MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloferax volcanii DS2 chromosome

Total Repeats: 83599

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013967	CGG	2	6	32910	32915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654211
1002	NC_013967	CTCG	2	8	32921	32928	0 %	25 %	25 %	50 %	292654211
1003	NC_013967	CGG	2	6	32935	32940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654211
1004	NC_013967	CAC	2	6	33002	33007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292654211
1005	NC_013967	ACC	2	6	33060	33065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292654211
1006	NC_013967	GCC	2	6	33082	33087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654211
1007	NC_013967	TCCA	2	8	33108	33115	25 %	25 %	0 %	50 %	292654211
1008	NC_013967	CCGC	2	8	33125	33132	0 %	0 %	25 %	75 %	292654211
1009	NC_013967	GTT	2	6	33149	33154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292654211
1010	NC_013967	CGAC	2	8	33217	33224	25 %	0 %	25 %	50 %	292654211
1011	NC_013967	ATT	2	6	33268	33273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_013967	GGT	2	6	33413	33418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_013967	GACGCC	2	12	33421	33432	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1014	NC_013967	TC	3	6	33435	33440	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1015	NC_013967	GGA	2	6	33452	33457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_013967	CGGG	2	8	33493	33500	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1017	NC_013967	GAC	2	6	33584	33589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_013967	ACG	2	6	33623	33628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_013967	CGC	2	6	33697	33702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654212
1020	NC_013967	TTCGAT	2	12	33707	33718	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	292654212
1021	NC_013967	GTC	2	6	33785	33790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654212
1022	NC_013967	GAG	2	6	33797	33802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654212
1023	NC_013967	TCG	2	6	33816	33821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654212
1024	NC_013967	CGC	2	6	33842	33847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654212
1025	NC_013967	CTG	2	6	33848	33853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654212
1026	NC_013967	AGC	2	6	33891	33896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654212
1027	NC_013967	ACGT	2	8	33918	33925	25 %	25 %	25 %	25 %	292654212
1028	NC_013967	GAT	2	6	33974	33979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292654212
1029	NC_013967	GC	3	6	33981	33986	0 %	0 %	50 %	50 %	292654212
1030	NC_013967	CCG	2	6	34000	34005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654212
1031	NC_013967	CG	3	6	34004	34009	0 %	0 %	50 %	50 %	292654212
1032	NC_013967	GAT	2	6	34082	34087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292654212
1033	NC_013967	CGG	2	6	34120	34125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654212
1034	NC_013967	CGG	3	9	34161	34169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654212
1035	NC_013967	CGG	2	6	34174	34179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654212
1036	NC_013967	CTG	2	6	34184	34189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654212
1037	NC_013967	TCG	2	6	34263	34268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654212
1038	NC_013967	TCG	2	6	34275	34280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654212
1039	NC_013967	CGG	2	6	34287	34292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654212
1040	NC_013967	GC	3	6	34295	34300	0 %	0 %	50 %	50 %	292654212
1041	NC_013967	GC	3	6	34316	34321	0 %	0 %	50 %	50 %	292654212
1042	NC_013967	GTC	2	6	34328	34333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654212
1043	NC_013967	GGC	2	6	34352	34357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654212
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1052	NC_013967	CGGCGA	2	12	34663	34674	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	292654212
1053	NC_013967	GAC	2	6	34682	34687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654212
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1055	NC_013967	GAC	2	6	34721	34726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654212
1056	NC_013967	GAC	2	6	34742	34747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654212
1057	NC_013967	ACCGCG	2	12	34749	34760	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	292654212
1058	NC_013967	G	6	6	34762	34767	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_013967	CGA	3	9	34817	34825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_013967	GAC	2	6	34827	34832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_013967	GAG	2	6	34833	34838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_013967	TGG	2	6	34879	34884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_013967	CCA	2	6	34942	34947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1064	NC_013967	CGAA	2	8	34983	34990	50 %	0 %	25 %	25 %	292654213
1065	NC_013967	GGA	2	6	35009	35014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654213
1066	NC_013967	CTG	2	6	35016	35021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654213
1067	NC_013967	ATC	2	6	35025	35030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292654213
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1069	NC_013967	ATC	2	6	35064	35069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292654213
1070	NC_013967	GCT	2	6	35096	35101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654213
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1072	NC_013967	GCT	2	6	35156	35161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654213
1073	NC_013967	CGA	2	6	35186	35191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_013967	TC	3	6	35204	35209	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1075	NC_013967	CGCC	2	8	35260	35267	0 %	0 %	25 %	75 %	292654214
1076	NC_013967	GCG	2	6	35380	35385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654214
1077	NC_013967	CG	3	6	35384	35389	0 %	0 %	50 %	50 %	292654214
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1081	NC_013967	CGA	2	6	35524	35529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654214
1082	NC_013967	CGA	2	6	35557	35562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654214
1083	NC_013967	CGCT	2	8	35580	35587	0 %	25 %	25 %	50 %	292654214
1084	NC_013967	CGG	2	6	35590	35595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654214
1085	NC_013967	CG	3	6	35612	35617	0 %	0 %	50 %	50 %	292654214
1086	NC_013967	TCG	2	6	35678	35683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654214
1087	NC_013967	CGG	2	6	35744	35749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_013967	CG	3	6	35781	35786	0 %	0 %	50 %	50 %	292654215
1089	NC_013967	CTC	2	6	35809	35814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292654215
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1091	NC_013967	GCC	2	6	35904	35909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654215
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1095	NC_013967	GTC	2	6	36034	36039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654215
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1098	NC_013967	ATG	2	6	36080	36085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292654215
1099	NC_013967	GCC	2	6	36109	36114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654215
1100	NC_013967	CGG	2	6	36157	36162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654215
1101	NC_013967	CCGC	2	8	36235	36242	0 %	0 %	25 %	75 %	292654215
1102	NC_013967	CGCCTC	2	12	36274	36285	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	292654215
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1104	NC_013967	CGT	2	6	36331	36336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654215
1105	NC_013967	GAG	2	6	36349	36354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654215
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1109	NC_013967	CTC	2	6	36445	36450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292654215
1110	NC_013967	CGTCG	2	10	36454	36463	0 %	20 %	40 %	40 %	292654215
1111	NC_013967	GAC	2	6	36473	36478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654215
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1113	NC_013967	CGGGT	2	10	36613	36622	0 %	20 %	60 %	20 %	292654215
1114	NC_013967	CG	3	6	36629	36634	0 %	0 %	50 %	50 %	292654215
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1119	NC_013967	CGTCGC	2	12	36756	36767	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	292654215
1120	NC_013967	ACG	2	6	36771	36776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654215
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1125	NC_013967	CAG	2	6	36907	36912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654215
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1130	NC_013967	GCTCAG	2	12	37226	37237	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	292654216
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1372	NC_013967	CGA	2	6	44857	44862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654222
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1495	NC_013967	TCC	2	6	48908	48913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292654226
1496	NC_013967	GCC	2	6	48943	48948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654226
1497	NC_013967	GCC	2	6	49000	49005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654226
1498	NC_013967	CGG	2	6	49026	49031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654226
1499	NC_013967	GC	3	6	49100	49105	0 %	0 %	50 %	50 %	292654226
1500	NC_013967	CTC	2	6	49177	49182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292654226

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