MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloferax volcanii DS2 plasmid pHV4

Total Repeats: 16271

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013966	TGA	2	6	44534	44539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292653614
1002	NC_013966	GAT	2	6	44589	44594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292653614
1003	NC_013966	GCC	2	6	44704	44709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653614
1004	NC_013966	AGC	2	6	44753	44758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653614
1005	NC_013966	GAAACC	2	12	44800	44811	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	292653614
1006	NC_013966	TCG	2	6	44858	44863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653614
1007	NC_013966	G	6	6	44917	44922	0 %	0 %	100 %	0 %	292653614
1008	NC_013966	CGT	2	6	44931	44936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653614
1009	NC_013966	CGA	2	6	44940	44945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653614
1010	NC_013966	TCG	2	6	44996	45001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653614
1011	NC_013966	CTA	2	6	45041	45046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292653614
1012	NC_013966	GAC	2	6	45058	45063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653614
1013	NC_013966	GTAC	2	8	45065	45072	25 %	25 %	25 %	25 %	292653614
1014	NC_013966	CGG	2	6	45081	45086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653614
1015	NC_013966	GAAC	2	8	45105	45112	50 %	0 %	25 %	25 %	292653614
1016	NC_013966	TGA	2	6	45198	45203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292653614
1017	NC_013966	GTT	2	6	45331	45336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_013966	AG	3	6	45350	45355	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_013966	CGAC	2	8	45403	45410	25 %	0 %	25 %	50 %	292653615
1020	NC_013966	CGA	2	6	45604	45609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653615
1021	NC_013966	TCG	2	6	45616	45621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653615
1022	NC_013966	CCTG	2	8	45625	45632	0 %	25 %	25 %	50 %	292653615
1023	NC_013966	TGG	2	6	45686	45691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292653615
1024	NC_013966	GAA	2	6	45749	45754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292653615
1025	NC_013966	CGTT	2	8	45789	45796	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1026	NC_013966	C	6	6	45843	45848	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1027	NC_013966	GAT	2	6	45909	45914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292653616
1028	NC_013966	CGT	2	6	45920	45925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653616
1029	NC_013966	CGT	2	6	45939	45944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653616
1030	NC_013966	TCG	2	6	45958	45963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653616
1031	NC_013966	GCTCGC	2	12	46070	46081	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	292653616
1032	NC_013966	CTC	3	9	46083	46091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292653616
1033	NC_013966	GAC	2	6	46101	46106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653616
1034	NC_013966	GAG	2	6	46122	46127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292653616
1035	NC_013966	GCT	2	6	46183	46188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653616
1036	NC_013966	CCGT	2	8	46251	46258	0 %	25 %	25 %	50 %	292653616
1037	NC_013966	AG	3	6	46273	46278	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_013966	ACCC	2	8	46293	46300	25 %	0 %	0 %	75 %	292653617
1039	NC_013966	CGAC	2	8	46325	46332	25 %	0 %	25 %	50 %	292653617
1040	NC_013966	AGCGA	2	10	46367	46376	40 %	0 %	40 %	20 %	292653617
1041	NC_013966	TCAC	2	8	46387	46394	25 %	25 %	0 %	50 %	292653617
1042	NC_013966	GAC	2	6	46552	46557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653617
1043	NC_013966	ATC	2	6	46606	46611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_013966	AGA	2	6	46624	46629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292653618
1045	NC_013966	CGAA	2	8	46644	46651	50 %	0 %	25 %	25 %	292653618
1046	NC_013966	TCA	2	6	46692	46697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292653618
1047	NC_013966	TTC	2	6	46782	46787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292653618
1048	NC_013966	CAG	2	6	46799	46804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653618
1049	NC_013966	CGA	2	6	46807	46812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653618
1050	NC_013966	G	6	6	46875	46880	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_013966	CGA	2	6	46920	46925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_013966	GCGA	2	8	46948	46955	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1053	NC_013966	CGA	2	6	47004	47009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653619
1054	NC_013966	CTC	3	9	47143	47151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292653619
1055	NC_013966	CGA	3	9	47160	47168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653619
1056	NC_013966	GTG	2	6	47209	47214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292653619
1057	NC_013966	CGA	2	6	47262	47267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653619
1058	NC_013966	TGG	2	6	47319	47324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292653619
1059	NC_013966	GCG	2	6	47391	47396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653619
1060	NC_013966	CGT	2	6	47412	47417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653619
1061	NC_013966	GAG	2	6	47434	47439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292653619
1062	NC_013966	GCT	2	6	47442	47447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653619
1063	NC_013966	GAG	2	6	47512	47517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292653619
1064	NC_013966	CCG	2	6	47528	47533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653619
1065	NC_013966	TCG	2	6	47564	47569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653619
1066	NC_013966	GGA	3	9	47574	47582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292653619
1067	NC_013966	TG	3	6	47583	47588	0 %	50 %	50 %	0 %	292653619
1068	NC_013966	CT	3	6	47604	47609	0 %	50 %	0 %	50 %	292653620
1069	NC_013966	CGG	2	6	47688	47693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653620
1070	NC_013966	GA	3	6	47700	47705	50 %	0 %	50 %	0 %	292653620
1071	NC_013966	CGG	2	6	47725	47730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653620
1072	NC_013966	CCA	2	6	47755	47760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292653621
1073	NC_013966	CGGG	2	8	47805	47812	0 %	0 %	75 %	25 %	292653621
1074	NC_013966	CGAG	2	8	47875	47882	25 %	0 %	50 %	25 %	292653621
1075	NC_013966	CAT	2	6	47933	47938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292653621
1076	NC_013966	GAC	2	6	47948	47953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653621
1077	NC_013966	CAC	2	6	47975	47980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292653621
1078	NC_013966	CGA	2	6	48073	48078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653621
1079	NC_013966	TCG	2	6	48081	48086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653621
1080	NC_013966	CTC	2	6	48197	48202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292653621
1081	NC_013966	CGTT	2	8	48207	48214	0 %	50 %	25 %	25 %	292653621
1082	NC_013966	CA	3	6	48375	48380	50 %	0 %	0 %	50 %	292653621
1083	NC_013966	CGA	2	6	48436	48441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653621
1084	NC_013966	AGA	2	6	48473	48478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292653621
1085	NC_013966	TGA	2	6	48584	48589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292653621
1086	NC_013966	GGT	2	6	48598	48603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_013966	TCA	2	6	48604	48609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_013966	GAA	2	6	48623	48628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_013966	AGA	2	6	48632	48637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_013966	CGTT	2	8	48640	48647	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1091	NC_013966	ACA	2	6	48667	48672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_013966	AG	3	6	48700	48705	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_013966	AGT	2	6	48720	48725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_013966	TTG	2	6	48768	48773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292653622
1095	NC_013966	TCG	2	6	48793	48798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653622
1096	NC_013966	CTC	2	6	48814	48819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292653622
1097	NC_013966	AAC	2	6	48831	48836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292653622
1098	NC_013966	AC	3	6	48840	48845	50 %	0 %	0 %	50 %	292653622
1099	NC_013966	TCC	2	6	48861	48866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292653622
1100	NC_013966	GAA	2	6	48883	48888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292653622
1101	NC_013966	ACG	2	6	48890	48895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653622
1102	NC_013966	CTT	2	6	48905	48910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292653622
1103	NC_013966	TTC	2	6	49023	49028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292653622
1104	NC_013966	TC	3	6	49033	49038	0 %	50 %	0 %	50 %	292653622
1105	NC_013966	CAAC	2	8	49053	49060	50 %	0 %	0 %	50 %	292653622
1106	NC_013966	GTC	2	6	49064	49069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653622
1107	NC_013966	CAG	2	6	49142	49147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653622
1108	NC_013966	ATC	2	6	49187	49192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292653622
1109	NC_013966	TCA	2	6	49245	49250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292653622
1110	NC_013966	AGA	2	6	49305	49310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292653622
1111	NC_013966	CG	3	6	49313	49318	0 %	0 %	50 %	50 %	292653622
1112	NC_013966	TCA	2	6	49367	49372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292653622
1113	NC_013966	CGCT	2	8	49390	49397	0 %	25 %	25 %	50 %	292653622
1114	NC_013966	GTTC	2	8	49475	49482	0 %	50 %	25 %	25 %	292653622
1115	NC_013966	TGG	2	6	49490	49495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292653622
1116	NC_013966	CT	3	6	49548	49553	0 %	50 %	0 %	50 %	292653622
1117	NC_013966	ACTC	2	8	49567	49574	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1118	NC_013966	CCT	2	6	49585	49590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1119	NC_013966	CCA	2	6	49672	49677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1120	NC_013966	AAT	2	6	49686	49691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_013966	GTA	2	6	49719	49724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_013966	GA	3	6	49779	49784	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_013966	CT	3	6	49820	49825	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1124	NC_013966	CCA	2	6	49885	49890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1125	NC_013966	CCCAA	2	10	49911	49920	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
1126	NC_013966	TGAT	2	8	50048	50055	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_013966	TTG	2	6	50065	50070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_013966	ATG	2	6	50082	50087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_013966	TACA	2	8	50096	50103	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1130	NC_013966	CAA	2	6	50167	50172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_013966	GCC	2	6	50202	50207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1132	NC_013966	TCG	2	6	50232	50237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_013966	CGG	2	6	50266	50271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_013966	CAGTC	2	10	50288	50297	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1135	NC_013966	GAC	2	6	50337	50342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_013966	CTG	2	6	50400	50405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1137	NC_013966	CGA	2	6	50446	50451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1138	NC_013966	GGC	2	6	50594	50599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1139	NC_013966	GCAAA	2	10	50678	50687	60 %	0 %	20 %	20 %	292653623
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1254	NC_013966	GGA	2	6	56546	56551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292653629
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1363	NC_013966	CA	3	6	61334	61339	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1364	NC_013966	TCGC	2	8	61341	61348	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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1372	NC_013966	CCT	2	6	61719	61724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292653633
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1500	NC_013966	GA	3	6	66364	66369	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

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