309348
5	NC_014323	GC	3	6	2251	2256	0 %	0 %	50 %	50 %	300309348
6	NC_014323	GC	3	6	4202	4207	0 %	0 %	50 %	50 %	300309349
7	NC_014323	GC	3	6	4713	4718	0 %	0 %	50 %	50 %	300309349
8	NC_014323	AG	3	6	5861	5866	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014323	AT	3	6	6127	6132	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014323	TG	3	6	6874	6879	0 %	50 %	50 %	0 %	300309350
11	NC_014323	CA	3	6	7628	7633	50 %	0 %	0 %	50 %	300309351
12	NC_014323	GC	3	6	8658	8663	0 %	0 %	50 %	50 %	300309352
13	NC_014323	GA	4	8	8728	8735	50 %	0 %	50 %	0 %	300309352
14	NC_014323	GA	3	6	11076	11081	50 %	0 %	50 %	0 %	300309352
15	NC_014323	GT	3	6	11778	11783	0 %	50 %	50 %	0 %	300309353
16	NC_014323	CG	4	8	12859	12866	0 %	0 %	50 %	50 %	300309354
17	NC_014323	GC	3	6	13339	13344	0 %	0 %	50 %	50 %	300309354
18	NC_014323	CG	3	6	13407	13412	0 %	0 %	50 %	50 %	300309354
19	NC_014323	GA	3	6	13457	13462	50 %	0 %	50 %	0 %	300309354
20	NC_014323	TC	3	6	13764	13769	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_014323	GC	3	6	14150	14155	0 %	0 %	50 %	50 %	300309355
22	NC_014323	GC	3	6	14812	14817	0 %	0 %	50 %	50 %	300309355
23	NC_014323	CG	3	6	15060	15065	0 %	0 %	50 %	50 %	300309356
24	NC_014323	CG	3	6	15208	15213	0 %	0 %	50 %	50 %	300309356
25	NC_014323	CA	3	6	15478	15483	50 %	0 %	0 %	50 %	300309356
26	NC_014323	GC	3	6	16727	16732	0 %	0 %	50 %	50 %	300309357
27	NC_014323	CT	3	6	17229	17234	0 %	50 %	0 %	50 %	300309357
28	NC_014323	CG	3	6	17384	17389	0 %	0 %	50 %	50 %	300309357
29	NC_014323	GA	3	6	17612	17617	50 %	0 %	50 %	0 %	300309357
30	NC_014323	CG	3	6	17841	17846	0 %	0 %	50 %	50 %	300309358
31	NC_014323	TC	3	6	18112	18117	0 %	50 %	0 %	50 %	300309358
32	NC_014323	AG	3	6	19187	19192	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014323	CG	3	6	19827	19832	0 %	0 %	50 %	50 %	300309359
34	NC_014323	CG	3	6	20551	20556	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_014323	GC	3	6	21216	21221	0 %	0 %	50 %	50 %	300309360
36	NC_014323	GC	3	6	21306	21311	0 %	0 %	50 %	50 %	300309360
37	NC_014323	GC	3	6	21444	21449	0 %	0 %	50 %	50 %	300309360
38	NC_014323	GC	4	8	21664	21671	0 %	0 %	50 %	50 %	300309360
39	NC_014323	GC	3	6	23459	23464	0 %	0 %	50 %	50 %	300309361
40	NC_014323	CG	4	8	23575	23582	0 %	0 %	50 %	50 %	300309361
41	NC_014323	GC	3	6	23929	23934	0 %	0 %	50 %	50 %	300309361
42	NC_014323	TC	3	6	24378	24383	0 %	50 %	0 %	50 %	300309362
43	NC_014323	GC	3	6	24438	24443	0 %	0 %	50 %	50 %	300309362
44	NC_014323	GC	3	6	24575	24580	0 %	0 %	50 %	50 %	300309362
45	NC_014323	GC	4	8	24958	24965	0 %	0 %	50 %	50 %	300309362
46	NC_014323	CG	3	6	25123	25128	0 %	0 %	50 %	50 %	300309362
47	NC_014323	GT	3	6	25540	25545	0 %	50 %	50 %	0 %	300309363
48	NC_014323	TC	3	6	25859	25864	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_014323	GC	3	6	26405	26410	0 %	0 %	50 %	50 %	300309364
50	NC_014323	CG	3	6	26824	26829	0 %	0 %	50 %	50 %	300309364
51	NC_014323	GC	3	6	26959	26964	0 %	0 %	50 %	50 %	300309364
52	NC_014323	CG	3	6	27725	27730	0 %	0 %	50 %	50 %	300309365
53	NC_014323	GC	3	6	27862	27867	0 %	0 %	50 %	50 %	300309365
54	NC_014323	GC	4	8	28046	28053	0 %	0 %	50 %	50 %	300309365
55	NC_014323	GC	3	6	28337	28342	0 %	0 %	50 %	50 %	300309365
56	NC_014323	CG	3	6	29452	29457	0 %	0 %	50 %	50 %	300309366
57	NC_014323	CG	4	8	29771	29778	0 %	0 %	50 %	50 %	300309366
58	NC_014323	GC	3	6	30032	30037	0 %	0 %	50 %	50 %	300309366
59	NC_014323	GC	3	6	30216	30221	0 %	0 %	50 %	50 %	300309366
60	NC_014323	CG	3	6	31991	31996	0 %	0 %	50 %	50 %	300309366
61	NC_014323	CG	3	6	35103	35108	0 %	0 %	50 %	50 %	300309369
62	NC_014323	CT	4	8	35575	35582	0 %	50 %	0 %	50 %	300309369
63	NC_014323	GC	3	6	36520	36525	0 %	0 %	50 %	50 %	300309370
64	NC_014323	AG	4	8	37152	37159	50 %	0 %	50 %	0 %	300309370
65	NC_014323	TC	3	6	37351	37356	0 %	50 %	0 %	50 %	300309370
66	NC_014323	GA	3	6	38186	38191	50 %	0 %	50 %	0 %	300309371
67	NC_014323	GC	3	6	38843	38848	0 %	0 %	50 %	50 %	300309372
68	NC_014323	GC	3	6	41677	41682	0 %	0 %	50 %	50 %	300309376
69	NC_014323	CG	4	8	41832	41839	0 %	0 %	50 %	50 %	300309376
70	NC_014323	GC	3	6	42478	42483	0 %	0 %	50 %	50 %	300309376
71	NC_014323	GC	3	6	43198	43203	0 %	0 %	50 %	50 %	300309377
72	NC_014323	CG	3	6	44897	44902	0 %	0 %	50 %	50 %	300309379
73	NC_014323	GC	3	6	46134	46139	0 %	0 %	50 %	50 %	300309379
74	NC_014323	GC	3	6	46745	46750	0 %	0 %	50 %	50 %	300309380
75	NC_014323	CG	3	6	46811	46816	0 %	0 %	50 %	50 %	300309380
76	NC_014323	GC	3	6	46883	46888	0 %	0 %	50 %	50 %	300309380
77	NC_014323	CG	3	6	46992	46997	0 %	0 %	50 %	50 %	300309380
78	NC_014323	GC	3	6	47236	47241	0 %	0 %	50 %	50 %	300309380
79	NC_014323	CG	3	6	47427	47432	0 %	0 %	50 %	50 %	300309380
80	NC_014323	GC	3	6	47447	47452	0 %	0 %	50 %	50 %	300309380
81	NC_014323	GC	3	6	47948	47953	0 %	0 %	50 %	50 %	300309381
82	NC_014323	GC	3	6	48519	48524	0 %	0 %	50 %	50 %	300309382
83	NC_014323	CG	3	6	48533	48538	0 %	0 %	50 %	50 %	300309382
84	NC_014323	GC	3	6	48622	48627	0 %	0 %	50 %	50 %	300309382
85	NC_014323	GC	3	6	49467	49472	0 %	0 %	50 %	50 %	300309383
86	NC_014323	GC	3	6	49697	49702	0 %	0 %	50 %	50 %	300309383
87	NC_014323	CG	3	6	49737	49742	0 %	0 %	50 %	50 %	300309383
88	NC_014323	GC	3	6	49887	49892	0 %	0 %	50 %	50 %	300309383
89	NC_014323	CT	3	6	50283	50288	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_014323	GC	3	6	50639	50644	0 %	0 %	50 %	50 %	300309384
91	NC_014323	GC	3	6	50694	50699	0 %	0 %	50 %	50 %	300309384
92	NC_014323	CG	3	6	51275	51280	0 %	0 %	50 %	50 %	300309384
93	NC_014323	GC	3	6	51391	51396	0 %	0 %	50 %	50 %	300309385
94	NC_014323	GT	3	6	51467	51472	0 %	50 %	50 %	0 %	300309385
95	NC_014323	GC	3	6	51490	51495	0 %	0 %	50 %	50 %	300309385
96	NC_014323	CG	3	6	51566	51571	0 %	0 %	50 %	50 %	300309385
97	NC_014323	GC	3	6	51726	51731	0 %	0 %	50 %	50 %	300309385
98	NC_014323	GC	4	8	52742	52749	0 %	0 %	50 %	50 %	300309385
99	NC_014323	TC	3	6	53884	53889	0 %	50 %	0 %	50 %	300309386
100	NC_014323	GC	3	6	54108	54113	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_014323	GC	4	8	54263	54270	0 %	0 %	50 %	50 %	300309387
102	NC_014323	GC	3	6	54308	54313	0 %	0 %	50 %	50 %	300309387
103	NC_014323	GC	4	8	54765	54772	0 %	0 %	50 %	50 %	300309387
104	NC_014323	GC	3	6	55155	55160	0 %	0 %	50 %	50 %	300309387
105	NC_014323	GC	3	6	55535	55540	0 %	0 %	50 %	50 %	300309387
106	NC_014323	GC	3	6	55757	55762	0 %	0 %	50 %	50 %	300309387
107	NC_014323	GC	3	6	55995	56000	0 %	0 %	50 %	50 %	300309387
108	NC_014323	GC	4	8	56132	56139	0 %	0 %	50 %	50 %	300309387
109	NC_014323	GC	4	8	56873	56880	0 %	0 %	50 %	50 %	300309388
110	NC_014323	GC	3	6	57429	57434	0 %	0 %	50 %	50 %	300309388
111	NC_014323	GC	3	6	57445	57450	0 %	0 %	50 %	50 %	300309388
112	NC_014323	GC	3	6	57508	57513	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_014323	GC	3	6	57672	57677	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_014323	CG	3	6	57685	57690	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_014323	GA	3	6	58426	58431	50 %	0 %	50 %	0 %	300309389
116	NC_014323	TG	3	6	58478	58483	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014323	TA	3	6	58813	58818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014323	GC	3	6	58954	58959	0 %	0 %	50 %	50 %	300309390
119	NC_014323	GC	3	6	59091	59096	0 %	0 %	50 %	50 %	300309390
120	NC_014323	GC	5	10	59112	59121	0 %	0 %	50 %	50 %	300309390
121	NC_014323	CG	3	6	59336	59341	0 %	0 %	50 %	50 %	300309390
122	NC_014323	GC	3	6	59344	59349	0 %	0 %	50 %	50 %	300309390
123	NC_014323	GC	3	6	59514	59519	0 %	0 %	50 %	50 %	300309390
124	NC_014323	GC	3	6	60756	60761	0 %	0 %	50 %	50 %	300309392
125	NC_014323	GC	3	6	61414	61419	0 %	0 %	50 %	50 %	300309392
126	NC_014323	GC	3	6	61593	61598	0 %	0 %	50 %	50 %	300309392
127	NC_014323	CG	3	6	61968	61973	0 %	0 %	50 %	50 %	300309392
128	NC_014323	AT	3	6	62104	62109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014323	GC	3	6	62394	62399	0 %	0 %	50 %	50 %	300309393
130	NC_014323	CG	3	6	62430	62435	0 %	0 %	50 %	50 %	300309393
131	NC_014323	GC	3	6	63516	63521	0 %	0 %	50 %	50 %	300309394
132	NC_014323	GC	3	6	64424	64429	0 %	0 %	50 %	50 %	300309397
133	NC_014323	GC	4	8	64820	64827	0 %	0 %	50 %	50 %	300309397
134	NC_014323	GC	3	6	64906	64911	0 %	0 %	50 %	50 %	300309397
135	NC_014323	GC	3	6	65591	65596	0 %	0 %	50 %	50 %	300309397
136	NC_014323	CG	3	6	65603	65608	0 %	0 %	50 %	50 %	300309397
137	NC_014323	CG	4	8	65775	65782	0 %	0 %	50 %	50 %	300309397
138	NC_014323	CG	4	8	65890	65897	0 %	0 %	50 %	50 %	300309397
139	NC_014323	GC	3	6	65964	65969	0 %	0 %	50 %	50 %	300309397
140	NC_014323	GC	3	6	66600	66605	0 %	0 %	50 %	50 %	300309398
141	NC_014323	GC	3	6	66659	66664	0 %	0 %	50 %	50 %	300309398
142	NC_014323	CG	3	6	66682	66687	0 %	0 %	50 %	50 %	300309398
143	NC_014323	GC	3	6	66717	66722	0 %	0 %	50 %	50 %	300309398
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