MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 chromosome

Total Repeats: 106449

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_013743	TCG	2	6	216582	216587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163494
6002	NC_013743	TCG	2	6	216625	216630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163494
6003	NC_013743	CGT	2	6	216653	216658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163494
6004	NC_013743	GTC	2	6	216666	216671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163494
6005	NC_013743	GCTC	2	8	216739	216746	0 %	25 %	25 %	50 %	284163494
6006	NC_013743	CG	3	6	216822	216827	0 %	0 %	50 %	50 %	284163494
6007	NC_013743	CGG	2	6	216830	216835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163494
6008	NC_013743	CGTTC	2	10	216843	216852	0 %	40 %	20 %	40 %	284163494
6009	NC_013743	CGA	2	6	216863	216868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163494
6010	NC_013743	CAG	3	9	216930	216938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163494
6011	NC_013743	CGC	2	6	216980	216985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163494
6012	NC_013743	TCG	2	6	217060	217065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163494
6013	NC_013743	CGT	2	6	217079	217084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163494
6014	NC_013743	GGC	2	6	217174	217179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163494
6015	NC_013743	CGA	2	6	217190	217195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163494
6016	NC_013743	AGA	2	6	217196	217201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284163494
6017	NC_013743	CGG	2	6	217217	217222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163494
6018	NC_013743	TCG	2	6	217258	217263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163494
6019	NC_013743	GC	3	6	217267	217272	0 %	0 %	50 %	50 %	284163494
6020	NC_013743	GCT	2	6	217291	217296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163494
6021	NC_013743	TCG	2	6	217327	217332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163494
6022	NC_013743	GGGCGA	2	12	217334	217345	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	284163494
6023	NC_013743	CGT	3	9	217355	217363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163494
6024	NC_013743	CGG	2	6	217368	217373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163494
6025	NC_013743	CGT	2	6	217391	217396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163494
6026	NC_013743	TCGC	3	12	217413	217424	0 %	25 %	25 %	50 %	284163494
6027	NC_013743	AGC	2	6	217468	217473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163494
6028	NC_013743	GC	3	6	217581	217586	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6029	NC_013743	CGAA	2	8	217630	217637	50 %	0 %	25 %	25 %	284163495
6030	NC_013743	CGG	2	6	217651	217656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163495
6031	NC_013743	ACG	2	6	217686	217691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163495
6032	NC_013743	CTG	2	6	217742	217747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163495
6033	NC_013743	CGA	2	6	217774	217779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163495
6034	NC_013743	CGA	2	6	217789	217794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163495
6035	NC_013743	CGA	2	6	217816	217821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163495
6036	NC_013743	A	7	7	217853	217859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_013743	GACCGC	2	12	217967	217978	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
6038	NC_013743	CGC	2	6	217982	217987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6039	NC_013743	CGA	2	6	218022	218027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6040	NC_013743	CTG	2	6	218131	218136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6041	NC_013743	GAC	2	6	218171	218176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6042	NC_013743	CG	4	8	218213	218220	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6043	NC_013743	CG	3	6	218247	218252	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6044	NC_013743	GAG	2	6	218286	218291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163496
6045	NC_013743	CGGC	2	8	218356	218363	0 %	0 %	50 %	50 %	284163496
6046	NC_013743	GTG	2	6	218370	218375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284163496
6047	NC_013743	CG	3	6	218418	218423	0 %	0 %	50 %	50 %	284163496
6048	NC_013743	CGA	2	6	218447	218452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163496
6049	NC_013743	GCGAC	2	10	218464	218473	20 %	0 %	40 %	40 %	284163496
6050	NC_013743	CTA	2	6	218480	218485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284163496
6051	NC_013743	GAC	2	6	218511	218516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163496
6052	NC_013743	CGA	2	6	218525	218530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163496
6053	NC_013743	CTG	2	6	218532	218537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163496
6054	NC_013743	TCC	2	6	218581	218586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284163496
6055	NC_013743	CGA	2	6	218588	218593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163496
6056	NC_013743	CG	3	6	218682	218687	0 %	0 %	50 %	50 %	284163496
6057	NC_013743	CGC	2	6	218708	218713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163496
6058	NC_013743	CGT	2	6	218771	218776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163496
6059	NC_013743	GTC	2	6	218778	218783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163496
6060	NC_013743	CGA	2	6	218824	218829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163496
6061	NC_013743	GAC	2	6	218862	218867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163496
6062	NC_013743	CGA	2	6	218885	218890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163496
6063	NC_013743	CAG	2	6	218925	218930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163496
6064	NC_013743	CCG	2	6	218939	218944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163496
6065	NC_013743	GAC	2	6	218975	218980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163496
6066	NC_013743	CGA	2	6	219067	219072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163496
6067	NC_013743	GCG	2	6	219115	219120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163496
6068	NC_013743	ACG	2	6	219133	219138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163496
6069	NC_013743	GGC	2	6	219147	219152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163496
6070	NC_013743	CAA	2	6	219215	219220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284163496
6071	NC_013743	GCT	2	6	219227	219232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163496
6072	NC_013743	CGA	2	6	219238	219243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163496
6073	NC_013743	CAA	2	6	219248	219253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284163496
6074	NC_013743	GTC	2	6	219265	219270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163496
6075	NC_013743	AC	3	6	219314	219319	50 %	0 %	0 %	50 %	284163496
6076	NC_013743	ACG	2	6	219346	219351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163496
6077	NC_013743	TC	3	6	219352	219357	0 %	50 %	0 %	50 %	284163496
6078	NC_013743	CGA	2	6	219383	219388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163496
6079	NC_013743	GAC	2	6	219389	219394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163496
6080	NC_013743	CGA	2	6	219440	219445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163496
6081	NC_013743	TCGGCG	2	12	219511	219522	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	284163496
6082	NC_013743	CGC	2	6	219557	219562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163496
6083	NC_013743	CGA	2	6	219584	219589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163496
6084	NC_013743	GGA	2	6	219617	219622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163496
6085	NC_013743	GAG	2	6	219717	219722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163496
6086	NC_013743	TAC	2	6	219738	219743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284163496
6087	NC_013743	GTC	2	6	219783	219788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163496
6088	NC_013743	CGA	2	6	219797	219802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163496
6089	NC_013743	CTG	2	6	219834	219839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163496
6090	NC_013743	GC	3	6	219851	219856	0 %	0 %	50 %	50 %	284163496
6091	NC_013743	CGGA	2	8	219858	219865	25 %	0 %	50 %	25 %	284163496
6092	NC_013743	GTC	2	6	219891	219896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163496
6093	NC_013743	GGC	2	6	219948	219953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163496
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6097	NC_013743	CGAT	2	8	220019	220026	25 %	25 %	25 %	25 %	284163496
6098	NC_013743	CGCGCT	2	12	220033	220044	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	284163496
6099	NC_013743	CGG	2	6	220047	220052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163496
6100	NC_013743	CGGT	2	8	220055	220062	0 %	25 %	50 %	25 %	284163496
6101	NC_013743	ACGG	2	8	220098	220105	25 %	0 %	50 %	25 %	284163496
6102	NC_013743	CGAGAC	2	12	220135	220146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6103	NC_013743	CGG	2	6	220164	220169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6104	NC_013743	TGCG	2	8	220187	220194	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6105	NC_013743	CGA	2	6	220204	220209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6106	NC_013743	GAG	2	6	220248	220253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6107	NC_013743	ATC	2	6	220254	220259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6108	NC_013743	GGC	2	6	220355	220360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6109	NC_013743	CG	3	6	220381	220386	0 %	0 %	50 %	50 %	284163497
6110	NC_013743	CCA	2	6	220388	220393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284163497
6111	NC_013743	CGG	2	6	220460	220465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163497
6112	NC_013743	GCGG	2	8	220493	220500	0 %	0 %	75 %	25 %	284163497
6113	NC_013743	GAC	2	6	220539	220544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163497
6114	NC_013743	GCC	2	6	220545	220550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163497
6115	NC_013743	GCG	2	6	220570	220575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163497
6116	NC_013743	GGA	2	6	220577	220582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163497
6117	NC_013743	TCCGTC	2	12	220608	220619	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	284163497
6118	NC_013743	TCG	2	6	220648	220653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163497
6119	NC_013743	CGC	2	6	220670	220675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163497
6120	NC_013743	GTA	2	6	220680	220685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284163497
6121	NC_013743	CAC	2	6	220692	220697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284163497
6122	NC_013743	CGT	2	6	220766	220771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163497
6123	NC_013743	CG	3	6	220834	220839	0 %	0 %	50 %	50 %	284163497
6124	NC_013743	TCG	2	6	220900	220905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163497
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6126	NC_013743	CGT	2	6	221075	221080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163497
6127	NC_013743	TCG	2	6	221092	221097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163497
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6132	NC_013743	TCGCG	2	10	221447	221456	0 %	20 %	40 %	40 %	284163497
6133	NC_013743	CCGC	2	8	221457	221464	0 %	0 %	25 %	75 %	284163497
6134	NC_013743	GC	3	6	221463	221468	0 %	0 %	50 %	50 %	284163497
6135	NC_013743	GTC	2	6	221487	221492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163497
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6137	NC_013743	CG	3	6	221532	221537	0 %	0 %	50 %	50 %	284163497
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6141	NC_013743	CGT	2	6	221591	221596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163497
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6150	NC_013743	GTC	2	6	221936	221941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163498
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6152	NC_013743	GTC	3	9	221995	222003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163498
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6174	NC_013743	CGATC	2	10	222648	222657	20 %	20 %	20 %	40 %	284163498
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6232	NC_013743	CGA	2	6	224935	224940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6241	NC_013743	ATC	2	6	225264	225269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284163500
6242	NC_013743	CCG	2	6	225349	225354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163500
6243	NC_013743	GAC	2	6	225369	225374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163500
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6246	NC_013743	CGG	2	6	225438	225443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163500
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6251	NC_013743	TCGA	2	8	225601	225608	25 %	25 %	25 %	25 %	284163500
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6255	NC_013743	CTG	2	6	225889	225894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163501
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6288	NC_013743	ATG	2	6	226814	226819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6329	NC_013743	GCCG	2	8	228118	228125	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6330	NC_013743	GC	3	6	228160	228165	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6331	NC_013743	CAT	2	6	228271	228276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6334	NC_013743	GA	3	6	228500	228505	50 %	0 %	50 %	0 %	284163504
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6341	NC_013743	GCTC	2	8	228668	228675	0 %	25 %	25 %	50 %	284163504
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6343	NC_013743	TCG	2	6	228700	228705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163504
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6347	NC_013743	TCG	2	6	228847	228852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163504
6348	NC_013743	CTG	2	6	228855	228860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163504
6349	NC_013743	ACG	2	6	228871	228876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163504
6350	NC_013743	TCGA	2	8	228900	228907	25 %	25 %	25 %	25 %	284163504
6351	NC_013743	CG	3	6	228946	228951	0 %	0 %	50 %	50 %	284163504
6352	NC_013743	TGG	2	6	228955	228960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284163504
6353	NC_013743	GCGG	2	8	228971	228978	0 %	0 %	75 %	25 %	284163504
6354	NC_013743	CGAC	2	8	228998	229005	25 %	0 %	25 %	50 %	284163504
6355	NC_013743	ACG	2	6	229048	229053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163504
6356	NC_013743	CGA	3	9	229094	229102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163504
6357	NC_013743	CGA	2	6	229130	229135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163504
6358	NC_013743	ACCGGC	2	12	229143	229154	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	284163504
6359	NC_013743	CGG	2	6	229157	229162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163504
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6361	NC_013743	GTGC	2	8	229190	229197	0 %	25 %	50 %	25 %	284163504
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6469	NC_013743	TCGTC	2	10	232713	232722	0 %	40 %	20 %	40 %	284163507
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6479	NC_013743	TCG	2	6	233112	233117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6481	NC_013743	AT	3	6	233274	233279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6482	NC_013743	TCG	2	6	233380	233385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6483	NC_013743	GAC	2	6	233427	233432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163508
6484	NC_013743	CTC	2	6	233433	233438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284163508
6485	NC_013743	CCG	2	6	233450	233455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163508
6486	NC_013743	CG	3	6	233465	233470	0 %	0 %	50 %	50 %	284163508
6487	NC_013743	CGCTCG	2	12	233575	233586	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	284163508
6488	NC_013743	ACC	2	6	233593	233598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284163508
6489	NC_013743	CCG	2	6	233599	233604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163508
6490	NC_013743	TCG	2	6	233605	233610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163508
6491	NC_013743	GAC	2	6	233663	233668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163508
6492	NC_013743	TCG	2	6	233686	233691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163508
6493	NC_013743	CGA	2	6	233714	233719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163508
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6498	NC_013743	CGG	2	6	233884	233889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163508
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