MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Haloferax volcanii DS2 plasmid pHV4

Total Repeats: 1422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013966	GT	3	6	62	67	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013966	TA	3	6	79	84	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013966	GC	3	6	805	810	0 %	0 %	50 %	50 %	292653567
4	NC_013966	CG	3	6	3315	3320	0 %	0 %	50 %	50 %	292653569
5	NC_013966	GA	3	6	4077	4082	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013966	GA	3	6	5097	5102	50 %	0 %	50 %	0 %	292653570
7	NC_013966	AC	3	6	5879	5884	50 %	0 %	0 %	50 %	292653571
8	NC_013966	GA	3	6	6357	6362	50 %	0 %	50 %	0 %	292653571
9	NC_013966	GA	3	6	6386	6391	50 %	0 %	50 %	0 %	292653571
10	NC_013966	GC	3	6	6634	6639	0 %	0 %	50 %	50 %	292653572
11	NC_013966	AC	3	6	6696	6701	50 %	0 %	0 %	50 %	292653572
12	NC_013966	CT	3	6	6733	6738	0 %	50 %	0 %	50 %	292653572
13	NC_013966	GA	3	6	6840	6845	50 %	0 %	50 %	0 %	292653572
14	NC_013966	TC	4	8	7025	7032	0 %	50 %	0 %	50 %	292653572
15	NC_013966	GA	3	6	7450	7455	50 %	0 %	50 %	0 %	292653572
16	NC_013966	GC	3	6	7464	7469	0 %	0 %	50 %	50 %	292653572
17	NC_013966	GC	3	6	7493	7498	0 %	0 %	50 %	50 %	292653572
18	NC_013966	CA	3	6	7842	7847	50 %	0 %	0 %	50 %	292653572
19	NC_013966	GT	3	6	9212	9217	0 %	50 %	50 %	0 %	292653573
20	NC_013966	AC	3	6	9448	9453	50 %	0 %	0 %	50 %	292653573
21	NC_013966	CA	3	6	9558	9563	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_013966	TG	3	6	9605	9610	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013966	CG	3	6	9763	9768	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_013966	CT	3	6	10140	10145	0 %	50 %	0 %	50 %	292653574
25	NC_013966	AG	3	6	10550	10555	50 %	0 %	50 %	0 %	292653574
26	NC_013966	TG	4	8	10716	10723	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013966	CA	3	6	12244	12249	50 %	0 %	0 %	50 %	292653576
28	NC_013966	TG	3	6	12287	12292	0 %	50 %	50 %	0 %	292653576
29	NC_013966	AT	3	6	12541	12546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013966	GC	3	6	12646	12651	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_013966	GT	3	6	12761	12766	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013966	GA	3	6	13693	13698	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013966	CA	3	6	13780	13785	50 %	0 %	0 %	50 %	292653578
34	NC_013966	TC	3	6	14543	14548	0 %	50 %	0 %	50 %	292653578
35	NC_013966	GC	3	6	14839	14844	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_013966	CG	3	6	15575	15580	0 %	0 %	50 %	50 %	292653579
37	NC_013966	GC	3	6	16528	16533	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_013966	AG	3	6	16583	16588	50 %	0 %	50 %	0 %	292653580
39	NC_013966	GA	3	6	16637	16642	50 %	0 %	50 %	0 %	292653580
40	NC_013966	TG	3	6	16794	16799	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013966	TC	3	6	16933	16938	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_013966	GC	3	6	17498	17503	0 %	0 %	50 %	50 %	292653581
43	NC_013966	CG	3	6	17807	17812	0 %	0 %	50 %	50 %	292653581
44	NC_013966	AG	3	6	18383	18388	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013966	GC	3	6	18724	18729	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_013966	CA	3	6	19609	19614	50 %	0 %	0 %	50 %	292653583
47	NC_013966	GA	3	6	20122	20127	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013966	CG	3	6	20541	20546	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_013966	GC	3	6	20660	20665	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_013966	GC	3	6	20692	20697	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_013966	GC	3	6	20742	20747	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_013966	GA	3	6	21157	21162	50 %	0 %	50 %	0 %	292653584
53	NC_013966	GC	4	8	21822	21829	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_013966	AG	3	6	22924	22929	50 %	0 %	50 %	0 %	292653585
55	NC_013966	GT	3	6	24046	24051	0 %	50 %	50 %	0 %	292653587
56	NC_013966	GC	3	6	24141	24146	0 %	0 %	50 %	50 %	292653587
57	NC_013966	GA	3	6	27245	27250	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013966	AT	3	6	27848	27853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013966	GC	3	6	28371	28376	0 %	0 %	50 %	50 %	292653593
60	NC_013966	GT	3	6	28788	28793	0 %	50 %	50 %	0 %	292653593
61	NC_013966	GA	3	6	29075	29080	50 %	0 %	50 %	0 %	292653594
62	NC_013966	CG	3	6	29704	29709	0 %	0 %	50 %	50 %	292653596
63	NC_013966	GA	3	6	30101	30106	50 %	0 %	50 %	0 %	292653596
64	NC_013966	GC	3	6	30119	30124	0 %	0 %	50 %	50 %	292653596
65	NC_013966	CA	4	8	30493	30500	50 %	0 %	0 %	50 %	292653597
66	NC_013966	AG	3	6	31401	31406	50 %	0 %	50 %	0 %	292653598
67	NC_013966	AG	5	10	31840	31849	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013966	CT	3	6	33186	33191	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_013966	AT	3	6	36888	36893	50 %	50 %	0 %	0 %	292653605
70	NC_013966	TG	3	6	36971	36976	0 %	50 %	50 %	0 %	292653605
71	NC_013966	GA	3	6	37401	37406	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013966	CT	3	6	37655	37660	0 %	50 %	0 %	50 %	292653607
73	NC_013966	TG	4	8	38510	38517	0 %	50 %	50 %	0 %	292653607
74	NC_013966	TG	3	6	38554	38559	0 %	50 %	50 %	0 %	292653607
75	NC_013966	GT	3	6	39499	39504	0 %	50 %	50 %	0 %	292653608
76	NC_013966	AT	3	6	39956	39961	50 %	50 %	0 %	0 %	292653608
77	NC_013966	GC	3	6	40577	40582	0 %	0 %	50 %	50 %	292653610
78	NC_013966	AC	3	6	41747	41752	50 %	0 %	0 %	50 %	292653611
79	NC_013966	AT	3	6	42178	42183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013966	TA	3	6	42334	42339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013966	CG	3	6	42548	42553	0 %	0 %	50 %	50 %	292653612
82	NC_013966	TC	3	6	42807	42812	0 %	50 %	0 %	50 %	292653612
83	NC_013966	CT	3	6	42970	42975	0 %	50 %	0 %	50 %	292653612
84	NC_013966	AC	3	6	44087	44092	50 %	0 %	0 %	50 %	292653614
85	NC_013966	AG	3	6	45350	45355	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013966	AG	3	6	46273	46278	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013966	TG	3	6	47583	47588	0 %	50 %	50 %	0 %	292653619
88	NC_013966	CT	3	6	47604	47609	0 %	50 %	0 %	50 %	292653620
89	NC_013966	GA	3	6	47700	47705	50 %	0 %	50 %	0 %	292653620
90	NC_013966	CA	3	6	48375	48380	50 %	0 %	0 %	50 %	292653621
91	NC_013966	AG	3	6	48700	48705	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013966	AC	3	6	48840	48845	50 %	0 %	0 %	50 %	292653622
93	NC_013966	TC	3	6	49033	49038	0 %	50 %	0 %	50 %	292653622
94	NC_013966	CG	3	6	49313	49318	0 %	0 %	50 %	50 %	292653622
95	NC_013966	CT	3	6	49548	49553	0 %	50 %	0 %	50 %	292653622
96	NC_013966	GA	3	6	49779	49784	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013966	CT	3	6	49820	49825	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_013966	GC	3	6	51240	51245	0 %	0 %	50 %	50 %	292653623
99	NC_013966	AC	3	6	51762	51767	50 %	0 %	0 %	50 %	292653624
100	NC_013966	TC	3	6	54004	54009	0 %	50 %	0 %	50 %	292653627
101	NC_013966	CG	3	6	54340	54345	0 %	0 %	50 %	50 %	292653627
102	NC_013966	GA	3	6	56127	56132	50 %	0 %	50 %	0 %	292653629
103	NC_013966	AG	3	6	56415	56420	50 %	0 %	50 %	0 %	292653629
104	NC_013966	AT	3	6	57600	57605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013966	GC	3	6	58325	58330	0 %	0 %	50 %	50 %	292653630
106	NC_013966	CG	4	8	58745	58752	0 %	0 %	50 %	50 %	292653630
107	NC_013966	GC	3	6	59643	59648	0 %	0 %	50 %	50 %	292653630
108	NC_013966	GT	3	6	60458	60463	0 %	50 %	50 %	0 %	292653631
109	NC_013966	CA	3	6	61334	61339	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_013966	CT	3	6	61429	61434	0 %	50 %	0 %	50 %	292653632
111	NC_013966	AG	3	6	62793	62798	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013966	TG	4	8	63949	63956	0 %	50 %	50 %	0 %	292653635
113	NC_013966	TG	3	6	64557	64562	0 %	50 %	50 %	0 %	292653636
114	NC_013966	AG	3	6	66206	66211	50 %	0 %	50 %	0 %	292653637
115	NC_013966	GA	3	6	66364	66369	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013966	GA	4	8	66560	66567	50 %	0 %	50 %	0 %	292653638
117	NC_013966	GT	3	6	66835	66840	0 %	50 %	50 %	0 %	292653639
118	NC_013966	AC	3	6	68452	68457	50 %	0 %	0 %	50 %	292653639
119	NC_013966	TC	3	6	69801	69806	0 %	50 %	0 %	50 %	292653639
120	NC_013966	AC	3	6	70829	70834	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_013966	CT	3	6	70859	70864	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_013966	TG	3	6	72009	72014	0 %	50 %	50 %	0 %	292653640
123	NC_013966	GC	3	6	72358	72363	0 %	0 %	50 %	50 %	292653640
124	NC_013966	GC	3	6	72387	72392	0 %	0 %	50 %	50 %	292653640
125	NC_013966	TC	3	6	72401	72406	0 %	50 %	0 %	50 %	292653640
126	NC_013966	GA	3	6	72657	72662	50 %	0 %	50 %	0 %	292653640
127	NC_013966	GA	4	8	72824	72831	50 %	0 %	50 %	0 %	292653640
128	NC_013966	TC	3	6	73011	73016	0 %	50 %	0 %	50 %	292653640
129	NC_013966	GA	3	6	73117	73122	50 %	0 %	50 %	0 %	292653640
130	NC_013966	GT	3	6	73155	73160	0 %	50 %	50 %	0 %	292653640
131	NC_013966	GC	3	6	73217	73222	0 %	0 %	50 %	50 %	292653640
132	NC_013966	TC	3	6	75095	75100	0 %	50 %	0 %	50 %	292653641
133	NC_013966	AT	3	6	75944	75949	50 %	50 %	0 %	0 %	292653642
134	NC_013966	CG	3	6	76170	76175	0 %	0 %	50 %	50 %	292653642
135	NC_013966	AG	3	6	76294	76299	50 %	0 %	50 %	0 %	292653642
136	NC_013966	GT	3	6	76694	76699	0 %	50 %	50 %	0 %	292653642
137	NC_013966	AG	3	6	77628	77633	50 %	0 %	50 %	0 %	292653642
138	NC_013966	AG	3	6	77818	77823	50 %	0 %	50 %	0 %	292653642
139	NC_013966	GT	3	6	77943	77948	0 %	50 %	50 %	0 %	292653642
140	NC_013966	GT	3	6	78216	78221	0 %	50 %	50 %	0 %	292653642
141	NC_013966	GA	3	6	79030	79035	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013966	CG	4	8	79115	79122	0 %	0 %	50 %	50 %	292653643
143	NC_013966	TC	3	6	80175	80180	0 %	50 %	0 %	50 %	292653643
144	NC_013966	CA	3	6	80357	80362	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_013966	AG	3	6	80594	80599	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013966	GA	3	6	80934	80939	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_013966	GA	3	6	82112	82117	50 %	0 %	50 %	0 %	292653644
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