MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 chromosome

Total Repeats: 106449

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_013743	CGG	2	6	252185	252190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163526
7002	NC_013743	GCCC	2	8	252263	252270	0 %	0 %	25 %	75 %	284163526
7003	NC_013743	CGCCGA	2	12	252296	252307	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	284163526
7004	NC_013743	CGG	2	6	252332	252337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163526
7005	NC_013743	CGG	2	6	252395	252400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163526
7006	NC_013743	GAG	2	6	252432	252437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163526
7007	NC_013743	ACG	2	6	252441	252446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163526
7008	NC_013743	CG	3	6	252497	252502	0 %	0 %	50 %	50 %	284163526
7009	NC_013743	GCA	2	6	252517	252522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163526
7010	NC_013743	CGA	2	6	252559	252564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163526
7011	NC_013743	GAC	2	6	252572	252577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163526
7012	NC_013743	GAG	2	6	252582	252587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163526
7013	NC_013743	CGA	2	6	252683	252688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7014	NC_013743	CGA	2	6	252715	252720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7015	NC_013743	GTC	2	6	252744	252749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7016	NC_013743	CGATAC	2	12	252787	252798	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7017	NC_013743	AGCG	2	8	252812	252819	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7018	NC_013743	CCG	2	6	252836	252841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7019	NC_013743	GCC	2	6	252927	252932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163527
7020	NC_013743	CGG	2	6	252935	252940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163527
7021	NC_013743	CGGC	2	8	252943	252950	0 %	0 %	50 %	50 %	284163527
7022	NC_013743	GCC	2	6	253085	253090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163527
7023	NC_013743	CGG	2	6	253108	253113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163527
7024	NC_013743	GC	3	6	253193	253198	0 %	0 %	50 %	50 %	284163527
7025	NC_013743	CT	3	6	253212	253217	0 %	50 %	0 %	50 %	284163527
7026	NC_013743	CGG	2	6	253222	253227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163527
7027	NC_013743	CGT	2	6	253247	253252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163527
7028	NC_013743	CTG	3	9	253332	253340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163527
7029	NC_013743	CGG	2	6	253373	253378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163527
7030	NC_013743	CGA	2	6	253406	253411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163527
7031	NC_013743	GCGA	2	8	253458	253465	25 %	0 %	50 %	25 %	284163527
7032	NC_013743	CGT	2	6	253538	253543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163527
7033	NC_013743	GCG	2	6	253584	253589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163527
7034	NC_013743	CCG	2	6	253597	253602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163527
7035	NC_013743	GCCG	2	8	253641	253648	0 %	0 %	50 %	50 %	284163527
7036	NC_013743	CGG	2	6	253718	253723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163527
7037	NC_013743	CCG	2	6	253821	253826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7038	NC_013743	CTA	2	6	253894	253899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284163528
7039	NC_013743	AAG	3	9	253920	253928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284163528
7040	NC_013743	ATG	2	6	253977	253982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284163528
7041	NC_013743	GGC	2	6	254026	254031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163528
7042	NC_013743	CGT	2	6	254080	254085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163529
7043	NC_013743	AAG	2	6	254108	254113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284163529
7044	NC_013743	GCC	2	6	254129	254134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163529
7045	NC_013743	CGA	2	6	254185	254190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163529
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7047	NC_013743	CG	3	6	254273	254278	0 %	0 %	50 %	50 %	284163529
7048	NC_013743	CGA	2	6	254287	254292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163529
7049	NC_013743	CGT	2	6	254305	254310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163529
7050	NC_013743	CGCCT	2	10	254341	254350	0 %	20 %	20 %	60 %	284163530
7051	NC_013743	CG	3	6	254383	254388	0 %	0 %	50 %	50 %	284163530
7052	NC_013743	CGTG	2	8	254396	254403	0 %	25 %	50 %	25 %	284163530
7053	NC_013743	CGA	2	6	254421	254426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163530
7054	NC_013743	CGT	2	6	254430	254435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163530
7055	NC_013743	CGA	2	6	254448	254453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163530
7056	NC_013743	ACC	2	6	254476	254481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284163530
7057	NC_013743	CGG	2	6	254484	254489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163530
7058	NC_013743	GCT	2	6	254532	254537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163530
7059	NC_013743	GAG	2	6	254578	254583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163530
7060	NC_013743	CGC	2	6	254625	254630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163530
7061	NC_013743	CGT	2	6	254637	254642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163530
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7063	NC_013743	CGA	2	6	254780	254785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163530
7064	NC_013743	CGAC	2	8	254813	254820	25 %	0 %	25 %	50 %	284163530
7065	NC_013743	CGT	2	6	254931	254936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163530
7066	NC_013743	ACC	2	6	254947	254952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284163530
7067	NC_013743	TCT	2	6	255004	255009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7068	NC_013743	GCT	2	6	255068	255073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7069	NC_013743	CGA	2	6	255106	255111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7070	NC_013743	CGAGA	2	10	255117	255126	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
7071	NC_013743	TCG	2	6	255143	255148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7072	NC_013743	GC	3	6	255156	255161	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7073	NC_013743	GCT	2	6	255210	255215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163531
7074	NC_013743	GTC	3	9	255241	255249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163531
7075	NC_013743	GTC	2	6	255259	255264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163531
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7077	NC_013743	GTC	2	6	255301	255306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163531
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7079	NC_013743	GCGT	2	8	255348	255355	0 %	25 %	50 %	25 %	284163531
7080	NC_013743	GCA	2	6	255486	255491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163531
7081	NC_013743	CGCA	2	8	255539	255546	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7082	NC_013743	CGA	2	6	255565	255570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7083	NC_013743	CCG	2	6	255763	255768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7084	NC_013743	CGG	2	6	255775	255780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7085	NC_013743	TTC	2	6	255820	255825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7086	NC_013743	CTGC	2	8	255829	255836	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7087	NC_013743	CCGG	2	8	255869	255876	0 %	0 %	50 %	50 %	284163532
7088	NC_013743	ACG	2	6	255887	255892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163532
7089	NC_013743	GC	3	6	255901	255906	0 %	0 %	50 %	50 %	284163532
7090	NC_013743	GTCG	2	8	255937	255944	0 %	25 %	50 %	25 %	284163532
7091	NC_013743	TC	4	8	255954	255961	0 %	50 %	0 %	50 %	284163532
7092	NC_013743	CGAAG	2	10	255983	255992	40 %	0 %	40 %	20 %	284163532
7093	NC_013743	CAA	2	6	256018	256023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284163532
7094	NC_013743	CAA	3	9	256029	256037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284163533
7095	NC_013743	CAG	2	6	256041	256046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163533
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7098	NC_013743	CGG	3	9	256193	256201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163533
7099	NC_013743	CCA	2	6	256216	256221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284163533
7100	NC_013743	CGA	2	6	256232	256237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163533
7101	NC_013743	TCG	2	6	256243	256248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163533
7102	NC_013743	CGC	2	6	256265	256270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163533
7103	NC_013743	GAG	2	6	256278	256283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163533
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7105	NC_013743	AAG	2	6	256311	256316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284163533
7106	NC_013743	CGA	2	6	256325	256330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163533
7107	NC_013743	CGA	2	6	256337	256342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163533
7108	NC_013743	GAG	2	6	256380	256385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163533
7109	NC_013743	AGC	2	6	256390	256395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163533
7110	NC_013743	CAG	2	6	256401	256406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163533
7111	NC_013743	CAG	3	9	256410	256418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163533
7112	NC_013743	CAG	2	6	256428	256433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163533
7113	NC_013743	GCA	2	6	256436	256441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163533
7114	NC_013743	GGGCCA	2	12	256445	256456	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	284163533
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7116	NC_013743	ACG	2	6	256472	256477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163533
7117	NC_013743	CCA	2	6	256489	256494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284163534
7118	NC_013743	GAA	2	6	256542	256547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284163534
7119	NC_013743	GCC	2	6	256548	256553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163534
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7121	NC_013743	CGA	2	6	256574	256579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163534
7122	NC_013743	GAG	2	6	256590	256595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163534
7123	NC_013743	GAG	2	6	256605	256610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163534
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7233	NC_013743	CGA	2	6	260214	260219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163536
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7237	NC_013743	CAT	2	6	260331	260336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284163536
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7239	NC_013743	CGA	2	6	260397	260402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163536
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7241	NC_013743	CCT	2	6	260441	260446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284163536
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7243	NC_013743	TCG	2	6	260537	260542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163536
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7246	NC_013743	GCCC	2	8	260616	260623	0 %	0 %	25 %	75 %	284163536
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7350	NC_013743	CGA	2	6	264091	264096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163539
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7352	NC_013743	GCTCGC	2	12	264118	264129	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	284163539
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7360	NC_013743	CTC	2	6	264410	264415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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7362	NC_013743	CTC	2	6	264438	264443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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7364	NC_013743	CGT	2	6	264533	264538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7469	NC_013743	GCC	2	6	268291	268296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7470	NC_013743	ACG	2	6	268372	268377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163545
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7472	NC_013743	A	7	7	268449	268455	100 %	0 %	0 %	0 %	284163545
7473	NC_013743	CGA	2	6	268459	268464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163545
7474	NC_013743	GAC	2	6	268472	268477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163545
7475	NC_013743	CGA	2	6	268483	268488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163545
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7477	NC_013743	CGA	2	6	268531	268536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163545
7478	NC_013743	CGA	2	6	268585	268590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163545
7479	NC_013743	GCAC	2	8	268596	268603	25 %	0 %	25 %	50 %	284163545
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7481	NC_013743	TGA	2	6	268653	268658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284163545
7482	NC_013743	CGC	2	6	268677	268682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163545
7483	NC_013743	CGA	2	6	268693	268698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163545
7484	NC_013743	GTC	2	6	268742	268747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163545
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