MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 plasmid pHTUR05

Total Repeats: 239

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013748	GAAA	2	8	545	552	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013748	ACTC	2	8	902	909	25 %	25 %	0 %	50 %	284176295
3	NC_013748	GCTT	2	8	1078	1085	0 %	50 %	25 %	25 %	284176295
4	NC_013748	ACCA	2	8	1189	1196	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_013748	TAGG	2	8	1264	1271	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013748	ATCT	2	8	1298	1305	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_013748	TCGC	2	8	1764	1771	0 %	25 %	25 %	50 %	284176296
8	NC_013748	CGGT	2	8	1957	1964	0 %	25 %	50 %	25 %	284176296
9	NC_013748	GACG	2	8	2455	2462	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_013748	TCAT	2	8	3004	3011	25 %	50 %	0 %	25 %	284176297
11	NC_013748	CTAC	2	8	3635	3642	25 %	25 %	0 %	50 %	284176299
12	NC_013748	CTGG	2	8	3814	3821	0 %	25 %	50 %	25 %	284176299
13	NC_013748	AGTA	2	8	4157	4164	50 %	25 %	25 %	0 %	284176299
14	NC_013748	CAAC	2	8	4527	4534	50 %	0 %	0 %	50 %	284176300
15	NC_013748	CAAT	2	8	4750	4757	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_013748	GCGG	2	8	4882	4889	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17	NC_013748	CGGC	2	8	5680	5687	0 %	0 %	50 %	50 %	284176302
18	NC_013748	ACTG	2	8	6267	6274	25 %	25 %	25 %	25 %	284176302
19	NC_013748	ACGG	2	8	6852	6859	25 %	0 %	50 %	25 %	284176302
20	NC_013748	CGTT	2	8	6931	6938	0 %	50 %	25 %	25 %	284176302
21	NC_013748	CGTC	2	8	6945	6952	0 %	25 %	25 %	50 %	284176302
22	NC_013748	ACCT	2	8	6987	6994	25 %	25 %	0 %	50 %	284176302
23	NC_013748	ACCG	2	8	7591	7598	25 %	0 %	25 %	50 %	284176302
24	NC_013748	TCCA	2	8	7656	7663	25 %	25 %	0 %	50 %	284176302
25	NC_013748	GGTC	2	8	7703	7710	0 %	25 %	50 %	25 %	284176302
26	NC_013748	TCGA	2	8	7908	7915	25 %	25 %	25 %	25 %	284176302
27	NC_013748	CGGA	2	8	7931	7938	25 %	0 %	50 %	25 %	284176302
28	NC_013748	GTCG	2	8	8183	8190	0 %	25 %	50 %	25 %	284176302
29	NC_013748	CGAC	2	8	8221	8228	25 %	0 %	25 %	50 %	284176302
30	NC_013748	TTCG	2	8	8277	8284	0 %	50 %	25 %	25 %	284176302
31	NC_013748	CTCG	2	8	8459	8466	0 %	25 %	25 %	50 %	284176302
32	NC_013748	CATC	2	8	8615	8622	25 %	25 %	0 %	50 %	284176302
33	NC_013748	GCCA	2	8	8677	8684	25 %	0 %	25 %	50 %	284176302
34	NC_013748	GGCA	2	8	9006	9013	25 %	0 %	50 %	25 %	284176303
35	NC_013748	CGGT	2	8	9227	9234	0 %	25 %	50 %	25 %	284176303
36	NC_013748	GCCT	2	8	9910	9917	0 %	25 %	25 %	50 %	284176303
37	NC_013748	TGGC	2	8	10283	10290	0 %	25 %	50 %	25 %	284176303
38	NC_013748	TCGA	2	8	11497	11504	25 %	25 %	25 %	25 %	284176305
39	NC_013748	ACCA	2	8	11801	11808	50 %	0 %	0 %	50 %	284176305
40	NC_013748	ATTA	2	8	12972	12979	50 %	50 %	0 %	0 %	284176306
41	NC_013748	CGAC	2	8	13202	13209	25 %	0 %	25 %	50 %	284176306
42	NC_013748	CTGG	2	8	13315	13322	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_013748	GAAA	2	8	13427	13434	75 %	0 %	25 %	0 %	284176307
44	NC_013748	CAAC	2	8	13746	13753	50 %	0 %	0 %	50 %	284176307
45	NC_013748	AACC	2	8	14705	14712	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_013748	TTCA	2	8	14715	14722	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_013748	TCGA	2	8	15262	15269	25 %	25 %	25 %	25 %	284176308
48	NC_013748	GTCG	2	8	15288	15295	0 %	25 %	50 %	25 %	284176308
49	NC_013748	CACG	2	8	15405	15412	25 %	0 %	25 %	50 %	284176308
50	NC_013748	AGGC	2	8	15473	15480	25 %	0 %	50 %	25 %	284176308
51	NC_013748	ACGT	2	8	16495	16502	25 %	25 %	25 %	25 %	284176310
52	NC_013748	CCCG	2	8	16572	16579	0 %	0 %	25 %	75 %	284176310
53	NC_013748	CCCA	2	8	16723	16730	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
54	NC_013748	CAAC	2	8	16742	16749	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_013748	GAGC	2	8	16821	16828	25 %	0 %	50 %	25 %	284176311
56	NC_013748	CCGA	2	8	16983	16990	25 %	0 %	25 %	50 %	284176311
57	NC_013748	CGGC	2	8	17070	17077	0 %	0 %	50 %	50 %	284176311
58	NC_013748	TGAT	2	8	17238	17245	25 %	50 %	25 %	0 %	284176311
59	NC_013748	ACGC	2	8	17529	17536	25 %	0 %	25 %	50 %	284176312
60	NC_013748	GCTC	2	8	17561	17568	0 %	25 %	25 %	50 %	284176312
61	NC_013748	TCGA	2	8	17781	17788	25 %	25 %	25 %	25 %	284176313
62	NC_013748	CCCG	2	8	17798	17805	0 %	0 %	25 %	75 %	284176313
63	NC_013748	CACG	2	8	18208	18215	25 %	0 %	25 %	50 %	284176314
64	NC_013748	GTTC	2	8	18316	18323	0 %	50 %	25 %	25 %	284176314
65	NC_013748	TGCG	2	8	18353	18360	0 %	25 %	50 %	25 %	284176314
66	NC_013748	TGGA	2	8	19113	19120	25 %	25 %	50 %	0 %	284176315
67	NC_013748	TGGC	2	8	19147	19154	0 %	25 %	50 %	25 %	284176315
68	NC_013748	TGAC	2	8	19572	19579	25 %	25 %	25 %	25 %	284176316
69	NC_013748	GGCG	2	8	19836	19843	0 %	0 %	75 %	25 %	284176317
70	NC_013748	GACC	2	8	20042	20049	25 %	0 %	25 %	50 %	284176318
71	NC_013748	TGGA	2	8	20070	20077	25 %	25 %	50 %	0 %	284176318
72	NC_013748	GCCG	2	8	20093	20100	0 %	0 %	50 %	50 %	284176318
73	NC_013748	ATCC	2	8	20102	20109	25 %	25 %	0 %	50 %	284176318
74	NC_013748	CGAC	2	8	20270	20277	25 %	0 %	25 %	50 %	284176318
75	NC_013748	CGAC	2	8	20282	20289	25 %	0 %	25 %	50 %	284176318
76	NC_013748	GCCG	2	8	20337	20344	0 %	0 %	50 %	50 %	284176318
77	NC_013748	AACG	2	8	20992	20999	50 %	0 %	25 %	25 %	284176319
78	NC_013748	TCGG	2	8	21085	21092	0 %	25 %	50 %	25 %	284176319
79	NC_013748	ACTC	2	8	21306	21313	25 %	25 %	0 %	50 %	284176319
80	NC_013748	TTGC	2	8	21568	21575	0 %	50 %	25 %	25 %	284176320
81	NC_013748	GTCT	2	8	21577	21584	0 %	50 %	25 %	25 %	284176320
82	NC_013748	GACC	2	8	22035	22042	25 %	0 %	25 %	50 %	284176320
83	NC_013748	CGGC	2	8	22383	22390	0 %	0 %	50 %	50 %	284176320
84	NC_013748	GCGA	2	8	22527	22534	25 %	0 %	50 %	25 %	284176320
85	NC_013748	CGAA	2	8	22631	22638	50 %	0 %	25 %	25 %	284176320
86	NC_013748	ACTT	2	8	22655	22662	25 %	50 %	0 %	25 %	284176320
87	NC_013748	GCAA	2	8	22757	22764	50 %	0 %	25 %	25 %	284176320
88	NC_013748	GCCG	2	8	22782	22789	0 %	0 %	50 %	50 %	284176320
89	NC_013748	GTCG	2	8	22962	22969	0 %	25 %	50 %	25 %	284176321
90	NC_013748	CCCG	2	8	23450	23457	0 %	0 %	25 %	75 %	284176321
91	NC_013748	CCGG	2	8	23643	23650	0 %	0 %	50 %	50 %	284176321
92	NC_013748	GACC	2	8	23822	23829	25 %	0 %	25 %	50 %	284176321
93	NC_013748	CGAC	2	8	23954	23961	25 %	0 %	25 %	50 %	284176321
94	NC_013748	CGAA	2	8	24734	24741	50 %	0 %	25 %	25 %	284176322
95	NC_013748	GGCC	2	8	24815	24822	0 %	0 %	50 %	50 %	284176322
96	NC_013748	GTCG	2	8	24860	24867	0 %	25 %	50 %	25 %	284176322
97	NC_013748	AGCG	2	8	26800	26807	25 %	0 %	50 %	25 %	284176322
98	NC_013748	GCTC	2	8	26947	26954	0 %	25 %	25 %	50 %	284176323
99	NC_013748	GTCG	2	8	26990	26997	0 %	25 %	50 %	25 %	284176323
100	NC_013748	TCCG	2	8	27168	27175	0 %	25 %	25 %	50 %	284176323
101	NC_013748	CGAA	2	8	27292	27299	50 %	0 %	25 %	25 %	284176323
102	NC_013748	CGAC	2	8	27643	27650	25 %	0 %	25 %	50 %	284176323
103	NC_013748	GCGT	2	8	27703	27710	0 %	25 %	50 %	25 %	284176323
104	NC_013748	CGGT	2	8	27858	27865	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_013748	GACA	2	8	27990	27997	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_013748	CGCC	2	8	28248	28255	0 %	0 %	25 %	75 %	284176324
107	NC_013748	TCGG	2	8	29175	29182	0 %	25 %	50 %	25 %	284176324
108	NC_013748	GAAC	2	8	29220	29227	50 %	0 %	25 %	25 %	284176324
109	NC_013748	GATC	2	8	29547	29554	25 %	25 %	25 %	25 %	284176324
110	NC_013748	GACC	2	8	29753	29760	25 %	0 %	25 %	50 %	284176325
111	NC_013748	CGAT	2	8	29761	29768	25 %	25 %	25 %	25 %	284176325
112	NC_013748	CGGC	2	8	29978	29985	0 %	0 %	50 %	50 %	284176325
113	NC_013748	CTCG	2	8	30062	30069	0 %	25 %	25 %	50 %	284176325
114	NC_013748	CGAG	2	8	31036	31043	25 %	0 %	50 %	25 %	284176326
115	NC_013748	AATC	2	8	31213	31220	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_013748	TCAC	2	8	31672	31679	25 %	25 %	0 %	50 %	284176327
117	NC_013748	TGCA	2	8	31697	31704	25 %	25 %	25 %	25 %	284176327
118	NC_013748	GGAG	2	8	32039	32046	25 %	0 %	75 %	0 %	284176328
119	NC_013748	ACAT	2	8	32916	32923	50 %	25 %	0 %	25 %	284176328
120	NC_013748	TCAG	2	8	33346	33353	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_013748	TCCT	2	8	34038	34045	0 %	50 %	0 %	50 %	284176329
122	NC_013748	TATC	2	8	34126	34133	25 %	50 %	0 %	25 %	284176329
123	NC_013748	GCCT	2	8	36553	36560	0 %	25 %	25 %	50 %	284176329
124	NC_013748	GGAT	2	8	36652	36659	25 %	25 %	50 %	0 %	284176329
125	NC_013748	TCGA	2	8	37139	37146	25 %	25 %	25 %	25 %	284176330
126	NC_013748	ACTT	2	8	38379	38386	25 %	50 %	0 %	25 %	284176331
127	NC_013748	CCAT	2	8	38845	38852	25 %	25 %	0 %	50 %	284176332
128	NC_013748	TTCG	2	8	39158	39165	0 %	50 %	25 %	25 %	284176333
129	NC_013748	GCGA	2	8	39856	39863	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_013748	CGGG	2	8	39866	39873	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
131	NC_013748	GATA	2	8	40136	40143	50 %	25 %	25 %	0 %	284176337
132	NC_013748	GCGG	2	8	40218	40225	0 %	0 %	75 %	25 %	284176337
133	NC_013748	CTGT	2	8	40323	40330	0 %	50 %	25 %	25 %	284176337
134	NC_013748	GAGC	2	8	41382	41389	25 %	0 %	50 %	25 %	284176339
135	NC_013748	CGAA	2	8	41535	41542	50 %	0 %	25 %	25 %	284176340
136	NC_013748	GTCG	2	8	41896	41903	0 %	25 %	50 %	25 %	284176340
137	NC_013748	CCCA	2	8	41984	41991	25 %	0 %	0 %	75 %	284176341
138	NC_013748	GCGG	2	8	42236	42243	0 %	0 %	75 %	25 %	284176341
139	NC_013748	GTAC	2	8	42311	42318	25 %	25 %	25 %	25 %	284176341
140	NC_013748	GGCC	2	8	42329	42336	0 %	0 %	50 %	50 %	284176341
141	NC_013748	CGAG	2	8	42353	42360	25 %	0 %	50 %	25 %	284176341
142	NC_013748	GTGA	2	8	42802	42809	25 %	25 %	50 %	0 %	284176343
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.