MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halomicrobium mukohataei DSM 12286 plasmid pHmuk01

Total Repeats: 5721

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_013201	CGA	2	6	140165	140170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257373005
3502	NC_013201	CTC	2	6	140211	140216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257373005
3503	NC_013201	CGGG	2	8	140217	140224	0 %	0 %	75 %	25 %	257373005
3504	NC_013201	GCGG	2	8	140225	140232	0 %	0 %	75 %	25 %	257373005
3505	NC_013201	CGG	2	6	140252	140257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257373005
3506	NC_013201	CTG	2	6	140280	140285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257373005
3507	NC_013201	CG	4	8	140290	140297	0 %	0 %	50 %	50 %	257373005
3508	NC_013201	TCG	2	6	140304	140309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257373005
3509	NC_013201	CG	3	6	140313	140318	0 %	0 %	50 %	50 %	257373005
3510	NC_013201	GTC	2	6	140331	140336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257373005
3511	NC_013201	GA	4	8	140359	140366	50 %	0 %	50 %	0 %	257373005
3512	NC_013201	GACAC	2	10	140383	140392	40 %	0 %	20 %	40 %	257373006
3513	NC_013201	ACG	2	6	140394	140399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257373006
3514	NC_013201	GC	3	6	140405	140410	0 %	0 %	50 %	50 %	257373006
3515	NC_013201	CG	3	6	140416	140421	0 %	0 %	50 %	50 %	257373006
3516	NC_013201	CCACG	2	10	140422	140431	20 %	0 %	20 %	60 %	257373006
3517	NC_013201	CGA	2	6	140491	140496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257373006
3518	NC_013201	CG	3	6	140563	140568	0 %	0 %	50 %	50 %	257373006
3519	NC_013201	GAG	2	6	140630	140635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257373006
3520	NC_013201	CG	3	6	140697	140702	0 %	0 %	50 %	50 %	257373006
3521	NC_013201	GCT	2	6	140725	140730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257373006
3522	NC_013201	TCG	2	6	140769	140774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257373006
3523	NC_013201	CGT	2	6	140780	140785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257373006
3524	NC_013201	CGA	2	6	140788	140793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257373006
3525	NC_013201	CGT	2	6	140965	140970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257373006
3526	NC_013201	CG	3	6	140985	140990	0 %	0 %	50 %	50 %	257373006
3527	NC_013201	GCC	2	6	140999	141004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257373006
3528	NC_013201	CGA	2	6	141046	141051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257373006
3529	NC_013201	CGT	2	6	141052	141057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257373006
3530	NC_013201	CGA	2	6	141070	141075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257373006
3531	NC_013201	CCT	2	6	141204	141209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257373006
3532	NC_013201	CGA	2	6	141364	141369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257373006
3533	NC_013201	AGAGCG	2	12	141420	141431	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	257373006
3534	NC_013201	GTC	2	6	141449	141454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257373006
3535	NC_013201	AG	3	6	141458	141463	50 %	0 %	50 %	0 %	257373006
3536	NC_013201	CGG	2	6	141485	141490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257373006
3537	NC_013201	CCGG	2	8	141640	141647	0 %	0 %	50 %	50 %	257373006
3538	NC_013201	CAG	2	6	141692	141697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257373006
3539	NC_013201	CGA	3	9	141715	141723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257373006
3540	NC_013201	TAC	2	6	141764	141769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257373006
3541	NC_013201	GATCG	2	10	141788	141797	20 %	20 %	40 %	20 %	257373006
3542	NC_013201	CGA	2	6	141856	141861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257373006
3543	NC_013201	CTA	2	6	141871	141876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257373006
3544	NC_013201	CGT	2	6	141877	141882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257373006
3545	NC_013201	AAC	2	6	141887	141892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257373006
3546	NC_013201	CCG	2	6	141921	141926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257373006
3547	NC_013201	TGG	2	6	141930	141935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257373006
3548	NC_013201	CTC	2	6	141947	141952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257373006
3549	NC_013201	ACC	2	6	141966	141971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257373006
3550	NC_013201	TCG	2	6	141974	141979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257373006
3551	NC_013201	CCGT	2	8	141994	142001	0 %	25 %	25 %	50 %	257373006
3552	NC_013201	TCG	2	6	142004	142009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257373006
3553	NC_013201	CTC	2	6	142022	142027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257373006
3554	NC_013201	CGA	2	6	142081	142086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257373006
3555	NC_013201	GAC	2	6	142106	142111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257373006
3556	NC_013201	GAG	2	6	142148	142153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257373006
3557	NC_013201	CGCC	2	8	142181	142188	0 %	0 %	25 %	75 %	257373007
3558	NC_013201	GTCG	2	8	142191	142198	0 %	25 %	50 %	25 %	257373007
3559	NC_013201	CGA	2	6	142203	142208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257373007
3560	NC_013201	ACG	2	6	142223	142228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257373007
3561	NC_013201	TCCG	2	8	142253	142260	0 %	25 %	25 %	50 %	257373007
3562	NC_013201	CGGC	2	8	142281	142288	0 %	0 %	50 %	50 %	257373007
3563	NC_013201	GA	3	6	142358	142363	50 %	0 %	50 %	0 %	257373007
3564	NC_013201	GAC	2	6	142459	142464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257373007
3565	NC_013201	CGAC	2	8	142493	142500	25 %	0 %	25 %	50 %	257373007
3566	NC_013201	CCT	2	6	142512	142517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257373007
3567	NC_013201	CCG	2	6	142525	142530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257373007
3568	NC_013201	TCG	2	6	142535	142540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257373007
3569	NC_013201	TGC	2	6	142574	142579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257373007
3570	NC_013201	CA	3	6	142590	142595	50 %	0 %	0 %	50 %	257373007
3571	NC_013201	GACC	2	8	142602	142609	25 %	0 %	25 %	50 %	257373007
3572	NC_013201	GTC	2	6	142642	142647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257373007
3573	NC_013201	GA	3	6	142685	142690	50 %	0 %	50 %	0 %	257373007
3574	NC_013201	GAG	2	6	142744	142749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257373007
3575	NC_013201	GCCGC	2	10	142766	142775	0 %	0 %	40 %	60 %	257373007
3576	NC_013201	GACC	2	8	142804	142811	25 %	0 %	25 %	50 %	257373008
3577	NC_013201	GGC	2	6	142894	142899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257373008
3578	NC_013201	GACC	2	8	143041	143048	25 %	0 %	25 %	50 %	257373008
3579	NC_013201	TTCTAC	2	12	143060	143071	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	257373008
3580	NC_013201	TCG	2	6	143089	143094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257373008
3581	NC_013201	ACG	2	6	143100	143105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257373008
3582	NC_013201	TCGAC	2	10	143128	143137	20 %	20 %	20 %	40 %	257373008
3583	NC_013201	GCC	2	6	143151	143156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257373008
3584	NC_013201	CGA	2	6	143242	143247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257373008
3585	NC_013201	TCG	3	9	143250	143258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257373008
3586	NC_013201	CCG	2	6	143341	143346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257373008
3587	NC_013201	CGT	2	6	143377	143382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257373008
3588	NC_013201	GCC	2	6	143399	143404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257373008
3589	NC_013201	GTC	2	6	143408	143413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257373008
3590	NC_013201	TTC	2	6	143480	143485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257373008
3591	NC_013201	AGACG	2	10	143569	143578	40 %	0 %	40 %	20 %	257373008
3592	NC_013201	CCT	2	6	143593	143598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257373008
3593	NC_013201	CG	3	6	143667	143672	0 %	0 %	50 %	50 %	257373008
3594	NC_013201	CGA	2	6	143694	143699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257373008
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3596	NC_013201	CGAC	2	8	143721	143728	25 %	0 %	25 %	50 %	257373008
3597	NC_013201	CCA	2	6	143749	143754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257373008
3598	NC_013201	CAG	2	6	143759	143764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257373008
3599	NC_013201	GTC	2	6	143795	143800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257373008
3600	NC_013201	ACC	2	6	143814	143819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257373008
3601	NC_013201	CGT	2	6	143829	143834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257373008
3602	NC_013201	AGA	2	6	143848	143853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257373008
3603	NC_013201	GGC	2	6	143877	143882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257373008
3604	NC_013201	GGC	2	6	143925	143930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257373008
3605	NC_013201	TCTGGG	2	12	143980	143991	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	257373008
3606	NC_013201	TCG	2	6	144012	144017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257373008
3607	NC_013201	CGA	2	6	144049	144054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257373008
3608	NC_013201	CCG	2	6	144105	144110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257373008
3609	NC_013201	GCC	2	6	144135	144140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257373008
3610	NC_013201	CGAA	2	8	144149	144156	50 %	0 %	25 %	25 %	257373009
3611	NC_013201	ACG	2	6	144172	144177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257373009
3612	NC_013201	GAG	2	6	144262	144267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257373009
3613	NC_013201	GCC	2	6	144338	144343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257373009
3614	NC_013201	GAC	2	6	144426	144431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257373009
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3616	NC_013201	GCC	2	6	144463	144468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257373009
3617	NC_013201	TTG	2	6	144518	144523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257373009
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3619	NC_013201	GAC	2	6	144558	144563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257373009
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3621	NC_013201	CCA	2	6	144637	144642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257373009
3622	NC_013201	CA	3	6	144641	144646	50 %	0 %	0 %	50 %	257373009
3623	NC_013201	CGG	2	6	144672	144677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257373009
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3655	NC_013201	CGA	2	6	146032	146037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257373010
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3863	NC_013201	GCT	2	6	153519	153524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257373018
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3963	NC_013201	CGT	2	6	158122	158127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3965	NC_013201	TC	3	6	158304	158309	0 %	50 %	0 %	50 %	257373023
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3970	NC_013201	T	6	6	158573	158578	0 %	100 %	0 %	0 %	257373023
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3974	NC_013201	ACT	2	6	158739	158744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3976	NC_013201	GGT	2	6	158803	158808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3977	NC_013201	GTA	2	6	158846	158851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3978	NC_013201	GAT	2	6	158877	158882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3979	NC_013201	ACT	2	6	158915	158920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3980	NC_013201	GCT	2	6	158999	159004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3981	NC_013201	CCT	2	6	159117	159122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3982	NC_013201	CAG	2	6	159146	159151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3983	NC_013201	TCAAC	2	10	159201	159210	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
3984	NC_013201	ACC	2	6	159301	159306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3985	NC_013201	GAC	2	6	159411	159416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3986	NC_013201	CACTA	2	10	159466	159475	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
3987	NC_013201	CGA	2	6	159497	159502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3988	NC_013201	TCCG	2	8	159636	159643	0 %	25 %	25 %	50 %	257373024
3989	NC_013201	GAC	2	6	159659	159664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257373024
3990	NC_013201	CCGC	2	8	159666	159673	0 %	0 %	25 %	75 %	257373024
3991	NC_013201	CAA	2	6	159712	159717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257373024
3992	NC_013201	CGA	3	9	159721	159729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257373024
3993	NC_013201	AGAC	2	8	159751	159758	50 %	0 %	25 %	25 %	257373024
3994	NC_013201	GCCC	2	8	159799	159806	0 %	0 %	25 %	75 %	257373024
3995	NC_013201	TGG	2	6	159811	159816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257373024
3996	NC_013201	GAC	2	6	159842	159847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257373024
3997	NC_013201	CGA	2	6	159850	159855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257373024
3998	NC_013201	GCC	3	9	159906	159914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3999	NC_013201	CAG	2	6	159924	159929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4000	NC_013201	CCA	2	6	159962	159967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

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