MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Halomicrobium mukohataei DSM 12286 plasmid pHmuk01

Total Repeats: 439

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013201	CA	3	6	300	305	50 %	0 %	0 %	50 %	257372909
2	NC_013201	TC	3	6	724	729	0 %	50 %	0 %	50 %	257372909
3	NC_013201	GC	3	6	2344	2349	0 %	0 %	50 %	50 %	257372910
4	NC_013201	CG	3	6	3515	3520	0 %	0 %	50 %	50 %	257372912
5	NC_013201	GT	3	6	4514	4519	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013201	CG	3	6	6706	6711	0 %	0 %	50 %	50 %	257372913
7	NC_013201	AG	3	6	7031	7036	50 %	0 %	50 %	0 %	257372913
8	NC_013201	CG	3	6	7319	7324	0 %	0 %	50 %	50 %	257372913
9	NC_013201	GT	3	6	7727	7732	0 %	50 %	50 %	0 %	257372913
10	NC_013201	GC	3	6	8401	8406	0 %	0 %	50 %	50 %	257372914
11	NC_013201	GC	3	6	8530	8535	0 %	0 %	50 %	50 %	257372914
12	NC_013201	AG	3	6	8738	8743	50 %	0 %	50 %	0 %	257372914
13	NC_013201	AG	3	6	10518	10523	50 %	0 %	50 %	0 %	257372914
14	NC_013201	CT	3	6	10715	10720	0 %	50 %	0 %	50 %	257372914
15	NC_013201	GC	3	6	11050	11055	0 %	0 %	50 %	50 %	257372914
16	NC_013201	CA	3	6	11770	11775	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_013201	AG	3	6	11788	11793	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013201	TC	3	6	11891	11896	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_013201	CA	3	6	11964	11969	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_013201	GC	3	6	12088	12093	0 %	0 %	50 %	50 %	257372915
21	NC_013201	CA	4	8	12392	12399	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_013201	GT	3	6	12745	12750	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013201	GC	3	6	13354	13359	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_013201	TC	3	6	14675	14680	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_013201	CT	3	6	15015	15020	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_013201	GT	3	6	16159	16164	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013201	CG	3	6	16188	16193	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_013201	GA	3	6	17794	17799	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013201	GT	3	6	18376	18381	0 %	50 %	50 %	0 %	257372916
30	NC_013201	CA	3	6	18611	18616	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_013201	GC	3	6	19243	19248	0 %	0 %	50 %	50 %	257372917
32	NC_013201	AC	3	6	19576	19581	50 %	0 %	0 %	50 %	257372917
33	NC_013201	CG	4	8	20690	20697	0 %	0 %	50 %	50 %	257372918
34	NC_013201	GT	3	6	21401	21406	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013201	GC	3	6	22982	22987	0 %	0 %	50 %	50 %	257372919
36	NC_013201	CG	3	6	23055	23060	0 %	0 %	50 %	50 %	257372919
37	NC_013201	GA	3	6	23863	23868	50 %	0 %	50 %	0 %	257372919
38	NC_013201	CA	3	6	24002	24007	50 %	0 %	0 %	50 %	257372920
39	NC_013201	GC	3	6	24227	24232	0 %	0 %	50 %	50 %	257372920
40	NC_013201	TG	3	6	24568	24573	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013201	GC	3	6	25452	25457	0 %	0 %	50 %	50 %	257372921
42	NC_013201	TG	3	6	25732	25737	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013201	CG	3	6	26245	26250	0 %	0 %	50 %	50 %	257372922
44	NC_013201	GA	3	6	26554	26559	50 %	0 %	50 %	0 %	257372922
45	NC_013201	AG	3	6	26619	26624	50 %	0 %	50 %	0 %	257372922
46	NC_013201	CG	3	6	28052	28057	0 %	0 %	50 %	50 %	257372924
47	NC_013201	GC	3	6	28215	28220	0 %	0 %	50 %	50 %	257372924
48	NC_013201	GC	3	6	28304	28309	0 %	0 %	50 %	50 %	257372924
49	NC_013201	TC	3	6	28964	28969	0 %	50 %	0 %	50 %	257372925
50	NC_013201	AG	3	6	30747	30752	50 %	0 %	50 %	0 %	257372925
51	NC_013201	AC	3	6	31120	31125	50 %	0 %	0 %	50 %	257372925
52	NC_013201	AG	3	6	31188	31193	50 %	0 %	50 %	0 %	257372925
53	NC_013201	CG	3	6	31360	31365	0 %	0 %	50 %	50 %	257372925
54	NC_013201	CT	3	6	31965	31970	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_013201	GA	3	6	32307	32312	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013201	TC	3	6	33472	33477	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_013201	CA	3	6	33739	33744	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_013201	CA	3	6	33949	33954	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_013201	CA	4	8	34197	34204	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_013201	AC	3	6	34783	34788	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_013201	TC	3	6	35289	35294	0 %	50 %	0 %	50 %	257372926
62	NC_013201	TG	3	6	35658	35663	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013201	CA	3	6	36082	36087	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_013201	AC	3	6	37020	37025	50 %	0 %	0 %	50 %	257372930
65	NC_013201	AC	3	6	37090	37095	50 %	0 %	0 %	50 %	257372930
66	NC_013201	AC	3	6	37465	37470	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_013201	CA	3	6	37565	37570	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_013201	AC	3	6	38972	38977	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_013201	AC	3	6	39134	39139	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_013201	AC	3	6	39205	39210	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_013201	GA	3	6	39261	39266	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013201	CG	3	6	39310	39315	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_013201	CG	3	6	39830	39835	0 %	0 %	50 %	50 %	257372933
74	NC_013201	GT	3	6	40836	40841	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013201	CA	3	6	40994	40999	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_013201	AG	3	6	41044	41049	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013201	CT	4	8	41461	41468	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_013201	CT	3	6	41538	41543	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_013201	CG	3	6	41779	41784	0 %	0 %	50 %	50 %	257372934
80	NC_013201	TG	3	6	42124	42129	0 %	50 %	50 %	0 %	257372934
81	NC_013201	TC	3	6	42187	42192	0 %	50 %	0 %	50 %	257372934
82	NC_013201	AG	3	6	43311	43316	50 %	0 %	50 %	0 %	257372934
83	NC_013201	GA	3	6	44087	44092	50 %	0 %	50 %	0 %	257372934
84	NC_013201	CG	3	6	47653	47658	0 %	0 %	50 %	50 %	257372936
85	NC_013201	GC	3	6	47961	47966	0 %	0 %	50 %	50 %	257372936
86	NC_013201	CG	4	8	48342	48349	0 %	0 %	50 %	50 %	257372936
87	NC_013201	CG	3	6	48901	48906	0 %	0 %	50 %	50 %	257372937
88	NC_013201	GC	3	6	49325	49330	0 %	0 %	50 %	50 %	257372937
89	NC_013201	GC	3	6	49473	49478	0 %	0 %	50 %	50 %	257372937
90	NC_013201	GC	3	6	50117	50122	0 %	0 %	50 %	50 %	257372937
91	NC_013201	CG	3	6	50386	50391	0 %	0 %	50 %	50 %	257372938
92	NC_013201	CG	3	6	50418	50423	0 %	0 %	50 %	50 %	257372938
93	NC_013201	GC	3	6	51090	51095	0 %	0 %	50 %	50 %	257372938
94	NC_013201	CG	3	6	51285	51290	0 %	0 %	50 %	50 %	257372938
95	NC_013201	CG	3	6	51606	51611	0 %	0 %	50 %	50 %	257372938
96	NC_013201	GC	3	6	52201	52206	0 %	0 %	50 %	50 %	257372938
97	NC_013201	CG	3	6	52355	52360	0 %	0 %	50 %	50 %	257372938
98	NC_013201	CG	3	6	52594	52599	0 %	0 %	50 %	50 %	257372938
99	NC_013201	GC	3	6	52670	52675	0 %	0 %	50 %	50 %	257372938
100	NC_013201	GC	3	6	52934	52939	0 %	0 %	50 %	50 %	257372938
101	NC_013201	AG	3	6	53004	53009	50 %	0 %	50 %	0 %	257372938
102	NC_013201	CG	3	6	53284	53289	0 %	0 %	50 %	50 %	257372938
103	NC_013201	TG	3	6	53456	53461	0 %	50 %	50 %	0 %	257372938
104	NC_013201	GC	3	6	53786	53791	0 %	0 %	50 %	50 %	257372938
105	NC_013201	CG	3	6	53891	53896	0 %	0 %	50 %	50 %	257372938
106	NC_013201	CG	3	6	53931	53936	0 %	0 %	50 %	50 %	257372938
107	NC_013201	GA	3	6	54609	54614	50 %	0 %	50 %	0 %	257372938
108	NC_013201	TC	3	6	54741	54746	0 %	50 %	0 %	50 %	257372938
109	NC_013201	CT	3	6	54786	54791	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_013201	CG	3	6	55038	55043	0 %	0 %	50 %	50 %	257372939
111	NC_013201	GC	3	6	55053	55058	0 %	0 %	50 %	50 %	257372939
112	NC_013201	TC	3	6	56054	56059	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_013201	TC	3	6	56884	56889	0 %	50 %	0 %	50 %	257372940
114	NC_013201	CG	3	6	56936	56941	0 %	0 %	50 %	50 %	257372940
115	NC_013201	CT	3	6	57259	57264	0 %	50 %	0 %	50 %	257372940
116	NC_013201	TC	4	8	58390	58397	0 %	50 %	0 %	50 %	257372941
117	NC_013201	TG	3	6	59151	59156	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013201	CT	3	6	59294	59299	0 %	50 %	0 %	50 %	257372942
119	NC_013201	AC	3	6	59378	59383	50 %	0 %	0 %	50 %	257372942
120	NC_013201	GA	3	6	60275	60280	50 %	0 %	50 %	0 %	257372942
121	NC_013201	AG	3	6	61332	61337	50 %	0 %	50 %	0 %	257372944
122	NC_013201	GC	3	6	61904	61909	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_013201	TC	3	6	62019	62024	0 %	50 %	0 %	50 %	257372945
124	NC_013201	GC	3	6	62238	62243	0 %	0 %	50 %	50 %	257372945
125	NC_013201	TC	3	6	62596	62601	0 %	50 %	0 %	50 %	257372946
126	NC_013201	TG	3	6	63347	63352	0 %	50 %	50 %	0 %	257372946
127	NC_013201	GC	3	6	63630	63635	0 %	0 %	50 %	50 %	257372946
128	NC_013201	TC	3	6	63865	63870	0 %	50 %	0 %	50 %	257372946
129	NC_013201	AC	3	6	64174	64179	50 %	0 %	0 %	50 %	257372947
130	NC_013201	CT	3	6	65018	65023	0 %	50 %	0 %	50 %	257372948
131	NC_013201	GA	3	6	66300	66305	50 %	0 %	50 %	0 %	257372948
132	NC_013201	GA	3	6	67080	67085	50 %	0 %	50 %	0 %	257372948
133	NC_013201	TC	3	6	67820	67825	0 %	50 %	0 %	50 %	257372950
134	NC_013201	TC	3	6	68369	68374	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_013201	GT	3	6	68435	68440	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013201	CT	3	6	68478	68483	0 %	50 %	0 %	50 %	257372951
137	NC_013201	CT	3	6	68729	68734	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_013201	CG	3	6	68884	68889	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_013201	TG	4	8	70008	70015	0 %	50 %	50 %	0 %	257372952
140	NC_013201	AG	3	6	70506	70511	50 %	0 %	50 %	0 %	257372953
141	NC_013201	CT	3	6	70632	70637	0 %	50 %	0 %	50 %	257372953
142	NC_013201	CT	3	6	70908	70913	0 %	50 %	0 %	50 %	257372953
143	NC_013201	CA	3	6	71079	71084	50 %	0 %	0 %	50 %	257372954
144	NC_013201	TC	4	8	72190	72197	0 %	50 %	0 %	50 %	257372955
145	NC_013201	CT	3	6	72576	72581	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_013201	GA	3	6	73012	73017	50 %	0 %	50 %	0 %	257372956
147	NC_013201	CG	3	6	73298	73303	0 %	0 %	50 %	50 %	257372956
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431	NC_013201	TG	3	6	216032	216037	0 %	50 %	50 %	0 %	257373079
432	NC_013201	GC	3	6	217252	217257	0 %	0 %	50 %	50 %	257373081
433	NC_013201	GA	3	6	217806	217811	50 %	0 %	50 %	0 %	257373081
434	NC_013201	GC	3	6	217909	217914	0 %	0 %	50 %	50 %	257373081
435	NC_013201	AC	3	6	218112	218117	50 %	0 %	0 %	50 %	257373081
436	NC_013201	CG	3	6	218348	218353	0 %	0 %	50 %	50 %	257373081
437	NC_013201	GT	4	8	218450	218457	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
438	NC_013201	CT	3	6	220003	220008	0 %	50 %	0 %	50 %	257373083
439	NC_013201	CG	3	6	221053	221058	0 %	0 %	50 %	50 %	257373084

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.