MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloferax volcanii DS2 chromosome

Total Repeats: 83599

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_013967	GAA	2	6	100492	100497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292654280
3002	NC_013967	CGT	2	6	100524	100529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654280
3003	NC_013967	CGG	2	6	100576	100581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654280
3004	NC_013967	CGA	2	6	100582	100587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654280
3005	NC_013967	TCG	2	6	100611	100616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654280
3006	NC_013967	CAT	2	6	100618	100623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292654280
3007	NC_013967	TCG	2	6	100632	100637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654280
3008	NC_013967	CCT	2	6	100654	100659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292654280
3009	NC_013967	CGC	2	6	100690	100695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654280
3010	NC_013967	GCC	2	6	100706	100711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654280
3011	NC_013967	TCA	2	6	100713	100718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292654280
3012	NC_013967	GCC	2	6	100722	100727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654280
3013	NC_013967	CTC	2	6	100748	100753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292654280
3014	NC_013967	TTC	2	6	100820	100825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292654280
3015	NC_013967	ATC	2	6	100826	100831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292654280
3016	NC_013967	ACCC	2	8	100868	100875	25 %	0 %	0 %	75 %	292654280
3017	NC_013967	ATTC	2	8	100956	100963	25 %	50 %	0 %	25 %	292654281
3018	NC_013967	CGA	2	6	101083	101088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654281
3019	NC_013967	GGC	2	6	101089	101094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654281
3020	NC_013967	TCC	2	6	101105	101110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292654281
3021	NC_013967	CCG	2	6	101163	101168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654281
3022	NC_013967	GCC	2	6	101196	101201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654281
3023	NC_013967	GTC	2	6	101228	101233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654281
3024	NC_013967	CGA	3	9	101239	101247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654281
3025	NC_013967	CGA	2	6	101284	101289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654281
3026	NC_013967	CGC	2	6	101323	101328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654281
3027	NC_013967	CCG	2	6	101380	101385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654281
3028	NC_013967	TAC	2	6	101393	101398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292654281
3029	NC_013967	CGA	2	6	101488	101493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654281
3030	NC_013967	CGT	2	6	101560	101565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3031	NC_013967	TCG	2	6	101577	101582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_013967	CTTTC	2	10	101597	101606	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
3033	NC_013967	TC	3	6	101665	101670	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3034	NC_013967	CAC	2	6	101733	101738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3035	NC_013967	AGA	2	6	101812	101817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292654282
3036	NC_013967	TCG	2	6	101865	101870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654282
3037	NC_013967	CAT	2	6	101962	101967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292654282
3038	NC_013967	GGC	2	6	101996	102001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654282
3039	NC_013967	ACG	2	6	102028	102033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654282
3040	NC_013967	CGA	2	6	102064	102069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654282
3041	NC_013967	CTC	2	6	102080	102085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292654282
3042	NC_013967	GGC	2	6	102086	102091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654282
3043	NC_013967	CCA	2	6	102157	102162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292654282
3044	NC_013967	CGG	3	9	102205	102213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654282
3045	NC_013967	CGA	2	6	102259	102264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654282
3046	NC_013967	CGA	2	6	102307	102312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654282
3047	NC_013967	CGA	3	9	102334	102342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654282
3048	NC_013967	TCG	2	6	102360	102365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654282
3049	NC_013967	ACC	2	6	102411	102416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292654282
3050	NC_013967	TTC	2	6	102420	102425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292654282
3051	NC_013967	CCT	2	6	102484	102489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292654282
3052	NC_013967	CAG	2	6	102557	102562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654282
3053	NC_013967	CAA	2	6	102568	102573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292654282
3054	NC_013967	TCG	2	6	102641	102646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654282
3055	NC_013967	CGACC	2	10	102667	102676	20 %	0 %	20 %	60 %	292654282
3056	NC_013967	CAT	2	6	102799	102804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292654282
3057	NC_013967	TCGG	2	8	102847	102854	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3058	NC_013967	CTCG	2	8	102866	102873	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3059	NC_013967	GCCG	2	8	102874	102881	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3060	NC_013967	C	6	6	102909	102914	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3061	NC_013967	CTCC	2	8	102916	102923	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3062	NC_013967	CACTC	5	25	102928	102952	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
3063	NC_013967	CCCCA	2	10	102959	102968	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
3064	NC_013967	TCGTC	2	10	102983	102992	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3065	NC_013967	CCG	2	6	103008	103013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3066	NC_013967	TCG	2	6	103054	103059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3067	NC_013967	TAGG	2	8	103073	103080	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_013967	GAC	2	6	103176	103181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654283
3069	NC_013967	CGA	2	6	103208	103213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654283
3070	NC_013967	GAC	2	6	103272	103277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654283
3071	NC_013967	TCG	2	6	103300	103305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654283
3072	NC_013967	CGA	2	6	103352	103357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654283
3073	NC_013967	CGA	2	6	103382	103387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654283
3074	NC_013967	CAC	2	6	103470	103475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292654283
3075	NC_013967	CGT	2	6	103550	103555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654283
3076	NC_013967	GCCGC	2	10	103578	103587	0 %	0 %	40 %	60 %	292654283
3077	NC_013967	GAC	2	6	103608	103613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654283
3078	NC_013967	GGAGC	2	10	103670	103679	20 %	0 %	60 %	20 %	292654283
3079	NC_013967	TCG	3	9	103753	103761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654283
3080	NC_013967	GTC	2	6	103785	103790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654283
3081	NC_013967	CGG	2	6	103792	103797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654283
3082	NC_013967	GCG	2	6	103801	103806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654283
3083	NC_013967	CGC	2	6	103840	103845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654283
3084	NC_013967	TCA	2	6	103861	103866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292654283
3085	NC_013967	CCG	3	9	103927	103935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654283
3086	NC_013967	CGG	2	6	103960	103965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654283
3087	NC_013967	GCG	2	6	103992	103997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654283
3088	NC_013967	CGC	2	6	104030	104035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654283
3089	NC_013967	CGA	2	6	104056	104061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654283
3090	NC_013967	ACG	2	6	104068	104073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654283
3091	NC_013967	TCG	2	6	104089	104094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654283
3092	NC_013967	CGA	2	6	104105	104110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654283
3093	NC_013967	CGT	2	6	104113	104118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654283
3094	NC_013967	CGA	2	6	104146	104151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654283
3095	NC_013967	AACC	2	8	104258	104265	50 %	0 %	0 %	50 %	292654284
3096	NC_013967	ACG	2	6	104266	104271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654284
3097	NC_013967	CAG	2	6	104278	104283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654284
3098	NC_013967	AAC	2	6	104314	104319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292654284
3099	NC_013967	GAG	2	6	104323	104328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654284
3100	NC_013967	CTC	2	6	104335	104340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292654284
3101	NC_013967	TCGGCG	2	12	104387	104398	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	292654284
3102	NC_013967	CGA	3	9	104403	104411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654284
3103	NC_013967	TCGC	2	8	104422	104429	0 %	25 %	25 %	50 %	292654284
3104	NC_013967	CTCG	2	8	104442	104449	0 %	25 %	25 %	50 %	292654284
3105	NC_013967	GAC	2	6	104461	104466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654284
3106	NC_013967	GGA	2	6	104526	104531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654284
3107	NC_013967	CCT	2	6	104562	104567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292654284
3108	NC_013967	TCG	2	6	104612	104617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654284
3109	NC_013967	GGC	3	9	104622	104630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654284
3110	NC_013967	GACG	2	8	104643	104650	25 %	0 %	50 %	25 %	292654284
3111	NC_013967	GTTCG	2	10	104669	104678	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3112	NC_013967	GCCG	2	8	104689	104696	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3113	NC_013967	GTC	2	6	104708	104713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654285
3114	NC_013967	CGT	2	6	104752	104757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654285
3115	NC_013967	CG	3	6	104787	104792	0 %	0 %	50 %	50 %	292654285
3116	NC_013967	GTC	2	6	104849	104854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654285
3117	NC_013967	CGT	2	6	104882	104887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654285
3118	NC_013967	CTGA	2	8	104924	104931	25 %	25 %	25 %	25 %	292654285
3119	NC_013967	ACGCG	2	10	104953	104962	20 %	0 %	40 %	40 %	292654285
3120	NC_013967	CGT	2	6	104977	104982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654285
3121	NC_013967	ATCGTA	2	12	105000	105011	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	292654285
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3481	NC_013967	CGT	2	6	116609	116614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654301
3482	NC_013967	GACGG	2	10	116628	116637	20 %	0 %	60 %	20 %	292654301
3483	NC_013967	GGC	2	6	116646	116651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654301
3484	NC_013967	GC	3	6	116650	116655	0 %	0 %	50 %	50 %	292654301
3485	NC_013967	CCG	2	6	116659	116664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654301
3486	NC_013967	TC	3	6	116749	116754	0 %	50 %	0 %	50 %	292654301
3487	NC_013967	GCT	2	6	116756	116761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654301
3488	NC_013967	GAG	2	6	116847	116852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654301
3489	NC_013967	ATG	2	6	116853	116858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292654301
3490	NC_013967	CGG	3	9	116954	116962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654301
3491	NC_013967	GAC	2	6	116982	116987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654301
3492	NC_013967	CGTT	2	8	117015	117022	0 %	50 %	25 %	25 %	292654301
3493	NC_013967	TCA	2	6	117028	117033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292654301
3494	NC_013967	GAG	2	6	117048	117053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654301
3495	NC_013967	GAG	2	6	117123	117128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654301
3496	NC_013967	ATG	2	6	117159	117164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292654301
3497	NC_013967	GGCGAC	2	12	117195	117206	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	292654301
3498	NC_013967	GAT	2	6	117215	117220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292654301
3499	NC_013967	GAA	2	6	117221	117226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292654301
3500	NC_013967	GGC	3	9	117243	117251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654301

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