MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 plasmid pHTUR03

Total Repeats: 2615

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013746	TTG	2	6	32	37	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013746	CTG	2	6	328	333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_013746	CGT	2	6	378	383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_013746	CAG	2	6	406	411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172855
5	NC_013746	CGA	2	6	456	461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172855
6	NC_013746	TCG	2	6	542	547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_013746	AGC	2	6	731	736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_013746	CGA	2	6	825	830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172856
9	NC_013746	TCC	2	6	837	842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284172856
10	NC_013746	GCC	2	6	949	954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172856
11	NC_013746	GAC	3	9	970	978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172856
12	NC_013746	GAT	2	6	994	999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284172856
13	NC_013746	CTC	2	6	1021	1026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284172856
14	NC_013746	TTG	2	6	1123	1128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013746	CTC	2	6	1204	1209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_013746	TCG	2	6	1253	1258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_013746	TTC	2	6	1271	1276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_013746	TGA	2	6	1519	1524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013746	GAT	2	6	1563	1568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013746	TTG	2	6	1696	1701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013746	CTG	2	6	1708	1713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_013746	GGT	2	6	1827	1832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013746	ATC	2	6	1889	1894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_013746	GAG	2	6	1953	1958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013746	CCG	2	6	1971	1976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_013746	TTG	2	6	2014	2019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013746	GTC	2	6	2067	2072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_013746	GCA	2	6	2097	2102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_013746	CCA	2	6	2110	2115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_013746	CTG	2	6	2238	2243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172857
31	NC_013746	CCT	2	6	2272	2277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284172857
32	NC_013746	GCC	2	6	2382	2387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172857
33	NC_013746	GAG	2	6	2411	2416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284172857
34	NC_013746	GAG	2	6	2420	2425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284172857
35	NC_013746	CGC	2	6	2426	2431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172857
36	NC_013746	GTA	2	6	2452	2457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284172857
37	NC_013746	TGG	2	6	2461	2466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284172857
38	NC_013746	GCC	2	6	2485	2490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172857
39	NC_013746	TGT	2	6	2562	2567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284172857
40	NC_013746	TGC	2	6	2643	2648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172857
41	NC_013746	GTG	2	6	2837	2842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013746	AGT	2	6	2898	2903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013746	AGT	2	6	2923	2928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013746	TCG	2	6	2936	2941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_013746	GAG	2	6	3159	3164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013746	GTC	2	6	3374	3379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172858
47	NC_013746	GTC	2	6	3402	3407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172858
48	NC_013746	CTC	2	6	3410	3415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284172858
49	NC_013746	GGA	2	6	3448	3453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284172858
50	NC_013746	GTT	2	6	3461	3466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284172858
51	NC_013746	CCA	2	6	3486	3491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284172858
52	NC_013746	TGA	2	6	3639	3644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284172858
53	NC_013746	ATC	2	6	3738	3743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_013746	ATT	2	6	3816	3821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013746	TAA	2	6	4091	4096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013746	AAC	2	6	4216	4221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284172859
57	NC_013746	GAA	2	6	4291	4296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284172859
58	NC_013746	CAA	2	6	4317	4322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284172859
59	NC_013746	AGC	2	6	4350	4355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172859
60	NC_013746	TTA	2	6	4414	4419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284172859
61	NC_013746	TTC	2	6	4454	4459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284172859
62	NC_013746	ACC	2	6	4472	4477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284172859
63	NC_013746	ATT	2	6	4501	4506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284172859
64	NC_013746	ATG	2	6	4553	4558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284172859
65	NC_013746	CGA	2	6	4596	4601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172859
66	NC_013746	CGT	2	6	4644	4649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172859
67	NC_013746	GGC	2	6	4886	4891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_013746	CGG	2	6	4909	4914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_013746	CAA	3	9	4968	4976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_013746	ATT	2	6	5135	5140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013746	CAA	3	9	5318	5326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_013746	TGG	2	6	5413	5418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013746	TTC	2	6	5428	5433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_013746	TCT	2	6	5456	5461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_013746	CGA	2	6	5483	5488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_013746	TAC	2	6	5500	5505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_013746	TCA	2	6	5516	5521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_013746	TCC	2	6	5570	5575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_013746	AAC	2	6	5646	5651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_013746	GAA	2	6	5673	5678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013746	GAA	2	6	5844	5849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284172860
82	NC_013746	AGC	2	6	5923	5928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172860
83	NC_013746	CTC	2	6	5964	5969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284172860
84	NC_013746	ACG	2	6	5989	5994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172860
85	NC_013746	TTC	2	6	6045	6050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284172860
86	NC_013746	CCG	2	6	6078	6083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172860
87	NC_013746	CGT	2	6	6134	6139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172860
88	NC_013746	CGG	2	6	6172	6177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172860
89	NC_013746	CGG	2	6	6288	6293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172860
90	NC_013746	TCG	2	6	6328	6333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172860
91	NC_013746	CTC	2	6	6357	6362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284172860
92	NC_013746	GGA	2	6	6393	6398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284172860
93	NC_013746	GGT	2	6	6534	6539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284172860
94	NC_013746	GTA	2	6	6556	6561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284172860
95	NC_013746	TCG	2	6	6649	6654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172860
96	NC_013746	TCG	2	6	6658	6663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172860
97	NC_013746	TCG	2	6	6742	6747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172860
98	NC_013746	ACT	2	6	6826	6831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_013746	TTA	2	6	6833	6838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284172861
100	NC_013746	TTC	2	6	6867	6872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284172861
101	NC_013746	CAG	2	6	6895	6900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172861
102	NC_013746	CGA	2	6	6931	6936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172861
103	NC_013746	CAC	2	6	7207	7212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_013746	CGA	2	6	7253	7258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_013746	GAC	2	6	7314	7319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_013746	AGA	2	6	7362	7367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013746	CCT	2	6	7428	7433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_013746	ACA	2	6	7455	7460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_013746	GAC	2	6	7625	7630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_013746	CTT	2	6	7673	7678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_013746	GCG	2	6	7680	7685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_013746	ACA	2	6	7705	7710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_013746	GGA	2	6	7785	7790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013746	ACC	2	6	7820	7825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_013746	GAG	2	6	7980	7985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013746	CTG	2	6	8101	8106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_013746	GTT	2	6	8161	8166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013746	CGA	2	6	8339	8344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_013746	AGG	2	6	8377	8382	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013746	CTG	2	6	8467	8472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_013746	AAC	2	6	8486	8491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_013746	AAC	2	6	8655	8660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284172862
123	NC_013746	GGA	2	6	8770	8775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284172862
124	NC_013746	CGG	2	6	8800	8805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172862
125	NC_013746	GAA	2	6	8968	8973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284172862
126	NC_013746	CCG	2	6	8977	8982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172862
127	NC_013746	ATC	2	6	8994	8999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284172862
128	NC_013746	GCG	2	6	9014	9019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172862
129	NC_013746	TTG	2	6	9250	9255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013746	ATG	2	6	9292	9297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284172863
131	NC_013746	CGA	3	9	9315	9323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172863
132	NC_013746	GAG	2	6	9370	9375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284172863
133	NC_013746	AAC	2	6	9736	9741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_013746	ATT	2	6	9822	9827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013746	CTT	2	6	9833	9838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_013746	CTG	2	6	9840	9845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_013746	GTG	2	6	9891	9896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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499	NC_013746	AGG	2	6	34747	34752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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