MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halomicrobium mukohataei DSM 12286 chromosome

Total Repeats: 84768

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_013202	GGCG	2	8	207149	207156	0 %	0 %	75 %	25 %	257386280
5502	NC_013202	TGA	2	6	207257	207262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257386280
5503	NC_013202	CTG	2	6	207391	207396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386280
5504	NC_013202	ACG	2	6	207431	207436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386280
5505	NC_013202	CTA	2	6	207501	207506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257386280
5506	NC_013202	CGA	2	6	207510	207515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386280
5507	NC_013202	TGG	2	6	207528	207533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257386280
5508	NC_013202	CGA	2	6	207534	207539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386280
5509	NC_013202	GAT	2	6	207558	207563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257386280
5510	NC_013202	CGT	2	6	207646	207651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386280
5511	NC_013202	GTC	3	9	207691	207699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386280
5512	NC_013202	CCG	2	6	207702	207707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386280
5513	NC_013202	GTC	2	6	207717	207722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386280
5514	NC_013202	GAC	2	6	207724	207729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386280
5515	NC_013202	CAC	2	6	207813	207818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257386280
5516	NC_013202	GA	3	6	207839	207844	50 %	0 %	50 %	0 %	257386280
5517	NC_013202	AGT	2	6	207980	207985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257386281
5518	NC_013202	GCG	2	6	207989	207994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386281
5519	NC_013202	TCGGTC	2	12	208000	208011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386281
5520	NC_013202	TCG	2	6	208072	208077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386281
5521	NC_013202	GGA	2	6	208127	208132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257386281
5522	NC_013202	CGA	2	6	208211	208216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386281
5523	NC_013202	CGA	2	6	208328	208333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386281
5524	NC_013202	CGA	2	6	208340	208345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386281
5525	NC_013202	CGG	2	6	208349	208354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386281
5526	NC_013202	ACG	2	6	208399	208404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386281
5527	NC_013202	CCG	2	6	208417	208422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386281
5528	NC_013202	TGAC	2	8	208427	208434	25 %	25 %	25 %	25 %	257386281
5529	NC_013202	CGT	2	6	208500	208505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386281
5530	NC_013202	ACCG	2	8	208668	208675	25 %	0 %	25 %	50 %	257386281
5531	NC_013202	CGT	2	6	208760	208765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386281
5532	NC_013202	CGCGAG	2	12	208797	208808	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	257386281
5533	NC_013202	GTA	2	6	208947	208952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257386281
5534	NC_013202	TCA	2	6	208976	208981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257386281
5535	NC_013202	CGC	2	6	208992	208997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386281
5536	NC_013202	CGTG	2	8	209078	209085	0 %	25 %	50 %	25 %	257386281
5537	NC_013202	TCG	2	6	209156	209161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386281
5538	NC_013202	GTT	2	6	209187	209192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257386281
5539	NC_013202	CTC	2	6	209223	209228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257386281
5540	NC_013202	TCGGG	2	10	209234	209243	0 %	20 %	60 %	20 %	257386281
5541	NC_013202	TGA	2	6	209249	209254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257386281
5542	NC_013202	GTCG	2	8	209295	209302	0 %	25 %	50 %	25 %	257386281
5543	NC_013202	CGT	2	6	209348	209353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386281
5544	NC_013202	GGT	2	6	209405	209410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257386281
5545	NC_013202	CGA	2	6	209411	209416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386281
5546	NC_013202	C	7	7	209417	209423	0 %	0 %	0 %	100 %	257386281
5547	NC_013202	CGA	2	6	209481	209486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386281
5548	NC_013202	TCG	2	6	209530	209535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386281
5549	NC_013202	TCG	2	6	209578	209583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386281
5550	NC_013202	TCCT	2	8	209628	209635	0 %	50 %	0 %	50 %	257386281
5551	NC_013202	GTT	2	6	209643	209648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257386281
5552	NC_013202	TCG	2	6	209651	209656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386281
5553	NC_013202	GTT	2	6	209712	209717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257386281
5554	NC_013202	CCG	2	6	209755	209760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386281
5555	NC_013202	AGT	2	6	209780	209785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257386281
5556	NC_013202	GC	3	6	209787	209792	0 %	0 %	50 %	50 %	257386281
5557	NC_013202	ACCGT	2	10	209824	209833	20 %	20 %	20 %	40 %	257386281
5558	NC_013202	CT	3	6	209857	209862	0 %	50 %	0 %	50 %	257386281
5559	NC_013202	GAT	2	6	209931	209936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257386281
5560	NC_013202	CGT	2	6	209984	209989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386281
5561	NC_013202	GTT	2	6	210018	210023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257386281
5562	NC_013202	CGT	2	6	210035	210040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386281
5563	NC_013202	GTG	2	6	210077	210082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257386281
5564	NC_013202	CCG	2	6	210201	210206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5565	NC_013202	CTA	2	6	210223	210228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5566	NC_013202	TGT	2	6	210233	210238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_013202	A	6	6	210275	210280	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_013202	GTA	2	6	210296	210301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_013202	ACA	2	6	210307	210312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5570	NC_013202	GTG	2	6	210323	210328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5571	NC_013202	TCA	2	6	210348	210353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5572	NC_013202	TCG	2	6	210431	210436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5573	NC_013202	TGTC	2	8	210516	210523	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5574	NC_013202	GCCGT	2	10	210558	210567	0 %	20 %	40 %	40 %	257386282
5575	NC_013202	CGG	2	6	210596	210601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386282
5576	NC_013202	CGA	2	6	210607	210612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386282
5577	NC_013202	GGC	2	6	210648	210653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386282
5578	NC_013202	CG	3	6	210752	210757	0 %	0 %	50 %	50 %	257386282
5579	NC_013202	CGG	2	6	210760	210765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386282
5580	NC_013202	GTCGCG	2	12	210794	210805	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	257386282
5581	NC_013202	CCGA	2	8	210815	210822	25 %	0 %	25 %	50 %	257386282
5582	NC_013202	CGG	2	6	210823	210828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386282
5583	NC_013202	CGT	2	6	210845	210850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386282
5584	NC_013202	ACG	2	6	210852	210857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386282
5585	NC_013202	GCG	2	6	210959	210964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386282
5586	NC_013202	GTC	2	6	210971	210976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386282
5587	NC_013202	CGT	2	6	211009	211014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386282
5588	NC_013202	ACG	2	6	211074	211079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386282
5589	NC_013202	CGAG	2	8	211137	211144	25 %	0 %	50 %	25 %	257386282
5590	NC_013202	CGT	2	6	211165	211170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386282
5591	NC_013202	ACC	2	6	211196	211201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257386282
5592	NC_013202	CGA	2	6	211218	211223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386282
5593	NC_013202	CGGA	3	12	211293	211304	25 %	0 %	50 %	25 %	257386283
5594	NC_013202	GA	3	6	211326	211331	50 %	0 %	50 %	0 %	257386283
5595	NC_013202	CGG	2	6	211362	211367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386283
5596	NC_013202	CAGA	2	8	211389	211396	50 %	0 %	25 %	25 %	257386283
5597	NC_013202	CGGCCG	2	12	211485	211496	0 %	0 %	50 %	50 %	257386283
5598	NC_013202	GCG	2	6	211497	211502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386283
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5601	NC_013202	GCC	2	6	211553	211558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386283
5602	NC_013202	TCG	2	6	211593	211598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386283
5603	NC_013202	CGG	2	6	211612	211617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386283
5604	NC_013202	ACT	2	6	211645	211650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257386283
5605	NC_013202	CGG	2	6	211746	211751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386283
5606	NC_013202	ACCGTC	2	12	211766	211777	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	257386283
5607	NC_013202	GCG	2	6	211808	211813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386283
5608	NC_013202	CGA	2	6	211822	211827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386283
5609	NC_013202	CCGC	2	8	211854	211861	0 %	0 %	25 %	75 %	257386283
5610	NC_013202	GCC	3	9	211868	211876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386283
5611	NC_013202	CGAG	2	8	211879	211886	25 %	0 %	50 %	25 %	257386283
5612	NC_013202	ACG	2	6	211908	211913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386283
5613	NC_013202	CA	3	6	211929	211934	50 %	0 %	0 %	50 %	257386283
5614	NC_013202	GAC	2	6	211978	211983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386283
5615	NC_013202	CCT	2	6	212002	212007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257386283
5616	NC_013202	CGA	2	6	212026	212031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386283
5617	NC_013202	GCAC	2	8	212037	212044	25 %	0 %	25 %	50 %	257386283
5618	NC_013202	CGC	2	6	212058	212063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386283
5619	NC_013202	CGC	2	6	212078	212083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386283
5620	NC_013202	CGT	2	6	212101	212106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386283
5621	NC_013202	CGAC	2	8	212130	212137	25 %	0 %	25 %	50 %	257386283
5622	NC_013202	TCG	2	6	212277	212282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386283
5623	NC_013202	CCG	2	6	212292	212297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386283
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5649	NC_013202	GA	3	6	213475	213480	50 %	0 %	50 %	0 %	257386286
5650	NC_013202	ACG	2	6	213493	213498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386286
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5652	NC_013202	GAT	2	6	213548	213553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257386286
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5732	NC_013202	TCG	2	6	216968	216973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386288
5733	NC_013202	CGT	2	6	216978	216983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386288
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5736	NC_013202	AAC	2	6	217093	217098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5737	NC_013202	GCC	2	6	217215	217220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386289
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5740	NC_013202	CGAG	2	8	217409	217416	25 %	0 %	50 %	25 %	257386289
5741	NC_013202	CGCT	2	8	217418	217425	0 %	25 %	25 %	50 %	257386289
5742	NC_013202	GCC	2	6	217432	217437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386289
5743	NC_013202	C	6	6	217436	217441	0 %	0 %	0 %	100 %	257386289
5744	NC_013202	CGC	2	6	217484	217489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386289
5745	NC_013202	CGTT	2	8	217503	217510	0 %	50 %	25 %	25 %	257386289
5746	NC_013202	CTCGAT	2	12	217556	217567	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	257386289
5747	NC_013202	CGGG	2	8	217573	217580	0 %	0 %	75 %	25 %	257386289
5748	NC_013202	CAG	2	6	217703	217708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386289
5749	NC_013202	GTC	2	6	217733	217738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386289
5750	NC_013202	CGA	2	6	217765	217770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386289
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5752	NC_013202	TCC	2	6	217872	217877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257386289
5753	NC_013202	TGA	2	6	217885	217890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257386289
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5755	NC_013202	GC	3	6	217963	217968	0 %	0 %	50 %	50 %	257386289
5756	NC_013202	CGCTGG	2	12	217983	217994	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	257386289
5757	NC_013202	TGT	2	6	218082	218087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257386289
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5761	NC_013202	GTCG	2	8	218282	218289	0 %	25 %	50 %	25 %	257386289
5762	NC_013202	CAG	2	6	218294	218299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386289
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5764	NC_013202	TCC	2	6	218445	218450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257386289
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5768	NC_013202	CTCG	2	8	218513	218520	0 %	25 %	25 %	50 %	257386289
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5772	NC_013202	CGG	2	6	218634	218639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386289
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5811	NC_013202	GCAG	2	8	220048	220055	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5812	NC_013202	ACT	2	6	220058	220063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5832	NC_013202	TCG	2	6	220804	220809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386291
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5843	NC_013202	AG	3	6	221296	221301	50 %	0 %	50 %	0 %	257386291
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5850	NC_013202	ACG	2	6	221499	221504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5852	NC_013202	TC	3	6	221600	221605	0 %	50 %	0 %	50 %	257386292
5853	NC_013202	CGA	2	6	221618	221623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386292
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5857	NC_013202	TCG	2	6	221794	221799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386292
5858	NC_013202	GCG	2	6	221842	221847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386292
5859	NC_013202	CTG	2	6	221898	221903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386292
5860	NC_013202	GACGC	2	10	221935	221944	20 %	0 %	40 %	40 %	257386292
5861	NC_013202	GCCG	2	8	221956	221963	0 %	0 %	50 %	50 %	257386293
5862	NC_013202	CCGCC	2	10	221978	221987	0 %	0 %	20 %	80 %	257386293
5863	NC_013202	GACC	2	8	221992	221999	25 %	0 %	25 %	50 %	257386293
5864	NC_013202	CG	3	6	222026	222031	0 %	0 %	50 %	50 %	257386293
5865	NC_013202	ACCG	2	8	222038	222045	25 %	0 %	25 %	50 %	257386293
5866	NC_013202	CCG	2	6	222081	222086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386293
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5868	NC_013202	CGT	2	6	222169	222174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386293
5869	NC_013202	CGA	2	6	222220	222225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386293
5870	NC_013202	GAC	2	6	222227	222232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386293
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5872	NC_013202	GCT	2	6	222304	222309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386293
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5874	NC_013202	AGCG	2	8	222416	222423	25 %	0 %	50 %	25 %	257386293
5875	NC_013202	GCC	2	6	222715	222720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386294
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5877	NC_013202	CG	3	6	222768	222773	0 %	0 %	50 %	50 %	257386294
5878	NC_013202	GTC	2	6	222792	222797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386294
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5882	NC_013202	TCG	2	6	223012	223017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386294
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5884	NC_013202	TCG	2	6	223042	223047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386294
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5889	NC_013202	GTA	2	6	223223	223228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5890	NC_013202	CGT	2	6	223245	223250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386295
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5892	NC_013202	CCG	2	6	223292	223297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386295
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5969	NC_013202	TG	4	8	225908	225915	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5970	NC_013202	CGC	2	6	225975	225980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5971	NC_013202	TCG	2	6	226021	226026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386299
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5976	NC_013202	GCG	2	6	226106	226111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386299
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5979	NC_013202	CG	3	6	226191	226196	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5980	NC_013202	CG	3	6	226225	226230	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5981	NC_013202	GC	3	6	226242	226247	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5982	NC_013202	AGCGA	2	10	226305	226314	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5983	NC_013202	TGG	2	6	226369	226374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257386300
5984	NC_013202	CAG	2	6	226403	226408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386300
5985	NC_013202	GCC	2	6	226439	226444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386300
5986	NC_013202	ATG	4	12	226488	226499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257386300
5987	NC_013202	CAG	2	6	226502	226507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386300
5988	NC_013202	TGT	2	6	226525	226530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257386300
5989	NC_013202	GAG	2	6	226575	226580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257386300
5990	NC_013202	CGA	2	6	226595	226600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386300
5991	NC_013202	GAC	2	6	226610	226615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386300
5992	NC_013202	GAA	2	6	226628	226633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257386300
5993	NC_013202	CGC	2	6	226646	226651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386300
5994	NC_013202	CAG	2	6	226751	226756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386300
5995	NC_013202	GCC	2	6	226766	226771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386300
5996	NC_013202	CGG	2	6	226831	226836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386300
5997	NC_013202	CGG	2	6	226855	226860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386300
5998	NC_013202	GTC	2	6	226892	226897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386300
5999	NC_013202	GC	3	6	226912	226917	0 %	0 %	50 %	50 %	257386300
6000	NC_013202	TC	3	6	226927	226932	0 %	50 %	0 %	50 %	257386300

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