MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 plasmid pHTUR01

Total Repeats: 132

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013744	C	6	6	3536	3541	0 %	0 %	0 %	100 %	284167040
2	NC_013744	C	6	6	12594	12599	0 %	0 %	0 %	100 %	284167048
3	NC_013744	C	7	7	17997	18003	0 %	0 %	0 %	100 %	284167054
4	NC_013744	G	6	6	24072	24077	0 %	0 %	100 %	0 %	284167059
5	NC_013744	C	6	6	27042	27047	0 %	0 %	0 %	100 %	284167062
6	NC_013744	C	6	6	28711	28716	0 %	0 %	0 %	100 %	284167063
7	NC_013744	G	6	6	30723	30728	0 %	0 %	100 %	0 %	284167065
8	NC_013744	C	6	6	38723	38728	0 %	0 %	0 %	100 %	284167072
9	NC_013744	A	6	6	44636	44641	100 %	0 %	0 %	0 %	284167076
10	NC_013744	A	6	6	47672	47677	100 %	0 %	0 %	0 %	284167078
11	NC_013744	C	6	6	52727	52732	0 %	0 %	0 %	100 %	284167082
12	NC_013744	C	6	6	57473	57478	0 %	0 %	0 %	100 %	284167086
13	NC_013744	G	6	6	58345	58350	0 %	0 %	100 %	0 %	284167086
14	NC_013744	G	6	6	68037	68042	0 %	0 %	100 %	0 %	284167095
15	NC_013744	C	6	6	68754	68759	0 %	0 %	0 %	100 %	284167096
16	NC_013744	A	7	7	79433	79439	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013744	C	6	6	83200	83205	0 %	0 %	0 %	100 %	284167110
18	NC_013744	G	6	6	83442	83447	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013744	G	6	6	86604	86609	0 %	0 %	100 %	0 %	284167112
20	NC_013744	G	6	6	87703	87708	0 %	0 %	100 %	0 %	284167113
21	NC_013744	C	6	6	91984	91989	0 %	0 %	0 %	100 %	284167117
22	NC_013744	C	6	6	100853	100858	0 %	0 %	0 %	100 %	284167124
23	NC_013744	A	6	6	103339	103344	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013744	T	6	6	108872	108877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013744	C	6	6	116653	116658	0 %	0 %	0 %	100 %	284167137
26	NC_013744	G	6	6	120633	120638	0 %	0 %	100 %	0 %	284167140
27	NC_013744	T	6	6	123083	123088	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013744	G	6	6	130921	130926	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013744	C	6	6	131866	131871	0 %	0 %	0 %	100 %	284167147
30	NC_013744	G	6	6	132248	132253	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013744	G	6	6	150881	150886	0 %	0 %	100 %	0 %	284167156
32	NC_013744	C	6	6	151374	151379	0 %	0 %	0 %	100 %	284167156
33	NC_013744	C	6	6	171166	171171	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
34	NC_013744	C	6	6	171281	171286	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
35	NC_013744	A	6	6	172772	172777	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013744	G	6	6	173117	173122	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013744	G	6	6	182131	182136	0 %	0 %	100 %	0 %	284167174
38	NC_013744	C	6	6	195627	195632	0 %	0 %	0 %	100 %	284167190
39	NC_013744	A	6	6	209543	209548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013744	G	7	7	210353	210359	0 %	0 %	100 %	0 %	284167200
41	NC_013744	A	6	6	215999	216004	100 %	0 %	0 %	0 %	284167204
42	NC_013744	A	6	6	218823	218828	100 %	0 %	0 %	0 %	284167206
43	NC_013744	T	6	6	224007	224012	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013744	G	6	6	225954	225959	0 %	0 %	100 %	0 %	284167214
45	NC_013744	G	6	6	228920	228925	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013744	C	6	6	233202	233207	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
47	NC_013744	G	6	6	249665	249670	0 %	0 %	100 %	0 %	284167238
48	NC_013744	C	6	6	253677	253682	0 %	0 %	0 %	100 %	284167242
49	NC_013744	G	6	6	258726	258731	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013744	C	6	6	259368	259373	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
51	NC_013744	T	6	6	260094	260099	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013744	C	6	6	264317	264322	0 %	0 %	0 %	100 %	284167252
53	NC_013744	C	6	6	264483	264488	0 %	0 %	0 %	100 %	284167252
54	NC_013744	A	6	6	268800	268805	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013744	C	6	6	277643	277648	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
56	NC_013744	G	6	6	283968	283973	0 %	0 %	100 %	0 %	284167267
57	NC_013744	T	6	6	287758	287763	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013744	T	6	6	300903	300908	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013744	G	6	6	302995	303000	0 %	0 %	100 %	0 %	284167284
60	NC_013744	C	6	6	310639	310644	0 %	0 %	0 %	100 %	284167291
61	NC_013744	G	6	6	310902	310907	0 %	0 %	100 %	0 %	284167291
62	NC_013744	T	6	6	314888	314893	0 %	100 %	0 %	0 %	284167295
63	NC_013744	T	6	6	317371	317376	0 %	100 %	0 %	0 %	284167296
64	NC_013744	C	8	8	317452	317459	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
65	NC_013744	A	6	6	324768	324773	100 %	0 %	0 %	0 %	284167300
66	NC_013744	C	6	6	327449	327454	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
67	NC_013744	A	6	6	331064	331069	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013744	C	6	6	332354	332359	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
69	NC_013744	C	6	6	345000	345005	0 %	0 %	0 %	100 %	284167317
70	NC_013744	G	6	6	346298	346303	0 %	0 %	100 %	0 %	284167317
71	NC_013744	C	6	6	351829	351834	0 %	0 %	0 %	100 %	284167321
72	NC_013744	G	6	6	359353	359358	0 %	0 %	100 %	0 %	284167326
73	NC_013744	T	6	6	361370	361375	0 %	100 %	0 %	0 %	284167327
74	NC_013744	G	6	6	367281	367286	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013744	C	6	6	370338	370343	0 %	0 %	0 %	100 %	284167332
76	NC_013744	T	7	7	373789	373795	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013744	C	6	6	377636	377641	0 %	0 %	0 %	100 %	284167336
78	NC_013744	C	6	6	382092	382097	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
79	NC_013744	G	6	6	389644	389649	0 %	0 %	100 %	0 %	284167342
80	NC_013744	G	6	6	408869	408874	0 %	0 %	100 %	0 %	284167359
81	NC_013744	C	6	6	414256	414261	0 %	0 %	0 %	100 %	284167364
82	NC_013744	C	6	6	414595	414600	0 %	0 %	0 %	100 %	284167364
83	NC_013744	C	6	6	420445	420450	0 %	0 %	0 %	100 %	284167369
84	NC_013744	G	6	6	425466	425471	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013744	G	6	6	431844	431849	0 %	0 %	100 %	0 %	284167378
86	NC_013744	A	6	6	433497	433502	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013744	G	6	6	439675	439680	0 %	0 %	100 %	0 %	284167386
88	NC_013744	G	6	6	440529	440534	0 %	0 %	100 %	0 %	284167387
89	NC_013744	T	6	6	444100	444105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013744	A	6	6	463785	463790	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013744	G	6	6	465838	465843	0 %	0 %	100 %	0 %	284167414
92	NC_013744	T	6	6	466618	466623	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013744	G	6	6	467748	467753	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013744	T	6	6	468673	468678	0 %	100 %	0 %	0 %	284167416
95	NC_013744	T	6	6	469310	469315	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013744	C	6	6	470163	470168	0 %	0 %	0 %	100 %	284167417
97	NC_013744	T	6	6	470419	470424	0 %	100 %	0 %	0 %	284167417
98	NC_013744	T	7	7	473154	473160	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013744	G	6	6	475575	475580	0 %	0 %	100 %	0 %	284167421
100	NC_013744	C	6	6	478940	478945	0 %	0 %	0 %	100 %	284167424
101	NC_013744	A	6	6	479377	479382	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013744	G	6	6	480836	480841	0 %	0 %	100 %	0 %	284167425
103	NC_013744	A	7	7	495327	495333	100 %	0 %	0 %	0 %	284167439
104	NC_013744	A	6	6	503558	503563	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013744	T	6	6	504251	504256	0 %	100 %	0 %	0 %	284167448
106	NC_013744	G	6	6	505643	505648	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013744	T	6	6	508741	508746	0 %	100 %	0 %	0 %	284167451
108	NC_013744	C	6	6	509331	509336	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
109	NC_013744	C	6	6	519724	519729	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
110	NC_013744	G	6	6	520701	520706	0 %	0 %	100 %	0 %	284167466
111	NC_013744	G	6	6	526025	526030	0 %	0 %	100 %	0 %	284167471
112	NC_013744	C	6	6	538676	538681	0 %	0 %	0 %	100 %	284167486
113	NC_013744	A	6	6	541453	541458	100 %	0 %	0 %	0 %	284167488
114	NC_013744	G	6	6	549681	549686	0 %	0 %	100 %	0 %	284167495
115	NC_013744	G	6	6	549749	549754	0 %	0 %	100 %	0 %	284167495
116	NC_013744	C	6	6	556304	556309	0 %	0 %	0 %	100 %	284167504
117	NC_013744	G	6	6	559958	559963	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013744	C	6	6	562882	562887	0 %	0 %	0 %	100 %	284167510
119	NC_013744	G	6	6	582296	582301	0 %	0 %	100 %	0 %	284167532
120	NC_013744	T	6	6	585085	585090	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013744	G	6	6	594633	594638	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013744	C	6	6	595390	595395	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
123	NC_013744	G	6	6	607222	607227	0 %	0 %	100 %	0 %	284167552
124	NC_013744	C	6	6	610751	610756	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
125	NC_013744	G	6	6	619079	619084	0 %	0 %	100 %	0 %	284167564
126	NC_013744	C	6	6	621984	621989	0 %	0 %	0 %	100 %	284167567
127	NC_013744	T	6	6	652479	652484	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013744	C	6	6	661867	661872	0 %	0 %	0 %	100 %	284167599
129	NC_013744	C	6	6	675661	675666	0 %	0 %	0 %	100 %	284167609
130	NC_013744	G	6	6	684849	684854	0 %	0 %	100 %	0 %	284167617
131	NC_013744	C	7	7	686951	686957	0 %	0 %	0 %	100 %	284167619
132	NC_013744	T	6	6	688618	688623	0 %	100 %	0 %	0 %	284167620

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.