MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloferax volcanii DS2 plasmid pHV4

Total Repeats: 16271

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_013966	CGC	2	6	225713	225718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653779
5502	NC_013966	CCGC	2	8	225728	225735	0 %	0 %	25 %	75 %	292653779
5503	NC_013966	CCG	2	6	225764	225769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653779
5504	NC_013966	CGA	2	6	225780	225785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653779
5505	NC_013966	CGG	2	6	225794	225799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653779
5506	NC_013966	GA	3	6	225803	225808	50 %	0 %	50 %	0 %	292653779
5507	NC_013966	CG	3	6	225868	225873	0 %	0 %	50 %	50 %	292653779
5508	NC_013966	CGC	2	6	225879	225884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653779
5509	NC_013966	CGAC	2	8	225894	225901	25 %	0 %	25 %	50 %	292653779
5510	NC_013966	GTC	2	6	225955	225960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653779
5511	NC_013966	GTC	2	6	226027	226032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653779
5512	NC_013966	CGC	2	6	226034	226039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653779
5513	NC_013966	GAG	2	6	226042	226047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292653779
5514	NC_013966	GCC	2	6	226066	226071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653779
5515	NC_013966	CGA	2	6	226074	226079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653779
5516	NC_013966	TCG	4	12	226082	226093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653779
5517	NC_013966	CGG	3	9	226140	226148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653779
5518	NC_013966	GTC	2	6	226161	226166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653779
5519	NC_013966	GGCC	2	8	226176	226183	0 %	0 %	50 %	50 %	292653779
5520	NC_013966	TCG	2	6	226201	226206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653779
5521	NC_013966	GGGCC	2	10	226213	226222	0 %	0 %	60 %	40 %	292653779
5522	NC_013966	GTC	2	6	226248	226253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653780
5523	NC_013966	GC	4	8	226255	226262	0 %	0 %	50 %	50 %	292653780
5524	NC_013966	TCA	2	6	226270	226275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292653780
5525	NC_013966	ACG	2	6	226312	226317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653780
5526	NC_013966	ACG	2	6	226345	226350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653780
5527	NC_013966	TTC	2	6	226368	226373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292653780
5528	NC_013966	CGC	2	6	226430	226435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653780
5529	NC_013966	CCG	2	6	226441	226446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653780
5530	NC_013966	GAT	2	6	226448	226453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292653780
5531	NC_013966	CGT	2	6	226469	226474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653780
5532	NC_013966	CGA	2	6	226478	226483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653780
5533	NC_013966	GTG	2	6	226494	226499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292653780
5534	NC_013966	CGG	2	6	226531	226536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653780
5535	NC_013966	GGCC	2	8	226580	226587	0 %	0 %	50 %	50 %	292653780
5536	NC_013966	GAG	2	6	226614	226619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292653780
5537	NC_013966	CTG	2	6	226653	226658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653780
5538	NC_013966	GCC	2	6	226677	226682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653780
5539	NC_013966	GGC	2	6	226691	226696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653780
5540	NC_013966	ACG	2	6	226741	226746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653780
5541	NC_013966	TCC	2	6	226750	226755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292653780
5542	NC_013966	GCC	2	6	226767	226772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653780
5543	NC_013966	GTC	2	6	226781	226786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653780
5544	NC_013966	CGA	2	6	226793	226798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653780
5545	NC_013966	CGC	2	6	226844	226849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653780
5546	NC_013966	CGA	2	6	226856	226861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653780
5547	NC_013966	CGT	2	6	226897	226902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653780
5548	NC_013966	GTC	2	6	226914	226919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653780
5549	NC_013966	CGT	2	6	226994	226999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653780
5550	NC_013966	CGG	2	6	227072	227077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653780
5551	NC_013966	AGG	2	6	227086	227091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292653780
5552	NC_013966	CGA	2	6	227126	227131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653780
5553	NC_013966	TCG	2	6	227173	227178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653780
5554	NC_013966	GCG	2	6	227202	227207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653780
5555	NC_013966	CGA	3	9	227213	227221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653780
5556	NC_013966	GCC	2	6	227262	227267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653780
5557	NC_013966	TCG	2	6	227275	227280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653780
5558	NC_013966	CG	3	6	227328	227333	0 %	0 %	50 %	50 %	292653781
5559	NC_013966	GTCT	2	8	227404	227411	0 %	50 %	25 %	25 %	292653781
5560	NC_013966	ACG	2	6	227417	227422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653781
5561	NC_013966	TAC	2	6	227455	227460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292653781
5562	NC_013966	GCG	2	6	227461	227466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653781
5563	NC_013966	ACC	2	6	227483	227488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292653781
5564	NC_013966	CTC	2	6	227497	227502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292653781
5565	NC_013966	CGG	2	6	227503	227508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653781
5566	NC_013966	TCG	2	6	227569	227574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653781
5567	NC_013966	GAGCC	2	10	227590	227599	20 %	0 %	40 %	40 %	292653781
5568	NC_013966	G	8	8	227713	227720	0 %	0 %	100 %	0 %	292653781
5569	NC_013966	CGA	2	6	227757	227762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653781
5570	NC_013966	CCGAA	2	10	227775	227784	40 %	0 %	20 %	40 %	292653781
5571	NC_013966	CG	3	6	227786	227791	0 %	0 %	50 %	50 %	292653781
5572	NC_013966	TCG	2	6	227819	227824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653781
5573	NC_013966	GCC	2	6	227828	227833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653781
5574	NC_013966	CAC	2	6	227836	227841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292653781
5575	NC_013966	ACC	2	6	227870	227875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292653781
5576	NC_013966	ACG	2	6	227894	227899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653781
5577	NC_013966	CGA	3	9	227961	227969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653781
5578	NC_013966	TCG	2	6	227972	227977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653781
5579	NC_013966	CGCTGA	2	12	227984	227995	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	292653781
5580	NC_013966	CGA	2	6	228030	228035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653781
5581	NC_013966	ACG	2	6	228080	228085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653781
5582	NC_013966	TGA	2	6	228089	228094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292653781
5583	NC_013966	CCG	2	6	228144	228149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653781
5584	NC_013966	CCG	2	6	228156	228161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653781
5585	NC_013966	TCG	2	6	228164	228169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653781
5586	NC_013966	ACT	2	6	228212	228217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292653781
5587	NC_013966	CGA	2	6	228255	228260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653781
5588	NC_013966	CGA	2	6	228267	228272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653781
5589	NC_013966	CGAC	2	8	228287	228294	25 %	0 %	25 %	50 %	292653781
5590	NC_013966	ACC	2	6	228301	228306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292653781
5591	NC_013966	CCG	2	6	228317	228322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653781
5592	NC_013966	ACT	2	6	228332	228337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292653781
5593	NC_013966	CT	5	10	228336	228345	0 %	50 %	0 %	50 %	292653781
5594	NC_013966	TCG	2	6	228363	228368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653781
5595	NC_013966	AG	3	6	228431	228436	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5596	NC_013966	CAAC	2	8	228456	228463	50 %	0 %	0 %	50 %	292653782
5597	NC_013966	CGA	2	6	228482	228487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653782
5598	NC_013966	CGA	2	6	228530	228535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653782
5599	NC_013966	CGCGAC	2	12	228552	228563	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	292653782
5600	NC_013966	AGC	2	6	228594	228599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653782
5601	NC_013966	TCA	2	6	228658	228663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292653782
5602	NC_013966	CCGC	2	8	228683	228690	0 %	0 %	25 %	75 %	292653782
5603	NC_013966	CGG	2	6	228793	228798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653782
5604	NC_013966	CGA	2	6	228809	228814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653782
5605	NC_013966	TCG	2	6	228838	228843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653782
5606	NC_013966	CCAGG	2	10	228848	228857	20 %	0 %	40 %	40 %	292653782
5607	NC_013966	CTC	2	6	228981	228986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292653782
5608	NC_013966	CCG	2	6	229030	229035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653782
5609	NC_013966	TGC	2	6	229042	229047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653782
5610	NC_013966	CGA	2	6	229049	229054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653782
5611	NC_013966	GAC	2	6	229074	229079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653782
5612	NC_013966	ACT	2	6	229093	229098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292653782
5613	NC_013966	GTT	2	6	229154	229159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292653782
5614	NC_013966	CGA	2	6	229184	229189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653782
5615	NC_013966	TCG	2	6	229225	229230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653782
5616	NC_013966	GACC	2	8	229241	229248	25 %	0 %	25 %	50 %	292653782
5617	NC_013966	GCG	2	6	229249	229254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653782
5618	NC_013966	GGT	2	6	229255	229260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292653782
5619	NC_013966	ACC	2	6	229303	229308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292653782
5620	NC_013966	GTC	2	6	229350	229355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653782
5621	NC_013966	ACG	2	6	229369	229374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653782
5622	NC_013966	CGCT	2	8	229378	229385	0 %	25 %	25 %	50 %	292653782
5623	NC_013966	CGA	2	6	229418	229423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653782
5624	NC_013966	GC	3	6	229429	229434	0 %	0 %	50 %	50 %	292653782
5625	NC_013966	CGA	2	6	229442	229447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653782
5626	NC_013966	GC	3	6	229532	229537	0 %	0 %	50 %	50 %	292653782
5627	NC_013966	CGTCC	2	10	229565	229574	0 %	20 %	20 %	60 %	292653782
5628	NC_013966	GGT	2	6	229633	229638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292653782
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5632	NC_013966	AGT	2	6	229831	229836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5633	NC_013966	CGACC	2	10	229871	229880	20 %	0 %	20 %	60 %	292653783
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5643	NC_013966	GTCG	2	8	230098	230105	0 %	25 %	50 %	25 %	292653784
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5671	NC_013966	ACCG	2	8	231153	231160	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5672	NC_013966	ACCG	2	8	231177	231184	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5673	NC_013966	ACC	2	6	231188	231193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5674	NC_013966	CACGAC	2	12	231200	231211	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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5728	NC_013966	CTTCG	2	10	233043	233052	0 %	40 %	20 %	40 %	292653788
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5740	NC_013966	CGT	2	6	233332	233337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653788
5741	NC_013966	CGCC	2	8	233388	233395	0 %	0 %	25 %	75 %	292653788
5742	NC_013966	CTT	2	6	233425	233430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292653788
5743	NC_013966	CCCG	2	8	233437	233444	0 %	0 %	25 %	75 %	292653788
5744	NC_013966	TCCCG	2	10	233459	233468	0 %	20 %	20 %	60 %	292653788
5745	NC_013966	CGA	2	6	233518	233523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653788
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5748	NC_013966	CAG	2	6	233606	233611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653788
5749	NC_013966	GC	3	6	233634	233639	0 %	0 %	50 %	50 %	292653788
5750	NC_013966	CGA	4	12	233668	233679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653788
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5754	NC_013966	CCA	2	6	233833	233838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292653788
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5840	NC_013966	CGG	2	6	236752	236757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5841	NC_013966	AGT	2	6	236818	236823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5847	NC_013966	CGCCTC	2	12	237061	237072	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	292653793
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5849	NC_013966	GCG	2	6	237116	237121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653793
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5852	NC_013966	CCT	2	6	237180	237185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292653793
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5854	NC_013966	GAG	2	6	237241	237246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292653793
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5857	NC_013966	TCGAGG	2	12	237446	237457	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	292653794
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5859	NC_013966	CTC	2	6	237481	237486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292653794
5860	NC_013966	TCC	2	6	237488	237493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292653794
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5862	NC_013966	CGT	2	6	237618	237623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653794
5863	NC_013966	CGT	2	6	237626	237631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653794
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5980	NC_013966	ATCAA	2	10	243014	243023	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5981	NC_013966	TTC	2	6	243039	243044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5982	NC_013966	TCG	2	6	243082	243087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653799
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5984	NC_013966	GAATC	2	10	243134	243143	40 %	20 %	20 %	20 %	292653799
5985	NC_013966	TCG	2	6	243151	243156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653799
5986	NC_013966	TCG	2	6	243181	243186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653799
5987	NC_013966	GAC	2	6	243198	243203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653799
5988	NC_013966	GTC	3	9	243204	243212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653799
5989	NC_013966	TCG	2	6	243247	243252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653799
5990	NC_013966	ACC	2	6	243262	243267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292653799
5991	NC_013966	GCA	2	6	243274	243279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653799
5992	NC_013966	CGA	2	6	243293	243298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653799
5993	NC_013966	TCG	2	6	243334	243339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653799
5994	NC_013966	AACG	2	8	243495	243502	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5995	NC_013966	AGA	2	6	243508	243513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5996	NC_013966	TA	3	6	243541	243546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5997	NC_013966	TGAA	2	8	243550	243557	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5998	NC_013966	AGA	2	6	243591	243596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5999	NC_013966	CAG	2	6	243638	243643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6000	NC_013966	AGG	2	6	243653	243658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

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