MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 plasmid pHTUR03

Total Repeats: 388

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013746	CA	3	6	793	798	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_013746	AC	3	6	3182	3187	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_013746	AG	3	6	3318	3323	50 %	0 %	50 %	0 %	284172858
4	NC_013746	GT	3	6	3532	3537	0 %	50 %	50 %	0 %	284172858
5	NC_013746	TC	3	6	3544	3549	0 %	50 %	0 %	50 %	284172858
6	NC_013746	CA	3	6	4192	4197	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_013746	AG	3	6	5258	5263	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013746	CA	3	6	5556	5561	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_013746	TC	3	6	5909	5914	0 %	50 %	0 %	50 %	284172860
10	NC_013746	CT	3	6	6779	6784	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_013746	TC	3	6	6861	6866	0 %	50 %	0 %	50 %	284172861
12	NC_013746	TC	3	6	8274	8279	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_013746	GA	3	6	8529	8534	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013746	GA	3	6	8960	8965	50 %	0 %	50 %	0 %	284172862
15	NC_013746	GA	3	6	9072	9077	50 %	0 %	50 %	0 %	284172862
16	NC_013746	TA	3	6	9080	9085	50 %	50 %	0 %	0 %	284172862
17	NC_013746	AT	3	6	10346	10351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013746	TC	3	6	10433	10438	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_013746	GA	3	6	10478	10483	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013746	CG	3	6	10786	10791	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_013746	GA	3	6	11158	11163	50 %	0 %	50 %	0 %	284172864
22	NC_013746	TC	3	6	11323	11328	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_013746	GA	3	6	11676	11681	50 %	0 %	50 %	0 %	284172866
24	NC_013746	TC	3	6	12012	12017	0 %	50 %	0 %	50 %	284172866
25	NC_013746	GT	3	6	13632	13637	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013746	AG	3	6	14452	14457	50 %	0 %	50 %	0 %	284172868
27	NC_013746	CT	3	6	14587	14592	0 %	50 %	0 %	50 %	284172868
28	NC_013746	TC	3	6	14827	14832	0 %	50 %	0 %	50 %	284172868
29	NC_013746	GC	3	6	14894	14899	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_013746	GA	3	6	15870	15875	50 %	0 %	50 %	0 %	284172869
31	NC_013746	TC	3	6	16679	16684	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_013746	CG	3	6	16994	16999	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_013746	AG	3	6	17066	17071	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013746	AT	4	8	18662	18669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013746	TC	4	8	19017	19024	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_013746	CG	3	6	19096	19101	0 %	0 %	50 %	50 %	284172872
37	NC_013746	AG	3	6	19185	19190	50 %	0 %	50 %	0 %	284172872
38	NC_013746	GA	3	6	19664	19669	50 %	0 %	50 %	0 %	284172872
39	NC_013746	AG	3	6	20401	20406	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013746	CA	3	6	20962	20967	50 %	0 %	0 %	50 %	284172873
41	NC_013746	TC	3	6	21019	21024	0 %	50 %	0 %	50 %	284172873
42	NC_013746	GA	3	6	21025	21030	50 %	0 %	50 %	0 %	284172873
43	NC_013746	AC	3	6	21277	21282	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_013746	CA	3	6	21358	21363	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_013746	CT	3	6	22929	22934	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_013746	GC	3	6	23412	23417	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_013746	CT	3	6	24099	24104	0 %	50 %	0 %	50 %	284172875
48	NC_013746	TA	3	6	24335	24340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013746	GT	3	6	24497	24502	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013746	AC	3	6	25210	25215	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_013746	TC	3	6	25276	25281	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_013746	AT	3	6	25816	25821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013746	GC	3	6	26177	26182	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_013746	AC	3	6	26337	26342	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_013746	AC	3	6	27001	27006	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_013746	AT	3	6	27178	27183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013746	TA	3	6	27217	27222	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013746	AG	3	6	27290	27295	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013746	AC	3	6	27466	27471	50 %	0 %	0 %	50 %	284172876
60	NC_013746	GC	3	6	28047	28052	0 %	0 %	50 %	50 %	284172877
61	NC_013746	GT	3	6	28285	28290	0 %	50 %	50 %	0 %	284172878
62	NC_013746	AG	3	6	28477	28482	50 %	0 %	50 %	0 %	284172878
63	NC_013746	AG	3	6	28772	28777	50 %	0 %	50 %	0 %	284172878
64	NC_013746	TA	3	6	29108	29113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013746	GT	3	6	29452	29457	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013746	AG	3	6	29770	29775	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013746	GA	3	6	30437	30442	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013746	AG	3	6	30603	30608	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013746	AT	3	6	31368	31373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013746	TA	3	6	31579	31584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013746	CT	3	6	32150	32155	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_013746	GA	4	8	32159	32166	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013746	AT	3	6	32209	32214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013746	AG	3	6	32265	32270	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013746	GA	3	6	32447	32452	50 %	0 %	50 %	0 %	284172881
76	NC_013746	AC	3	6	33217	33222	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_013746	TA	3	6	35692	35697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013746	CG	4	8	36643	36650	0 %	0 %	50 %	50 %	284172887
79	NC_013746	AC	3	6	36832	36837	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_013746	CA	3	6	37655	37660	50 %	0 %	0 %	50 %	284172889
81	NC_013746	CG	3	6	37878	37883	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_013746	AT	3	6	37985	37990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013746	AC	3	6	38777	38782	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_013746	GA	3	6	39487	39492	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013746	CT	3	6	39765	39770	0 %	50 %	0 %	50 %	284172893
86	NC_013746	TC	3	6	40935	40940	0 %	50 %	0 %	50 %	284172894
87	NC_013746	CA	3	6	41351	41356	50 %	0 %	0 %	50 %	284172894
88	NC_013746	GA	4	8	41449	41456	50 %	0 %	50 %	0 %	284172895
89	NC_013746	GA	3	6	41655	41660	50 %	0 %	50 %	0 %	284172895
90	NC_013746	AT	3	6	41825	41830	50 %	50 %	0 %	0 %	284172895
91	NC_013746	TA	3	6	42013	42018	50 %	50 %	0 %	0 %	284172895
92	NC_013746	CA	3	6	43337	43342	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_013746	AC	3	6	44184	44189	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_013746	CT	3	6	44354	44359	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_013746	GC	3	6	44478	44483	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_013746	CT	3	6	46699	46704	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_013746	TC	3	6	47253	47258	0 %	50 %	0 %	50 %	284172900
98	NC_013746	GA	3	6	49218	49223	50 %	0 %	50 %	0 %	284172901
99	NC_013746	GT	3	6	49327	49332	0 %	50 %	50 %	0 %	284172901
100	NC_013746	AG	3	6	49979	49984	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013746	AT	3	6	51004	51009	50 %	50 %	0 %	0 %	284172904
102	NC_013746	AT	3	6	51068	51073	50 %	50 %	0 %	0 %	284172904
103	NC_013746	TC	3	6	51239	51244	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_013746	CT	3	6	51598	51603	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_013746	TC	3	6	52250	52255	0 %	50 %	0 %	50 %	284172906
106	NC_013746	CG	3	6	52379	52384	0 %	0 %	50 %	50 %	284172906
107	NC_013746	CG	3	6	52933	52938	0 %	0 %	50 %	50 %	284172906
108	NC_013746	CA	3	6	52993	52998	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_013746	CG	3	6	53092	53097	0 %	0 %	50 %	50 %	284172907
110	NC_013746	GA	3	6	53865	53870	50 %	0 %	50 %	0 %	284172908
111	NC_013746	GA	3	6	53903	53908	50 %	0 %	50 %	0 %	284172908
112	NC_013746	AG	3	6	54105	54110	50 %	0 %	50 %	0 %	284172908
113	NC_013746	GA	3	6	54373	54378	50 %	0 %	50 %	0 %	284172908
114	NC_013746	TG	3	6	54625	54630	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013746	CT	3	6	54635	54640	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_013746	TC	3	6	54792	54797	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_013746	AG	3	6	55475	55480	50 %	0 %	50 %	0 %	284172909
118	NC_013746	CT	3	6	56078	56083	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_013746	AT	3	6	56257	56262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013746	AC	3	6	57124	57129	50 %	0 %	0 %	50 %	284172911
121	NC_013746	TC	3	6	57408	57413	0 %	50 %	0 %	50 %	284172911
122	NC_013746	TA	3	6	57560	57565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013746	TG	3	6	57780	57785	0 %	50 %	50 %	0 %	284172912
124	NC_013746	TG	3	6	57968	57973	0 %	50 %	50 %	0 %	284172913
125	NC_013746	CT	3	6	58003	58008	0 %	50 %	0 %	50 %	284172913
126	NC_013746	GA	3	6	58181	58186	50 %	0 %	50 %	0 %	284172913
127	NC_013746	TC	3	6	58461	58466	0 %	50 %	0 %	50 %	284172913
128	NC_013746	CA	4	8	58709	58716	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_013746	CA	3	6	58810	58815	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_013746	AT	3	6	58907	58912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013746	AT	3	6	58940	58945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013746	TA	4	8	58951	58958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013746	TC	4	8	59205	59212	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_013746	GA	3	6	59790	59795	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013746	GA	3	6	59886	59891	50 %	0 %	50 %	0 %	284172915
136	NC_013746	GT	3	6	60690	60695	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013746	CG	3	6	61537	61542	0 %	0 %	50 %	50 %	284172917
138	NC_013746	GC	4	8	63256	63263	0 %	0 %	50 %	50 %	284172918
139	NC_013746	TA	3	6	63709	63714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013746	GT	3	6	63840	63845	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013746	AT	3	6	64148	64153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013746	TC	3	6	64325	64330	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_013746	TG	3	6	65431	65436	0 %	50 %	50 %	0 %	284172919
144	NC_013746	GC	3	6	65472	65477	0 %	0 %	50 %	50 %	284172919
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146	NC_013746	GA	4	8	66031	66038	50 %	0 %	50 %	0 %	284172919
147	NC_013746	TG	3	6	68042	68047	0 %	50 %	50 %	0 %	284172920
148	NC_013746	AC	3	6	68376	68381	50 %	0 %	0 %	50 %	284172921
149	NC_013746	AC	3	6	68387	68392	50 %	0 %	0 %	50 %	284172921
150	NC_013746	GA	3	6	69078	69083	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_013746	TC	3	6	70142	70147	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.