MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori B8 plasmid HPB8p

Total Repeats: 60

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014257	ACA	2	6	205	210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014257	GTT	2	6	213	218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014257	TAA	2	6	227	232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014257	AAC	2	6	234	239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_014257	GTT	2	6	595	600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014257	TAC	2	6	671	676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_014257	GAA	2	6	738	743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014257	AAG	2	6	999	1004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014257	AAC	2	6	1017	1022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298717636
10	NC_014257	CAA	2	6	1079	1084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298717636
11	NC_014257	TGT	2	6	1170	1175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298717636
12	NC_014257	TCA	2	6	1194	1199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717636
13	NC_014257	ATA	2	6	1570	1575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014257	ATA	2	6	1609	1614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014257	ACC	2	6	1693	1698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_014257	CAA	2	6	1886	1891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298717638
17	NC_014257	TAA	2	6	1917	1922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298717638
18	NC_014257	TAA	2	6	1989	1994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298717638
19	NC_014257	AAC	2	6	2021	2026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298717638
20	NC_014257	TGA	2	6	2269	2274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717639
21	NC_014257	ACA	2	6	2343	2348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298717639
22	NC_014257	ACA	2	6	2533	2538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298717639
23	NC_014257	ACT	2	6	2547	2552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717639
24	NC_014257	ACA	2	6	2553	2558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298717639
25	NC_014257	TTA	2	6	2639	2644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298717639
26	NC_014257	ATA	2	6	2660	2665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298717639
27	NC_014257	CAA	2	6	2738	2743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298717639
28	NC_014257	AAT	2	6	2764	2769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298717639
29	NC_014257	ATG	2	6	2772	2777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717639
30	NC_014257	AAC	3	9	2934	2942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298717639
31	NC_014257	CTA	2	6	2971	2976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717639
32	NC_014257	CAA	2	6	3050	3055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298717639
33	NC_014257	ACA	2	6	3061	3066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298717639
34	NC_014257	TCA	2	6	3151	3156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717639
35	NC_014257	TCA	2	6	3166	3171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717639
36	NC_014257	TCA	2	6	3202	3207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717639
37	NC_014257	AAC	2	6	3285	3290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298717639
38	NC_014257	CAG	2	6	3502	3507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717639
39	NC_014257	ATT	2	6	3697	3702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298717639
40	NC_014257	ACA	2	6	3852	3857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298717639
41	NC_014257	CTT	2	6	3931	3936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298717639
42	NC_014257	AGA	2	6	3943	3948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298717639
43	NC_014257	ACA	2	6	4001	4006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298717639
44	NC_014257	TTC	2	6	4129	4134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298717640
45	NC_014257	TTG	2	6	4255	4260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298717640
46	NC_014257	TCA	2	6	4321	4326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717640
47	NC_014257	TCT	2	6	4378	4383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298717640
48	NC_014257	AGT	2	6	4423	4428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717640
49	NC_014257	GTG	2	6	4525	4530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298717640
50	NC_014257	AAG	2	6	5024	5029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298717640
51	NC_014257	TAA	2	6	5228	5233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298717640
52	NC_014257	TTA	2	6	5392	5397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298717640
53	NC_014257	GGT	2	6	5412	5417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298717640
54	NC_014257	GTG	2	6	5489	5494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298717640
55	NC_014257	TTG	2	6	5631	5636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298717640
56	NC_014257	TAA	2	6	5731	5736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014257	CCT	2	6	5871	5876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_014257	TCC	2	6	5898	5903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_014257	CAA	2	6	5916	5921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_014257	TTA	2	6	5991	5996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.