MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halomicrobium mukohataei DSM 12286 plasmid pHmuk01

Total Repeats: 5721

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_013201	CGAG	2	8	99860	99867	25 %	0 %	50 %	25 %	257372980
2502	NC_013201	ACG	2	6	99916	99921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372980
2503	NC_013201	GAC	2	6	99954	99959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372980
2504	NC_013201	CGT	2	6	99964	99969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372980
2505	NC_013201	GAC	2	6	99972	99977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372980
2506	NC_013201	CGC	2	6	100025	100030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257372980
2507	NC_013201	ACC	2	6	100039	100044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257372980
2508	NC_013201	CCG	2	6	100075	100080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257372980
2509	NC_013201	CGA	2	6	100093	100098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372980
2510	NC_013201	GCG	2	6	100119	100124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372980
2511	NC_013201	ACGG	2	8	100178	100185	25 %	0 %	50 %	25 %	257372980
2512	NC_013201	GCG	2	6	100192	100197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372980
2513	NC_013201	GTCG	2	8	100223	100230	0 %	25 %	50 %	25 %	257372980
2514	NC_013201	GCCG	2	8	100268	100275	0 %	0 %	50 %	50 %	257372980
2515	NC_013201	CCGGA	2	10	100297	100306	20 %	0 %	40 %	40 %	257372980
2516	NC_013201	GC	3	6	100319	100324	0 %	0 %	50 %	50 %	257372980
2517	NC_013201	GA	3	6	100342	100347	50 %	0 %	50 %	0 %	257372980
2518	NC_013201	CCT	2	6	100367	100372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257372980
2519	NC_013201	TCC	2	6	100505	100510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257372980
2520	NC_013201	GACGG	2	10	100521	100530	20 %	0 %	60 %	20 %	257372980
2521	NC_013201	CGG	2	6	100538	100543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372980
2522	NC_013201	GGC	2	6	100548	100553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372980
2523	NC_013201	AGC	2	6	100585	100590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372980
2524	NC_013201	ACCG	2	8	100625	100632	25 %	0 %	25 %	50 %	257372980
2525	NC_013201	GTC	2	6	100739	100744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372980
2526	NC_013201	TGG	2	6	100753	100758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257372980
2527	NC_013201	GCT	2	6	100777	100782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372980
2528	NC_013201	GAC	2	6	100878	100883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372980
2529	NC_013201	TCG	2	6	100891	100896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372980
2530	NC_013201	AAC	2	6	100899	100904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257372980
2531	NC_013201	CAA	2	6	100907	100912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257372980
2532	NC_013201	CCA	2	6	100930	100935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257372980
2533	NC_013201	GGTC	2	8	100969	100976	0 %	25 %	50 %	25 %	257372980
2534	NC_013201	CGG	2	6	101107	101112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372980
2535	NC_013201	GCT	2	6	101115	101120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372980
2536	NC_013201	CGG	2	6	101140	101145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372980
2537	NC_013201	GGCG	2	8	101162	101169	0 %	0 %	75 %	25 %	257372980
2538	NC_013201	AACG	2	8	101217	101224	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2539	NC_013201	TGC	2	6	101309	101314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2540	NC_013201	GCTG	2	8	101339	101346	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2541	NC_013201	TAGC	2	8	101363	101370	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2542	NC_013201	GCTG	2	8	101378	101385	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2543	NC_013201	GTC	2	6	101422	101427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2544	NC_013201	CGG	2	6	101496	101501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372981
2545	NC_013201	GAC	2	6	101511	101516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372981
2546	NC_013201	CGC	2	6	101520	101525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257372981
2547	NC_013201	TCG	3	9	101567	101575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372981
2548	NC_013201	AGG	2	6	101588	101593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257372981
2549	NC_013201	CGA	2	6	101622	101627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372981
2550	NC_013201	AAC	2	6	101632	101637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257372981
2551	NC_013201	CGAG	2	8	101708	101715	25 %	0 %	50 %	25 %	257372981
2552	NC_013201	GAG	3	9	101779	101787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257372981
2553	NC_013201	CTC	2	6	101827	101832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257372981
2554	NC_013201	TCG	2	6	101879	101884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372981
2555	NC_013201	CCCG	2	8	101886	101893	0 %	0 %	25 %	75 %	257372981
2556	NC_013201	ACGCG	2	10	101927	101936	20 %	0 %	40 %	40 %	257372981
2557	NC_013201	CGT	2	6	101940	101945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372981
2558	NC_013201	CGG	2	6	102006	102011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372981
2559	NC_013201	GTC	2	6	102052	102057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372981
2560	NC_013201	CGA	2	6	102099	102104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372981
2561	NC_013201	GGC	2	6	102108	102113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372981
2562	NC_013201	GCT	2	6	102156	102161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372981
2563	NC_013201	ACG	2	6	102257	102262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372981
2564	NC_013201	GGC	2	6	102267	102272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372981
2565	NC_013201	GCGG	2	8	102288	102295	0 %	0 %	75 %	25 %	257372981
2566	NC_013201	CGA	2	6	102335	102340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372982
2567	NC_013201	CGAG	2	8	102350	102357	25 %	0 %	50 %	25 %	257372982
2568	NC_013201	CGA	2	6	102368	102373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372982
2569	NC_013201	ACCG	2	8	102374	102381	25 %	0 %	25 %	50 %	257372982
2570	NC_013201	GGC	2	6	102393	102398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372982
2571	NC_013201	GTC	3	9	102410	102418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372982
2572	NC_013201	ACG	2	6	102433	102438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372982
2573	NC_013201	GACG	3	12	102435	102446	25 %	0 %	50 %	25 %	257372982
2574	NC_013201	CAG	2	6	102489	102494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372982
2575	NC_013201	GAC	2	6	102600	102605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372982
2576	NC_013201	CGA	2	6	102620	102625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372982
2577	NC_013201	TCG	2	6	102628	102633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372982
2578	NC_013201	GTC	2	6	102696	102701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372982
2579	NC_013201	TCG	3	9	102721	102729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372982
2580	NC_013201	CTG	2	6	102767	102772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2581	NC_013201	TCGCT	2	10	102777	102786	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2582	NC_013201	GCG	2	6	102790	102795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2583	NC_013201	TC	3	6	102798	102803	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2584	NC_013201	GGC	2	6	102872	102877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372983
2585	NC_013201	CG	3	6	102884	102889	0 %	0 %	50 %	50 %	257372983
2586	NC_013201	CG	3	6	102898	102903	0 %	0 %	50 %	50 %	257372983
2587	NC_013201	CGA	2	6	102915	102920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372983
2588	NC_013201	CGT	2	6	102921	102926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372983
2589	NC_013201	CGAG	2	8	102959	102966	25 %	0 %	50 %	25 %	257372983
2590	NC_013201	TGA	2	6	103005	103010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257372983
2591	NC_013201	GCG	2	6	103025	103030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372983
2592	NC_013201	CGT	2	6	103062	103067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372983
2593	NC_013201	CGT	2	6	103072	103077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372983
2594	NC_013201	TCG	2	6	103094	103099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372983
2595	NC_013201	CGC	2	6	103110	103115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257372983
2596	NC_013201	TTC	2	6	103138	103143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257372983
2597	NC_013201	CGCT	2	8	103209	103216	0 %	25 %	25 %	50 %	257372983
2598	NC_013201	GTC	2	6	103226	103231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372983
2599	NC_013201	GAC	2	6	103264	103269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372983
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2601	NC_013201	GGGT	2	8	103296	103303	0 %	25 %	75 %	0 %	257372983
2602	NC_013201	GCG	2	6	103321	103326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372983
2603	NC_013201	CAG	2	6	103342	103347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372983
2604	NC_013201	CGG	2	6	103392	103397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372983
2605	NC_013201	GGCG	2	8	103428	103435	0 %	0 %	75 %	25 %	257372983
2606	NC_013201	TCG	2	6	103436	103441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372983
2607	NC_013201	CAG	2	6	103489	103494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372983
2608	NC_013201	TCGCCG	2	12	103496	103507	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	257372983
2609	NC_013201	GGTC	2	8	103587	103594	0 %	25 %	50 %	25 %	257372983
2610	NC_013201	TCC	2	6	103678	103683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257372983
2611	NC_013201	CGG	2	6	103701	103706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372983
2612	NC_013201	CG	3	6	103725	103730	0 %	0 %	50 %	50 %	257372983
2613	NC_013201	TCCG	2	8	103760	103767	0 %	25 %	25 %	50 %	257372983
2614	NC_013201	GTGC	2	8	103772	103779	0 %	25 %	50 %	25 %	257372983
2615	NC_013201	GTC	2	6	103780	103785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372983
2616	NC_013201	CGTC	2	8	103791	103798	0 %	25 %	25 %	50 %	257372983
2617	NC_013201	GTC	2	6	103849	103854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372983
2618	NC_013201	CGT	2	6	103909	103914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372983
2619	NC_013201	CGA	2	6	103953	103958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372983
2620	NC_013201	GTC	2	6	104023	104028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372983
2621	NC_013201	CGAT	2	8	104040	104047	25 %	25 %	25 %	25 %	257372983
2622	NC_013201	AGC	2	6	104084	104089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372983
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2864	NC_013201	CGA	2	6	112360	112365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372988
2865	NC_013201	TTCG	2	8	112429	112436	0 %	50 %	25 %	25 %	257372988
2866	NC_013201	CGCTCG	2	12	112452	112463	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	257372988
2867	NC_013201	CGA	2	6	112495	112500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372988
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2895	NC_013201	CGA	2	6	113431	113436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372988
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2983	NC_013201	GGT	2	6	117093	117098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257372990
2984	NC_013201	GTCGT	2	10	117152	117161	0 %	40 %	40 %	20 %	257372990
2985	NC_013201	GT	3	6	117165	117170	0 %	50 %	50 %	0 %	257372990
2986	NC_013201	GTC	2	6	117298	117303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372990
2987	NC_013201	GTC	2	6	117346	117351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372990
2988	NC_013201	ACA	2	6	117525	117530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257372990
2989	NC_013201	CGA	2	6	117534	117539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372990
2990	NC_013201	CGA	3	9	117618	117626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372990
2991	NC_013201	TCG	2	6	117725	117730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372990
2992	NC_013201	CG	3	6	117834	117839	0 %	0 %	50 %	50 %	257372990
2993	NC_013201	CAG	2	6	117883	117888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372990
2994	NC_013201	ATG	2	6	117929	117934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257372990
2995	NC_013201	TCG	2	6	117973	117978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372990
2996	NC_013201	CGA	3	9	118011	118019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372990
2997	NC_013201	TCG	2	6	118076	118081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372990
2998	NC_013201	GCG	2	6	118160	118165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372990
2999	NC_013201	GCT	2	6	118182	118187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372990
3000	NC_013201	CCT	3	9	118191	118199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257372990

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