MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Halalkalicoccus jeotgali B3 plasmid 3

Total Repeats: 130

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014300	CGTT	2	8	41	48	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_014300	AAAC	2	8	127	134	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_014300	ACGC	2	8	332	339	25 %	0 %	25 %	50 %	299883391
4	NC_014300	TTCC	2	8	478	485	0 %	50 %	0 %	50 %	299883391
5	NC_014300	TGGT	2	8	530	537	0 %	50 %	50 %	0 %	299883391
6	NC_014300	CTCG	2	8	652	659	0 %	25 %	25 %	50 %	299883391
7	NC_014300	CATC	2	8	1068	1075	25 %	25 %	0 %	50 %	299883391
8	NC_014300	CGTT	2	8	1676	1683	0 %	50 %	25 %	25 %	299883391
9	NC_014300	GATT	2	8	1703	1710	25 %	50 %	25 %	0 %	299883391
10	NC_014300	CGAC	2	8	2698	2705	25 %	0 %	25 %	50 %	299883392
11	NC_014300	GGTT	2	8	2845	2852	0 %	50 %	50 %	0 %	299883392
12	NC_014300	TCGC	2	8	3332	3339	0 %	25 %	25 %	50 %	299883393
13	NC_014300	TCAC	2	8	3515	3522	25 %	25 %	0 %	50 %	299883393
14	NC_014300	AGCG	2	8	3664	3671	25 %	0 %	50 %	25 %	299883393
15	NC_014300	ATCG	2	8	4568	4575	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_014300	GAGC	2	8	4908	4915	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_014300	CCTG	2	8	5146	5153	0 %	25 %	25 %	50 %	299883395
18	NC_014300	GCGA	2	8	5665	5672	25 %	0 %	50 %	25 %	299883397
19	NC_014300	ATCG	2	8	6226	6233	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_014300	TGAT	2	8	6691	6698	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014300	GCGT	2	8	6807	6814	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_014300	CCAG	2	8	7256	7263	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_014300	TTGA	2	8	7512	7519	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014300	GCCT	2	8	7904	7911	0 %	25 %	25 %	50 %	299883399
25	NC_014300	CCGC	2	8	8074	8081	0 %	0 %	25 %	75 %	299883399
26	NC_014300	CGAC	2	8	8168	8175	25 %	0 %	25 %	50 %	299883399
27	NC_014300	CGCT	2	8	8178	8185	0 %	25 %	25 %	50 %	299883399
28	NC_014300	CAGC	2	8	9370	9377	25 %	0 %	25 %	50 %	299883400
29	NC_014300	CGGA	2	8	9637	9644	25 %	0 %	50 %	25 %	299883400
30	NC_014300	TCCA	2	8	9785	9792	25 %	25 %	0 %	50 %	299883400
31	NC_014300	TCCG	2	8	9944	9951	0 %	25 %	25 %	50 %	299883400
32	NC_014300	CGAC	2	8	10772	10779	25 %	0 %	25 %	50 %	299883401
33	NC_014300	GTCG	2	8	10860	10867	0 %	25 %	50 %	25 %	299883401
34	NC_014300	CCGG	2	8	11305	11312	0 %	0 %	50 %	50 %	299883401
35	NC_014300	CGGT	2	8	11606	11613	0 %	25 %	50 %	25 %	299883401
36	NC_014300	AGTC	2	8	11792	11799	25 %	25 %	25 %	25 %	299883402
37	NC_014300	GACG	2	8	11916	11923	25 %	0 %	50 %	25 %	299883402
38	NC_014300	CCCG	2	8	11995	12002	0 %	0 %	25 %	75 %	299883402
39	NC_014300	CCCA	2	8	12019	12026	25 %	0 %	0 %	75 %	299883402
40	NC_014300	GACC	2	8	12081	12088	25 %	0 %	25 %	50 %	299883402
41	NC_014300	GTCC	2	8	12106	12113	0 %	25 %	25 %	50 %	299883402
42	NC_014300	TCCG	2	8	13183	13190	0 %	25 %	25 %	50 %	299883405
43	NC_014300	CGAC	2	8	13967	13974	25 %	0 %	25 %	50 %	299883406
44	NC_014300	CGGG	2	8	14420	14427	0 %	0 %	75 %	25 %	299883406
45	NC_014300	CCGG	2	8	14628	14635	0 %	0 %	50 %	50 %	299883406
46	NC_014300	CCGA	2	8	14647	14654	25 %	0 %	25 %	50 %	299883406
47	NC_014300	GAAG	2	8	14838	14845	50 %	0 %	50 %	0 %	299883406
48	NC_014300	TGGC	2	8	15023	15030	0 %	25 %	50 %	25 %	299883406
49	NC_014300	GTTG	2	8	15657	15664	0 %	50 %	50 %	0 %	299883406
50	NC_014300	TGAC	2	8	16505	16512	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_014300	GCCA	2	8	17156	17163	25 %	0 %	25 %	50 %	299883408
52	NC_014300	ACCG	2	8	17364	17371	25 %	0 %	25 %	50 %	299883408
53	NC_014300	TCCG	2	8	17674	17681	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_014300	TGGC	2	8	18430	18437	0 %	25 %	50 %	25 %	299883409
55	NC_014300	CGTT	2	8	18735	18742	0 %	50 %	25 %	25 %	299883409
56	NC_014300	TCAC	2	8	19083	19090	25 %	25 %	0 %	50 %	299883409
57	NC_014300	GAAC	2	8	19444	19451	50 %	0 %	25 %	25 %	299883410
58	NC_014300	GGCC	2	8	19482	19489	0 %	0 %	50 %	50 %	299883410
59	NC_014300	ACCG	2	8	19583	19590	25 %	0 %	25 %	50 %	299883410
60	NC_014300	CGAA	2	8	19843	19850	50 %	0 %	25 %	25 %	299883411
61	NC_014300	GACG	2	8	19882	19889	25 %	0 %	50 %	25 %	299883411
62	NC_014300	TGGT	2	8	20043	20050	0 %	50 %	50 %	0 %	299883411
63	NC_014300	TTCG	2	8	20195	20202	0 %	50 %	25 %	25 %	299883411
64	NC_014300	CGAA	2	8	20761	20768	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_014300	TCCG	2	8	21039	21046	0 %	25 %	25 %	50 %	299883412
66	NC_014300	GGGC	2	8	22026	22033	0 %	0 %	75 %	25 %	299883412
67	NC_014300	GACC	2	8	23493	23500	25 %	0 %	25 %	50 %	299883412
68	NC_014300	GGTC	2	8	23583	23590	0 %	25 %	50 %	25 %	299883412
69	NC_014300	CTGT	2	8	24377	24384	0 %	50 %	25 %	25 %	299883412
70	NC_014300	GGTC	2	8	24701	24708	0 %	25 %	50 %	25 %	299883413
71	NC_014300	CGAA	2	8	25405	25412	50 %	0 %	25 %	25 %	299883413
72	NC_014300	CGAA	2	8	26294	26301	50 %	0 %	25 %	25 %	299883413
73	NC_014300	CGTC	2	8	26564	26571	0 %	25 %	25 %	50 %	299883413
74	NC_014300	CGGT	2	8	26778	26785	0 %	25 %	50 %	25 %	299883413
75	NC_014300	GTTC	2	8	27026	27033	0 %	50 %	25 %	25 %	299883413
76	NC_014300	GGAG	2	8	27355	27362	25 %	0 %	75 %	0 %	299883413
77	NC_014300	TCGA	2	8	27658	27665	25 %	25 %	25 %	25 %	299883413
78	NC_014300	TCGG	2	8	27688	27695	0 %	25 %	50 %	25 %	299883413
79	NC_014300	AACG	2	8	28923	28930	50 %	0 %	25 %	25 %	299883415
80	NC_014300	GGTC	2	8	29273	29280	0 %	25 %	50 %	25 %	299883415
81	NC_014300	GGCG	2	8	30731	30738	0 %	0 %	75 %	25 %	299883419
82	NC_014300	CGGG	2	8	30767	30774	0 %	0 %	75 %	25 %	299883419
83	NC_014300	CGCA	2	8	30909	30916	25 %	0 %	25 %	50 %	299883419
84	NC_014300	CGGG	2	8	31067	31074	0 %	0 %	75 %	25 %	299883419
85	NC_014300	GCTC	2	8	31929	31936	0 %	25 %	25 %	50 %	299883419
86	NC_014300	CAAT	2	8	31953	31960	50 %	25 %	0 %	25 %	299883419
87	NC_014300	GCTC	2	8	32048	32055	0 %	25 %	25 %	50 %	299883420
88	NC_014300	TCGT	2	8	32191	32198	0 %	50 %	25 %	25 %	299883420
89	NC_014300	CCCG	2	8	32424	32431	0 %	0 %	25 %	75 %	299883420
90	NC_014300	TTCT	2	8	32583	32590	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_014300	GGCT	2	8	32689	32696	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_014300	CATG	2	8	32713	32720	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_014300	TCAC	2	8	33285	33292	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_014300	CCTA	2	8	33383	33390	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_014300	TCCG	2	8	33458	33465	0 %	25 %	25 %	50 %	299883422
96	NC_014300	AATC	2	8	33595	33602	50 %	25 %	0 %	25 %	299883422
97	NC_014300	CCCG	2	8	33647	33654	0 %	0 %	25 %	75 %	299883422
98	NC_014300	GACC	2	8	33907	33914	25 %	0 %	25 %	50 %	299883422
99	NC_014300	GTTT	2	8	34382	34389	0 %	75 %	25 %	0 %	299883422
100	NC_014300	TTGT	2	8	34732	34739	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014300	CGTC	2	8	34802	34809	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_014300	TCGG	2	8	34915	34922	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_014300	ACCC	2	8	35556	35563	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
104	NC_014300	GTGC	2	8	35887	35894	0 %	25 %	50 %	25 %	299883424
105	NC_014300	GCGA	2	8	36281	36288	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_014300	ATCA	2	8	36456	36463	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_014300	GGCA	2	8	37625	37632	25 %	0 %	50 %	25 %	299883425
108	NC_014300	TTCT	2	8	37815	37822	0 %	75 %	0 %	25 %	299883425
109	NC_014300	CGGA	2	8	38052	38059	25 %	0 %	50 %	25 %	299883425
110	NC_014300	GACG	2	8	38124	38131	25 %	0 %	50 %	25 %	299883425
111	NC_014300	CGCT	2	8	38414	38421	0 %	25 %	25 %	50 %	299883425
112	NC_014300	GTTG	2	8	38677	38684	0 %	50 %	50 %	0 %	299883425
113	NC_014300	CGGA	2	8	38776	38783	25 %	0 %	50 %	25 %	299883425
114	NC_014300	CGGG	2	8	39843	39850	0 %	0 %	75 %	25 %	299883427
115	NC_014300	CTTT	2	8	39873	39880	0 %	75 %	0 %	25 %	299883427
116	NC_014300	TGAC	2	8	41240	41247	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_014300	TCTA	2	8	41397	41404	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_014300	GACC	2	8	41451	41458	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_014300	CTGC	2	8	42057	42064	0 %	25 %	25 %	50 %	299883429
120	NC_014300	GTTC	2	8	42084	42091	0 %	50 %	25 %	25 %	299883429
121	NC_014300	TGGC	2	8	42171	42178	0 %	25 %	50 %	25 %	299883429
122	NC_014300	AAAT	2	8	42483	42490	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014300	TGGT	2	8	42691	42698	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014300	TCCT	2	8	42808	42815	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_014300	CGTT	2	8	42929	42936	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_014300	AGAC	2	8	43187	43194	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_014300	CAAG	2	8	43200	43207	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_014300	GTCG	2	8	43414	43421	0 %	25 %	50 %	25 %	299883430
129	NC_014300	CACT	2	8	44227	44234	25 %	25 %	0 %	50 %	299883431
130	NC_014300	TGCT	2	8	44427	44434	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.