MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 chromosome

Total Repeats: 106449

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_013743	CTG	2	6	55465	55470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163344
1502	NC_013743	CGA	2	6	55512	55517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163344
1503	NC_013743	CAC	2	6	55524	55529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284163344
1504	NC_013743	TCG	2	6	55568	55573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163344
1505	NC_013743	CGA	2	6	55617	55622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163344
1506	NC_013743	GAG	2	6	55699	55704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163344
1507	NC_013743	CG	3	6	55735	55740	0 %	0 %	50 %	50 %	284163344
1508	NC_013743	TCG	2	6	55748	55753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163344
1509	NC_013743	AGG	2	6	55754	55759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163344
1510	NC_013743	GAG	2	6	55762	55767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163344
1511	NC_013743	ACG	2	6	55775	55780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163344
1512	NC_013743	CAT	2	6	55818	55823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284163344
1513	NC_013743	AGC	2	6	55847	55852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163344
1514	NC_013743	GAG	2	6	55867	55872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163344
1515	NC_013743	GGA	2	6	55878	55883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163344
1516	NC_013743	CGA	2	6	55893	55898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163344
1517	NC_013743	AGT	2	6	55916	55921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284163344
1518	NC_013743	GTC	2	6	55924	55929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163345
1519	NC_013743	TCG	2	6	56030	56035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163345
1520	NC_013743	CGA	2	6	56040	56045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163345
1521	NC_013743	ACG	2	6	56052	56057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163345
1522	NC_013743	GTC	2	6	56063	56068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163345
1523	NC_013743	TTC	2	6	56092	56097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284163345
1524	NC_013743	GC	3	6	56105	56110	0 %	0 %	50 %	50 %	284163345
1525	NC_013743	CGT	2	6	56139	56144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163345
1526	NC_013743	CCGATC	2	12	56174	56185	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	284163345
1527	NC_013743	GTTC	2	8	56202	56209	0 %	50 %	25 %	25 %	284163345
1528	NC_013743	TCG	2	6	56267	56272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163345
1529	NC_013743	GCC	2	6	56290	56295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163345
1530	NC_013743	GTT	3	9	56308	56316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284163345
1531	NC_013743	CCT	2	6	56483	56488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284163346
1532	NC_013743	CGG	2	6	56507	56512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163346
1533	NC_013743	TGG	2	6	56518	56523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284163346
1534	NC_013743	CAG	2	6	56532	56537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163346
1535	NC_013743	GC	3	6	56556	56561	0 %	0 %	50 %	50 %	284163346
1536	NC_013743	ATCGA	2	10	56572	56581	40 %	20 %	20 %	20 %	284163346
1537	NC_013743	CGC	2	6	56588	56593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163346
1538	NC_013743	TCG	2	6	56605	56610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163346
1539	NC_013743	CAG	2	6	56613	56618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163346
1540	NC_013743	GTC	2	6	56619	56624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163346
1541	NC_013743	CGT	2	6	56663	56668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163346
1542	NC_013743	GCC	2	6	56722	56727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163346
1543	NC_013743	GTC	2	6	56758	56763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163346
1544	NC_013743	GCC	2	6	56767	56772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163346
1545	NC_013743	CGA	2	6	56810	56815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163346
1546	NC_013743	CGT	2	6	56831	56836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163346
1547	NC_013743	CGA	2	6	56855	56860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163346
1548	NC_013743	GC	3	6	56897	56902	0 %	0 %	50 %	50 %	284163346
1549	NC_013743	CGG	2	6	56934	56939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163346
1550	NC_013743	GAT	2	6	56967	56972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284163346
1551	NC_013743	CGT	2	6	56979	56984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163346
1552	NC_013743	GGT	2	6	56987	56992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284163346
1553	NC_013743	CTG	2	6	57018	57023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163346
1554	NC_013743	CAG	2	6	57054	57059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163346
1555	NC_013743	GAG	2	6	57142	57147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163346
1556	NC_013743	CGAC	2	8	57148	57155	25 %	0 %	25 %	50 %	284163346
1557	NC_013743	GAA	2	6	57207	57212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284163346
1558	NC_013743	CGAG	2	8	57265	57272	25 %	0 %	50 %	25 %	284163346
1559	NC_013743	CG	3	6	57273	57278	0 %	0 %	50 %	50 %	284163346
1560	NC_013743	GCC	3	9	57280	57288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163346
1561	NC_013743	CGGG	2	8	57302	57309	0 %	0 %	75 %	25 %	284163346
1562	NC_013743	AGG	3	9	57316	57324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163346
1563	NC_013743	TCG	2	6	57334	57339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163346
1564	NC_013743	CGT	2	6	57365	57370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163346
1565	NC_013743	GCG	2	6	57416	57421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163346
1566	NC_013743	GCCG	2	8	57443	57450	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1567	NC_013743	TCGG	2	8	57460	57467	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1568	NC_013743	CGT	3	9	57470	57478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_013743	CGT	2	6	57493	57498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163347
1570	NC_013743	CCG	2	6	57528	57533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163347
1571	NC_013743	TCG	2	6	57537	57542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163347
1572	NC_013743	CGT	2	6	57563	57568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163347
1573	NC_013743	GCG	2	6	57595	57600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163347
1574	NC_013743	GCTC	2	8	57613	57620	0 %	25 %	25 %	50 %	284163347
1575	NC_013743	CGA	2	6	57634	57639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163347
1576	NC_013743	TCG	2	6	57654	57659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163347
1577	NC_013743	TCG	2	6	57678	57683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163347
1578	NC_013743	CGA	2	6	57736	57741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163347
1579	NC_013743	CGA	2	6	57766	57771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163347
1580	NC_013743	CTC	2	6	57776	57781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284163347
1581	NC_013743	ATC	2	6	57809	57814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284163347
1582	NC_013743	CGT	2	6	57842	57847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163347
1583	NC_013743	TCG	2	6	57867	57872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163347
1584	NC_013743	GTC	2	6	57930	57935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163347
1585	NC_013743	CTG	2	6	57986	57991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163347
1586	NC_013743	CTG	2	6	58028	58033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163347
1587	NC_013743	TCGG	2	8	58044	58051	0 %	25 %	50 %	25 %	284163347
1588	NC_013743	CGG	2	6	58063	58068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163347
1589	NC_013743	GTC	2	6	58089	58094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163347
1590	NC_013743	GC	3	6	58105	58110	0 %	0 %	50 %	50 %	284163347
1591	NC_013743	GTC	2	6	58133	58138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163347
1592	NC_013743	CGT	2	6	58144	58149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163347
1593	NC_013743	GCC	2	6	58154	58159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163347
1594	NC_013743	TCC	2	6	58212	58217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284163347
1595	NC_013743	TCG	3	9	58248	58256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163347
1596	NC_013743	GTG	2	6	58257	58262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284163347
1597	NC_013743	CGA	2	6	58291	58296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163347
1598	NC_013743	ACG	3	9	58398	58406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163347
1599	NC_013743	GCC	2	6	58409	58414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163347
1600	NC_013743	TCG	2	6	58431	58436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163347
1601	NC_013743	CGC	2	6	58541	58546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163347
1602	NC_013743	CGATCG	2	12	58552	58563	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	284163347
1603	NC_013743	ATC	2	6	58629	58634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_013743	CGAC	2	8	58649	58656	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1605	NC_013743	GTTC	2	8	58669	58676	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1606	NC_013743	CGC	2	6	58736	58741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1607	NC_013743	GGTTC	2	10	58742	58751	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1608	NC_013743	CGA	2	6	58894	58899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163348
1609	NC_013743	TCG	2	6	58924	58929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163348
1610	NC_013743	GAG	2	6	58941	58946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163348
1611	NC_013743	CTG	2	6	58947	58952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163348
1612	NC_013743	GAT	2	6	58982	58987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284163348
1613	NC_013743	GCT	2	6	59066	59071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163348
1614	NC_013743	GAG	2	6	59097	59102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163348
1615	NC_013743	CGC	2	6	59133	59138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163348
1616	NC_013743	CGGCGA	2	12	59204	59215	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	284163348
1617	NC_013743	CGA	2	6	59231	59236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163348
1618	NC_013743	CG	3	6	59247	59252	0 %	0 %	50 %	50 %	284163348
1619	NC_013743	CGAC	2	8	59257	59264	25 %	0 %	25 %	50 %	284163348
1620	NC_013743	ACG	2	6	59266	59271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163348
1621	NC_013743	TCGG	2	8	59277	59284	0 %	25 %	50 %	25 %	284163348
1622	NC_013743	TCG	2	6	59293	59298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163348
1623	NC_013743	GAC	2	6	59301	59306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163348
1624	NC_013743	TCGAT	2	10	59315	59324	20 %	40 %	20 %	20 %	284163348
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1627	NC_013743	GTC	2	6	59433	59438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163348
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1644	NC_013743	CG	3	6	59905	59910	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1645	NC_013743	GGC	2	6	59913	59918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1647	NC_013743	GCT	2	6	60043	60048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1736	NC_013743	TGA	2	6	63274	63279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1737	NC_013743	CGA	2	6	63349	63354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1738	NC_013743	CGCTC	2	10	63368	63377	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1739	NC_013743	TGA	2	6	63383	63388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1740	NC_013743	CTTC	2	8	63397	63404	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1741	NC_013743	TTCA	2	8	63408	63415	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1742	NC_013743	GTC	2	6	63435	63440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1743	NC_013743	CGCT	2	8	63496	63503	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1744	NC_013743	AGC	2	6	63567	63572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1745	NC_013743	GACT	2	8	63592	63599	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1746	NC_013743	AGA	2	6	63612	63617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1748	NC_013743	CGG	3	9	63660	63668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163353
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