MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 chromosome

Total Repeats: 106449

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013743	TCG	2	6	18651	18656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163312
502	NC_013743	CGA	3	9	18666	18674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163312
503	NC_013743	ACG	2	6	18687	18692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163312
504	NC_013743	GTCG	2	8	18753	18760	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
505	NC_013743	AGTC	2	8	18798	18805	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
506	NC_013743	ACG	2	6	18806	18811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_013743	GAAC	2	8	18854	18861	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
508	NC_013743	CG	3	6	18906	18911	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
509	NC_013743	TCG	2	6	19046	19051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163313
510	NC_013743	CCT	2	6	19053	19058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284163313
511	NC_013743	GGC	2	6	19098	19103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163313
512	NC_013743	GCG	2	6	19112	19117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163313
513	NC_013743	CGA	2	6	19146	19151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163313
514	NC_013743	CG	3	6	19187	19192	0 %	0 %	50 %	50 %	284163313
515	NC_013743	CCA	2	6	19203	19208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284163313
516	NC_013743	CGCGG	2	10	19213	19222	0 %	0 %	60 %	40 %	284163313
517	NC_013743	GCT	2	6	19242	19247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163313
518	NC_013743	CAA	2	6	19269	19274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284163313
519	NC_013743	ACG	2	6	19288	19293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163313
520	NC_013743	GC	3	6	19398	19403	0 %	0 %	50 %	50 %	284163313
521	NC_013743	GTC	2	6	19411	19416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163313
522	NC_013743	AAC	2	6	19465	19470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284163313
523	NC_013743	CGG	2	6	19475	19480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163313
524	NC_013743	CGC	2	6	19507	19512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163313
525	NC_013743	CGA	2	6	19527	19532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163313
526	NC_013743	CGG	2	6	19591	19596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163313
527	NC_013743	CGA	2	6	19626	19631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163313
528	NC_013743	AAC	2	6	19643	19648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284163313
529	NC_013743	AAG	2	6	19681	19686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284163313
530	NC_013743	CGG	2	6	19704	19709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163313
531	NC_013743	TCG	2	6	19712	19717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163313
532	NC_013743	CGAC	2	8	19718	19725	25 %	0 %	25 %	50 %	284163313
533	NC_013743	AGC	2	6	19751	19756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163313
534	NC_013743	CGG	2	6	19788	19793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163313
535	NC_013743	CCGG	2	8	19799	19806	0 %	0 %	50 %	50 %	284163313
536	NC_013743	CGC	2	6	19812	19817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163313
537	NC_013743	GAG	2	6	19846	19851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163313
538	NC_013743	CG	3	6	19882	19887	0 %	0 %	50 %	50 %	284163313
539	NC_013743	CGC	2	6	19928	19933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163313
540	NC_013743	GGT	2	6	19936	19941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284163313
541	NC_013743	CGA	2	6	19989	19994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163313
542	NC_013743	GGC	2	6	20035	20040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163313
543	NC_013743	CCGG	2	8	20085	20092	0 %	0 %	50 %	50 %	284163313
544	NC_013743	CCG	2	6	20159	20164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163313
545	NC_013743	CTGT	2	8	20263	20270	0 %	50 %	25 %	25 %	284163313
546	NC_013743	GC	4	8	20330	20337	0 %	0 %	50 %	50 %	284163314
547	NC_013743	GCT	2	6	20393	20398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163314
548	NC_013743	GATC	2	8	20444	20451	25 %	25 %	25 %	25 %	284163314
549	NC_013743	CGT	2	6	20482	20487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163314
550	NC_013743	GGC	2	6	20544	20549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163314
551	NC_013743	GTCA	2	8	20550	20557	25 %	25 %	25 %	25 %	284163314
552	NC_013743	CGG	2	6	20563	20568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163314
553	NC_013743	GACCGC	2	12	20589	20600	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	284163314
554	NC_013743	GCG	2	6	20685	20690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_013743	TC	3	6	20704	20709	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
556	NC_013743	CCG	2	6	20720	20725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
557	NC_013743	CGC	2	6	20743	20748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
558	NC_013743	CGAC	2	8	20781	20788	25 %	0 %	25 %	50 %	284163315
559	NC_013743	CGC	2	6	20794	20799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163315
560	NC_013743	GCT	2	6	20806	20811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163315
561	NC_013743	TCGA	2	8	20823	20830	25 %	25 %	25 %	25 %	284163315
562	NC_013743	CGT	2	6	20863	20868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163315
563	NC_013743	TCCC	2	8	20888	20895	0 %	25 %	0 %	75 %	284163315
564	NC_013743	CGG	2	6	20949	20954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163315
565	NC_013743	CTT	2	6	21007	21012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284163315
566	NC_013743	CGG	2	6	21058	21063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163315
567	NC_013743	CGC	2	6	21076	21081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163315
568	NC_013743	TCG	2	6	21084	21089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163315
569	NC_013743	GTC	3	9	21182	21190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163315
570	NC_013743	CGAA	2	8	21223	21230	50 %	0 %	25 %	25 %	284163315
571	NC_013743	CTCGT	2	10	21237	21246	0 %	40 %	20 %	40 %	284163315
572	NC_013743	GTC	2	6	21251	21256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163315
573	NC_013743	GTCG	2	8	21271	21278	0 %	25 %	50 %	25 %	284163316
574	NC_013743	CAA	2	6	21287	21292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284163316
575	NC_013743	TCG	2	6	21294	21299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163316
576	NC_013743	CGA	2	6	21340	21345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163316
577	NC_013743	GCG	2	6	21354	21359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163316
578	NC_013743	GAC	2	6	21377	21382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163316
579	NC_013743	GGC	2	6	21383	21388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163316
580	NC_013743	CGA	2	6	21400	21405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163316
581	NC_013743	GGC	2	6	21415	21420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163316
582	NC_013743	GACCG	2	10	21422	21431	20 %	0 %	40 %	40 %	284163316
583	NC_013743	CTC	2	6	21518	21523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284163316
584	NC_013743	GAC	2	6	21554	21559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163316
585	NC_013743	TCG	2	6	21582	21587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163316
586	NC_013743	AGG	2	6	21654	21659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163316
587	NC_013743	CGT	2	6	21664	21669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163316
588	NC_013743	TCG	2	6	21684	21689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163316
589	NC_013743	GTC	3	9	21690	21698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163316
590	NC_013743	GGTC	2	8	21727	21734	0 %	25 %	50 %	25 %	284163316
591	NC_013743	CCGGG	2	10	21748	21757	0 %	0 %	60 %	40 %	284163316
592	NC_013743	CAG	2	6	21840	21845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_013743	CCG	2	6	21857	21862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
594	NC_013743	GC	4	8	21904	21911	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
595	NC_013743	AC	3	6	21944	21949	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
596	NC_013743	AGT	2	6	21976	21981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
597	NC_013743	GTT	2	6	22062	22067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
598	NC_013743	CGC	2	6	22094	22099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
599	NC_013743	CGA	2	6	22163	22168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163317
600	NC_013743	GTC	2	6	22198	22203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163317
601	NC_013743	ACG	2	6	22213	22218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163317
602	NC_013743	TTC	2	6	22237	22242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284163317
603	NC_013743	TCG	2	6	22247	22252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163317
604	NC_013743	CGA	2	6	22260	22265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163317
605	NC_013743	GAC	2	6	22321	22326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163317
606	NC_013743	GAG	2	6	22363	22368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163317
607	NC_013743	CGC	2	6	22382	22387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163317
608	NC_013743	GAC	2	6	22389	22394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163317
609	NC_013743	CGG	2	6	22401	22406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163317
610	NC_013743	GCT	2	6	22407	22412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163317
611	NC_013743	ACC	2	6	22426	22431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284163317
612	NC_013743	GAC	2	6	22443	22448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163317
613	NC_013743	CTG	2	6	22494	22499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163317
614	NC_013743	CGA	2	6	22545	22550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163317
615	NC_013743	ACAA	2	8	22583	22590	75 %	0 %	0 %	25 %	284163317
616	NC_013743	CGCGC	2	10	22591	22600	0 %	0 %	40 %	60 %	284163317
617	NC_013743	GAG	2	6	22630	22635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163317
618	NC_013743	TCG	2	6	22681	22686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163317
619	NC_013743	GCC	2	6	22690	22695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163317
620	NC_013743	GGCG	2	8	22696	22703	0 %	0 %	75 %	25 %	284163317
621	NC_013743	CCG	2	6	22707	22712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163317
622	NC_013743	GAG	2	6	22747	22752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163317
623	NC_013743	GCG	2	6	22765	22770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_013743	ACG	2	6	22771	22776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_013743	CGA	2	6	22814	22819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_013743	CG	4	8	22858	22865	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
627	NC_013743	CGA	2	6	22912	22917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_013743	CGCGG	2	10	22953	22962	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
629	NC_013743	GT	3	6	23009	23014	0 %	50 %	50 %	0 %	284163318
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644	NC_013743	ACCG	2	8	23425	23432	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
645	NC_013743	ATGGT	2	10	23433	23442	20 %	40 %	40 %	0 %	284163319
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670	NC_013743	GCGG	2	8	24782	24789	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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758	NC_013743	CGG	2	6	28574	28579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163323
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762	NC_013743	CGC	2	6	28731	28736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163323
763	NC_013743	CGG	2	6	28745	28750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163323
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880	NC_013743	GGCC	2	8	32951	32958	0 %	0 %	50 %	50 %	284163327
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