MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Haloferax volcanii DS2 chromosome

Total Repeats: 8518

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013967	CCCG	2	8	57	64	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2	NC_013967	GACC	2	8	668	675	25 %	0 %	25 %	50 %	292654179
3	NC_013967	CCGA	2	8	1092	1099	25 %	0 %	25 %	50 %	292654179
4	NC_013967	CGGC	2	8	1501	1508	0 %	0 %	50 %	50 %	292654179
5	NC_013967	GTCC	2	8	1850	1857	0 %	25 %	25 %	50 %	292654179
6	NC_013967	GGGC	2	8	2167	2174	0 %	0 %	75 %	25 %	292654180
7	NC_013967	ACCC	2	8	2220	2227	25 %	0 %	0 %	75 %	292654180
8	NC_013967	GGGC	2	8	2837	2844	0 %	0 %	75 %	25 %	292654180
9	NC_013967	GCCG	2	8	4213	4220	0 %	0 %	50 %	50 %	292654181
10	NC_013967	GACC	2	8	5141	5148	25 %	0 %	25 %	50 %	292654182
11	NC_013967	CCGC	2	8	5155	5162	0 %	0 %	25 %	75 %	292654182
12	NC_013967	GCGG	2	8	5174	5181	0 %	0 %	75 %	25 %	292654182
13	NC_013967	CTAC	2	8	5237	5244	25 %	25 %	0 %	50 %	292654182
14	NC_013967	ATGG	2	8	6338	6345	25 %	25 %	50 %	0 %	292654183
15	NC_013967	CCCG	2	8	6512	6519	0 %	0 %	25 %	75 %	292654183
16	NC_013967	CGAG	2	8	6598	6605	25 %	0 %	50 %	25 %	292654183
17	NC_013967	GCGA	2	8	6711	6718	25 %	0 %	50 %	25 %	292654183
18	NC_013967	GTAT	2	8	6811	6818	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013967	GCCG	2	8	6836	6843	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_013967	CCGC	2	8	7316	7323	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
21	NC_013967	CTCG	2	8	7499	7506	0 %	25 %	25 %	50 %	292654185
22	NC_013967	GCGA	2	8	8255	8262	25 %	0 %	50 %	25 %	292654185
23	NC_013967	ACCG	2	8	8269	8276	25 %	0 %	25 %	50 %	292654185
24	NC_013967	CGCC	2	8	9285	9292	0 %	0 %	25 %	75 %	292654187
25	NC_013967	GACC	2	8	9805	9812	25 %	0 %	25 %	50 %	292654187
26	NC_013967	ACCG	2	8	9874	9881	25 %	0 %	25 %	50 %	292654187
27	NC_013967	ACCG	2	8	10025	10032	25 %	0 %	25 %	50 %	292654187
28	NC_013967	CGGC	2	8	10125	10132	0 %	0 %	50 %	50 %	292654187
29	NC_013967	GGCC	2	8	10289	10296	0 %	0 %	50 %	50 %	292654188
30	NC_013967	GTCG	2	8	10823	10830	0 %	25 %	50 %	25 %	292654188
31	NC_013967	TACA	2	8	11524	11531	50 %	25 %	0 %	25 %	292654189
32	NC_013967	CGTC	3	12	11575	11586	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_013967	GTTT	2	8	11821	11828	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013967	CGGC	2	8	13703	13710	0 %	0 %	50 %	50 %	292654191
35	NC_013967	CGAG	2	8	14106	14113	25 %	0 %	50 %	25 %	292654191
36	NC_013967	TCCA	2	8	14462	14469	25 %	25 %	0 %	50 %	292654191
37	NC_013967	CGAG	2	8	14487	14494	25 %	0 %	50 %	25 %	292654191
38	NC_013967	CCGT	2	8	14753	14760	0 %	25 %	25 %	50 %	292654191
39	NC_013967	GGCC	2	8	14763	14770	0 %	0 %	50 %	50 %	292654191
40	NC_013967	CGAC	2	8	15336	15343	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_013967	GACC	2	8	15748	15755	25 %	0 %	25 %	50 %	292654193
42	NC_013967	CGAG	2	8	15924	15931	25 %	0 %	50 %	25 %	292654193
43	NC_013967	GTCG	2	8	16336	16343	0 %	25 %	50 %	25 %	292654193
44	NC_013967	CGGT	2	8	16806	16813	0 %	25 %	50 %	25 %	292654194
45	NC_013967	CGGT	2	8	16842	16849	0 %	25 %	50 %	25 %	292654194
46	NC_013967	CGAC	2	8	18210	18217	25 %	0 %	25 %	50 %	292654196
47	NC_013967	ACCG	2	8	18308	18315	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_013967	TCGG	2	8	19242	19249	0 %	25 %	50 %	25 %	292654197
49	NC_013967	CGAC	2	8	19333	19340	25 %	0 %	25 %	50 %	292654197
50	NC_013967	CGAG	2	8	19793	19800	25 %	0 %	50 %	25 %	292654198
51	NC_013967	GCCG	2	8	19817	19824	0 %	0 %	50 %	50 %	292654198
52	NC_013967	GGAC	2	8	20342	20349	25 %	0 %	50 %	25 %	292654198
53	NC_013967	GCTG	2	8	20387	20394	0 %	25 %	50 %	25 %	292654198
54	NC_013967	CGAG	2	8	20657	20664	25 %	0 %	50 %	25 %	292654198
55	NC_013967	GAGC	2	8	20901	20908	25 %	0 %	50 %	25 %	292654198
56	NC_013967	CTCG	2	8	21039	21046	0 %	25 %	25 %	50 %	292654198
57	NC_013967	GCCG	2	8	21077	21084	0 %	0 %	50 %	50 %	292654198
58	NC_013967	GGTC	2	8	21584	21591	0 %	25 %	50 %	25 %	292654199
59	NC_013967	CGAG	2	8	21869	21876	25 %	0 %	50 %	25 %	292654199
60	NC_013967	CGGT	2	8	22859	22866	0 %	25 %	50 %	25 %	292654200
61	NC_013967	CGGT	2	8	22879	22886	0 %	25 %	50 %	25 %	292654200
62	NC_013967	GTCG	2	8	23295	23302	0 %	25 %	50 %	25 %	292654200
63	NC_013967	GTGG	2	8	23335	23342	0 %	25 %	75 %	0 %	292654200
64	NC_013967	CTCG	2	8	23402	23409	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_013967	CGGC	2	8	23772	23779	0 %	0 %	50 %	50 %	292654201
66	NC_013967	CTCG	2	8	23809	23816	0 %	25 %	25 %	50 %	292654201
67	NC_013967	TCGC	2	8	24956	24963	0 %	25 %	25 %	50 %	292654202
68	NC_013967	ACCG	3	12	25326	25337	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_013967	CGAG	2	8	25984	25991	25 %	0 %	50 %	25 %	292654203
70	NC_013967	CGAG	2	8	26008	26015	25 %	0 %	50 %	25 %	292654203
71	NC_013967	GTCG	2	8	26069	26076	0 %	25 %	50 %	25 %	292654203
72	NC_013967	ACGA	2	8	26427	26434	50 %	0 %	25 %	25 %	292654203
73	NC_013967	CGAA	2	8	26578	26585	50 %	0 %	25 %	25 %	292654203
74	NC_013967	CGGC	2	8	26659	26666	0 %	0 %	50 %	50 %	292654203
75	NC_013967	CGAC	2	8	26668	26675	25 %	0 %	25 %	50 %	292654203
76	NC_013967	CCTG	2	8	26773	26780	0 %	25 %	25 %	50 %	292654203
77	NC_013967	TCAC	2	8	27583	27590	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_013967	ACCC	2	8	27609	27616	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
79	NC_013967	TTCG	2	8	27748	27755	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_013967	TGAG	2	8	27789	27796	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013967	GTGG	2	8	28378	28385	0 %	25 %	75 %	0 %	292654206
82	NC_013967	CTCG	2	8	29302	29309	0 %	25 %	25 %	50 %	292654206
83	NC_013967	CCGC	2	8	29347	29354	0 %	0 %	25 %	75 %	292654206
84	NC_013967	GACG	2	8	29893	29900	25 %	0 %	50 %	25 %	292654206
85	NC_013967	CGGC	2	8	30321	30328	0 %	0 %	50 %	50 %	292654207
86	NC_013967	TCGT	2	8	31547	31554	0 %	50 %	25 %	25 %	292654209
87	NC_013967	CCGA	2	8	32297	32304	25 %	0 %	25 %	50 %	292654210
88	NC_013967	CGGC	2	8	32421	32428	0 %	0 %	50 %	50 %	292654210
89	NC_013967	GCTC	2	8	32726	32733	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_013967	CTCG	2	8	32921	32928	0 %	25 %	25 %	50 %	292654211
91	NC_013967	TCCA	2	8	33108	33115	25 %	25 %	0 %	50 %	292654211
92	NC_013967	CCGC	2	8	33125	33132	0 %	0 %	25 %	75 %	292654211
93	NC_013967	CGAC	2	8	33217	33224	25 %	0 %	25 %	50 %	292654211
94	NC_013967	CGGG	2	8	33493	33500	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
95	NC_013967	ACGT	2	8	33918	33925	25 %	25 %	25 %	25 %	292654212
96	NC_013967	CGAA	2	8	34983	34990	50 %	0 %	25 %	25 %	292654213
97	NC_013967	CGCC	2	8	35260	35267	0 %	0 %	25 %	75 %	292654214
98	NC_013967	CGCT	2	8	35580	35587	0 %	25 %	25 %	50 %	292654214
99	NC_013967	GCGG	2	8	35979	35986	0 %	0 %	75 %	25 %	292654215
100	NC_013967	CCGC	2	8	36235	36242	0 %	0 %	25 %	75 %	292654215
101	NC_013967	TCCG	2	8	36788	36795	0 %	25 %	25 %	50 %	292654215
102	NC_013967	TCCG	2	8	39394	39401	0 %	25 %	25 %	50 %	292654216
103	NC_013967	GCTC	2	8	39659	39666	0 %	25 %	25 %	50 %	292654217
104	NC_013967	CGGG	2	8	39749	39756	0 %	0 %	75 %	25 %	292654217
105	NC_013967	CGAG	2	8	40161	40168	25 %	0 %	50 %	25 %	292654218
106	NC_013967	GGCA	2	8	40217	40224	25 %	0 %	50 %	25 %	292654218
107	NC_013967	GTCG	2	8	40378	40385	0 %	25 %	50 %	25 %	292654218
108	NC_013967	ACGA	2	8	40499	40506	50 %	0 %	25 %	25 %	292654218
109	NC_013967	GTGG	2	8	40975	40982	0 %	25 %	75 %	0 %	292654218
110	NC_013967	GTTC	2	8	41150	41157	0 %	50 %	25 %	25 %	292654219
111	NC_013967	CGCC	2	8	43908	43915	0 %	0 %	25 %	75 %	292654221
112	NC_013967	ACGT	2	8	44027	44034	25 %	25 %	25 %	25 %	292654221
113	NC_013967	CGAC	2	8	44580	44587	25 %	0 %	25 %	50 %	292654222
114	NC_013967	CGGC	2	8	46425	46432	0 %	0 %	50 %	50 %	292654224
115	NC_013967	GACG	2	8	46503	46510	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_013967	GTCG	2	8	46689	46696	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_013967	CGAG	2	8	46853	46860	25 %	0 %	50 %	25 %	292654225
118	NC_013967	CCGA	2	8	46951	46958	25 %	0 %	25 %	50 %	292654225
119	NC_013967	TCGG	2	8	46978	46985	0 %	25 %	50 %	25 %	292654225
120	NC_013967	GCGG	2	8	47094	47101	0 %	0 %	75 %	25 %	292654225
121	NC_013967	GGCC	2	8	47141	47148	0 %	0 %	50 %	50 %	292654225
122	NC_013967	GGCG	2	8	47723	47730	0 %	0 %	75 %	25 %	292654225
123	NC_013967	AGCG	2	8	47868	47875	25 %	0 %	50 %	25 %	292654225
124	NC_013967	GCGG	2	8	47949	47956	0 %	0 %	75 %	25 %	292654225
125	NC_013967	TCGC	2	8	48085	48092	0 %	25 %	25 %	50 %	292654225
126	NC_013967	CGGG	2	8	48205	48212	0 %	0 %	75 %	25 %	292654225
127	NC_013967	CGGG	2	8	48466	48473	0 %	0 %	75 %	25 %	292654226
128	NC_013967	GGTC	2	8	48888	48895	0 %	25 %	50 %	25 %	292654226
129	NC_013967	TCGG	2	8	49934	49941	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_013967	CGAG	2	8	50164	50171	25 %	0 %	50 %	25 %	292654228
131	NC_013967	GCGA	2	8	50625	50632	25 %	0 %	50 %	25 %	292654228
132	NC_013967	CGAG	2	8	50671	50678	25 %	0 %	50 %	25 %	292654228
133	NC_013967	GACG	2	8	51325	51332	25 %	0 %	50 %	25 %	292654229
134	NC_013967	CACC	2	8	51961	51968	25 %	0 %	0 %	75 %	292654230
135	NC_013967	CCGA	2	8	52550	52557	25 %	0 %	25 %	50 %	292654231
136	NC_013967	GCCG	2	8	52589	52596	0 %	0 %	50 %	50 %	292654231
137	NC_013967	CGAC	2	8	52684	52691	25 %	0 %	25 %	50 %	292654231
138	NC_013967	CGAC	2	8	53680	53687	25 %	0 %	25 %	50 %	292654231
139	NC_013967	CTCA	2	8	54104	54111	25 %	25 %	0 %	50 %	292654231
140	NC_013967	ACGT	2	8	54532	54539	25 %	25 %	25 %	25 %	292654232
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