MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloferax volcanii DS2 chromosome

Total Repeats: 83599

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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83502	NC_013967	CGG	3	9	2843731	2843739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292657118
83503	NC_013967	CGC	2	6	2843776	2843781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292657118
83504	NC_013967	CG	3	6	2843783	2843788	0 %	0 %	50 %	50 %	292657118
83505	NC_013967	TCG	2	6	2843796	2843801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657118
83506	NC_013967	AGGTG	2	10	2843803	2843812	20 %	20 %	60 %	0 %	292657118
83507	NC_013967	GCG	2	6	2843866	2843871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292657118
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83512	NC_013967	TGC	2	6	2843991	2843996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657118
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83514	NC_013967	CGT	2	6	2844043	2844048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657118
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83517	NC_013967	GGCGA	2	10	2844140	2844149	20 %	0 %	60 %	20 %	292657118
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83572	NC_013967	AT	3	6	2846567	2846572	50 %	50 %	0 %	0 %	292657122
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83585	NC_013967	GTGG	2	8	2847136	2847143	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
83586	NC_013967	G	6	6	2847142	2847147	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
83587	NC_013967	CGG	2	6	2847159	2847164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83588	NC_013967	AG	3	6	2847182	2847187	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83589	NC_013967	TC	3	6	2847209	2847214	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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83592	NC_013967	CCCCT	2	10	2847277	2847286	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
83593	NC_013967	CTA	2	6	2847414	2847419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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83595	NC_013967	GTCA	2	8	2847538	2847545	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
83596	NC_013967	CCA	2	6	2847599	2847604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83597	NC_013967	CAC	2	6	2847650	2847655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83598	NC_013967	CGAGC	2	10	2847681	2847690	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
83599	NC_013967	CCG	2	6	2847747	2847752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.