MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 139543

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_014323	GACT	2	8	534841	534848	25 %	25 %	25 %	25 %	300309825
13502	NC_014323	GCC	2	6	534911	534916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309825
13503	NC_014323	GGC	2	6	534934	534939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309825
13504	NC_014323	CGA	2	6	534951	534956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309825
13505	NC_014323	GCC	3	9	534968	534976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309825
13506	NC_014323	GCGG	2	8	534987	534994	0 %	0 %	75 %	25 %	300309825
13507	NC_014323	CGT	2	6	535004	535009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309825
13508	NC_014323	GC	4	8	535082	535089	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13509	NC_014323	AGACGG	2	12	535109	535120	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
13510	NC_014323	GCC	2	6	535176	535181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13511	NC_014323	CTG	2	6	535208	535213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309826
13512	NC_014323	GCCG	2	8	535262	535269	0 %	0 %	50 %	50 %	300309826
13513	NC_014323	GCC	2	6	535306	535311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309826
13514	NC_014323	CGGC	2	8	535329	535336	0 %	0 %	50 %	50 %	300309826
13515	NC_014323	TGG	2	6	535343	535348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309826
13516	NC_014323	CGG	2	6	535357	535362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309826
13517	NC_014323	GCG	2	6	535372	535377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309826
13518	NC_014323	GCC	2	6	535389	535394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309826
13519	NC_014323	GCG	2	6	535469	535474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13520	NC_014323	CGCT	2	8	535504	535511	0 %	25 %	25 %	50 %	300309827
13521	NC_014323	CCA	2	6	535541	535546	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309827
13522	NC_014323	GGATG	2	10	535565	535574	20 %	20 %	60 %	0 %	300309827
13523	NC_014323	CAC	2	6	535659	535664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309827
13524	NC_014323	TTC	2	6	535726	535731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309827
13525	NC_014323	CGC	2	6	535757	535762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309827
13526	NC_014323	TGCAC	2	10	535982	535991	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
13527	NC_014323	CAG	2	6	536037	536042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13528	NC_014323	T	6	6	536061	536066	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13529	NC_014323	TCC	2	6	536068	536073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13530	NC_014323	CTC	2	6	536129	536134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300309828
13531	NC_014323	TCA	2	6	536148	536153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309828
13532	NC_014323	TCG	2	6	536160	536165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309828
13533	NC_014323	TCC	2	6	536192	536197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300309828
13534	NC_014323	CTG	2	6	536225	536230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309828
13535	NC_014323	TC	3	6	536248	536253	0 %	50 %	0 %	50 %	300309828
13536	NC_014323	CTG	2	6	536311	536316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309828
13537	NC_014323	ACCG	2	8	536360	536367	25 %	0 %	25 %	50 %	300309828
13538	NC_014323	GTC	2	6	536384	536389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309828
13539	NC_014323	ATC	2	6	536396	536401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309828
13540	NC_014323	GCCG	2	8	536410	536417	0 %	0 %	50 %	50 %	300309828
13541	NC_014323	TCG	2	6	536493	536498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309828
13542	NC_014323	TCA	2	6	536505	536510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309828
13543	NC_014323	CGC	2	6	536525	536530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309828
13544	NC_014323	ATGAC	2	10	536577	536586	40 %	20 %	20 %	20 %	300309828
13545	NC_014323	CCA	2	6	536658	536663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309828
13546	NC_014323	CGG	2	6	536668	536673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309828
13547	NC_014323	ATG	2	6	536675	536680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309828
13548	NC_014323	GGC	2	6	536698	536703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309828
13549	NC_014323	CTT	2	6	536716	536721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309828
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13551	NC_014323	GC	4	8	536773	536780	0 %	0 %	50 %	50 %	300309828
13552	NC_014323	GCC	2	6	536789	536794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309828
13553	NC_014323	GCC	2	6	536825	536830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309828
13554	NC_014323	TGCG	2	8	536849	536856	0 %	25 %	50 %	25 %	300309828
13555	NC_014323	GCT	2	6	536860	536865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309828
13556	NC_014323	CAT	2	6	536911	536916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309828
13557	NC_014323	CAT	2	6	536923	536928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309828
13558	NC_014323	GTG	2	6	536954	536959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309828
13559	NC_014323	CCGG	2	8	536976	536983	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13560	NC_014323	GCA	2	6	537030	537035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13561	NC_014323	CGC	2	6	537039	537044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13562	NC_014323	CGG	3	9	537057	537065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13563	NC_014323	CCAT	2	8	537076	537083	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13564	NC_014323	CCTC	2	8	537154	537161	0 %	25 %	0 %	75 %	300309829
13565	NC_014323	CTG	2	6	537180	537185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309829
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13567	NC_014323	TCC	2	6	537222	537227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300309829
13568	NC_014323	CTG	2	6	537255	537260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309829
13569	NC_014323	GCC	2	6	537291	537296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309829
13570	NC_014323	GCC	2	6	537315	537320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309829
13571	NC_014323	CGG	2	6	537359	537364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309829
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13573	NC_014323	GGCT	2	8	537412	537419	0 %	25 %	50 %	25 %	300309829
13574	NC_014323	CAT	2	6	537425	537430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309829
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13579	NC_014323	GCC	2	6	537574	537579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309829
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13581	NC_014323	TCG	2	6	537622	537627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309829
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13584	NC_014323	GAA	2	6	537714	537719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309829
13585	NC_014323	TCCT	2	8	537732	537739	0 %	50 %	0 %	50 %	300309829
13586	NC_014323	CTG	2	6	537828	537833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309829
13587	NC_014323	GCT	2	6	537839	537844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309829
13588	NC_014323	GCG	2	6	537867	537872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309829
13589	NC_014323	TGA	2	6	537883	537888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309829
13590	NC_014323	T	6	6	537947	537952	0 %	100 %	0 %	0 %	300309829
13591	NC_014323	GCTG	2	8	537973	537980	0 %	25 %	50 %	25 %	300309829
13592	NC_014323	CA	3	6	538003	538008	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13593	NC_014323	CTT	2	6	538020	538025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13594	NC_014323	CCG	2	6	538050	538055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309830
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13599	NC_014323	CTG	2	6	538223	538228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309830
13600	NC_014323	GTG	2	6	538244	538249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309830
13601	NC_014323	CGC	2	6	538254	538259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309830
13602	NC_014323	GC	3	6	538309	538314	0 %	0 %	50 %	50 %	300309830
13603	NC_014323	CGA	2	6	538342	538347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309830
13604	NC_014323	TGA	2	6	538416	538421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309830
13605	NC_014323	CGC	2	6	538422	538427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309830
13606	NC_014323	CTG	2	6	538439	538444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309830
13607	NC_014323	GC	3	6	538451	538456	0 %	0 %	50 %	50 %	300309830
13608	NC_014323	CGA	2	6	538474	538479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309830
13609	NC_014323	TGC	2	6	538539	538544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309830
13610	NC_014323	CAG	2	6	538595	538600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309830
13611	NC_014323	ATC	2	6	538613	538618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309830
13612	NC_014323	GC	3	6	538640	538645	0 %	0 %	50 %	50 %	300309830
13613	NC_014323	TCGTC	2	10	538650	538659	0 %	40 %	20 %	40 %	300309830
13614	NC_014323	TCG	2	6	538689	538694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309830
13615	NC_014323	AGC	2	6	538713	538718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309830
13616	NC_014323	TCA	2	6	538728	538733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309830
13617	NC_014323	AAG	2	6	538781	538786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309830
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13619	NC_014323	CCG	2	6	538797	538802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309830
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13621	NC_014323	CCA	2	6	538917	538922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309830
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13866	NC_014323	GCG	2	6	550291	550296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13867	NC_014323	CA	3	6	550313	550318	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13868	NC_014323	TTGT	2	8	550341	550348	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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13988	NC_014323	GGCA	2	8	555550	555557	25 %	0 %	50 %	25 %	300309843
13989	NC_014323	CCG	2	6	555603	555608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309843
13990	NC_014323	GGC	2	6	555615	555620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309843
13991	NC_014323	GCC	3	9	555626	555634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309843
13992	NC_014323	GCT	2	6	555657	555662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309843
13993	NC_014323	GGC	2	6	555680	555685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309843
13994	NC_014323	GCAC	2	8	555729	555736	25 %	0 %	25 %	50 %	300309843
13995	NC_014323	AGG	2	6	555775	555780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13996	NC_014323	CCAG	2	8	555824	555831	25 %	0 %	25 %	50 %	300309844
13997	NC_014323	AGCG	2	8	555895	555902	25 %	0 %	50 %	25 %	300309844
13998	NC_014323	GC	3	6	556004	556009	0 %	0 %	50 %	50 %	300309844
13999	NC_014323	AC	3	6	556032	556037	50 %	0 %	0 %	50 %	300309844
14000	NC_014323	CAGG	2	8	556050	556057	25 %	0 %	50 %	25 %	300309844

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