MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 chromosome

Total Repeats: 106449

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_013743	ACCG	2	8	108150	108157	25 %	0 %	25 %	50 %	284163393
3002	NC_013743	GCG	2	6	108191	108196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163393
3003	NC_013743	GTC	2	6	108254	108259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163393
3004	NC_013743	GAA	2	6	108304	108309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284163393
3005	NC_013743	CGC	2	6	108342	108347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163393
3006	NC_013743	CCG	2	6	108353	108358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163393
3007	NC_013743	CCA	2	6	108361	108366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284163393
3008	NC_013743	GAC	2	6	108385	108390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163393
3009	NC_013743	CCG	2	6	108405	108410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163393
3010	NC_013743	AGG	2	6	108416	108421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163393
3011	NC_013743	CCCG	2	8	108442	108449	0 %	0 %	25 %	75 %	284163393
3012	NC_013743	AGCC	2	8	108461	108468	25 %	0 %	25 %	50 %	284163393
3013	NC_013743	AGC	2	6	108494	108499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163393
3014	NC_013743	CGA	2	6	108579	108584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163393
3015	NC_013743	GTC	2	6	108602	108607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163393
3016	NC_013743	GATC	2	8	108709	108716	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3017	NC_013743	CCAT	2	8	108768	108775	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3018	NC_013743	GGT	2	6	108828	108833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_013743	CGA	2	6	108869	108874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3020	NC_013743	TCG	2	6	108938	108943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163394
3021	NC_013743	CTG	2	6	109009	109014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163394
3022	NC_013743	CATGTC	2	12	109015	109026	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	284163394
3023	NC_013743	CGG	2	6	109110	109115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163394
3024	NC_013743	TCG	2	6	109166	109171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163394
3025	NC_013743	GTC	4	12	109201	109212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163394
3026	NC_013743	GTC	2	6	109228	109233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163394
3027	NC_013743	TCGA	2	8	109372	109379	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3028	NC_013743	GA	3	6	109395	109400	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_013743	CAAC	2	8	109414	109421	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3030	NC_013743	TA	4	8	109453	109460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_013743	TGG	2	6	109470	109475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_013743	ACG	2	6	109482	109487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3033	NC_013743	CGC	2	6	109507	109512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3034	NC_013743	GTC	2	6	109561	109566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3035	NC_013743	CGC	2	6	109570	109575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3036	NC_013743	TGA	2	6	109610	109615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284163395
3037	NC_013743	GAC	2	6	109641	109646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163395
3038	NC_013743	GTC	2	6	109672	109677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163395
3039	NC_013743	CTC	3	9	109719	109727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284163395
3040	NC_013743	CGG	2	6	109760	109765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163395
3041	NC_013743	GC	3	6	109769	109774	0 %	0 %	50 %	50 %	284163395
3042	NC_013743	CGC	2	6	109796	109801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163395
3043	NC_013743	GCG	2	6	109804	109809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163395
3044	NC_013743	CGT	3	9	109818	109826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163395
3045	NC_013743	TCGCG	2	10	109827	109836	0 %	20 %	40 %	40 %	284163395
3046	NC_013743	CGA	2	6	109853	109858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163395
3047	NC_013743	TCG	2	6	109865	109870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163395
3048	NC_013743	GAC	2	6	109875	109880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163395
3049	NC_013743	CGA	3	9	109913	109921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163395
3050	NC_013743	TGA	2	6	109931	109936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284163395
3051	NC_013743	CGA	3	9	109940	109948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163395
3052	NC_013743	CGACGG	2	12	110024	110035	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	284163395
3053	NC_013743	GATCAG	2	12	110046	110057	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	284163395
3054	NC_013743	CGA	4	12	110153	110164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163395
3055	NC_013743	CCG	2	6	110181	110186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163395
3056	NC_013743	ATC	2	6	110242	110247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284163395
3057	NC_013743	CCGT	2	8	110254	110261	0 %	25 %	25 %	50 %	284163395
3058	NC_013743	CGA	2	6	110312	110317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163395
3059	NC_013743	CGA	2	6	110348	110353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163395
3060	NC_013743	CCA	2	6	110355	110360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284163395
3061	NC_013743	GAC	2	6	110361	110366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163395
3062	NC_013743	GCG	2	6	110416	110421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163395
3063	NC_013743	CGG	2	6	110432	110437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163395
3064	NC_013743	CGA	2	6	110474	110479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163395
3065	NC_013743	GC	3	6	110483	110488	0 %	0 %	50 %	50 %	284163395
3066	NC_013743	GAA	2	6	110496	110501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284163395
3067	NC_013743	GAGCG	2	10	110518	110527	20 %	0 %	60 %	20 %	284163395
3068	NC_013743	GTG	2	6	110566	110571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284163395
3069	NC_013743	CGA	2	6	110600	110605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163395
3070	NC_013743	AGA	3	9	110606	110614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284163395
3071	NC_013743	CGG	2	6	110627	110632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163395
3072	NC_013743	CGT	2	6	110685	110690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163395
3073	NC_013743	GCC	2	6	110694	110699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163395
3074	NC_013743	TGT	2	6	110702	110707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284163395
3075	NC_013743	CGA	2	6	110711	110716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163395
3076	NC_013743	CGA	2	6	110735	110740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163395
3077	NC_013743	AGC	2	6	110743	110748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163395
3078	NC_013743	GCGA	2	8	110817	110824	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3079	NC_013743	CG	3	6	110833	110838	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3080	NC_013743	CCG	2	6	110842	110847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3081	NC_013743	TCG	2	6	110864	110869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3082	NC_013743	GT	3	6	110887	110892	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_013743	GACC	2	8	110909	110916	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3084	NC_013743	GAC	2	6	110930	110935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163396
3085	NC_013743	CGAC	2	8	110951	110958	25 %	0 %	25 %	50 %	284163396
3086	NC_013743	ACC	2	6	110961	110966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284163396
3087	NC_013743	CGA	2	6	110983	110988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163396
3088	NC_013743	CCG	2	6	111009	111014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163396
3089	NC_013743	ATCGT	2	10	111030	111039	20 %	40 %	20 %	20 %	284163396
3090	NC_013743	TCG	2	6	111042	111047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163396
3091	NC_013743	CCGGA	2	10	111065	111074	20 %	0 %	40 %	40 %	284163396
3092	NC_013743	CCG	2	6	111088	111093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163396
3093	NC_013743	CGA	2	6	111124	111129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163396
3094	NC_013743	CG	5	10	111133	111142	0 %	0 %	50 %	50 %	284163396
3095	NC_013743	GTC	2	6	111164	111169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163396
3096	NC_013743	GTC	2	6	111185	111190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163396
3097	NC_013743	CGA	2	6	111238	111243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163396
3098	NC_013743	GGT	2	6	111383	111388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_013743	ACG	2	6	111404	111409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3100	NC_013743	CG	3	6	111457	111462	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3101	NC_013743	TCG	3	9	111475	111483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3102	NC_013743	ATC	2	6	111541	111546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284163397
3103	NC_013743	GAC	2	6	111549	111554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163397
3104	NC_013743	GAC	2	6	111567	111572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163397
3105	NC_013743	CGT	2	6	111579	111584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163397
3106	NC_013743	TCG	2	6	111631	111636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163397
3107	NC_013743	CTC	2	6	111651	111656	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284163397
3108	NC_013743	CTC	2	6	111660	111665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284163397
3109	NC_013743	CGG	2	6	111668	111673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163397
3110	NC_013743	GC	3	6	111677	111682	0 %	0 %	50 %	50 %	284163397
3111	NC_013743	CTC	2	6	111702	111707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284163397
3112	NC_013743	CGCC	2	8	111744	111751	0 %	0 %	25 %	75 %	284163397
3113	NC_013743	GAT	2	6	111765	111770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284163397
3114	NC_013743	TCG	2	6	111776	111781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163397
3115	NC_013743	GAT	2	6	111783	111788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284163397
3116	NC_013743	CGAG	2	8	111830	111837	25 %	0 %	50 %	25 %	284163397
3117	NC_013743	GTTC	2	8	111887	111894	0 %	50 %	25 %	25 %	284163397
3118	NC_013743	CGC	2	6	111986	111991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163397
3119	NC_013743	CGA	2	6	111995	112000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163397
3120	NC_013743	GGA	2	6	112035	112040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163397
3121	NC_013743	C	6	6	112081	112086	0 %	0 %	0 %	100 %	284163397
3122	NC_013743	TCGG	2	8	112108	112115	0 %	25 %	50 %	25 %	284163397
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3240	NC_013743	TCG	2	6	115718	115723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163400
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3242	NC_013743	GTC	2	6	115756	115761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163400
3243	NC_013743	GTC	3	9	115786	115794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163400
3244	NC_013743	CGC	2	6	115833	115838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163400
3245	NC_013743	ACGTCG	2	12	115883	115894	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	284163400
3246	NC_013743	CGC	2	6	115914	115919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163400
3247	NC_013743	GCG	3	9	115970	115978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163400
3248	NC_013743	GC	3	6	116042	116047	0 %	0 %	50 %	50 %	284163400
3249	NC_013743	CGT	2	6	116123	116128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3250	NC_013743	TGC	2	6	116177	116182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3251	NC_013743	TTC	2	6	116186	116191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3252	NC_013743	CCTCG	2	10	116230	116239	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3253	NC_013743	GTA	2	6	116264	116269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3254	NC_013743	ACC	2	6	116329	116334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3255	NC_013743	CGAG	2	8	116346	116353	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3256	NC_013743	CGA	2	6	116376	116381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3257	NC_013743	GCG	2	6	116396	116401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3258	NC_013743	CGC	2	6	116407	116412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3259	NC_013743	CGG	2	6	116424	116429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3260	NC_013743	GAG	4	12	116544	116555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163401
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3264	NC_013743	CGAT	2	8	116729	116736	25 %	25 %	25 %	25 %	284163401
3265	NC_013743	AC	3	6	116787	116792	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3266	NC_013743	TCA	2	6	116807	116812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3267	NC_013743	GTC	2	6	116831	116836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3269	NC_013743	GCTC	2	8	117019	117026	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3270	NC_013743	CGG	2	6	117060	117065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3271	NC_013743	GAGC	2	8	117083	117090	25 %	0 %	50 %	25 %	284163402
3272	NC_013743	TCGA	2	8	117126	117133	25 %	25 %	25 %	25 %	284163402
3273	NC_013743	CGAT	2	8	117145	117152	25 %	25 %	25 %	25 %	284163402
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3276	NC_013743	CGA	2	6	117269	117274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163402
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3282	NC_013743	CGA	2	6	117608	117613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163402
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3292	NC_013743	GACTC	2	10	117865	117874	20 %	20 %	20 %	40 %	284163403
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3313	NC_013743	CGG	2	6	118492	118497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163403
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3316	NC_013743	CGA	2	6	118652	118657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163404
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3331	NC_013743	AGCCG	2	10	119379	119388	20 %	0 %	40 %	40 %	284163405
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3337	NC_013743	CAC	2	6	119593	119598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3338	NC_013743	GGC	2	6	119745	119750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163406
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3343	NC_013743	GAG	2	6	119848	119853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163406
3344	NC_013743	CCAC	2	8	119864	119871	25 %	0 %	0 %	75 %	284163406
3345	NC_013743	CGA	2	6	119901	119906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163406
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3348	NC_013743	CGC	2	6	119937	119942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163406
3349	NC_013743	TTC	2	6	119957	119962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284163406
3350	NC_013743	GAC	2	6	119977	119982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163406
3351	NC_013743	CGG	2	6	119999	120004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163406
3352	NC_013743	GTC	3	9	120055	120063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163406
3353	NC_013743	CTA	2	6	120069	120074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284163406
3354	NC_013743	CGG	2	6	120075	120080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163406
3355	NC_013743	AGG	2	6	120131	120136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163406
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3357	NC_013743	GAG	2	6	120160	120165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163406
3358	NC_013743	ACG	2	6	120200	120205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163406
3359	NC_013743	GAG	2	6	120301	120306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163406
3360	NC_013743	CGA	2	6	120338	120343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163406
3361	NC_013743	GCGG	3	12	120344	120355	0 %	0 %	75 %	25 %	284163406
3362	NC_013743	CGT	2	6	120375	120380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3363	NC_013743	GCC	2	6	120459	120464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3364	NC_013743	GAT	2	6	120534	120539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3483	NC_013743	GCC	2	6	124262	124267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163409
3484	NC_013743	TCG	2	6	124289	124294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163409
3485	NC_013743	GTC	2	6	124297	124302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163409
3486	NC_013743	GCT	2	6	124579	124584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163409
3487	NC_013743	AG	3	6	124622	124627	50 %	0 %	50 %	0 %	284163409
3488	NC_013743	CGA	2	6	124644	124649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163409
3489	NC_013743	GCC	2	6	124693	124698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163409
3490	NC_013743	GCG	2	6	124751	124756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163409
3491	NC_013743	AATG	2	8	124780	124787	50 %	25 %	25 %	0 %	284163409
3492	NC_013743	ATC	2	6	124859	124864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284163409
3493	NC_013743	TC	3	6	124863	124868	0 %	50 %	0 %	50 %	284163409
3494	NC_013743	ATA	2	6	124881	124886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3495	NC_013743	TGT	2	6	124887	124892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3496	NC_013743	TCAT	2	8	124920	124927	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3497	NC_013743	AAG	2	6	125031	125036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3498	NC_013743	TCG	2	6	125099	125104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3499	NC_013743	GTC	3	9	125107	125115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163410
3500	NC_013743	CCAG	2	8	125134	125141	25 %	0 %	25 %	50 %	284163410

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