MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 13878

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014323	CGGC	2	8	275	282	0 %	0 %	50 %	50 %	300309347
2	NC_014323	CGTG	2	8	990	997	0 %	25 %	50 %	25 %	300309347
3	NC_014323	CGCC	2	8	1203	1210	0 %	0 %	25 %	75 %	300309347
4	NC_014323	GGCC	2	8	1652	1659	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_014323	CAGG	2	8	1882	1889	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_014323	TCCT	2	8	3915	3922	0 %	50 %	0 %	50 %	300309349
7	NC_014323	GACC	2	8	3947	3954	25 %	0 %	25 %	50 %	300309349
8	NC_014323	CACC	2	8	4184	4191	25 %	0 %	0 %	75 %	300309349
9	NC_014323	CAAG	2	8	4643	4650	50 %	0 %	25 %	25 %	300309349
10	NC_014323	CGCC	2	8	5062	5069	0 %	0 %	25 %	75 %	300309349
11	NC_014323	CCGT	2	8	6083	6090	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_014323	ATCG	2	8	6454	6461	25 %	25 %	25 %	25 %	300309350
13	NC_014323	ATGT	2	8	7184	7191	25 %	50 %	25 %	0 %	300309351
14	NC_014323	GAAC	2	8	7541	7548	50 %	0 %	25 %	25 %	300309351
15	NC_014323	TCCC	2	8	7917	7924	0 %	25 %	0 %	75 %	300309351
16	NC_014323	GCAG	2	8	7948	7955	25 %	0 %	50 %	25 %	300309351
17	NC_014323	GCTT	2	8	8310	8317	0 %	50 %	25 %	25 %	300309352
18	NC_014323	TAAT	2	8	8589	8596	50 %	50 %	0 %	0 %	300309352
19	NC_014323	AGGA	2	8	9192	9199	50 %	0 %	50 %	0 %	300309352
20	NC_014323	AGCA	2	8	9795	9802	50 %	0 %	25 %	25 %	300309352
21	NC_014323	CTAT	2	8	10189	10196	25 %	50 %	0 %	25 %	300309352
22	NC_014323	GCAA	2	8	10392	10399	50 %	0 %	25 %	25 %	300309352
23	NC_014323	TGAA	2	8	10428	10435	50 %	25 %	25 %	0 %	300309352
24	NC_014323	ATGA	2	8	10541	10548	50 %	25 %	25 %	0 %	300309352
25	NC_014323	TGCA	2	8	10947	10954	25 %	25 %	25 %	25 %	300309352
26	NC_014323	ATCT	2	8	11568	11575	25 %	50 %	0 %	25 %	300309353
27	NC_014323	TTCT	2	8	12130	12137	0 %	75 %	0 %	25 %	300309353
28	NC_014323	ATCC	2	8	13197	13204	25 %	25 %	0 %	50 %	300309354
29	NC_014323	CCCG	2	8	13324	13331	0 %	0 %	25 %	75 %	300309354
30	NC_014323	GTCT	2	8	13816	13823	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_014323	GCTC	2	8	14043	14050	0 %	25 %	25 %	50 %	300309355
32	NC_014323	ACGC	2	8	14264	14271	25 %	0 %	25 %	50 %	300309355
33	NC_014323	CGAG	2	8	14558	14565	25 %	0 %	50 %	25 %	300309355
34	NC_014323	TTCT	2	8	15096	15103	0 %	75 %	0 %	25 %	300309356
35	NC_014323	GTCA	2	8	16270	16277	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_014323	GCCT	2	8	17288	17295	0 %	25 %	25 %	50 %	300309357
37	NC_014323	GGAT	2	8	17877	17884	25 %	25 %	50 %	0 %	300309358
38	NC_014323	CGTG	2	8	17989	17996	0 %	25 %	50 %	25 %	300309358
39	NC_014323	CAGG	2	8	18363	18370	25 %	0 %	50 %	25 %	300309358
40	NC_014323	TGGA	2	8	18903	18910	25 %	25 %	50 %	0 %	300309358
41	NC_014323	GCTG	2	8	18929	18936	0 %	25 %	50 %	25 %	300309358
42	NC_014323	TCCC	2	8	19007	19014	0 %	25 %	0 %	75 %	300309358
43	NC_014323	ATAG	2	8	19196	19203	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014323	GCCC	2	8	19550	19557	0 %	0 %	25 %	75 %	300309359
45	NC_014323	GGCC	2	8	19777	19784	0 %	0 %	50 %	50 %	300309359
46	NC_014323	GCCT	2	8	20512	20519	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_014323	GCTG	2	8	20876	20883	0 %	25 %	50 %	25 %	300309360
48	NC_014323	CCCG	2	8	21399	21406	0 %	0 %	25 %	75 %	300309360
49	NC_014323	CAGC	2	8	22013	22020	25 %	0 %	25 %	50 %	300309360
50	NC_014323	GATG	2	8	22196	22203	25 %	25 %	50 %	0 %	300309360
51	NC_014323	CGGC	2	8	22208	22215	0 %	0 %	50 %	50 %	300309360
52	NC_014323	CTGC	2	8	22697	22704	0 %	25 %	25 %	50 %	300309360
53	NC_014323	CGCA	2	8	23543	23550	25 %	0 %	25 %	50 %	300309361
54	NC_014323	ATCA	2	8	24208	24215	50 %	25 %	0 %	25 %	300309362
55	NC_014323	CCCG	2	8	24363	24370	0 %	0 %	25 %	75 %	300309362
56	NC_014323	GCGG	2	8	25312	25319	0 %	0 %	75 %	25 %	300309362
57	NC_014323	TTTC	2	8	25612	25619	0 %	75 %	0 %	25 %	300309363
58	NC_014323	AGGT	2	8	25639	25646	25 %	25 %	50 %	0 %	300309363
59	NC_014323	CAAG	2	8	26035	26042	50 %	0 %	25 %	25 %	300309364
60	NC_014323	TCTG	2	8	26076	26083	0 %	50 %	25 %	25 %	300309364
61	NC_014323	GCGG	2	8	26428	26435	0 %	0 %	75 %	25 %	300309364
62	NC_014323	TCCT	2	8	26477	26484	0 %	50 %	0 %	50 %	300309364
63	NC_014323	CGGC	2	8	26566	26573	0 %	0 %	50 %	50 %	300309364
64	NC_014323	GTGG	2	8	28884	28891	0 %	25 %	75 %	0 %	300309365
65	NC_014323	CTGC	2	8	29007	29014	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_014323	CGGA	2	8	29250	29257	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_014323	GCTG	2	8	30010	30017	0 %	25 %	50 %	25 %	300309366
68	NC_014323	CCTC	2	8	30397	30404	0 %	25 %	0 %	75 %	300309366
69	NC_014323	TGCG	2	8	30516	30523	0 %	25 %	50 %	25 %	300309366
70	NC_014323	GGTC	2	8	30599	30606	0 %	25 %	50 %	25 %	300309366
71	NC_014323	CGGC	2	8	30607	30614	0 %	0 %	50 %	50 %	300309366
72	NC_014323	AGCC	2	8	30743	30750	25 %	0 %	25 %	50 %	300309366
73	NC_014323	GGGC	2	8	30754	30761	0 %	0 %	75 %	25 %	300309366
74	NC_014323	GGCA	2	8	30926	30933	25 %	0 %	50 %	25 %	300309366
75	NC_014323	CAAC	2	8	30965	30972	50 %	0 %	0 %	50 %	300309366
76	NC_014323	TCTG	2	8	31531	31538	0 %	50 %	25 %	25 %	300309366
77	NC_014323	CAGC	2	8	31796	31803	25 %	0 %	25 %	50 %	300309366
78	NC_014323	GCCA	2	8	31820	31827	25 %	0 %	25 %	50 %	300309366
79	NC_014323	GGCC	2	8	31875	31882	0 %	0 %	50 %	50 %	300309366
80	NC_014323	GCCA	2	8	32508	32515	25 %	0 %	25 %	50 %	300309367
81	NC_014323	TGGC	2	8	32704	32711	0 %	25 %	50 %	25 %	300309367
82	NC_014323	ATCT	2	8	33138	33145	25 %	50 %	0 %	25 %	300309367
83	NC_014323	TGAT	2	8	33187	33194	25 %	50 %	25 %	0 %	300309367
84	NC_014323	GGAA	2	8	33202	33209	50 %	0 %	50 %	0 %	300309367
85	NC_014323	CGTT	2	8	34413	34420	0 %	50 %	25 %	25 %	300309368
86	NC_014323	TGCG	2	8	34843	34850	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_014323	CAGT	2	8	36027	36034	25 %	25 %	25 %	25 %	300309370
88	NC_014323	GTGC	2	8	36057	36064	0 %	25 %	50 %	25 %	300309370
89	NC_014323	GCCA	2	8	36806	36813	25 %	0 %	25 %	50 %	300309370
90	NC_014323	GAGT	2	8	36994	37001	25 %	25 %	50 %	0 %	300309370
91	NC_014323	ATCT	2	8	37077	37084	25 %	50 %	0 %	25 %	300309370
92	NC_014323	AAGA	2	8	37425	37432	75 %	0 %	25 %	0 %	300309370
93	NC_014323	GCAG	2	8	37603	37610	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_014323	TGAT	2	8	37826	37833	25 %	50 %	25 %	0 %	300309371
95	NC_014323	TGGA	2	8	38086	38093	25 %	25 %	50 %	0 %	300309371
96	NC_014323	AGCA	2	8	38368	38375	50 %	0 %	25 %	25 %	300309371
97	NC_014323	AGCC	2	8	38725	38732	25 %	0 %	25 %	50 %	300309371
98	NC_014323	CAAG	2	8	39745	39752	50 %	0 %	25 %	25 %	300309374
99	NC_014323	ATCA	2	8	39930	39937	50 %	25 %	0 %	25 %	300309374
100	NC_014323	AGCA	2	8	40339	40346	50 %	0 %	25 %	25 %	300309374
101	NC_014323	CCGC	2	8	40350	40357	0 %	0 %	25 %	75 %	300309374
102	NC_014323	CATG	2	8	41361	41368	25 %	25 %	25 %	25 %	300309376
103	NC_014323	GCTG	2	8	41706	41713	0 %	25 %	50 %	25 %	300309376
104	NC_014323	TGGC	2	8	41726	41733	0 %	25 %	50 %	25 %	300309376
105	NC_014323	TCAT	2	8	41909	41916	25 %	50 %	0 %	25 %	300309376
106	NC_014323	GCCG	2	8	41986	41993	0 %	0 %	50 %	50 %	300309376
107	NC_014323	ATCG	2	8	42241	42248	25 %	25 %	25 %	25 %	300309376
108	NC_014323	GCGA	2	8	42580	42587	25 %	0 %	50 %	25 %	300309376
109	NC_014323	GTTG	2	8	42697	42704	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014323	GACG	2	8	42786	42793	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_014323	GGCC	2	8	43377	43384	0 %	0 %	50 %	50 %	300309377
112	NC_014323	TCTG	2	8	43927	43934	0 %	50 %	25 %	25 %	300309378
113	NC_014323	GGTG	2	8	43992	43999	0 %	25 %	75 %	0 %	300309378
114	NC_014323	TCGC	2	8	44221	44228	0 %	25 %	25 %	50 %	300309379
115	NC_014323	CGGA	2	8	45436	45443	25 %	0 %	50 %	25 %	300309379
116	NC_014323	GGAT	2	8	45930	45937	25 %	25 %	50 %	0 %	300309379
117	NC_014323	CGGC	2	8	46122	46129	0 %	0 %	50 %	50 %	300309379
118	NC_014323	GCTC	2	8	46233	46240	0 %	25 %	25 %	50 %	300309379
119	NC_014323	GCCG	2	8	46273	46280	0 %	0 %	50 %	50 %	300309379
120	NC_014323	TGCC	2	8	46350	46357	0 %	25 %	25 %	50 %	300309379
121	NC_014323	CTTG	2	8	46453	46460	0 %	50 %	25 %	25 %	300309379
122	NC_014323	CGGC	2	8	46739	46746	0 %	0 %	50 %	50 %	300309380
123	NC_014323	CGGT	2	8	46759	46766	0 %	25 %	50 %	25 %	300309380
124	NC_014323	GCCG	2	8	47063	47070	0 %	0 %	50 %	50 %	300309380
125	NC_014323	CGCT	2	8	47978	47985	0 %	25 %	25 %	50 %	300309381
126	NC_014323	GGCA	2	8	48142	48149	25 %	0 %	50 %	25 %	300309381
127	NC_014323	GCCG	2	8	48204	48211	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_014323	GGGC	2	8	48441	48448	0 %	0 %	75 %	25 %	300309382
129	NC_014323	TGCA	2	8	48498	48505	25 %	25 %	25 %	25 %	300309382
130	NC_014323	GGCG	2	8	48650	48657	0 %	0 %	75 %	25 %	300309382
131	NC_014323	CGCT	2	8	48910	48917	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
132	NC_014323	GCCG	2	8	49438	49445	0 %	0 %	50 %	50 %	300309383
133	NC_014323	CCGA	2	8	49514	49521	25 %	0 %	25 %	50 %	300309383
134	NC_014323	GCCA	2	8	49909	49916	25 %	0 %	25 %	50 %	300309383
135	NC_014323	GGCC	2	8	50127	50134	0 %	0 %	50 %	50 %	300309383
136	NC_014323	GACC	2	8	50438	50445	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_014323	GCTC	2	8	50563	50570	0 %	25 %	25 %	50 %	300309384
138	NC_014323	CCAC	2	8	50593	50600	25 %	0 %	0 %	75 %	300309384
139	NC_014323	GGCC	2	8	50954	50961	0 %	0 %	50 %	50 %	300309384
140	NC_014323	TCCG	2	8	51082	51089	0 %	25 %	25 %	50 %	300309384
141	NC_014323	CTGC	2	8	51242	51249	0 %	25 %	25 %	50 %	300309384
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