MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 chromosome

Total Repeats: 106449

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_013743	CGC	2	6	455938	455943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12502	NC_013743	GAC	2	6	455968	455973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12503	NC_013743	TGAC	2	8	455987	455994	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12504	NC_013743	CGA	2	6	456053	456058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12505	NC_013743	GAA	2	6	456094	456099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12506	NC_013743	TGG	2	6	456162	456167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284163722
12507	NC_013743	GCC	2	6	456232	456237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163722
12508	NC_013743	GAA	2	6	456253	456258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284163722
12509	NC_013743	GCC	2	6	456298	456303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163722
12510	NC_013743	GAA	2	6	456313	456318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284163722
12511	NC_013743	AG	3	6	456349	456354	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12512	NC_013743	GAATC	2	10	456414	456423	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12513	NC_013743	CGG	2	6	456433	456438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12514	NC_013743	ATT	2	6	456447	456452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12515	NC_013743	ACT	2	6	456481	456486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12516	NC_013743	AGG	2	6	456507	456512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12517	NC_013743	ATC	2	6	456542	456547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12518	NC_013743	TGC	2	6	456585	456590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12519	NC_013743	GGC	2	6	456845	456850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163723
12520	NC_013743	GCGA	2	8	456876	456883	25 %	0 %	50 %	25 %	284163723
12521	NC_013743	GGT	2	6	456920	456925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284163723
12522	NC_013743	TCG	2	6	456952	456957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163723
12523	NC_013743	CGA	2	6	456976	456981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163723
12524	NC_013743	CGA	2	6	457045	457050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163723
12525	NC_013743	CTG	2	6	457068	457073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163723
12526	NC_013743	CGT	2	6	457079	457084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163723
12527	NC_013743	CCGG	2	8	457132	457139	0 %	0 %	50 %	50 %	284163723
12528	NC_013743	TCG	2	6	457204	457209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163723
12529	NC_013743	CGCC	2	8	457228	457235	0 %	0 %	25 %	75 %	284163723
12530	NC_013743	TCGGCG	2	12	457240	457251	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	284163723
12531	NC_013743	TGA	2	6	457282	457287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284163723
12532	NC_013743	CTG	2	6	457299	457304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163723
12533	NC_013743	TCGT	2	8	457353	457360	0 %	50 %	25 %	25 %	284163723
12534	NC_013743	GC	3	6	457361	457366	0 %	0 %	50 %	50 %	284163723
12535	NC_013743	GAG	2	6	457371	457376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163723
12536	NC_013743	CGA	2	6	457385	457390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163723
12537	NC_013743	GAC	2	6	457391	457396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163723
12538	NC_013743	CGC	2	6	457409	457414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12539	NC_013743	GAC	2	6	457521	457526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163724
12540	NC_013743	TCGG	2	8	457536	457543	0 %	25 %	50 %	25 %	284163724
12541	NC_013743	TCGCGG	2	12	457561	457572	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	284163724
12542	NC_013743	GCGA	2	8	457588	457595	25 %	0 %	50 %	25 %	284163724
12543	NC_013743	CG	3	6	457638	457643	0 %	0 %	50 %	50 %	284163724
12544	NC_013743	CGA	2	6	457670	457675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163724
12545	NC_013743	TCG	2	6	457699	457704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163724
12546	NC_013743	CTCG	2	8	457724	457731	0 %	25 %	25 %	50 %	284163724
12547	NC_013743	GCG	2	6	457732	457737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163724
12548	NC_013743	CCG	2	6	457756	457761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163724
12549	NC_013743	GCG	2	6	457775	457780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163724
12550	NC_013743	ACA	2	6	457789	457794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284163724
12551	NC_013743	CAG	2	6	457872	457877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163724
12552	NC_013743	GAG	2	6	457893	457898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163724
12553	NC_013743	ACG	2	6	457915	457920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163724
12554	NC_013743	TCC	2	6	457924	457929	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284163724
12555	NC_013743	GAG	2	6	457950	457955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163724
12556	NC_013743	CGA	2	6	457988	457993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163724
12557	NC_013743	CGA	2	6	458036	458041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163724
12558	NC_013743	CGG	2	6	458047	458052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163724
12559	NC_013743	GCG	2	6	458098	458103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163724
12560	NC_013743	GGTGA	2	10	458133	458142	20 %	20 %	60 %	0 %	284163724
12561	NC_013743	GCG	2	6	458167	458172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163724
12562	NC_013743	AGTC	2	8	458173	458180	25 %	25 %	25 %	25 %	284163724
12563	NC_013743	GTC	2	6	458214	458219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163724
12564	NC_013743	ACG	2	6	458224	458229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163724
12565	NC_013743	CGAC	2	8	458266	458273	25 %	0 %	25 %	50 %	284163724
12566	NC_013743	GC	4	8	458278	458285	0 %	0 %	50 %	50 %	284163724
12567	NC_013743	ACA	2	6	458338	458343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284163724
12568	NC_013743	ACG	2	6	458398	458403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163724
12569	NC_013743	GTC	2	6	458502	458507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163724
12570	NC_013743	GAGCG	2	10	458587	458596	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
12571	NC_013743	CGAA	2	8	458631	458638	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12572	NC_013743	AGCG	2	8	458661	458668	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12573	NC_013743	ACGG	2	8	458736	458743	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12574	NC_013743	ATA	2	6	458756	458761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12575	NC_013743	GGC	2	6	458804	458809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12576	NC_013743	CACCG	2	10	458852	458861	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
12577	NC_013743	GCCC	2	8	458895	458902	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12578	NC_013743	CTG	2	6	458945	458950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12579	NC_013743	CGGG	2	8	459003	459010	0 %	0 %	75 %	25 %	284163725
12580	NC_013743	CGC	2	6	459011	459016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163725
12581	NC_013743	TAC	2	6	459033	459038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284163725
12582	NC_013743	ACG	2	6	459049	459054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163725
12583	NC_013743	GGA	2	6	459059	459064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163725
12584	NC_013743	CGA	2	6	459092	459097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163725
12585	NC_013743	GTC	2	6	459138	459143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163725
12586	NC_013743	GGGA	2	8	459163	459170	25 %	0 %	75 %	0 %	284163725
12587	NC_013743	GCCG	2	8	459215	459222	0 %	0 %	50 %	50 %	284163725
12588	NC_013743	GGC	2	6	459272	459277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163725
12589	NC_013743	TCG	2	6	459289	459294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163725
12590	NC_013743	GTCG	2	8	459298	459305	0 %	25 %	50 %	25 %	284163725
12591	NC_013743	CGC	2	6	459374	459379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163725
12592	NC_013743	CGA	2	6	459392	459397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163725
12593	NC_013743	ACG	2	6	459406	459411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163725
12594	NC_013743	GGC	2	6	459455	459460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163725
12595	NC_013743	CGA	2	6	459464	459469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163725
12596	NC_013743	GCT	2	6	459488	459493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163725
12597	NC_013743	GAC	2	6	459513	459518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163725
12598	NC_013743	ATC	2	6	459528	459533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284163725
12599	NC_013743	GCG	2	6	459560	459565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163725
12600	NC_013743	CTC	2	6	459649	459654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284163726
12601	NC_013743	CCT	2	6	459705	459710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284163726
12602	NC_013743	GTC	2	6	459728	459733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163726
12603	NC_013743	CGA	2	6	459735	459740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163726
12604	NC_013743	AGC	2	6	459767	459772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163726
12605	NC_013743	CGG	2	6	459810	459815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163726
12606	NC_013743	CGC	3	9	459846	459854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163726
12607	NC_013743	GGTC	2	8	459885	459892	0 %	25 %	50 %	25 %	284163726
12608	NC_013743	GTC	2	6	459902	459907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163726
12609	NC_013743	GCGG	2	8	459924	459931	0 %	0 %	75 %	25 %	284163726
12610	NC_013743	CGC	2	6	459939	459944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163726
12611	NC_013743	GCG	2	6	459951	459956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163726
12612	NC_013743	CCT	2	6	459978	459983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284163726
12613	NC_013743	TC	3	6	460002	460007	0 %	50 %	0 %	50 %	284163726
12614	NC_013743	CTC	3	9	460009	460017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284163726
12615	NC_013743	TCG	2	6	460047	460052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163726
12616	NC_013743	TCGC	2	8	460072	460079	0 %	25 %	25 %	50 %	284163726
12617	NC_013743	TGG	2	6	460103	460108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284163726
12618	NC_013743	GAG	2	6	460118	460123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163726
12619	NC_013743	CCG	2	6	460147	460152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163726
12620	NC_013743	CGT	2	6	460158	460163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163726
12621	NC_013743	TCG	2	6	460181	460186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163726
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12623	NC_013743	GGCT	2	8	460254	460261	0 %	25 %	50 %	25 %	284163726
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12987	NC_013743	TCG	2	6	473607	473612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163742
12988	NC_013743	GAG	2	6	473621	473626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163742
12989	NC_013743	GTCGA	2	10	473642	473651	20 %	20 %	40 %	20 %	284163742
12990	NC_013743	CGA	2	6	473656	473661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163742
12991	NC_013743	CGGC	2	8	473683	473690	0 %	0 %	50 %	50 %	284163742
12992	NC_013743	GC	3	6	473704	473709	0 %	0 %	50 %	50 %	284163742
12993	NC_013743	CGAG	2	8	473710	473717	25 %	0 %	50 %	25 %	284163742
12994	NC_013743	GAG	2	6	473726	473731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163742
12995	NC_013743	CT	3	6	473768	473773	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12996	NC_013743	GGCT	2	8	473795	473802	0 %	25 %	50 %	25 %	284163743
12997	NC_013743	CGATG	2	10	473822	473831	20 %	20 %	40 %	20 %	284163743
12998	NC_013743	CGG	2	6	473873	473878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163743
12999	NC_013743	CGA	2	6	473882	473887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163743
13000	NC_013743	CGT	2	6	473888	473893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163743

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