MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Haloferax volcanii DS2 plasmid pHV1

Total Repeats: 1282

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013968	GGT	2	6	39	44	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013968	TAT	2	6	67	72	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013968	GAT	2	6	161	166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292657125
4	NC_013968	GAC	2	6	200	205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657125
5	NC_013968	ATC	2	6	239	244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292657125
6	NC_013968	GCT	2	6	302	307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657125
7	NC_013968	CGA	2	6	541	546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657125
8	NC_013968	GCT	2	6	574	579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657125
9	NC_013968	CCT	2	6	583	588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292657125
10	NC_013968	ATG	2	6	606	611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292657125
11	NC_013968	CGA	3	9	642	650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657125
12	NC_013968	CGA	2	6	796	801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657125
13	NC_013968	CAA	2	6	836	841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292657125
14	NC_013968	CGA	2	6	1076	1081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657125
15	NC_013968	TCA	2	6	1189	1194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292657125
16	NC_013968	AAG	2	6	1200	1205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292657125
17	NC_013968	CAT	2	6	1403	1408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_013968	CTC	2	6	1501	1506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_013968	TCT	2	6	1528	1533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_013968	CAC	2	6	1555	1560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_013968	TAA	2	6	1565	1570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013968	ACG	2	6	1575	1580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_013968	TGG	2	6	1596	1601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013968	CAG	2	6	1625	1630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657126
25	NC_013968	GAG	2	6	1687	1692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292657126
26	NC_013968	TCG	2	6	1700	1705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657126
27	NC_013968	GAG	2	6	1726	1731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292657126
28	NC_013968	CGC	2	6	1786	1791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292657126
29	NC_013968	GTG	2	6	1895	1900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292657126
30	NC_013968	ACG	2	6	1916	1921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657126
31	NC_013968	TGC	2	6	1950	1955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657126
32	NC_013968	GTG	2	6	1964	1969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292657126
33	NC_013968	TGA	2	6	1977	1982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292657126
34	NC_013968	GAG	2	6	2107	2112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013968	GCT	2	6	2119	2124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_013968	ATC	2	6	2155	2160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_013968	TCG	2	6	2184	2189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_013968	GCT	2	6	2398	2403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657127
39	NC_013968	GAA	2	6	2440	2445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292657127
40	NC_013968	AAC	2	6	2534	2539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292657127
41	NC_013968	CCA	2	6	2542	2547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292657127
42	NC_013968	CTC	2	6	2555	2560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292657127
43	NC_013968	TAT	2	6	2758	2763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	292657127
44	NC_013968	TCT	2	6	2767	2772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292657127
45	NC_013968	ATT	2	6	2806	2811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	292657127
46	NC_013968	TGC	2	6	2862	2867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657127
47	NC_013968	TGG	2	6	2869	2874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292657127
48	NC_013968	AGA	2	6	2877	2882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292657127
49	NC_013968	ACT	2	6	2995	3000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292657127
50	NC_013968	ATG	2	6	3032	3037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292657127
51	NC_013968	AAT	2	6	3076	3081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	292657127
52	NC_013968	ATG	2	6	3155	3160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292657127
53	NC_013968	CGA	2	6	3273	3278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_013968	CGG	2	6	3296	3301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_013968	CGG	3	9	3316	3324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_013968	GCC	2	6	3327	3332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_013968	GTC	2	6	3395	3400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657128
58	NC_013968	TGA	2	6	3469	3474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292657128
59	NC_013968	CGG	2	6	3513	3518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292657128
60	NC_013968	CAC	2	6	3575	3580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292657128
61	NC_013968	CAG	2	6	3587	3592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657128
62	NC_013968	GTC	2	6	3618	3623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657128
63	NC_013968	GTG	2	6	3697	3702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292657128
64	NC_013968	GCG	2	6	3723	3728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292657128
65	NC_013968	TCG	2	6	3753	3758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657128
66	NC_013968	AGC	2	6	3939	3944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657128
67	NC_013968	CTG	2	6	4041	4046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657128
68	NC_013968	TTC	2	6	4095	4100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292657128
69	NC_013968	GGT	2	6	4136	4141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292657128
70	NC_013968	GTC	2	6	4178	4183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657128
71	NC_013968	TAG	2	6	4194	4199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292657128
72	NC_013968	CTG	2	6	4232	4237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657128
73	NC_013968	GGA	2	6	4264	4269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292657128
74	NC_013968	CGA	2	6	4402	4407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657128
75	NC_013968	TCG	2	6	4653	4658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657129
76	NC_013968	CGA	2	6	4675	4680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657129
77	NC_013968	CGA	4	12	4696	4707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657129
78	NC_013968	CAT	2	6	4714	4719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292657129
79	NC_013968	GAA	2	6	4721	4726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292657129
80	NC_013968	CAG	2	6	4749	4754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657129
81	NC_013968	ACG	3	9	4761	4769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657129
82	NC_013968	GTC	2	6	4772	4777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657129
83	NC_013968	CGA	2	6	4858	4863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657129
84	NC_013968	CCG	2	6	4908	4913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292657129
85	NC_013968	TCG	2	6	4914	4919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657129
86	NC_013968	CGT	2	6	4954	4959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657129
87	NC_013968	GAC	2	6	4973	4978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657129
88	NC_013968	ACC	2	6	4986	4991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292657129
89	NC_013968	ACA	2	6	5016	5021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292657129
90	NC_013968	GTG	2	6	5064	5069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292657129
91	NC_013968	ACG	2	6	5120	5125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657129
92	NC_013968	AGG	2	6	5136	5141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292657129
93	NC_013968	CGA	2	6	5146	5151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657129
94	NC_013968	ACC	2	6	5178	5183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292657129
95	NC_013968	GAG	2	6	5184	5189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292657129
96	NC_013968	ACG	2	6	5253	5258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657129
97	NC_013968	CGA	2	6	5272	5277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657129
98	NC_013968	CGC	2	6	5448	5453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_013968	AGT	2	6	5454	5459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013968	CAC	2	6	5522	5527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292657130
101	NC_013968	CGC	2	6	5544	5549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292657130
102	NC_013968	TCG	2	6	5588	5593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657130
103	NC_013968	TGC	2	6	5594	5599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657130
104	NC_013968	TCC	2	6	5730	5735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292657130
105	NC_013968	TCG	2	6	5780	5785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657131
106	NC_013968	TTC	2	6	5800	5805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292657131
107	NC_013968	TCG	2	6	5813	5818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657131
108	NC_013968	CAC	3	9	5829	5837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292657131
109	NC_013968	CCA	2	6	5894	5899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292657131
110	NC_013968	CGT	2	6	5940	5945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657131
111	NC_013968	GTC	3	9	5974	5982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657131
112	NC_013968	GAA	2	6	6049	6054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013968	GGA	2	6	6149	6154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292657132
114	NC_013968	GAA	2	6	6270	6275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292657132
115	NC_013968	CGA	2	6	6344	6349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657132
116	NC_013968	CTG	2	6	6410	6415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657132
117	NC_013968	TAT	3	9	6487	6495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013968	GTA	2	6	6509	6514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013968	GCA	2	6	6524	6529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657133
120	NC_013968	CTG	2	6	6585	6590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657133
121	NC_013968	ACG	2	6	6591	6596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657133
122	NC_013968	TTC	2	6	6680	6685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292657133
123	NC_013968	ACG	2	6	6714	6719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657133
124	NC_013968	GTC	3	9	6812	6820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657133
125	NC_013968	TCG	2	6	6906	6911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657133
126	NC_013968	CGC	2	6	6928	6933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292657133
127	NC_013968	GAC	2	6	6973	6978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_013968	TAA	2	6	7108	7113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013968	TGT	2	6	7129	7134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013968	CGT	2	6	7315	7320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657134
131	NC_013968	GAG	2	6	7334	7339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292657134
132	NC_013968	CGG	3	9	7375	7383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292657134
133	NC_013968	TGA	2	6	7489	7494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292657134
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258	NC_013968	TCG	2	6	16965	16970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
259	NC_013968	TCG	2	6	17022	17027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657145
260	NC_013968	GCG	2	6	17028	17033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292657145
261	NC_013968	CGT	2	6	17068	17073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657145
262	NC_013968	ACG	2	6	17075	17080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657145
263	NC_013968	GTC	2	6	17192	17197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657145
264	NC_013968	CGT	2	6	17452	17457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657145
265	NC_013968	CGA	2	6	17553	17558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
266	NC_013968	GTC	2	6	17743	17748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657146
267	NC_013968	CGT	2	6	17775	17780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657146
268	NC_013968	CGT	2	6	17913	17918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657146
269	NC_013968	CTG	2	6	17964	17969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657146
270	NC_013968	TAC	3	9	17980	17988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
271	NC_013968	TAA	2	6	18003	18008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
272	NC_013968	ATT	2	6	18040	18045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	292657147
273	NC_013968	GTA	2	6	18064	18069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292657147
274	NC_013968	ATG	2	6	18124	18129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292657147
275	NC_013968	GCC	2	6	18245	18250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292657147
276	NC_013968	CGA	2	6	18282	18287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657147
277	NC_013968	TGT	2	6	18382	18387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292657147
278	NC_013968	GAC	2	6	18425	18430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657147
279	NC_013968	ACG	2	6	18746	18751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657148
280	NC_013968	GGT	2	6	18832	18837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292657148
281	NC_013968	AGT	2	6	18857	18862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
282	NC_013968	GGT	2	6	18891	18896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
283	NC_013968	ACG	2	6	19376	19381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657149
284	NC_013968	ACC	2	6	19468	19473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292657149
285	NC_013968	TGA	2	6	19509	19514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292657149
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287	NC_013968	TAC	2	6	19637	19642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292657149
288	NC_013968	AAG	2	6	19662	19667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292657149
289	NC_013968	AGA	2	6	19807	19812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292657149
290	NC_013968	GAC	2	6	19850	19855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657149
291	NC_013968	CTG	2	6	19857	19862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657149
292	NC_013968	GAC	2	6	19870	19875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657149
293	NC_013968	GAT	2	6	20013	20018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292657150
294	NC_013968	AGC	2	6	20159	20164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657150
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296	NC_013968	ACT	2	6	20223	20228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292657150
297	NC_013968	CAA	2	6	20305	20310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292657150
298	NC_013968	GTG	2	6	20636	20641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
299	NC_013968	TCA	2	6	20764	20769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
300	NC_013968	AGC	2	6	20924	20929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657152
301	NC_013968	GCG	2	6	21002	21007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292657152
302	NC_013968	TGA	2	6	21027	21032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292657152
303	NC_013968	GTG	2	6	21063	21068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292657152
304	NC_013968	TGA	2	6	21072	21077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292657152
305	NC_013968	ACG	2	6	21106	21111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
306	NC_013968	CCG	2	6	21151	21156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292657153
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310	NC_013968	GTT	2	6	21373	21378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
311	NC_013968	ACG	2	6	21555	21560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657154
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315	NC_013968	GCC	2	6	21821	21826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292657154
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382	NC_013968	GAT	2	6	25794	25799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292657156
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