MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloferax volcanii DS2 plasmid pHV4

Total Repeats: 16271

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_013966	CGC	2	6	477808	477813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654016
11502	NC_013966	C	6	6	477840	477845	0 %	0 %	0 %	100 %	292654016
11503	NC_013966	ACT	2	6	477856	477861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292654016
11504	NC_013966	ACCG	2	8	477876	477883	25 %	0 %	25 %	50 %	292654016
11505	NC_013966	CGA	2	6	477917	477922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654016
11506	NC_013966	TTC	2	6	477928	477933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292654016
11507	NC_013966	GTC	2	6	477980	477985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654016
11508	NC_013966	CGGTC	2	10	478004	478013	0 %	20 %	40 %	40 %	292654016
11509	NC_013966	GC	3	6	478022	478027	0 %	0 %	50 %	50 %	292654016
11510	NC_013966	CGA	2	6	478060	478065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654016
11511	NC_013966	AGG	2	6	478120	478125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654016
11512	NC_013966	CGT	2	6	478166	478171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654016
11513	NC_013966	CCT	2	6	478175	478180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292654016
11514	NC_013966	CCA	2	6	478223	478228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292654016
11515	NC_013966	ACG	2	6	478297	478302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654016
11516	NC_013966	AGAC	2	8	478316	478323	50 %	0 %	25 %	25 %	292654016
11517	NC_013966	CGAC	2	8	478378	478385	25 %	0 %	25 %	50 %	292654016
11518	NC_013966	CCG	2	6	478443	478448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654016
11519	NC_013966	GGA	3	9	478454	478462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654016
11520	NC_013966	GA	3	6	478465	478470	50 %	0 %	50 %	0 %	292654016
11521	NC_013966	CGG	2	6	478529	478534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654016
11522	NC_013966	CGGC	2	8	478608	478615	0 %	0 %	50 %	50 %	292654017
11523	NC_013966	GC	3	6	478614	478619	0 %	0 %	50 %	50 %	292654017
11524	NC_013966	CGC	3	9	478617	478625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654017
11525	NC_013966	TCG	2	6	478692	478697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654017
11526	NC_013966	TCC	2	6	478704	478709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292654017
11527	NC_013966	CGC	2	6	478731	478736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654017
11528	NC_013966	GCC	2	6	478739	478744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654017
11529	NC_013966	GCC	2	6	478769	478774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654017
11530	NC_013966	C	6	6	478862	478867	0 %	0 %	0 %	100 %	292654017
11531	NC_013966	CGT	2	6	478873	478878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654017
11532	NC_013966	CGC	2	6	478909	478914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654017
11533	NC_013966	CCG	2	6	478936	478941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654017
11534	NC_013966	CGG	2	6	478945	478950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654017
11535	NC_013966	TCG	2	6	478953	478958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654017
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11537	NC_013966	CGA	2	6	479008	479013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654017
11538	NC_013966	CGG	2	6	479056	479061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654017
11539	NC_013966	TTC	2	6	479072	479077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292654017
11540	NC_013966	CGA	2	6	479089	479094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654017
11541	NC_013966	GACC	2	8	479107	479114	25 %	0 %	25 %	50 %	292654017
11542	NC_013966	CGACG	2	10	479155	479164	20 %	0 %	40 %	40 %	292654017
11543	NC_013966	ACG	3	9	479199	479207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654017
11544	NC_013966	CGACT	2	10	479237	479246	20 %	20 %	20 %	40 %	292654017
11545	NC_013966	CG	3	6	479249	479254	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11546	NC_013966	CG	3	6	479288	479293	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11547	NC_013966	GGT	2	6	479301	479306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11548	NC_013966	GAA	2	6	479316	479321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11549	NC_013966	GGAG	2	8	479331	479338	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
11550	NC_013966	GACC	2	8	479359	479366	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11551	NC_013966	TCG	2	6	479394	479399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654018
11552	NC_013966	TCGGCG	2	12	479421	479432	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	292654018
11553	NC_013966	GCG	2	6	479487	479492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654018
11554	NC_013966	CGG	2	6	479506	479511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654018
11555	NC_013966	CTC	2	6	479528	479533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292654018
11556	NC_013966	CACGTC	2	12	479588	479599	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	292654018
11557	NC_013966	GTC	3	9	479606	479614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654018
11558	NC_013966	ACG	2	6	479667	479672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654018
11559	NC_013966	TCG	4	12	479688	479699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654018
11560	NC_013966	CGA	3	9	479704	479712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654018
11561	NC_013966	CGT	2	6	479716	479721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654018
11562	NC_013966	TGG	2	6	479754	479759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292654018
11563	NC_013966	TGCG	2	8	479784	479791	0 %	25 %	50 %	25 %	292654018
11564	NC_013966	CGT	2	6	479888	479893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654018
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11567	NC_013966	CCG	3	9	479943	479951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654018
11568	NC_013966	ACG	2	6	480055	480060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11569	NC_013966	GC	3	6	480065	480070	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11570	NC_013966	CGAC	2	8	480151	480158	25 %	0 %	25 %	50 %	292654019
11571	NC_013966	CGC	3	9	480163	480171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654019
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11582	NC_013966	GTTCG	2	10	480772	480781	0 %	40 %	40 %	20 %	292654019
11583	NC_013966	CTG	2	6	480853	480858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654019
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11588	NC_013966	GCCG	2	8	481061	481068	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11589	NC_013966	GCG	2	6	481142	481147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654020
11590	NC_013966	TCA	2	6	481159	481164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292654020
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11592	NC_013966	CAG	2	6	481196	481201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654020
11593	NC_013966	GCG	2	6	481236	481241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654020
11594	NC_013966	CGG	2	6	481246	481251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654020
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11596	NC_013966	TCAC	2	8	481346	481353	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11597	NC_013966	CTCGC	2	10	481402	481411	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
11598	NC_013966	TCGG	2	8	481421	481428	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11599	NC_013966	CG	3	6	481454	481459	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11600	NC_013966	AGCG	2	8	481521	481528	25 %	0 %	50 %	25 %	292654021
11601	NC_013966	CGA	2	6	481545	481550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654021
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11603	NC_013966	CGC	2	6	481575	481580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654021
11604	NC_013966	GGGCC	2	10	481581	481590	0 %	0 %	60 %	40 %	292654021
11605	NC_013966	GTA	2	6	481600	481605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292654021
11606	NC_013966	GGATG	2	10	481632	481641	20 %	20 %	60 %	0 %	292654021
11607	NC_013966	GC	3	6	481653	481658	0 %	0 %	50 %	50 %	292654021
11608	NC_013966	CGA	3	9	481674	481682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654021
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11610	NC_013966	GCCG	2	8	481741	481748	0 %	0 %	50 %	50 %	292654021
11611	NC_013966	TCC	2	6	481790	481795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292654021
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11615	NC_013966	TGG	3	9	481994	482002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292654021
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11617	NC_013966	AC	3	6	482124	482129	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11618	NC_013966	GCTC	2	8	482196	482203	0 %	25 %	25 %	50 %	292654022
11619	NC_013966	CGT	2	6	482225	482230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654022
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11621	NC_013966	CGG	2	6	482262	482267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654022
11622	NC_013966	TCG	2	6	482317	482322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654022
11623	NC_013966	ACG	2	6	482327	482332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654022
11624	NC_013966	TCG	2	6	482386	482391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654022
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11626	NC_013966	TCG	2	6	482407	482412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654022
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11652	NC_013966	CGTA	2	8	483202	483209	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11653	NC_013966	TCG	2	6	483212	483217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11657	NC_013966	TAT	2	6	483341	483346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11731	NC_013966	CGAC	2	8	485779	485786	25 %	0 %	25 %	50 %	292654025
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11739	NC_013966	TCG	3	9	486073	486081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654025
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11985	NC_013966	ACCG	2	8	494449	494456	25 %	0 %	25 %	50 %	292654030
11986	NC_013966	CGC	2	6	494457	494462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654030
11987	NC_013966	CTT	2	6	494466	494471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292654030
11988	NC_013966	CGA	2	6	494472	494477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654030
11989	NC_013966	TCC	2	6	494486	494491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292654030
11990	NC_013966	CGG	2	6	494498	494503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654030
11991	NC_013966	CGCC	2	8	494510	494517	0 %	0 %	25 %	75 %	292654030
11992	NC_013966	CGACC	2	10	494532	494541	20 %	0 %	20 %	60 %	292654030
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11998	NC_013966	CGC	2	6	494736	494741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654030
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12000	NC_013966	GCG	2	6	494788	494793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654030

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