MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 139543

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_014323	CATGCC	2	12	237243	237254	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	300309572
6002	NC_014323	CGG	2	6	237306	237311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309572
6003	NC_014323	AGC	2	6	237329	237334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309572
6004	NC_014323	CAC	2	6	237356	237361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309573
6005	NC_014323	TGC	2	6	237403	237408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309573
6006	NC_014323	GC	3	6	237407	237412	0 %	0 %	50 %	50 %	300309573
6007	NC_014323	CGG	2	6	237428	237433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309573
6008	NC_014323	CCGG	2	8	237462	237469	0 %	0 %	50 %	50 %	300309573
6009	NC_014323	GCC	2	6	237543	237548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309573
6010	NC_014323	GCA	2	6	237583	237588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309573
6011	NC_014323	GGC	2	6	237646	237651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309573
6012	NC_014323	GCGG	2	8	237688	237695	0 %	0 %	75 %	25 %	300309573
6013	NC_014323	CGAC	2	8	237704	237711	25 %	0 %	25 %	50 %	300309573
6014	NC_014323	CGGA	2	8	237721	237728	25 %	0 %	50 %	25 %	300309573
6015	NC_014323	GGGA	2	8	237738	237745	25 %	0 %	75 %	0 %	300309573
6016	NC_014323	TGC	2	6	237788	237793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309574
6017	NC_014323	GC	4	8	237995	238002	0 %	0 %	50 %	50 %	300309574
6018	NC_014323	GCG	2	6	238091	238096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6019	NC_014323	G	6	6	238211	238216	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_014323	GCC	2	6	238258	238263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6021	NC_014323	CCAT	2	8	238288	238295	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6022	NC_014323	GCA	2	6	238310	238315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6023	NC_014323	CCG	2	6	238332	238337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6024	NC_014323	ATC	2	6	238354	238359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6025	NC_014323	CAG	2	6	238443	238448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309575
6026	NC_014323	TCG	2	6	238462	238467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309575
6027	NC_014323	T	6	6	238517	238522	0 %	100 %	0 %	0 %	300309575
6028	NC_014323	ATC	2	6	238530	238535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309575
6029	NC_014323	TTC	2	6	238545	238550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309575
6030	NC_014323	GCT	3	9	238574	238582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309575
6031	NC_014323	CTT	2	6	238607	238612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309575
6032	NC_014323	CTG	2	6	238635	238640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309575
6033	NC_014323	CAC	2	6	238709	238714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309575
6034	NC_014323	CGC	2	6	238759	238764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309575
6035	NC_014323	GCT	2	6	238784	238789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309575
6036	NC_014323	CGAGCG	2	12	238853	238864	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	300309575
6037	NC_014323	TGC	2	6	238909	238914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309575
6038	NC_014323	CGC	2	6	238955	238960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309575
6039	NC_014323	CTG	2	6	238995	239000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309575
6040	NC_014323	CAT	3	9	239003	239011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309575
6041	NC_014323	TAC	2	6	239025	239030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309575
6042	NC_014323	TCA	2	6	239036	239041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309575
6043	NC_014323	GAA	2	6	239046	239051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309575
6044	NC_014323	GAA	2	6	239067	239072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309575
6045	NC_014323	GAAG	2	8	239096	239103	50 %	0 %	50 %	0 %	300309575
6046	NC_014323	CG	3	6	239119	239124	0 %	0 %	50 %	50 %	300309575
6047	NC_014323	ACC	2	6	239229	239234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309575
6048	NC_014323	CAT	2	6	239267	239272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309575
6049	NC_014323	TCG	2	6	239287	239292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309575
6050	NC_014323	CCGT	2	8	239318	239325	0 %	25 %	25 %	50 %	300309575
6051	NC_014323	CGG	2	6	239338	239343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309575
6052	NC_014323	GCT	2	6	239408	239413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309575
6053	NC_014323	GGC	2	6	239468	239473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309575
6054	NC_014323	CGG	2	6	239549	239554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309575
6055	NC_014323	CTT	2	6	239564	239569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309575
6056	NC_014323	CGC	2	6	239585	239590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309575
6057	NC_014323	GCA	2	6	239596	239601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309575
6058	NC_014323	TGA	2	6	239623	239628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309575
6059	NC_014323	CGC	2	6	239630	239635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309575
6060	NC_014323	TCG	2	6	239647	239652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309575
6061	NC_014323	CGTG	2	8	239663	239670	0 %	25 %	50 %	25 %	300309575
6062	NC_014323	ATG	2	6	239772	239777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309576
6063	NC_014323	TCG	2	6	239799	239804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309576
6064	NC_014323	GC	3	6	239837	239842	0 %	0 %	50 %	50 %	300309576
6065	NC_014323	CCACGT	2	12	239890	239901	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	300309576
6066	NC_014323	TCG	2	6	239976	239981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309576
6067	NC_014323	CGG	2	6	240022	240027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309576
6068	NC_014323	CGG	2	6	240115	240120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309576
6069	NC_014323	CCGC	2	8	240133	240140	0 %	0 %	25 %	75 %	300309576
6070	NC_014323	GC	3	6	240191	240196	0 %	0 %	50 %	50 %	300309576
6071	NC_014323	GAA	2	6	240236	240241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309576
6072	NC_014323	AGATCA	2	12	240261	240272	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	300309576
6073	NC_014323	GCG	2	6	240282	240287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309576
6074	NC_014323	GCCGAA	2	12	240353	240364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309576
6075	NC_014323	CG	3	6	240404	240409	0 %	0 %	50 %	50 %	300309576
6076	NC_014323	GCG	2	6	240429	240434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309576
6077	NC_014323	GTG	2	6	240506	240511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309576
6078	NC_014323	GCC	2	6	240565	240570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309576
6079	NC_014323	CTG	2	6	240668	240673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309576
6080	NC_014323	TCA	2	6	240705	240710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309576
6081	NC_014323	GCC	3	9	240764	240772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309576
6082	NC_014323	GC	3	6	240805	240810	0 %	0 %	50 %	50 %	300309576
6083	NC_014323	GC	3	6	240813	240818	0 %	0 %	50 %	50 %	300309576
6084	NC_014323	CTC	2	6	240866	240871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300309576
6085	NC_014323	GCAG	2	8	240904	240911	25 %	0 %	50 %	25 %	300309576
6086	NC_014323	T	6	6	240951	240956	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6087	NC_014323	CGC	2	6	240957	240962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6088	NC_014323	CCA	2	6	240969	240974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6089	NC_014323	GCG	2	6	240989	240994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6090	NC_014323	C	6	6	241071	241076	0 %	0 %	0 %	100 %	300309577
6091	NC_014323	GCC	2	6	241101	241106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309577
6092	NC_014323	CGC	3	9	241130	241138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309577
6093	NC_014323	GCC	2	6	241168	241173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309577
6094	NC_014323	AAG	2	6	241203	241208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309577
6095	NC_014323	CTG	2	6	241281	241286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309577
6096	NC_014323	CAT	2	6	241313	241318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309577
6097	NC_014323	CGC	2	6	241384	241389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309577
6098	NC_014323	GC	3	6	241395	241400	0 %	0 %	50 %	50 %	300309577
6099	NC_014323	GTC	2	6	241437	241442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309577
6100	NC_014323	GCCC	2	8	241507	241514	0 %	0 %	25 %	75 %	300309577
6101	NC_014323	CG	3	6	241526	241531	0 %	0 %	50 %	50 %	300309577
6102	NC_014323	TGGA	2	8	241579	241586	25 %	25 %	50 %	0 %	300309577
6103	NC_014323	CTG	2	6	241590	241595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309577
6104	NC_014323	CCA	2	6	241613	241618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309577
6105	NC_014323	CAAT	2	8	241724	241731	50 %	25 %	0 %	25 %	300309577
6106	NC_014323	TGC	3	9	241738	241746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309577
6107	NC_014323	AGGGC	2	10	241760	241769	20 %	0 %	60 %	20 %	300309577
6108	NC_014323	GTG	2	6	241770	241775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309577
6109	NC_014323	CTGGC	2	10	241776	241785	0 %	20 %	40 %	40 %	300309577
6110	NC_014323	CTG	2	6	241818	241823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309577
6111	NC_014323	GC	3	6	241826	241831	0 %	0 %	50 %	50 %	300309577
6112	NC_014323	GCCAG	2	10	241834	241843	20 %	0 %	40 %	40 %	300309577
6113	NC_014323	GCG	2	6	241855	241860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309577
6114	NC_014323	CTA	2	6	241862	241867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309577
6115	NC_014323	CGC	3	9	241898	241906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309577
6116	NC_014323	GCTG	2	8	241921	241928	0 %	25 %	50 %	25 %	300309577
6117	NC_014323	GCT	2	6	241949	241954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309577
6118	NC_014323	CAAGC	2	10	242015	242024	40 %	0 %	20 %	40 %	300309578
6119	NC_014323	TGG	2	6	242049	242054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309578
6120	NC_014323	GC	3	6	242092	242097	0 %	0 %	50 %	50 %	300309578
6121	NC_014323	GAA	2	6	242186	242191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309578
6122	NC_014323	GTG	2	6	242201	242206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309578
6123	NC_014323	GGC	2	6	242310	242315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309578
6124	NC_014323	CCT	2	6	242362	242367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300309578
6125	NC_014323	CG	3	6	242400	242405	0 %	0 %	50 %	50 %	300309578
6126	NC_014323	GCC	2	6	242441	242446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309578
6127	NC_014323	CG	3	6	242522	242527	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6128	NC_014323	ACAAGA	2	12	242541	242552	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6129	NC_014323	ACA	2	6	242589	242594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300309579
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6131	NC_014323	GTC	2	6	242622	242627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309579
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6142	NC_014323	CGG	2	6	243184	243189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309579
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6147	NC_014323	GCG	2	6	243457	243462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309580
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6153	NC_014323	CCGG	2	8	243590	243597	0 %	0 %	50 %	50 %	300309580
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6156	NC_014323	TCGT	2	8	243648	243655	0 %	50 %	25 %	25 %	300309580
6157	NC_014323	CGGCG	2	10	243670	243679	0 %	0 %	60 %	40 %	300309580
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6181	NC_014323	CGG	2	6	244617	244622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6182	NC_014323	TAA	2	6	244650	244655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6183	NC_014323	GAT	2	6	244671	244676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309581
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6219	NC_014323	T	6	6	245912	245917	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6220	NC_014323	T	6	6	245928	245933	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6221	NC_014323	T	6	6	245937	245942	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6222	NC_014323	GGA	2	6	245993	245998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300309582
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6226	NC_014323	ACC	2	6	246190	246195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309582
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6231	NC_014323	CG	3	6	246335	246340	0 %	0 %	50 %	50 %	300309582
6232	NC_014323	TCT	2	6	246350	246355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309582
6233	NC_014323	GC	3	6	246398	246403	0 %	0 %	50 %	50 %	300309582
6234	NC_014323	CCA	2	6	246404	246409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309582
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6237	NC_014323	GTC	2	6	246621	246626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309582
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6240	NC_014323	GGC	2	6	246678	246683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309582
6241	NC_014323	CAG	2	6	246726	246731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309582
6242	NC_014323	CAA	2	6	246741	246746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300309582
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6244	NC_014323	GCC	2	6	246908	246913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309583
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6246	NC_014323	TCG	2	6	247080	247085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309583
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6365	NC_014323	GCA	2	6	251381	251386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309588
6366	NC_014323	GAA	2	6	251465	251470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309588
6367	NC_014323	GTA	2	6	251523	251528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309588
6368	NC_014323	GCA	2	6	251542	251547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309588
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6370	NC_014323	GT	3	6	251567	251572	0 %	50 %	50 %	0 %	300309588
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6386	NC_014323	TGG	2	6	252683	252688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6486	NC_014323	TGG	2	6	257127	257132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309592
6487	NC_014323	CTG	2	6	257242	257247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309592
6488	NC_014323	CGTG	2	8	257325	257332	0 %	25 %	50 %	25 %	300309592
6489	NC_014323	CTG	2	6	257355	257360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309592
6490	NC_014323	CTG	2	6	257363	257368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309592
6491	NC_014323	TTC	2	6	257372	257377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309592
6492	NC_014323	CGG	2	6	257384	257389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309592
6493	NC_014323	GCG	2	6	257404	257409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309592
6494	NC_014323	GCC	2	6	257442	257447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309592
6495	NC_014323	TGC	2	6	257448	257453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309592
6496	NC_014323	CCT	2	6	257511	257516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300309592
6497	NC_014323	CG	3	6	257536	257541	0 %	0 %	50 %	50 %	300309592
6498	NC_014323	GAT	2	6	257570	257575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309592
6499	NC_014323	GCG	2	6	257600	257605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309592
6500	NC_014323	CTC	2	6	257627	257632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300309592

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