MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Hydrogenobacter thermophilus TK-6

Total Repeats: 21017

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013799	CAA	2	6	10	15	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_013799	TGA	2	6	18	23	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013799	AGA	3	9	84	92	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013799	AGA	2	6	177	182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288817322
5	NC_013799	ACA	2	6	188	193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288817322
6	NC_013799	AAG	2	6	288	293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288817322
7	NC_013799	TGT	2	6	363	368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288817322
8	NC_013799	GAT	2	6	561	566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288817322
9	NC_013799	GAT	2	6	637	642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288817322
10	NC_013799	GAT	2	6	823	828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288817322
11	NC_013799	ATA	2	6	844	849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288817322
12	NC_013799	GGT	2	6	963	968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288817322
13	NC_013799	TGG	2	6	1019	1024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288817322
14	NC_013799	AGA	2	6	1056	1061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288817322
15	NC_013799	ATA	2	6	1090	1095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288817322
16	NC_013799	GGA	2	6	1215	1220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288817322
17	NC_013799	ATG	2	6	1252	1257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288817322
18	NC_013799	TAA	2	6	1297	1302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288817322
19	NC_013799	AGG	2	6	1307	1312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013799	TTA	2	6	1331	1336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	288817323
21	NC_013799	AGG	2	6	1496	1501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288817323
22	NC_013799	GGT	2	6	1509	1514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288817323
23	NC_013799	AGG	2	6	1580	1585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288817323
24	NC_013799	CTT	2	6	1609	1614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288817323
25	NC_013799	TGG	2	6	1658	1663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288817323
26	NC_013799	AAC	2	6	1672	1677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288817323
27	NC_013799	TGG	3	9	1754	1762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288817323
28	NC_013799	AGG	2	6	1778	1783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288817323
29	NC_013799	GCT	2	6	1963	1968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288817323
30	NC_013799	TGG	2	6	1973	1978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288817323
31	NC_013799	GAT	2	6	1990	1995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288817323
32	NC_013799	GTA	2	6	2005	2010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288817323
33	NC_013799	GAG	2	6	2167	2172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288817323
34	NC_013799	GGT	2	6	2220	2225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288817323
35	NC_013799	ATC	2	6	2309	2314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288817324
36	NC_013799	AGA	2	6	2407	2412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288817324
37	NC_013799	CTT	2	6	2588	2593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288817324
38	NC_013799	GCT	2	6	2867	2872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288817324
39	NC_013799	AGA	2	6	3087	3092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288817325
40	NC_013799	TGA	2	6	3167	3172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288817325
41	NC_013799	TAT	2	6	3179	3184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	288817325
42	NC_013799	TCC	2	6	3273	3278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288817325
43	NC_013799	ATT	2	6	3320	3325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	288817325
44	NC_013799	CTT	2	6	3463	3468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288817325
45	NC_013799	CTT	2	6	3499	3504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288817325
46	NC_013799	TTA	2	6	3514	3519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	288817325
47	NC_013799	TGA	2	6	3553	3558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288817325
48	NC_013799	GCG	2	6	3618	3623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_013799	AGG	2	6	3918	3923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288817326
50	NC_013799	GAG	2	6	3949	3954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288817326
51	NC_013799	ACA	2	6	4004	4009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288817326
52	NC_013799	AGG	2	6	4010	4015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288817326
53	NC_013799	GTG	2	6	4109	4114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288817326
54	NC_013799	TCT	2	6	4149	4154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288817326
55	NC_013799	ATA	2	6	4225	4230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288817326
56	NC_013799	TGG	2	6	4232	4237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288817326
57	NC_013799	AAG	2	6	4427	4432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288817326
58	NC_013799	AAG	2	6	4484	4489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288817326
59	NC_013799	TGG	2	6	4511	4516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288817326
60	NC_013799	GAG	2	6	4579	4584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288817326
61	NC_013799	AGG	2	6	4606	4611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288817327
62	NC_013799	AGG	2	6	4732	4737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288817327
63	NC_013799	TAG	2	6	4858	4863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288817327
64	NC_013799	TCC	2	6	4969	4974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288817327
65	NC_013799	CAT	2	6	4994	4999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288817327
66	NC_013799	ACC	2	6	5140	5145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288817327
67	NC_013799	ACC	2	6	5196	5201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288817328
68	NC_013799	CAA	2	6	5207	5212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288817328
69	NC_013799	CAA	2	6	5239	5244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288817328
70	NC_013799	GGA	2	6	5330	5335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288817328
71	NC_013799	CCA	2	6	5353	5358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288817328
72	NC_013799	AGC	2	6	5396	5401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288817328
73	NC_013799	AAG	2	6	5558	5563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288817328
74	NC_013799	GAA	2	6	5680	5685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288817328
75	NC_013799	ATA	2	6	5693	5698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288817328
76	NC_013799	CTG	2	6	5825	5830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288817328
77	NC_013799	TTA	2	6	5892	5897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	288817328
78	NC_013799	GGA	2	6	5977	5982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288817328
79	NC_013799	CAA	2	6	5998	6003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288817328
80	NC_013799	TCA	2	6	6004	6009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288817328
81	NC_013799	ACC	2	6	6047	6052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288817328
82	NC_013799	ACA	2	6	6072	6077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288817328
83	NC_013799	GCG	2	6	6156	6161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288817328
84	NC_013799	ATA	2	6	6189	6194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288817328
85	NC_013799	CAG	2	6	6251	6256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288817328
86	NC_013799	CTA	2	6	6292	6297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288817328
87	NC_013799	GCA	3	9	6414	6422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288817328
88	NC_013799	CCA	2	6	6698	6703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288817329
89	NC_013799	TCT	3	9	6825	6833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288817329
90	NC_013799	CAT	2	6	7097	7102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288817329
91	NC_013799	ATA	2	6	7132	7137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288817329
92	NC_013799	TCC	2	6	7183	7188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288817329
93	NC_013799	ATC	2	6	7266	7271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288817329
94	NC_013799	TTC	2	6	7293	7298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288817329
95	NC_013799	ACT	2	6	7309	7314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288817329
96	NC_013799	GAA	2	6	7373	7378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288817329
97	NC_013799	TCG	2	6	7384	7389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288817329
98	NC_013799	ACT	2	6	7447	7452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288817329
99	NC_013799	CTT	2	6	7580	7585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288817329
100	NC_013799	CTA	2	6	7631	7636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288817329
101	NC_013799	TCT	3	9	7761	7769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288817330
102	NC_013799	AGG	2	6	7929	7934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288817330
103	NC_013799	CTG	2	6	7978	7983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288817330
104	NC_013799	CAC	2	6	8087	8092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288817330
105	NC_013799	GTA	2	6	8105	8110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288817330
106	NC_013799	TCA	2	6	8140	8145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288817330
107	NC_013799	TTG	2	6	8218	8223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288817330
108	NC_013799	CAC	2	6	8233	8238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288817330
109	NC_013799	CTC	2	6	8246	8251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288817330
110	NC_013799	TCT	2	6	8394	8399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288817330
111	NC_013799	TCC	2	6	8548	8553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_013799	TTC	2	6	8659	8664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288817331
113	NC_013799	CAC	2	6	8756	8761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288817331
114	NC_013799	ACT	2	6	8781	8786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288817331
115	NC_013799	CTC	2	6	8942	8947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288817331
116	NC_013799	CTT	2	6	9049	9054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288817331
117	NC_013799	GCA	2	6	9178	9183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288817331
118	NC_013799	CAC	2	6	9196	9201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288817331
119	NC_013799	TAT	2	6	9284	9289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	288817331
120	NC_013799	AAT	2	6	9311	9316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288817331
121	NC_013799	CTT	2	6	9474	9479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288817332
122	NC_013799	GGA	2	6	9481	9486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288817332
123	NC_013799	AGG	2	6	9575	9580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288817332
124	NC_013799	CAC	2	6	9604	9609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288817332
125	NC_013799	CTT	2	6	9658	9663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288817332
126	NC_013799	TCC	2	6	9738	9743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288817332
127	NC_013799	CCT	2	6	9892	9897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288817332
128	NC_013799	CCT	2	6	9904	9909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288817332
129	NC_013799	CCT	2	6	10096	10101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288817333
130	NC_013799	AGG	2	6	10287	10292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288817333
131	NC_013799	GGT	2	6	10433	10438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288817333
132	NC_013799	CCT	2	6	10509	10514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288817334
133	NC_013799	TCC	2	6	10535	10540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288817334
134	NC_013799	TCC	3	9	10718	10726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288817334
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137	NC_013799	CTC	2	6	10894	10899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288817334
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141	NC_013799	CCT	2	6	11358	11363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288817334
142	NC_013799	AGG	2	6	11557	11562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288817334
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159	NC_013799	TGA	2	6	13107	13112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288817336
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252	NC_013799	TTC	2	6	20004	20009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288817340
253	NC_013799	AAT	2	6	20041	20046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288817340
254	NC_013799	TCA	2	6	20059	20064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288817340
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257	NC_013799	TCT	2	6	20238	20243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288817341
258	NC_013799	ATT	2	6	20277	20282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	288817341
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