MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Helicobacter mustelae 12198 chromosome

Total Repeats: 1198

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013949	TCAAA	2	10	72	81	60 %	20 %	0 %	20 %	291276244
2	NC_013949	CAAAA	2	10	1339	1348	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_013949	AAAGG	2	10	5754	5763	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013949	TAGGA	2	10	6379	6388	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013949	ACAAA	2	10	7619	7628	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_013949	TTTTA	2	10	7634	7643	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013949	ATGCG	2	10	8916	8925	20 %	20 %	40 %	20 %	291276251
8	NC_013949	TGTGG	2	10	9314	9323	0 %	40 %	60 %	0 %	291276252
9	NC_013949	TCTTG	2	10	12549	12558	0 %	60 %	20 %	20 %	291276256
10	NC_013949	TGATT	2	10	13137	13146	20 %	60 %	20 %	0 %	291276257
11	NC_013949	AGAAA	2	10	13595	13604	80 %	0 %	20 %	0 %	291276258
12	NC_013949	TTTCT	2	10	14573	14582	0 %	80 %	0 %	20 %	291276258
13	NC_013949	ATGCT	2	10	15516	15525	20 %	40 %	20 %	20 %	291276259
14	NC_013949	ATCAA	2	10	22019	22028	60 %	20 %	0 %	20 %	291276260
15	NC_013949	CTTTT	2	10	22535	22544	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_013949	CCAAG	2	10	22725	22734	40 %	0 %	20 %	40 %	291276261
17	NC_013949	TGCAT	2	10	22877	22886	20 %	40 %	20 %	20 %	291276261
18	NC_013949	TGGAA	2	10	24591	24600	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013949	GCTTG	2	10	24669	24678	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_013949	CCATA	2	10	25904	25913	40 %	20 %	0 %	40 %	291276264
21	NC_013949	ATTGA	2	10	26093	26102	40 %	40 %	20 %	0 %	291276264
22	NC_013949	GTTTT	2	10	26343	26352	0 %	80 %	20 %	0 %	291276264
23	NC_013949	TTGTT	2	10	26418	26427	0 %	80 %	20 %	0 %	291276264
24	NC_013949	TTGTT	2	10	26855	26864	0 %	80 %	20 %	0 %	291276265
25	NC_013949	TTTGG	2	10	27003	27012	0 %	60 %	40 %	0 %	291276265
26	NC_013949	AAAAC	2	10	27042	27051	80 %	0 %	0 %	20 %	291276265
27	NC_013949	TCCCT	2	10	29892	29901	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
28	NC_013949	TGCAA	2	10	32161	32170	40 %	20 %	20 %	20 %	291276268
29	NC_013949	TGATG	2	10	33203	33212	20 %	40 %	40 %	0 %	291276270
30	NC_013949	ATTTT	2	10	34894	34903	20 %	80 %	0 %	0 %	291276272
31	NC_013949	TTATG	2	10	36747	36756	20 %	60 %	20 %	0 %	291276274
32	NC_013949	AGGTG	2	10	37190	37199	20 %	20 %	60 %	0 %	291276275
33	NC_013949	TCGTG	2	10	37316	37325	0 %	40 %	40 %	20 %	291276275
34	NC_013949	TCGCA	2	10	37958	37967	20 %	20 %	20 %	40 %	291276275
35	NC_013949	ATTTT	2	10	38540	38549	20 %	80 %	0 %	0 %	291276276
36	NC_013949	CTTTG	2	10	41074	41083	0 %	60 %	20 %	20 %	291276277
37	NC_013949	TGGAT	2	10	42151	42160	20 %	40 %	40 %	0 %	291276278
38	NC_013949	GATGT	2	10	50441	50450	20 %	40 %	40 %	0 %	291276286
39	NC_013949	AAAGG	2	10	51268	51277	60 %	0 %	40 %	0 %	291276287
40	NC_013949	TGGAT	2	10	51462	51471	20 %	40 %	40 %	0 %	291276287
41	NC_013949	ACTCC	2	10	53271	53280	20 %	20 %	0 %	60 %	291276289
42	NC_013949	CCCCA	2	10	55033	55042	20 %	0 %	0 %	80 %	291276290
43	NC_013949	TTTTG	2	10	57211	57220	0 %	80 %	20 %	0 %	291276292
44	NC_013949	TTTTA	2	10	59521	59530	20 %	80 %	0 %	0 %	291276294
45	NC_013949	TTTTG	2	10	63709	63718	0 %	80 %	20 %	0 %	291276297
46	NC_013949	CCCCT	2	10	64638	64647	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
47	NC_013949	CAGCC	2	10	65995	66004	20 %	0 %	20 %	60 %	291276298
48	NC_013949	GGTGG	2	10	67555	67564	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013949	CCAAA	2	10	70609	70618	60 %	0 %	0 %	40 %	291276300
50	NC_013949	AGCTT	2	10	70881	70890	20 %	40 %	20 %	20 %	291276300
51	NC_013949	ACAAA	2	10	71500	71509	80 %	0 %	0 %	20 %	291276300
52	NC_013949	TTGTT	2	10	72519	72528	0 %	80 %	20 %	0 %	291276301
53	NC_013949	TTTGG	2	10	73409	73418	0 %	60 %	40 %	0 %	291276301
54	NC_013949	AATGC	2	10	75432	75441	40 %	20 %	20 %	20 %	291276301
55	NC_013949	GCATC	2	10	75448	75457	20 %	20 %	20 %	40 %	291276301
56	NC_013949	GAAAT	2	10	75660	75669	60 %	20 %	20 %	0 %	291276301
57	NC_013949	ATTGC	2	10	76881	76890	20 %	40 %	20 %	20 %	291276301
58	NC_013949	TTTAA	2	10	77570	77579	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013949	ATGTT	2	10	78566	78575	20 %	60 %	20 %	0 %	291276302
60	NC_013949	CCAAA	2	10	81726	81735	60 %	0 %	0 %	40 %	291276302
61	NC_013949	AGCTT	2	10	81998	82007	20 %	40 %	20 %	20 %	291276302
62	NC_013949	ACAAA	2	10	82617	82626	80 %	0 %	0 %	20 %	291276302
63	NC_013949	AACTC	2	10	84355	84364	40 %	20 %	0 %	40 %	291276303
64	NC_013949	GGGGA	2	10	86801	86810	20 %	0 %	80 %	0 %	291276304
65	NC_013949	ATAAA	2	10	88244	88253	80 %	20 %	0 %	0 %	291276305
66	NC_013949	TAGAG	2	10	89313	89322	40 %	20 %	40 %	0 %	291276305
67	NC_013949	AGCCA	2	10	91157	91166	40 %	0 %	20 %	40 %	291276307
68	NC_013949	AAAAC	2	10	91169	91178	80 %	0 %	0 %	20 %	291276307
69	NC_013949	AGGGG	2	10	92059	92068	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013949	AAAAT	2	10	92323	92332	80 %	20 %	0 %	0 %	291276309
71	NC_013949	ATCAA	2	10	96559	96568	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_013949	CCAAT	2	10	96624	96633	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
73	NC_013949	TCAGG	2	10	97014	97023	20 %	20 %	40 %	20 %	291276312
74	NC_013949	ATATT	2	10	98867	98876	40 %	60 %	0 %	0 %	291276312
75	NC_013949	GCTTT	2	10	99766	99775	0 %	60 %	20 %	20 %	291276313
76	NC_013949	TTTTG	2	10	100251	100260	0 %	80 %	20 %	0 %	291276313
77	NC_013949	AGAGG	2	10	105206	105215	40 %	0 %	60 %	0 %	291276318
78	NC_013949	GGGAA	2	10	108534	108543	40 %	0 %	60 %	0 %	291276323
79	NC_013949	GCTTG	2	10	112280	112289	0 %	40 %	40 %	20 %	291276326
80	NC_013949	TGTGC	2	10	112357	112366	0 %	40 %	40 %	20 %	291276326
81	NC_013949	GAGAA	2	10	115933	115942	60 %	0 %	40 %	0 %	291276329
82	NC_013949	GCGGT	2	10	116725	116734	0 %	20 %	60 %	20 %	291276330
83	NC_013949	GACAA	2	10	118640	118649	60 %	0 %	20 %	20 %	291276332
84	NC_013949	TGGGG	2	10	119039	119048	0 %	20 %	80 %	0 %	291276333
85	NC_013949	CTACC	2	10	119827	119836	20 %	20 %	0 %	60 %	291276334
86	NC_013949	CTCCA	2	10	120296	120305	20 %	20 %	0 %	60 %	291276334
87	NC_013949	TTATC	2	10	120993	121002	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_013949	ATTTA	2	10	121082	121091	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013949	TTCTG	2	10	121813	121822	0 %	60 %	20 %	20 %	291276335
90	NC_013949	AGGTC	2	10	122173	122182	20 %	20 %	40 %	20 %	291276335
91	NC_013949	AACCC	2	10	122495	122504	40 %	0 %	0 %	60 %	291276335
92	NC_013949	CTTTG	2	10	123046	123055	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_013949	TTTGT	2	10	123660	123669	0 %	80 %	20 %	0 %	291276338
94	NC_013949	CTTTG	2	10	124514	124523	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_013949	ATTTT	2	10	124758	124767	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013949	TCGTG	2	10	125946	125955	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
97	NC_013949	TTCTA	2	10	128147	128156	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_013949	AGATG	2	10	128760	128769	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013949	TTGAA	2	10	128994	129003	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013949	CTTTT	2	10	132413	132422	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_013949	TCTCT	2	10	132433	132442	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
102	NC_013949	TTATT	2	10	132466	132475	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013949	GGATG	2	10	132765	132774	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013949	CATTG	2	10	134147	134156	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_013949	TATAA	2	10	134501	134510	60 %	40 %	0 %	0 %	291276340
106	NC_013949	TGAAA	2	10	135222	135231	60 %	20 %	20 %	0 %	291276341
107	NC_013949	CACCG	2	10	136468	136477	20 %	0 %	20 %	60 %	291276342
108	NC_013949	TGGGG	2	10	136717	136726	0 %	20 %	80 %	0 %	291276342
109	NC_013949	GTTTG	2	10	139300	139309	0 %	60 %	40 %	0 %	291276346
110	NC_013949	TCCGC	2	10	144872	144881	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
111	NC_013949	ATTTT	2	10	145003	145012	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013949	ATTGA	2	10	145654	145663	40 %	40 %	20 %	0 %	291276354
113	NC_013949	TTGCT	2	10	149007	149016	0 %	60 %	20 %	20 %	291276354
114	NC_013949	GGGCT	2	10	149538	149547	0 %	20 %	60 %	20 %	291276354
115	NC_013949	TGGTT	2	10	150642	150651	0 %	60 %	40 %	0 %	291276354
116	NC_013949	AGTGC	2	10	150881	150890	20 %	20 %	40 %	20 %	291276354
117	NC_013949	TTGCT	2	10	154162	154171	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_013949	GAGCA	2	10	155629	155638	40 %	0 %	40 %	20 %	291276355
119	NC_013949	TCAAT	2	10	160095	160104	40 %	40 %	0 %	20 %	291276355
120	NC_013949	TCTCT	2	10	160518	160527	0 %	60 %	0 %	40 %	291276356
121	NC_013949	TGTCT	2	10	160613	160622	0 %	60 %	20 %	20 %	291276356
122	NC_013949	AGGCC	2	10	162182	162191	20 %	0 %	40 %	40 %	291276358
123	NC_013949	CTTTT	2	10	162920	162929	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_013949	TTGGG	2	10	163033	163042	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013949	CTGGG	2	10	165063	165072	0 %	20 %	60 %	20 %	291276360
126	NC_013949	TCTCA	2	10	166180	166189	20 %	40 %	0 %	40 %	291276361
127	NC_013949	GCCTA	2	10	167426	167435	20 %	20 %	20 %	40 %	291276362
128	NC_013949	CCCCA	2	10	172213	172222	20 %	0 %	0 %	80 %	291276364
129	NC_013949	GAGAT	2	10	173119	173128	40 %	20 %	40 %	0 %	291276366
130	NC_013949	AGCTC	2	10	173645	173654	20 %	20 %	20 %	40 %	291276366
131	NC_013949	CACTT	2	10	173808	173817	20 %	40 %	0 %	40 %	291276366
132	NC_013949	CTTTG	2	10	174436	174445	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
133	NC_013949	TTTTG	2	10	175145	175154	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013949	TCTTT	2	10	176164	176173	0 %	80 %	0 %	20 %	291276369
135	NC_013949	TGTAT	2	10	176443	176452	20 %	60 %	20 %	0 %	291276369
136	NC_013949	CAGCG	2	10	177393	177402	20 %	0 %	40 %	40 %	291276370
137	NC_013949	ATTGC	2	10	177905	177914	20 %	40 %	20 %	20 %	291276371
138	NC_013949	GCTCT	2	10	180701	180710	0 %	40 %	20 %	40 %	291276374
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266	NC_013949	TTTTA	2	10	367232	367241	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
267	NC_013949	TGCGA	2	10	367381	367390	20 %	20 %	40 %	20 %	291276540
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