MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halalkalicoccus jeotgali B3 plasmid 2

Total Repeats: 7772

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_014299	ACTGG	2	10	237526	237535	20 %	20 %	40 %	20 %	300713024
5002	NC_014299	TGA	2	6	237563	237568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300713024
5003	NC_014299	TG	4	8	237587	237594	0 %	50 %	50 %	0 %	300713024
5004	NC_014299	TACG	2	8	237642	237649	25 %	25 %	25 %	25 %	300713024
5005	NC_014299	CT	3	6	237685	237690	0 %	50 %	0 %	50 %	300713024
5006	NC_014299	TCCG	2	8	237711	237718	0 %	25 %	25 %	50 %	300713024
5007	NC_014299	TTCAC	2	10	237742	237751	20 %	40 %	0 %	40 %	300713024
5008	NC_014299	CCA	2	6	237836	237841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300713024
5009	NC_014299	GTCT	2	8	237867	237874	0 %	50 %	25 %	25 %	300713024
5010	NC_014299	ATGA	2	8	237982	237989	50 %	25 %	25 %	0 %	300713024
5011	NC_014299	CCG	2	6	237999	238004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300713024
5012	NC_014299	TCG	3	9	238018	238026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300713024
5013	NC_014299	AG	3	6	238052	238057	50 %	0 %	50 %	0 %	300713024
5014	NC_014299	CAGA	2	8	238077	238084	50 %	0 %	25 %	25 %	300713024
5015	NC_014299	TCACCA	2	12	238108	238119	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	300713024
5016	NC_014299	AGT	2	6	238139	238144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300713024
5017	NC_014299	GAC	2	6	238190	238195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300713024
5018	NC_014299	GGA	2	6	238292	238297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300713024
5019	NC_014299	TCA	3	9	238315	238323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300713024
5020	NC_014299	GAC	2	6	238437	238442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300713024
5021	NC_014299	TCT	2	6	238480	238485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300713024
5022	NC_014299	GTA	2	6	238488	238493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300713024
5023	NC_014299	GTT	2	6	238506	238511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300713024
5024	NC_014299	ACG	2	6	238513	238518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300713024
5025	NC_014299	TTC	2	6	238525	238530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300713024
5026	NC_014299	CGA	2	6	238541	238546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300713024
5027	NC_014299	TCG	2	6	238564	238569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300713024
5028	NC_014299	CGGT	2	8	238599	238606	0 %	25 %	50 %	25 %	300713024
5029	NC_014299	TCATCG	2	12	238624	238635	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	300713024
5030	NC_014299	CGG	2	6	238709	238714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300713024
5031	NC_014299	TTC	2	6	238815	238820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300713024
5032	NC_014299	ATC	2	6	238825	238830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300713024
5033	NC_014299	TGCC	2	8	238938	238945	0 %	25 %	25 %	50 %	300713024
5034	NC_014299	TGTT	2	8	238962	238969	0 %	75 %	25 %	0 %	300713024
5035	NC_014299	TGG	2	6	238992	238997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300713024
5036	NC_014299	TCA	2	6	239029	239034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300713024
5037	NC_014299	TC	3	6	239060	239065	0 %	50 %	0 %	50 %	300713024
5038	NC_014299	TCA	2	6	239125	239130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300713024
5039	NC_014299	AGAGT	2	10	239181	239190	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_014299	ATA	2	6	239217	239222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_014299	TCA	2	6	239226	239231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5042	NC_014299	GTA	2	6	239265	239270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_014299	CAA	2	6	239305	239310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5044	NC_014299	CT	3	6	239345	239350	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5045	NC_014299	TGTT	2	8	239370	239377	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_014299	C	6	6	239391	239396	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5047	NC_014299	CGG	2	6	239399	239404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5048	NC_014299	CTG	2	6	239425	239430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5049	NC_014299	CAA	2	6	239506	239511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5050	NC_014299	TGT	2	6	239537	239542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_014299	ATT	2	6	239636	239641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_014299	GAT	2	6	239648	239653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_014299	TCT	2	6	239673	239678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5054	NC_014299	AAT	2	6	239682	239687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_014299	TAC	2	6	239712	239717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5056	NC_014299	TCTTG	2	10	239718	239727	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
5057	NC_014299	TTA	2	6	239732	239737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_014299	TAT	2	6	239770	239775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_014299	TATGA	2	10	239788	239797	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_014299	GAA	2	6	239844	239849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_014299	TG	3	6	239886	239891	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_014299	GTG	2	6	239898	239903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_014299	GAG	2	6	239908	239913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_014299	CCG	2	6	239916	239921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5065	NC_014299	TGG	2	6	239987	239992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300713025
5066	NC_014299	TCGA	2	8	240012	240019	25 %	25 %	25 %	25 %	300713025
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5070	NC_014299	GA	3	6	240385	240390	50 %	0 %	50 %	0 %	300713025
5071	NC_014299	AGC	2	6	240469	240474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300713025
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5075	NC_014299	GAC	2	6	240639	240644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300713025
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5078	NC_014299	TGA	2	6	240791	240796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300713025
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5080	NC_014299	TC	3	6	240833	240838	0 %	50 %	0 %	50 %	300713025
5081	NC_014299	CGA	2	6	240962	240967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300713025
5082	NC_014299	GGGT	2	8	240968	240975	0 %	25 %	75 %	0 %	300713025
5083	NC_014299	CTT	2	6	241094	241099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300713025
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5089	NC_014299	TCG	2	6	241249	241254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300713025
5090	NC_014299	CAG	2	6	241272	241277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300713025
5091	NC_014299	CGC	2	6	241316	241321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300713025
5092	NC_014299	AGCG	2	8	241379	241386	25 %	0 %	50 %	25 %	300713025
5093	NC_014299	TCAC	2	8	241488	241495	25 %	25 %	0 %	50 %	300713025
5094	NC_014299	AGGA	2	8	241522	241529	50 %	0 %	50 %	0 %	300713025
5095	NC_014299	TCA	2	6	241658	241663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300713025
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5097	NC_014299	CACAG	2	10	241730	241739	40 %	0 %	20 %	40 %	300713025
5098	NC_014299	CAC	2	6	241753	241758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300713025
5099	NC_014299	GAG	2	6	241818	241823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300713025
5100	NC_014299	GTG	2	6	241833	241838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300713025
5101	NC_014299	CGA	2	6	241856	241861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300713025
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5104	NC_014299	GACA	2	8	241996	242003	50 %	0 %	25 %	25 %	300713025
5105	NC_014299	ACGA	2	8	242021	242028	50 %	0 %	25 %	25 %	300713026
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5107	NC_014299	GAA	2	6	242107	242112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300713026
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5110	NC_014299	TCG	2	6	242358	242363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300713026
5111	NC_014299	CGC	2	6	242437	242442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300713026
5112	NC_014299	AAG	2	6	242463	242468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300713026
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5115	NC_014299	ATC	2	6	242531	242536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300713026
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5118	NC_014299	TGCG	2	8	242577	242584	0 %	25 %	50 %	25 %	300713026
5119	NC_014299	CAG	2	6	242590	242595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300713026
5120	NC_014299	GTCG	2	8	242630	242637	0 %	25 %	50 %	25 %	300713026
5121	NC_014299	GCG	2	6	242692	242697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300713026
5122	NC_014299	GAT	2	6	242756	242761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300713026
5123	NC_014299	GAC	2	6	242846	242851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300713026
5124	NC_014299	TTC	2	6	242913	242918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300713026
5125	NC_014299	ACG	2	6	242925	242930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300713026
5126	NC_014299	CCT	2	6	242987	242992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300713026
5127	NC_014299	GGC	2	6	243149	243154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300713026
5128	NC_014299	ATC	2	6	243189	243194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300713026
5129	NC_014299	ATGGG	2	10	243203	243212	20 %	20 %	60 %	0 %	300713026
5130	NC_014299	AC	3	6	243273	243278	50 %	0 %	0 %	50 %	300713026
5131	NC_014299	GAA	2	6	243316	243321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300713026
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5133	NC_014299	GTG	2	6	243363	243368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300713026
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5138	NC_014299	GAC	2	6	243512	243517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300713026
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5140	NC_014299	GAA	2	6	243677	243682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300713026
5141	NC_014299	CTG	2	6	243699	243704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300713026
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5143	NC_014299	CGG	2	6	243747	243752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300713026
5144	NC_014299	CT	4	8	243865	243872	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5145	NC_014299	TCA	2	6	243879	243884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5146	NC_014299	TAT	2	6	243922	243927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5147	NC_014299	ATT	2	6	243955	243960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5148	NC_014299	CCA	2	6	243961	243966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5149	NC_014299	TAC	2	6	243990	243995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5150	NC_014299	TTG	2	6	244004	244009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5151	NC_014299	CGC	2	6	244053	244058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5152	NC_014299	GCCA	2	8	244065	244072	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5153	NC_014299	ATCCA	2	10	244078	244087	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
5154	NC_014299	CTG	2	6	244101	244106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5155	NC_014299	ATC	2	6	244222	244227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5156	NC_014299	ATA	2	6	244246	244251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5157	NC_014299	ATTC	2	8	244326	244333	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5158	NC_014299	ACCA	2	8	244337	244344	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5159	NC_014299	TCC	2	6	244379	244384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5160	NC_014299	GA	3	6	244385	244390	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5161	NC_014299	GAGT	2	8	244403	244410	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5162	NC_014299	CAT	2	6	244504	244509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5163	NC_014299	ATC	2	6	244618	244623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300713027
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5165	NC_014299	GAT	2	6	244659	244664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300713027
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5167	NC_014299	TGAAC	2	10	244710	244719	40 %	20 %	20 %	20 %	300713027
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5169	NC_014299	TAC	2	6	244822	244827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5171	NC_014299	CGAT	2	8	244893	244900	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5172	NC_014299	AGTT	2	8	244917	244924	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5173	NC_014299	CTT	2	6	244950	244955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5174	NC_014299	GCT	2	6	244976	244981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5176	NC_014299	AGG	2	6	245189	245194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5177	NC_014299	TCG	2	6	245230	245235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5178	NC_014299	AGT	2	6	245236	245241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5180	NC_014299	CTG	2	6	245388	245393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5183	NC_014299	TCG	2	6	245527	245532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5185	NC_014299	TA	3	6	245667	245672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5186	NC_014299	ATC	2	6	245676	245681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5189	NC_014299	CTC	2	6	245744	245749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5191	NC_014299	TCG	2	6	245811	245816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5205	NC_014299	GCC	2	6	246683	246688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5206	NC_014299	GCA	2	6	246814	246819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5214	NC_014299	GAC	2	6	247146	247151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5220	NC_014299	TAA	2	6	247467	247472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300713029
5221	NC_014299	AAC	2	6	247524	247529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5222	NC_014299	ACC	2	6	247594	247599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5223	NC_014299	TCC	2	6	247602	247607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5224	NC_014299	T	7	7	247644	247650	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5225	NC_014299	TTC	2	6	247695	247700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5226	NC_014299	CTA	2	6	247733	247738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5227	NC_014299	TCGTT	2	10	247740	247749	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
5228	NC_014299	CTAC	2	8	247800	247807	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5229	NC_014299	ATC	3	9	247823	247831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5230	NC_014299	TACG	2	8	247932	247939	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5231	NC_014299	CCG	2	6	248061	248066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5232	NC_014299	ATC	3	9	248074	248082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5233	NC_014299	TAAG	2	8	248182	248189	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5234	NC_014299	GGT	2	6	248242	248247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5235	NC_014299	CAG	2	6	248301	248306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5236	NC_014299	AAC	2	6	248325	248330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5237	NC_014299	CAC	2	6	248351	248356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5238	NC_014299	CTAC	2	8	248382	248389	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5239	NC_014299	ATCC	2	8	248416	248423	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5240	NC_014299	CGC	2	6	248455	248460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5241	NC_014299	CCA	2	6	248498	248503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300713030
5242	NC_014299	GC	4	8	248525	248532	0 %	0 %	50 %	50 %	300713030
5243	NC_014299	TCGC	2	8	248606	248613	0 %	25 %	25 %	50 %	300713030
5244	NC_014299	GAA	2	6	248614	248619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300713030
5245	NC_014299	GCT	2	6	248645	248650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300713030
5246	NC_014299	CCT	2	6	248709	248714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300713030
5247	NC_014299	CTC	2	6	248851	248856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300713030
5248	NC_014299	CGA	2	6	248901	248906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300713030
5249	NC_014299	CGC	2	6	249123	249128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300713030
5250	NC_014299	GAG	2	6	249130	249135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300713030
5251	NC_014299	ACCCAG	2	12	249163	249174	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	300713030
5252	NC_014299	CCA	2	6	249179	249184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300713030
5253	NC_014299	CACG	2	8	249194	249201	25 %	0 %	25 %	50 %	300713030
5254	NC_014299	CA	3	6	249210	249215	50 %	0 %	0 %	50 %	300713030
5255	NC_014299	CCA	2	6	249219	249224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300713030
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5257	NC_014299	CA	3	6	249263	249268	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5258	NC_014299	CCTG	2	8	249297	249304	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5259	NC_014299	GCCA	2	8	249362	249369	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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5286	NC_014299	TCG	2	6	250244	250249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5324	NC_014299	ATT	2	6	252241	252246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5376	NC_014299	TTTTC	2	10	254935	254944	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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