MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloferax volcanii DS2 chromosome

Total Repeats: 83599

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013967	CGGT	2	8	16806	16813	0 %	25 %	50 %	25 %	292654194
502	NC_013967	GAA	2	6	16823	16828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292654194
503	NC_013967	CGGT	2	8	16842	16849	0 %	25 %	50 %	25 %	292654194
504	NC_013967	GCC	2	6	16886	16891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654194
505	NC_013967	TCG	2	6	16897	16902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654194
506	NC_013967	GCG	2	6	16982	16987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_013967	CGC	2	6	17015	17020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
508	NC_013967	TCG	2	6	17086	17091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654195
509	NC_013967	CGCGAG	2	12	17195	17206	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	292654195
510	NC_013967	GA	3	6	17217	17222	50 %	0 %	50 %	0 %	292654195
511	NC_013967	CCG	2	6	17262	17267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654195
512	NC_013967	CT	3	6	17276	17281	0 %	50 %	0 %	50 %	292654195
513	NC_013967	GTC	2	6	17294	17299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654195
514	NC_013967	GC	3	6	17311	17316	0 %	0 %	50 %	50 %	292654195
515	NC_013967	GAT	2	6	17336	17341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292654195
516	NC_013967	CG	3	6	17376	17381	0 %	0 %	50 %	50 %	292654195
517	NC_013967	CCT	2	6	17392	17397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292654195
518	NC_013967	GAC	2	6	17402	17407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654195
519	NC_013967	GAG	2	6	17420	17425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654195
520	NC_013967	GCC	2	6	17429	17434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654195
521	NC_013967	GAC	2	6	17435	17440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654195
522	NC_013967	CTG	2	6	17441	17446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654195
523	NC_013967	CGG	2	6	17472	17477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654195
524	NC_013967	CGT	3	9	17493	17501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_013967	CGG	2	6	17504	17509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_013967	CG	3	6	17519	17524	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
527	NC_013967	G	7	7	17527	17533	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
528	NC_013967	GTC	3	9	17543	17551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_013967	CGGTC	2	10	17569	17578	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
530	NC_013967	GC	3	6	17598	17603	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
531	NC_013967	CGA	2	6	17626	17631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654196
532	NC_013967	GGC	2	6	17644	17649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654196
533	NC_013967	GGA	2	6	17671	17676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654196
534	NC_013967	CGT	2	6	17737	17742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654196
535	NC_013967	CG	3	6	17774	17779	0 %	0 %	50 %	50 %	292654196
536	NC_013967	CG	3	6	17849	17854	0 %	0 %	50 %	50 %	292654196
537	NC_013967	ACACCG	2	12	17856	17867	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	292654196
538	NC_013967	TCG	2	6	17883	17888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654196
539	NC_013967	CGA	2	6	17896	17901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654196
540	NC_013967	CGA	3	9	17911	17919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654196
541	NC_013967	CTA	2	6	17953	17958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292654196
542	NC_013967	CGC	2	6	17959	17964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654196
543	NC_013967	CAC	2	6	17972	17977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292654196
544	NC_013967	GAA	2	6	17984	17989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292654196
545	NC_013967	GGC	2	6	18011	18016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654196
546	NC_013967	ATT	2	6	18036	18041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	292654196
547	NC_013967	GAG	2	6	18044	18049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654196
548	NC_013967	TCGACA	2	12	18177	18188	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	292654196
549	NC_013967	CGG	2	6	18192	18197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654196
550	NC_013967	CGAC	2	8	18210	18217	25 %	0 %	25 %	50 %	292654196
551	NC_013967	CGG	2	6	18298	18303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_013967	ACCG	2	8	18308	18315	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
553	NC_013967	CGA	2	6	18328	18333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654197
554	NC_013967	CGC	2	6	18403	18408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654197
555	NC_013967	ACG	2	6	18423	18428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654197
556	NC_013967	GTTCC	2	10	18430	18439	0 %	40 %	20 %	40 %	292654197
557	NC_013967	CGT	2	6	18461	18466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654197
558	NC_013967	CGA	2	6	18487	18492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654197
559	NC_013967	GTT	2	6	18532	18537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292654197
560	NC_013967	TCG	2	6	18561	18566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654197
561	NC_013967	CGCCGA	2	12	18634	18645	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	292654197
562	NC_013967	C	7	7	18653	18659	0 %	0 %	0 %	100 %	292654197
563	NC_013967	CGA	2	6	18676	18681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654197
564	NC_013967	GTT	2	6	18695	18700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292654197
565	NC_013967	CGA	2	6	18718	18723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654197
566	NC_013967	GGT	2	6	18739	18744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292654197
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568	NC_013967	GTC	2	6	18849	18854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654197
569	NC_013967	CGG	2	6	18888	18893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654197
570	NC_013967	TCG	2	6	18933	18938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654197
571	NC_013967	AGC	2	6	18942	18947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654197
572	NC_013967	CCGGG	2	10	18952	18961	0 %	0 %	60 %	40 %	292654197
573	NC_013967	TGT	2	6	18990	18995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292654197
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575	NC_013967	CGA	2	6	19045	19050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654197
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577	NC_013967	GCC	3	9	19085	19093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654197
578	NC_013967	CGG	2	6	19094	19099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654197
579	NC_013967	ACG	2	6	19173	19178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654197
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581	NC_013967	GTC	2	6	19281	19286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654197
582	NC_013967	CGA	2	6	19306	19311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654197
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584	NC_013967	CGT	2	6	19327	19332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654197
585	NC_013967	CGAC	2	8	19333	19340	25 %	0 %	25 %	50 %	292654197
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587	NC_013967	CGG	2	6	19442	19447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_013967	GCC	2	6	19530	19535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654198
589	NC_013967	CGA	3	9	19544	19552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654198
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591	NC_013967	GAT	2	6	19674	19679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292654198
592	NC_013967	GTCGA	2	10	19681	19690	20 %	20 %	40 %	20 %	292654198
593	NC_013967	CGC	2	6	19719	19724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654198
594	NC_013967	CGA	2	6	19730	19735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654198
595	NC_013967	GC	3	6	19772	19777	0 %	0 %	50 %	50 %	292654198
596	NC_013967	CGAG	2	8	19793	19800	25 %	0 %	50 %	25 %	292654198
597	NC_013967	CG	3	6	19801	19806	0 %	0 %	50 %	50 %	292654198
598	NC_013967	GCCG	2	8	19817	19824	0 %	0 %	50 %	50 %	292654198
599	NC_013967	GCG	2	6	19841	19846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654198
600	NC_013967	CGA	2	6	19892	19897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654198
601	NC_013967	GC	3	6	19904	19909	0 %	0 %	50 %	50 %	292654198
602	NC_013967	AGGCCG	2	12	19966	19977	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	292654198
603	NC_013967	ACG	2	6	19978	19983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654198
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606	NC_013967	ACG	2	6	20089	20094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654198
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609	NC_013967	GAC	2	6	20256	20261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654198
610	NC_013967	CGA	3	9	20273	20281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654198
611	NC_013967	CCG	2	6	20290	20295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654198
612	NC_013967	GGAC	2	8	20342	20349	25 %	0 %	50 %	25 %	292654198
613	NC_013967	GCC	2	6	20373	20378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654198
614	NC_013967	GCTG	2	8	20387	20394	0 %	25 %	50 %	25 %	292654198
615	NC_013967	CGA	2	6	20444	20449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654198
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618	NC_013967	ACG	2	6	20555	20560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654198
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621	NC_013967	CGC	2	6	20641	20646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654198
622	NC_013967	CGAG	2	8	20657	20664	25 %	0 %	50 %	25 %	292654198
623	NC_013967	CGG	2	6	20705	20710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654198
624	NC_013967	GAC	2	6	20712	20717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654198
625	NC_013967	CGA	2	6	20723	20728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654198
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627	NC_013967	CAG	2	6	20778	20783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654198
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751	NC_013967	TCG	2	6	24535	24540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654202
752	NC_013967	GTGGAC	2	12	24543	24554	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	292654202
753	NC_013967	ACG	2	6	24565	24570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654202
754	NC_013967	GAC	2	6	24626	24631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654202
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864	NC_013967	CGG	2	6	28050	28055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654205
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995	NC_013967	GCTC	2	8	32726	32733	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
996	NC_013967	GCGCG	2	10	32764	32773	0 %	0 %	60 %	40 %	292654211
997	NC_013967	CTC	2	6	32816	32821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292654211
998	NC_013967	TCG	4	12	32862	32873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654211
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1000	NC_013967	AGG	2	6	32893	32898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654211

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