MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloferax volcanii DS2 chromosome

Total Repeats: 83599

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_013967	GC	3	6	49216	49221	0 %	0 %	50 %	50 %	292654226
1502	NC_013967	CCT	2	6	49353	49358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292654226
1503	NC_013967	CTC	2	6	49363	49368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292654226
1504	NC_013967	CGA	2	6	49398	49403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654226
1505	NC_013967	TCG	2	6	49406	49411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654226
1506	NC_013967	CTC	2	6	49420	49425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292654226
1507	NC_013967	TGTCG	2	10	49447	49456	0 %	40 %	40 %	20 %	292654226
1508	NC_013967	TTC	2	6	49484	49489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292654226
1509	NC_013967	AC	3	6	49511	49516	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1510	NC_013967	GAT	3	9	49613	49621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_013967	CGT	2	6	49639	49644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NC_013967	TGC	2	6	49691	49696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_013967	ACG	2	6	49721	49726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_013967	CAG	2	6	49796	49801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654227
1515	NC_013967	CGA	2	6	49810	49815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654227
1516	NC_013967	ACG	2	6	49845	49850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654227
1517	NC_013967	GAT	2	6	49856	49861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292654227
1518	NC_013967	CTC	2	6	49902	49907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1519	NC_013967	TCGG	2	8	49934	49941	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1520	NC_013967	CGC	2	6	49959	49964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1521	NC_013967	GCCGC	2	10	50007	50016	0 %	0 %	40 %	60 %	292654228
1522	NC_013967	GAT	2	6	50111	50116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292654228
1523	NC_013967	CGT	2	6	50132	50137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654228
1524	NC_013967	CGG	2	6	50143	50148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654228
1525	NC_013967	CGAG	2	8	50164	50171	25 %	0 %	50 %	25 %	292654228
1526	NC_013967	CCG	2	6	50241	50246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654228
1527	NC_013967	GA	3	6	50256	50261	50 %	0 %	50 %	0 %	292654228
1528	NC_013967	GAC	2	6	50282	50287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654228
1529	NC_013967	GCC	4	12	50307	50318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654228
1530	NC_013967	GTCGG	2	10	50325	50334	0 %	20 %	60 %	20 %	292654228
1531	NC_013967	AGA	3	9	50350	50358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292654228
1532	NC_013967	TCG	2	6	50422	50427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654228
1533	NC_013967	CGA	2	6	50440	50445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654228
1534	NC_013967	CGC	2	6	50450	50455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654228
1535	NC_013967	CGAGCG	2	12	50473	50484	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	292654228
1536	NC_013967	GAC	3	9	50501	50509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654228
1537	NC_013967	CCT	2	6	50533	50538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292654228
1538	NC_013967	CAG	2	6	50597	50602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654228
1539	NC_013967	GCGA	2	8	50625	50632	25 %	0 %	50 %	25 %	292654228
1540	NC_013967	CGC	2	6	50650	50655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654228
1541	NC_013967	CGC	2	6	50659	50664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654228
1542	NC_013967	CGAG	2	8	50671	50678	25 %	0 %	50 %	25 %	292654228
1543	NC_013967	GAC	2	6	50681	50686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654228
1544	NC_013967	CGA	3	9	50798	50806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654228
1545	NC_013967	GCC	2	6	50819	50824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654228
1546	NC_013967	CG	3	6	50912	50917	0 %	0 %	50 %	50 %	292654228
1547	NC_013967	CGA	2	6	50933	50938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654228
1548	NC_013967	CAG	2	6	50978	50983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654228
1549	NC_013967	CGA	2	6	51073	51078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654228
1550	NC_013967	CGC	2	6	51079	51084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654228
1551	NC_013967	CGA	2	6	51085	51090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654228
1552	NC_013967	CGA	2	6	51136	51141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654228
1553	NC_013967	GCC	3	9	51180	51188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654228
1554	NC_013967	CGA	2	6	51210	51215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654229
1555	NC_013967	GAC	2	6	51244	51249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654229
1556	NC_013967	CGC	2	6	51279	51284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654229
1557	NC_013967	GAC	2	6	51295	51300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654229
1558	NC_013967	TCG	2	6	51302	51307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654229
1559	NC_013967	GACG	2	8	51325	51332	25 %	0 %	50 %	25 %	292654229
1560	NC_013967	GAG	2	6	51481	51486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654229
1561	NC_013967	CG	3	6	51553	51558	0 %	0 %	50 %	50 %	292654229
1562	NC_013967	TGT	2	6	51582	51587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292654229
1563	NC_013967	TTC	2	6	51635	51640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292654229
1564	NC_013967	CGA	2	6	51680	51685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_013967	GCC	2	6	51707	51712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1566	NC_013967	AGC	2	6	51726	51731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654230
1567	NC_013967	CGC	2	6	51740	51745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654230
1568	NC_013967	CGG	2	6	51764	51769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654230
1569	NC_013967	GTC	2	6	51782	51787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654230
1570	NC_013967	CGA	2	6	51802	51807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654230
1571	NC_013967	CGG	2	6	51847	51852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654230
1572	NC_013967	GCC	2	6	51863	51868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654230
1573	NC_013967	C	6	6	51876	51881	0 %	0 %	0 %	100 %	292654230
1574	NC_013967	CGGCG	2	10	51899	51908	0 %	0 %	60 %	40 %	292654230
1575	NC_013967	CGC	2	6	51932	51937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654230
1576	NC_013967	CACC	2	8	51961	51968	25 %	0 %	0 %	75 %	292654230
1577	NC_013967	TGAGCA	2	12	52009	52020	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	292654230
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1581	NC_013967	CGC	2	6	52190	52195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654230
1582	NC_013967	GAG	2	6	52241	52246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654230
1583	NC_013967	CGG	2	6	52300	52305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654230
1584	NC_013967	CGG	2	6	52321	52326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654230
1585	NC_013967	CGA	2	6	52336	52341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654231
1586	NC_013967	GTC	2	6	52349	52354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654231
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1589	NC_013967	CGA	2	6	52393	52398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654231
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1597	NC_013967	GCCG	2	8	52589	52596	0 %	0 %	50 %	50 %	292654231
1598	NC_013967	CG	3	6	52595	52600	0 %	0 %	50 %	50 %	292654231
1599	NC_013967	CGT	2	6	52615	52620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654231
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1602	NC_013967	TCG	2	6	52731	52736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654231
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1605	NC_013967	CGTCGA	2	12	52885	52896	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	292654231
1606	NC_013967	TCG	2	6	52905	52910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654231
1607	NC_013967	CGG	2	6	52966	52971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654231
1608	NC_013967	GC	3	6	52975	52980	0 %	0 %	50 %	50 %	292654231
1609	NC_013967	CGA	2	6	53014	53019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654231
1610	NC_013967	GC	3	6	53022	53027	0 %	0 %	50 %	50 %	292654231
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1613	NC_013967	GTC	3	9	53069	53077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654231
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1616	NC_013967	GC	3	6	53193	53198	0 %	0 %	50 %	50 %	292654231
1617	NC_013967	GCGGAA	2	12	53216	53227	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	292654231
1618	NC_013967	GTC	2	6	53334	53339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654231
1619	NC_013967	CGT	2	6	53353	53358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654231
1620	NC_013967	CCT	2	6	53362	53367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292654231
1621	NC_013967	CCG	2	6	53407	53412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654231
1622	NC_013967	TCG	2	6	53424	53429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654231
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1624	NC_013967	CGA	2	6	53633	53638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654231
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1626	NC_013967	CGC	2	6	53704	53709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654231
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1741	NC_013967	G	6	6	57685	57690	0 %	0 %	100 %	0 %	292654236
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1992	NC_013967	ACCG	2	8	67164	67171	25 %	0 %	25 %	50 %	292654242
1993	NC_013967	CGC	2	6	67214	67219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654242
1994	NC_013967	CT	3	6	67230	67235	0 %	50 %	0 %	50 %	292654242
1995	NC_013967	GAT	2	6	67256	67261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292654242
1996	NC_013967	CG	3	6	67289	67294	0 %	0 %	50 %	50 %	292654242
1997	NC_013967	CGA	2	6	67310	67315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654242
1998	NC_013967	GACG	2	8	67316	67323	25 %	0 %	50 %	25 %	292654242
1999	NC_013967	GCG	2	6	67414	67419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654242
2000	NC_013967	CCG	2	6	67427	67432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654242

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