MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloferax volcanii DS2 plasmid pHV4

Total Repeats: 16271

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_013966	GTTT	2	8	66399	66406	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_013966	G	6	6	66512	66517	0 %	0 %	100 %	0 %	292653638
1503	NC_013966	GA	4	8	66560	66567	50 %	0 %	50 %	0 %	292653638
1504	NC_013966	TCA	2	6	66591	66596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292653638
1505	NC_013966	GTCA	2	8	66617	66624	25 %	25 %	25 %	25 %	292653638
1506	NC_013966	TCA	2	6	66807	66812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_013966	GT	3	6	66835	66840	0 %	50 %	50 %	0 %	292653639
1508	NC_013966	ATA	2	6	66850	66855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	292653639
1509	NC_013966	TCG	2	6	66982	66987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653639
1510	NC_013966	CGA	2	6	67001	67006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653639
1511	NC_013966	AAG	2	6	67068	67073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292653639
1512	NC_013966	TGA	2	6	67133	67138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292653639
1513	NC_013966	CCT	2	6	67208	67213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292653639
1514	NC_013966	TGA	2	6	67241	67246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292653639
1515	NC_013966	AGA	2	6	67262	67267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292653639
1516	NC_013966	TCC	2	6	67327	67332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292653639
1517	NC_013966	CAA	2	6	67336	67341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292653639
1518	NC_013966	ACC	2	6	67357	67362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292653639
1519	NC_013966	CTT	2	6	67417	67422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292653639
1520	NC_013966	CTT	2	6	67499	67504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292653639
1521	NC_013966	TGA	2	6	67571	67576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292653639
1522	NC_013966	CCA	2	6	67608	67613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292653639
1523	NC_013966	GAA	2	6	67773	67778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292653639
1524	NC_013966	GGTTGA	2	12	67787	67798	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	292653639
1525	NC_013966	GAC	3	9	67830	67838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653639
1526	NC_013966	TAC	2	6	67881	67886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292653639
1527	NC_013966	GAG	2	6	67980	67985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292653639
1528	NC_013966	AAG	2	6	68018	68023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292653639
1529	NC_013966	GGC	2	6	68049	68054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653639
1530	NC_013966	ACGA	2	8	68121	68128	50 %	0 %	25 %	25 %	292653639
1531	NC_013966	CGA	2	6	68141	68146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653639
1532	NC_013966	TCG	2	6	68173	68178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653639
1533	NC_013966	CGC	2	6	68183	68188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653639
1534	NC_013966	CGA	2	6	68243	68248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653639
1535	NC_013966	CGT	2	6	68366	68371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653639
1536	NC_013966	AC	3	6	68452	68457	50 %	0 %	0 %	50 %	292653639
1537	NC_013966	TAC	2	6	68478	68483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292653639
1538	NC_013966	CGA	2	6	68528	68533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653639
1539	NC_013966	TGA	2	6	68552	68557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292653639
1540	NC_013966	GAT	2	6	68568	68573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292653639
1541	NC_013966	ACG	2	6	68583	68588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653639
1542	NC_013966	TGA	2	6	68660	68665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292653639
1543	NC_013966	GAG	2	6	68724	68729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292653639
1544	NC_013966	GGA	2	6	68924	68929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292653639
1545	NC_013966	CAAAA	2	10	69056	69065	80 %	0 %	0 %	20 %	292653639
1546	NC_013966	GAT	2	6	69114	69119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292653639
1547	NC_013966	ACC	2	6	69185	69190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292653639
1548	NC_013966	CGA	2	6	69254	69259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653639
1549	NC_013966	TGG	2	6	69308	69313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292653639
1550	NC_013966	GTC	2	6	69396	69401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653639
1551	NC_013966	TCA	2	6	69412	69417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292653639
1552	NC_013966	CGA	2	6	69419	69424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653639
1553	NC_013966	AATC	2	8	69425	69432	50 %	25 %	0 %	25 %	292653639
1554	NC_013966	TCTG	2	8	69473	69480	0 %	50 %	25 %	25 %	292653639
1555	NC_013966	CAA	2	6	69544	69549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292653639
1556	NC_013966	ATT	2	6	69570	69575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	292653639
1557	NC_013966	GGC	2	6	69610	69615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653639
1558	NC_013966	CAC	2	6	69716	69721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292653639
1559	NC_013966	CTC	2	6	69744	69749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292653639
1560	NC_013966	GAT	2	6	69792	69797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292653639
1561	NC_013966	TC	3	6	69801	69806	0 %	50 %	0 %	50 %	292653639
1562	NC_013966	ATC	2	6	69900	69905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292653639
1563	NC_013966	CGG	2	6	69932	69937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653639
1564	NC_013966	CAG	2	6	70011	70016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653639
1565	NC_013966	TCAC	2	8	70032	70039	25 %	25 %	0 %	50 %	292653639
1566	NC_013966	CTT	2	6	70118	70123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292653639
1567	NC_013966	CGA	2	6	70136	70141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653639
1568	NC_013966	CCA	2	6	70178	70183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1569	NC_013966	GTAC	2	8	70196	70203	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1570	NC_013966	GCG	2	6	70211	70216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1571	NC_013966	GAC	2	6	70312	70317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_013966	TCA	2	6	70328	70333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1573	NC_013966	GGC	2	6	70595	70600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1574	NC_013966	GGACA	2	10	70702	70711	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1575	NC_013966	AC	3	6	70829	70834	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1576	NC_013966	GTT	2	6	70837	70842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_013966	GACA	2	8	70845	70852	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1578	NC_013966	CT	3	6	70859	70864	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1579	NC_013966	GAC	2	6	70975	70980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1580	NC_013966	CCA	2	6	70995	71000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1581	NC_013966	ACA	2	6	71041	71046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1582	NC_013966	ACG	2	6	71081	71086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_013966	CAT	3	9	71166	71174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1584	NC_013966	CGA	2	6	71196	71201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1585	NC_013966	GACTC	2	10	71204	71213	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1586	NC_013966	CTC	2	6	71218	71223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1587	NC_013966	TAC	2	6	71370	71375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1588	NC_013966	CGA	2	6	71388	71393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_013966	TCAC	2	8	71463	71470	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1590	NC_013966	AACT	2	8	71519	71526	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1591	NC_013966	TCT	2	6	71631	71636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1592	NC_013966	ATG	2	6	71645	71650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_013966	CAG	2	6	71747	71752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1594	NC_013966	TCG	2	6	71787	71792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1595	NC_013966	CTC	2	6	71918	71923	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1596	NC_013966	TAG	2	6	71954	71959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292653640
1597	NC_013966	TG	3	6	72009	72014	0 %	50 %	50 %	0 %	292653640
1598	NC_013966	GCGA	2	8	72122	72129	25 %	0 %	50 %	25 %	292653640
1599	NC_013966	CGA	2	6	72157	72162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653640
1600	NC_013966	GCG	2	6	72173	72178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653640
1601	NC_013966	TCA	3	9	72237	72245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292653640
1602	NC_013966	ATG	2	6	72260	72265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292653640
1603	NC_013966	GAT	2	6	72277	72282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292653640
1604	NC_013966	GTCG	2	8	72289	72296	0 %	25 %	50 %	25 %	292653640
1605	NC_013966	CAG	2	6	72340	72345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653640
1606	NC_013966	GC	3	6	72358	72363	0 %	0 %	50 %	50 %	292653640
1607	NC_013966	GC	3	6	72387	72392	0 %	0 %	50 %	50 %	292653640
1608	NC_013966	TC	3	6	72401	72406	0 %	50 %	0 %	50 %	292653640
1609	NC_013966	GAT	2	6	72426	72431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292653640
1610	NC_013966	TCG	2	6	72434	72439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653640
1611	NC_013966	TCT	2	6	72441	72446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292653640
1612	NC_013966	GTC	2	6	72553	72558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653640
1613	NC_013966	TTC	2	6	72619	72624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292653640
1614	NC_013966	CGT	2	6	72642	72647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653640
1615	NC_013966	GA	3	6	72657	72662	50 %	0 %	50 %	0 %	292653640
1616	NC_013966	AACC	2	8	72665	72672	50 %	0 %	0 %	50 %	292653640
1617	NC_013966	GTC	2	6	72782	72787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653640
1618	NC_013966	GA	4	8	72824	72831	50 %	0 %	50 %	0 %	292653640
1619	NC_013966	GGTGA	2	10	72835	72844	20 %	20 %	60 %	0 %	292653640
1620	NC_013966	GCG	2	6	72890	72895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653640
1621	NC_013966	TCT	2	6	72968	72973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292653640
1622	NC_013966	TC	3	6	73011	73016	0 %	50 %	0 %	50 %	292653640
1623	NC_013966	GA	3	6	73117	73122	50 %	0 %	50 %	0 %	292653640
1624	NC_013966	CAG	2	6	73134	73139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653640
1625	NC_013966	GT	3	6	73155	73160	0 %	50 %	50 %	0 %	292653640
1626	NC_013966	GC	3	6	73217	73222	0 %	0 %	50 %	50 %	292653640
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1628	NC_013966	CGA	2	6	73329	73334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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