MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloferax volcanii DS2 chromosome

Total Repeats: 83599

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_013967	CGG	2	6	149152	149157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654342
4502	NC_013967	CGAGCG	2	12	149159	149170	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	292654342
4503	NC_013967	CGC	2	6	149171	149176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654342
4504	NC_013967	G	7	7	149196	149202	0 %	0 %	100 %	0 %	292654342
4505	NC_013967	AGT	2	6	149204	149209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292654342
4506	NC_013967	CGTC	2	8	149211	149218	0 %	25 %	25 %	50 %	292654342
4507	NC_013967	GCG	2	6	149232	149237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654342
4508	NC_013967	TCG	2	6	149245	149250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654342
4509	NC_013967	GTG	2	6	149268	149273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292654342
4510	NC_013967	GC	3	6	149300	149305	0 %	0 %	50 %	50 %	292654342
4511	NC_013967	CTCA	2	8	149370	149377	25 %	25 %	0 %	50 %	292654342
4512	NC_013967	GTA	2	6	149417	149422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292654343
4513	NC_013967	GGCC	2	8	149440	149447	0 %	0 %	50 %	50 %	292654343
4514	NC_013967	CGA	2	6	149470	149475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654343
4515	NC_013967	GTG	2	6	149477	149482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292654343
4516	NC_013967	CGC	2	6	149500	149505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654343
4517	NC_013967	GCC	2	6	149526	149531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654343
4518	NC_013967	CGCGA	2	10	149532	149541	20 %	0 %	40 %	40 %	292654343
4519	NC_013967	CAGCGC	2	12	149549	149560	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	292654343
4520	NC_013967	CCG	3	9	149582	149590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654343
4521	NC_013967	CGA	2	6	149627	149632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654343
4522	NC_013967	ACG	2	6	149646	149651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654343
4523	NC_013967	CCGC	2	8	149670	149677	0 %	0 %	25 %	75 %	292654343
4524	NC_013967	CCG	2	6	149790	149795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4525	NC_013967	TC	3	6	149831	149836	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4526	NC_013967	CAC	2	6	149858	149863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4527	NC_013967	CGC	2	6	149866	149871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4528	NC_013967	CGACG	2	10	149927	149936	20 %	0 %	40 %	40 %	292654344
4529	NC_013967	CGA	2	6	149966	149971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654344
4530	NC_013967	CGACGC	2	12	150002	150013	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	292654344
4531	NC_013967	CGA	2	6	150014	150019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654344
4532	NC_013967	CGC	2	6	150029	150034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654344
4533	NC_013967	CGA	2	6	150107	150112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654344
4534	NC_013967	GC	3	6	150160	150165	0 %	0 %	50 %	50 %	292654344
4535	NC_013967	GC	3	6	150182	150187	0 %	0 %	50 %	50 %	292654344
4536	NC_013967	GAT	2	6	150212	150217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292654344
4537	NC_013967	ACC	2	6	150228	150233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292654344
4538	NC_013967	CGC	3	9	150269	150277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654344
4539	NC_013967	GAG	2	6	150282	150287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654344
4540	NC_013967	CGCC	2	8	150299	150306	0 %	0 %	25 %	75 %	292654344
4541	NC_013967	CGT	2	6	150317	150322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654344
4542	NC_013967	GAC	2	6	150336	150341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654344
4543	NC_013967	CG	3	6	150347	150352	0 %	0 %	50 %	50 %	292654344
4544	NC_013967	CGA	2	6	150362	150367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654344
4545	NC_013967	CGGCG	2	10	150395	150404	0 %	0 %	60 %	40 %	292654344
4546	NC_013967	CCG	2	6	150421	150426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654344
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4552	NC_013967	CGA	2	6	150533	150538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654344
4553	NC_013967	TCG	2	6	150550	150555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654344
4554	NC_013967	GCG	2	6	150562	150567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654344
4555	NC_013967	CCG	2	6	150607	150612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654344
4556	NC_013967	CGA	2	6	150641	150646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654344
4557	NC_013967	CGT	2	6	150683	150688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654344
4558	NC_013967	AAC	2	6	150795	150800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292654344
4559	NC_013967	CGA	2	6	150815	150820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654344
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4561	NC_013967	CGC	2	6	150851	150856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654344
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4564	NC_013967	CCG	4	12	150913	150924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654344
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4569	NC_013967	CGC	2	6	151037	151042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654344
4570	NC_013967	CGGG	2	8	151076	151083	0 %	0 %	75 %	25 %	292654344
4571	NC_013967	CGA	2	6	151115	151120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654344
4572	NC_013967	GCCCGC	2	12	151134	151145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654344
4573	NC_013967	GTCGC	2	10	151152	151161	0 %	20 %	40 %	40 %	292654344
4574	NC_013967	C	6	6	151180	151185	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4575	NC_013967	CGC	3	9	151194	151202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4576	NC_013967	CGC	2	6	151211	151216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4577	NC_013967	CGT	2	6	151275	151280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654345
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4580	NC_013967	CAGCT	2	10	151436	151445	20 %	20 %	20 %	40 %	292654345
4581	NC_013967	TCG	2	6	151463	151468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654345
4582	NC_013967	GGA	2	6	151476	151481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654345
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4584	NC_013967	AAC	2	6	151514	151519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292654345
4585	NC_013967	CGG	2	6	151568	151573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4586	NC_013967	GCG	2	6	151608	151613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4587	NC_013967	CGA	2	6	151694	151699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654346
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4589	NC_013967	CGGA	2	8	151713	151720	25 %	0 %	50 %	25 %	292654346
4590	NC_013967	GAC	2	6	151723	151728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654346
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4592	NC_013967	TCG	2	6	151858	151863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654346
4593	NC_013967	CTG	2	6	151866	151871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654346
4594	NC_013967	CGG	2	6	151877	151882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654346
4595	NC_013967	ACG	3	9	151924	151932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654346
4596	NC_013967	CGG	2	6	151936	151941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654346
4597	NC_013967	ACG	2	6	151954	151959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654346
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4600	NC_013967	CTA	2	6	152000	152005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292654346
4601	NC_013967	ACCG	2	8	152036	152043	25 %	0 %	25 %	50 %	292654346
4602	NC_013967	CGA	2	6	152051	152056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654346
4603	NC_013967	GAG	2	6	152085	152090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654346
4604	NC_013967	TCG	2	6	152113	152118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654346
4605	NC_013967	CG	3	6	152157	152162	0 %	0 %	50 %	50 %	292654346
4606	NC_013967	GAACT	2	10	152178	152187	40 %	20 %	20 %	20 %	292654346
4607	NC_013967	CACGG	2	10	152241	152250	20 %	0 %	40 %	40 %	292654346
4608	NC_013967	GTC	2	6	152255	152260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654346
4609	NC_013967	CCA	2	6	152266	152271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292654346
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4611	NC_013967	CGT	3	9	152309	152317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654346
4612	NC_013967	CGG	2	6	152318	152323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654346
4613	NC_013967	AAG	2	6	152352	152357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292654346
4614	NC_013967	GC	4	8	152405	152412	0 %	0 %	50 %	50 %	292654346
4615	NC_013967	ACG	2	6	152434	152439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654346
4616	NC_013967	GGA	2	6	152450	152455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654346
4617	NC_013967	TCA	2	6	152479	152484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292654346
4618	NC_013967	ACC	2	6	152487	152492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292654346
4619	NC_013967	TCA	2	6	152506	152511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292654346
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4621	NC_013967	GCC	3	9	152662	152670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654346
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4743	NC_013967	CGC	2	6	156231	156236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654352
4744	NC_013967	CGCGCC	2	12	156262	156273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654352
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4865	NC_013967	CGA	2	6	160275	160280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654356
4866	NC_013967	TCG	2	6	160295	160300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654356
4867	NC_013967	GA	3	6	160305	160310	50 %	0 %	50 %	0 %	292654356
4868	NC_013967	CCGA	2	8	160318	160325	25 %	0 %	25 %	50 %	292654356
4869	NC_013967	CTGT	2	8	160333	160340	0 %	50 %	25 %	25 %	292654356
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4981	NC_013967	GTCG	2	8	164636	164643	0 %	25 %	50 %	25 %	292654362
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4985	NC_013967	AGG	2	6	164721	164726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654362
4986	NC_013967	CGA	2	6	164746	164751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654362
4987	NC_013967	CGGCG	2	10	164792	164801	0 %	0 %	60 %	40 %	292654362
4988	NC_013967	CGA	2	6	164815	164820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654362
4989	NC_013967	TCG	2	6	164845	164850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654362
4990	NC_013967	GAC	3	9	164915	164923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654362
4991	NC_013967	CGA	2	6	164965	164970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654362
4992	NC_013967	CGA	2	6	164981	164986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654362
4993	NC_013967	GCG	2	6	165006	165011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654362
4994	NC_013967	CGG	2	6	165025	165030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654362
4995	NC_013967	GCG	2	6	165033	165038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654362
4996	NC_013967	GAG	2	6	165059	165064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654362
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4998	NC_013967	CGG	2	6	165111	165116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654362
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