MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori B8 chromosome

Total Repeats: 16926

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014256	TTA	2	6	29	34	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014256	TAA	2	6	144	149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014256	CAA	3	9	162	170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298735501
4	NC_014256	CAC	2	6	318	323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298735501
5	NC_014256	GGC	2	6	601	606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298735501
6	NC_014256	AGA	2	6	690	695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298735501
7	NC_014256	CTT	2	6	708	713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298735501
8	NC_014256	ACA	2	6	725	730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298735501
9	NC_014256	AGA	3	9	819	827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298735501
10	NC_014256	AGA	2	6	915	920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298735501
11	NC_014256	GAA	2	6	1036	1041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298735501
12	NC_014256	AGA	2	6	1170	1175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298735501
13	NC_014256	GAA	3	9	1426	1434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298735501
14	NC_014256	AGA	2	6	1461	1466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298735501
15	NC_014256	TCA	2	6	1536	1541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_014256	CTA	2	6	1638	1643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_014256	ATT	3	9	1653	1661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014256	TGA	2	6	1691	1696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014256	AGA	2	6	1830	1835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298735502
20	NC_014256	TGA	2	6	1989	1994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298735502
21	NC_014256	CTA	2	6	2033	2038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298735502
22	NC_014256	CTT	2	6	2105	2110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298735502
23	NC_014256	CAA	2	6	2155	2160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298735502
24	NC_014256	CAA	2	6	2279	2284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298735502
25	NC_014256	TTC	2	6	2310	2315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298735502
26	NC_014256	AGA	2	6	2316	2321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298735502
27	NC_014256	AAC	2	6	2329	2334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298735502
28	NC_014256	TGA	2	6	2541	2546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298735502
29	NC_014256	AGA	2	6	2661	2666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298735502
30	NC_014256	TTC	2	6	2702	2707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298735502
31	NC_014256	AGA	2	6	2784	2789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298735502
32	NC_014256	CAC	2	6	2826	2831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298735502
33	NC_014256	TTC	2	6	2916	2921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298735502
34	NC_014256	ATT	2	6	3002	3007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298735502
35	NC_014256	AAG	2	6	3071	3076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298735502
36	NC_014256	AGA	2	6	3099	3104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298735502
37	NC_014256	GTT	2	6	3151	3156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298735502
38	NC_014256	ATT	2	6	3173	3178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298735502
39	NC_014256	TGG	2	6	3198	3203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014256	ACC	2	6	3220	3225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_014256	TCT	2	6	3243	3248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_014256	ATT	2	6	3286	3291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014256	GCA	2	6	3489	3494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298735503
44	NC_014256	GGT	2	6	3567	3572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298735503
45	NC_014256	TAA	2	6	3647	3652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298735503
46	NC_014256	CAA	2	6	3703	3708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298735503
47	NC_014256	TGG	2	6	3970	3975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298735503
48	NC_014256	CAA	2	6	3985	3990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298735503
49	NC_014256	ATT	2	6	4022	4027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298735503
50	NC_014256	TGG	2	6	4231	4236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298735504
51	NC_014256	TGC	2	6	4313	4318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298735504
52	NC_014256	ATG	2	6	4330	4335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298735504
53	NC_014256	AGT	2	6	4544	4549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298735504
54	NC_014256	TGG	2	6	4801	4806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298735505
55	NC_014256	ATT	2	6	4866	4871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298735505
56	NC_014256	TCA	2	6	4876	4881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298735505
57	NC_014256	CTT	2	6	4913	4918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298735505
58	NC_014256	TGG	2	6	4919	4924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298735505
59	NC_014256	TCT	3	9	4933	4941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298735505
60	NC_014256	GTT	2	6	5007	5012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298735505
61	NC_014256	TCA	2	6	5108	5113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298735505
62	NC_014256	TTA	2	6	5211	5216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298735506
63	NC_014256	TTA	2	6	5289	5294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298735506
64	NC_014256	GCG	2	6	5317	5322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298735506
65	NC_014256	CGC	2	6	5695	5700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298735506
66	NC_014256	CTT	2	6	5869	5874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298735506
67	NC_014256	CAA	2	6	5898	5903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298735506
68	NC_014256	TAA	2	6	6026	6031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298735506
69	NC_014256	ATT	2	6	6119	6124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298735506
70	NC_014256	CGG	2	6	6128	6133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298735506
71	NC_014256	AAG	2	6	6141	6146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298735506
72	NC_014256	GTT	3	9	6200	6208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298735506
73	NC_014256	TGA	2	6	6248	6253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298735506
74	NC_014256	GAA	2	6	6486	6491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298735506
75	NC_014256	ACC	2	6	6502	6507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298735506
76	NC_014256	AAG	3	9	6637	6645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298735506
77	NC_014256	GAA	2	6	6651	6656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298735506
78	NC_014256	AAG	2	6	6838	6843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298735506
79	NC_014256	TGA	2	6	6869	6874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298735506
80	NC_014256	AAG	2	6	7226	7231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298735507
81	NC_014256	AGA	2	6	7268	7273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298735507
82	NC_014256	TCA	2	6	7381	7386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298735507
83	NC_014256	ACA	2	6	7468	7473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298735507
84	NC_014256	GAT	2	6	7500	7505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298735507
85	NC_014256	ATT	2	6	7543	7548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298735507
86	NC_014256	TTG	2	6	7629	7634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298735507
87	NC_014256	TCA	2	6	7672	7677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298735507
88	NC_014256	GCC	2	6	7695	7700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298735507
89	NC_014256	ATC	2	6	7748	7753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298735507
90	NC_014256	ATG	2	6	7783	7788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298735507
91	NC_014256	ATT	2	6	7909	7914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298735507
92	NC_014256	ACA	2	6	7932	7937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298735507
93	NC_014256	GAT	2	6	8025	8030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298735507
94	NC_014256	AGT	2	6	8052	8057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298735507
95	NC_014256	AAT	2	6	8058	8063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298735507
96	NC_014256	TTA	2	6	8094	8099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298735507
97	NC_014256	ACC	2	6	8123	8128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298735507
98	NC_014256	TAA	2	6	8183	8188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298735507
99	NC_014256	ATT	2	6	8193	8198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298735507
100	NC_014256	TAG	2	6	8213	8218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298735507
101	NC_014256	TCA	2	6	8310	8315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298735507
102	NC_014256	CGG	2	6	8342	8347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298735507
103	NC_014256	AAG	2	6	8362	8367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298735507
104	NC_014256	CAT	2	6	8459	8464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298735507
105	NC_014256	TAA	2	6	8516	8521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298735507
106	NC_014256	CGC	2	6	8577	8582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298735508
107	NC_014256	GAA	2	6	8710	8715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298735508
108	NC_014256	AAG	2	6	8744	8749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298735508
109	NC_014256	TGA	3	9	8793	8801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298735508
110	NC_014256	TTA	2	6	9312	9317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298735509
111	NC_014256	TGC	2	6	9627	9632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298735509
112	NC_014256	TGA	2	6	9640	9645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298735509
113	NC_014256	GAT	2	6	9864	9869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298735509
114	NC_014256	TAA	2	6	9872	9877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298735509
115	NC_014256	TGA	2	6	9959	9964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298735509
116	NC_014256	GGT	2	6	10082	10087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298735509
117	NC_014256	AGA	2	6	10106	10111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298735509
118	NC_014256	AAG	2	6	10216	10221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298735509
119	NC_014256	AAG	2	6	10231	10236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298735509
120	NC_014256	AGA	2	6	10259	10264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298735509
121	NC_014256	TTA	2	6	10306	10311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298735509
122	NC_014256	CAA	2	6	10383	10388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298735509
123	NC_014256	GAA	2	6	10395	10400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298735509
124	NC_014256	TGA	2	6	10630	10635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298735509
125	NC_014256	CAA	2	6	10680	10685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298735509
126	NC_014256	TGG	2	6	10771	10776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298735509
127	NC_014256	AGA	2	6	10865	10870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298735509
128	NC_014256	TTG	2	6	10888	10893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298735509
129	NC_014256	TGA	2	6	10958	10963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298735509
130	NC_014256	ATC	2	6	11188	11193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298735509
131	NC_014256	TTC	2	6	11258	11263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298735509
132	NC_014256	TAA	2	6	11402	11407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298735509
133	NC_014256	TGA	2	6	11453	11458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298735509
134	NC_014256	AGA	2	6	11510	11515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298735509
135	NC_014256	ATT	2	6	11529	11534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298735509
136	NC_014256	ACG	2	6	11577	11582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298735509
137	NC_014256	ATG	2	6	11611	11616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298735509
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139	NC_014256	AAC	2	6	11862	11867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298735509
140	NC_014256	GTT	2	6	11879	11884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298735509
141	NC_014256	GAA	2	6	11931	11936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298735509
142	NC_014256	TTA	2	6	12283	12288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298735510
143	NC_014256	TGA	2	6	12309	12314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298735510
144	NC_014256	TAA	2	6	12336	12341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298735510
145	NC_014256	GAA	2	6	12412	12417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298735510
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152	NC_014256	AGA	2	6	12909	12914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298735510
153	NC_014256	GAA	2	6	13009	13014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298735510
154	NC_014256	CAC	3	9	13449	13457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298735510
155	NC_014256	ATA	2	6	13475	13480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298735510
156	NC_014256	TTA	2	6	13580	13585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298735510
157	NC_014256	AGA	2	6	13668	13673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298735510
158	NC_014256	CGG	2	6	13757	13762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298735510
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161	NC_014256	CAT	2	6	13986	13991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298735510
162	NC_014256	TAT	2	6	14080	14085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298735510
163	NC_014256	CAA	2	6	14109	14114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298735510
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165	NC_014256	TAC	2	6	14230	14235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298735510
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188	NC_014256	GAT	2	6	16216	16221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
189	NC_014256	TTC	2	6	16366	16371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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208	NC_014256	ATT	2	6	17877	17882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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223	NC_014256	TAT	2	6	19261	19266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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239	NC_014256	ATG	2	6	20447	20452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298735515
240	NC_014256	TAA	2	6	20520	20525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
241	NC_014256	ATT	2	6	20822	20827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298735517
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245	NC_014256	TGA	2	6	21283	21288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298735517
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253	NC_014256	GTT	2	6	22694	22699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298735517
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257	NC_014256	AAG	2	6	22851	22856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298735517
258	NC_014256	CTG	2	6	22909	22914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298735517
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261	NC_014256	TTG	2	6	23181	23186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298735517
262	NC_014256	GTT	2	6	23235	23240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298735517
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377	NC_014256	TAT	2	6	33434	33439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
378	NC_014256	GGT	2	6	33452	33457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
379	NC_014256	TAA	2	6	33490	33495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
380	NC_014256	AAT	2	6	33496	33501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
381	NC_014256	AGA	2	6	33558	33563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298735528
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500	NC_014256	GGT	2	6	46140	46145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298735540

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