MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Halalkalicoccus jeotgali B3 plasmid 2

Total Repeats: 5556

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014299	CGG	2	6	37	42	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014299	TGG	2	6	195	200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014299	AAT	2	6	355	360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014299	GTC	2	6	380	385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_014299	TCA	2	6	440	445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014299	ACT	2	6	523	528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300712770
7	NC_014299	CGT	2	6	626	631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300712770
8	NC_014299	TGT	2	6	700	705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300712770
9	NC_014299	GAA	2	6	709	714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300712770
10	NC_014299	ACT	2	6	752	757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300712770
11	NC_014299	CCT	2	6	938	943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_014299	CGA	2	6	1110	1115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_014299	AAG	2	6	1134	1139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014299	AAT	2	6	1233	1238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014299	ATG	2	6	1399	1404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014299	ATG	2	6	1512	1517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300712771
17	NC_014299	GAA	2	6	1548	1553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300712771
18	NC_014299	GAT	2	6	1554	1559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300712771
19	NC_014299	GAT	3	9	1665	1673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300712771
20	NC_014299	AGA	2	6	1853	1858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300712771
21	NC_014299	GAG	2	6	1928	1933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300712771
22	NC_014299	AGT	2	6	2008	2013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300712771
23	NC_014299	CCT	2	6	2026	2031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_014299	AGC	2	6	2036	2041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_014299	TCC	2	6	2044	2049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_014299	ATT	2	6	2080	2085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014299	CGC	2	6	2091	2096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_014299	AAT	2	6	2169	2174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014299	CGA	2	6	2232	2237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712772
30	NC_014299	CTC	2	6	2324	2329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300712772
31	NC_014299	CGA	2	6	2380	2385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712772
32	NC_014299	AAC	2	6	2540	2545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300712772
33	NC_014299	TCA	2	6	2592	2597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300712772
34	NC_014299	TGA	2	6	2599	2604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300712772
35	NC_014299	CAC	2	6	2610	2615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300712772
36	NC_014299	AGG	2	6	2649	2654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300712772
37	NC_014299	ACA	2	6	2655	2660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300712772
38	NC_014299	AGC	2	6	2730	2735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712772
39	NC_014299	GGC	2	6	2758	2763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300712772
40	NC_014299	GAC	2	6	2771	2776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712772
41	NC_014299	CGA	2	6	2817	2822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712772
42	NC_014299	ACG	2	6	2834	2839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712772
43	NC_014299	CGA	3	9	2965	2973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712772
44	NC_014299	ATA	2	6	3052	3057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300712772
45	NC_014299	ACT	2	6	3086	3091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300712773
46	NC_014299	CGA	2	6	3180	3185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712773
47	NC_014299	AAC	2	6	3192	3197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300712773
48	NC_014299	GCA	2	6	3237	3242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712773
49	NC_014299	TCG	2	6	3247	3252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300712773
50	NC_014299	CTG	2	6	3295	3300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300712773
51	NC_014299	TCC	2	6	3343	3348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300712773
52	NC_014299	GTT	2	6	3350	3355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300712773
53	NC_014299	AGA	2	6	3431	3436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300712773
54	NC_014299	AGT	2	6	3502	3507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014299	TCG	2	6	3669	3674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300712774
56	NC_014299	GAC	2	6	3692	3697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712774
57	NC_014299	ATC	2	6	3705	3710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300712774
58	NC_014299	TCG	2	6	3727	3732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_014299	AGC	2	6	3959	3964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712775
60	NC_014299	GAT	2	6	3982	3987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300712775
61	NC_014299	GGA	2	6	4054	4059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300712775
62	NC_014299	GAG	2	6	4112	4117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300712775
63	NC_014299	GCT	2	6	4220	4225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300712776
64	NC_014299	CCA	2	6	4317	4322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300712776
65	NC_014299	GCC	2	6	4335	4340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300712776
66	NC_014299	CTT	2	6	4344	4349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300712776
67	NC_014299	GAC	2	6	4353	4358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712776
68	NC_014299	ATC	2	6	4458	4463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300712776
69	NC_014299	CTC	2	6	4476	4481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300712776
70	NC_014299	TAT	2	6	4597	4602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014299	TTA	2	6	4616	4621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014299	GAC	2	6	4845	4850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_014299	GAT	2	6	4860	4865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014299	AAC	2	6	4882	4887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_014299	GGC	2	6	4894	4899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_014299	AGC	2	6	5106	5111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712777
77	NC_014299	AGA	2	6	5118	5123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300712777
78	NC_014299	ATC	2	6	5155	5160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300712777
79	NC_014299	CGC	3	9	5458	5466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300712777
80	NC_014299	AAG	2	6	5474	5479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300712777
81	NC_014299	TGA	2	6	5518	5523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300712777
82	NC_014299	GAC	2	6	5534	5539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712777
83	NC_014299	GAA	2	6	5548	5553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300712777
84	NC_014299	GAA	2	6	5563	5568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300712777
85	NC_014299	GTC	2	6	5576	5581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300712777
86	NC_014299	CGA	2	6	5677	5682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_014299	AAC	2	6	5727	5732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_014299	AGT	3	9	5756	5764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014299	TAG	2	6	5770	5775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014299	CAC	2	6	5813	5818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_014299	CTT	2	6	5856	5861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_014299	TTC	2	6	5863	5868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_014299	GTC	2	6	5878	5883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_014299	ATG	2	6	5930	5935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014299	ACC	2	6	6199	6204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300712778
96	NC_014299	CGA	2	6	6261	6266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712779
97	NC_014299	GAA	2	6	6283	6288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300712779
98	NC_014299	GAG	2	6	6328	6333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300712779
99	NC_014299	GAA	2	6	6448	6453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300712779
100	NC_014299	GCA	2	6	6508	6513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712779
101	NC_014299	CGC	2	6	6529	6534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300712779
102	NC_014299	CCA	2	6	6828	6833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300712779
103	NC_014299	GCG	2	6	6857	6862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300712779
104	NC_014299	GAC	2	6	6874	6879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712779
105	NC_014299	ACA	2	6	6932	6937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300712779
106	NC_014299	ACG	2	6	6941	6946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712779
107	NC_014299	GAT	2	6	7003	7008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300712779
108	NC_014299	CCA	2	6	7270	7275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300712779
109	NC_014299	CGG	2	6	7302	7307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300712779
110	NC_014299	CTC	2	6	7405	7410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300712779
111	NC_014299	ACT	2	6	7454	7459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300712779
112	NC_014299	CGA	2	6	7527	7532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712779
113	NC_014299	GGT	2	6	7576	7581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300712779
114	NC_014299	TCG	2	6	7586	7591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300712779
115	NC_014299	CTA	2	6	7650	7655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300712779
116	NC_014299	GAC	2	6	7711	7716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712779
117	NC_014299	GGT	2	6	7762	7767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300712779
118	NC_014299	CGA	2	6	7926	7931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712779
119	NC_014299	ACG	2	6	8141	8146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712779
120	NC_014299	CAG	2	6	8197	8202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712779
121	NC_014299	AAG	2	6	8272	8277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300712779
122	NC_014299	ACG	2	6	8291	8296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712779
123	NC_014299	GAT	2	6	8305	8310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300712779
124	NC_014299	ACA	2	6	8429	8434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300712779
125	NC_014299	GGC	2	6	8472	8477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300712779
126	NC_014299	TTC	2	6	8488	8493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300712779
127	NC_014299	TCC	2	6	8580	8585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300712779
128	NC_014299	TGA	2	6	8601	8606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300712779
129	NC_014299	CAT	2	6	8727	8732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300712779
130	NC_014299	TGA	2	6	8838	8843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300712779
131	NC_014299	GAC	2	6	9027	9032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712779
132	NC_014299	TCA	2	6	9140	9145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300712779
133	NC_014299	GGT	2	6	9193	9198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300712779
134	NC_014299	TGA	2	6	9309	9314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300712779
135	NC_014299	TTG	2	6	9347	9352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300712779
136	NC_014299	AGT	2	6	9454	9459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300712779
137	NC_014299	TAC	2	6	9680	9685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300712779
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139	NC_014299	TCT	2	6	9699	9704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300712779
140	NC_014299	CGA	2	6	9885	9890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712779
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143	NC_014299	CGA	2	6	10130	10135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712779
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145	NC_014299	GAC	2	6	10198	10203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712779
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153	NC_014299	CCA	2	6	10558	10563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300712780
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157	NC_014299	CGA	2	6	10714	10719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712780
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241	NC_014299	TAC	2	6	15850	15855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
242	NC_014299	TTC	2	6	15943	15948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300712784
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249	NC_014299	TGG	3	9	16518	16526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
250	NC_014299	TAC	2	6	16557	16562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300712785
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254	NC_014299	TGA	2	6	16831	16836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
255	NC_014299	GTC	2	6	16870	16875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
256	NC_014299	CAA	2	6	16916	16921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300712786
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