MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorhabdus utahensis DSM 12940 chromosome

Total Repeats: 74047

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_013158	AGG	2	6	153899	153904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051244
3502	NC_013158	CGC	2	6	153930	153935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051244
3503	NC_013158	GAA	2	6	153942	153947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257051244
3504	NC_013158	CTC	2	6	153948	153953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051244
3505	NC_013158	AGCG	2	8	153992	153999	25 %	0 %	50 %	25 %	257051244
3506	NC_013158	CGT	2	6	154068	154073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051244
3507	NC_013158	GCCA	2	8	154120	154127	25 %	0 %	25 %	50 %	257051244
3508	NC_013158	GC	3	6	154198	154203	0 %	0 %	50 %	50 %	257051244
3509	NC_013158	TTC	2	6	154218	154223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257051244
3510	NC_013158	TCG	2	6	154234	154239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051244
3511	NC_013158	CGT	2	6	154241	154246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051244
3512	NC_013158	ACG	2	6	154270	154275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051244
3513	NC_013158	TCGC	2	8	154351	154358	0 %	25 %	25 %	50 %	257051244
3514	NC_013158	CGT	3	9	154361	154369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051244
3515	NC_013158	CG	3	6	154373	154378	0 %	0 %	50 %	50 %	257051244
3516	NC_013158	GCG	2	6	154399	154404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051244
3517	NC_013158	GCG	2	6	154429	154434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051244
3518	NC_013158	TCG	2	6	154465	154470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051244
3519	NC_013158	TCC	2	6	154483	154488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051244
3520	NC_013158	GTC	2	6	154548	154553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051244
3521	NC_013158	GAC	2	6	154596	154601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051244
3522	NC_013158	CGC	2	6	154706	154711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051244
3523	NC_013158	AGGT	2	8	154717	154724	25 %	25 %	50 %	0 %	257051244
3524	NC_013158	GTCG	2	8	154725	154732	0 %	25 %	50 %	25 %	257051244
3525	NC_013158	CGT	2	6	154769	154774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051244
3526	NC_013158	GCCG	2	8	154812	154819	0 %	0 %	50 %	50 %	257051244
3527	NC_013158	TCGATT	2	12	154828	154839	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	257051244
3528	NC_013158	AGCC	2	8	154843	154850	25 %	0 %	25 %	50 %	257051244
3529	NC_013158	CGA	2	6	154922	154927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051244
3530	NC_013158	TCC	2	6	154962	154967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051244
3531	NC_013158	CGA	2	6	154976	154981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051244
3532	NC_013158	CGG	2	6	155041	155046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051244
3533	NC_013158	CGT	2	6	155063	155068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051244
3534	NC_013158	CGA	2	6	155081	155086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051244
3535	NC_013158	GCC	2	6	155101	155106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051244
3536	NC_013158	CAGTCG	2	12	155107	155118	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	257051244
3537	NC_013158	CGG	2	6	155128	155133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051244
3538	NC_013158	GTC	2	6	155134	155139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051244
3539	NC_013158	CCGT	2	8	155140	155147	0 %	25 %	25 %	50 %	257051244
3540	NC_013158	ACG	2	6	155164	155169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051244
3541	NC_013158	GTT	2	6	155267	155272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257051244
3542	NC_013158	CGT	2	6	155279	155284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051244
3543	NC_013158	CGG	2	6	155384	155389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051244
3544	NC_013158	CGG	2	6	155437	155442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051244
3545	NC_013158	CGAC	2	8	155519	155526	25 %	0 %	25 %	50 %	257051244
3546	NC_013158	GAG	2	6	155527	155532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051244
3547	NC_013158	CGG	2	6	155537	155542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051244
3548	NC_013158	TCCCC	2	10	155564	155573	0 %	20 %	0 %	80 %	257051244
3549	NC_013158	TCG	2	6	155657	155662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051244
3550	NC_013158	G	6	6	155662	155667	0 %	0 %	100 %	0 %	257051244
3551	NC_013158	GGTC	2	8	155681	155688	0 %	25 %	50 %	25 %	257051244
3552	NC_013158	C	6	6	155709	155714	0 %	0 %	0 %	100 %	257051244
3553	NC_013158	CGT	2	6	155726	155731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051244
3554	NC_013158	GCG	2	6	155741	155746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051244
3555	NC_013158	GGTC	2	8	155753	155760	0 %	25 %	50 %	25 %	257051244
3556	NC_013158	GGT	2	6	155772	155777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257051244
3557	NC_013158	TCC	2	6	155798	155803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051244
3558	NC_013158	CGA	2	6	155810	155815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051244
3559	NC_013158	TCG	2	6	155839	155844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051244
3560	NC_013158	AAGCCA	2	12	155872	155883	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	257051244
3561	NC_013158	CGA	2	6	155895	155900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051244
3562	NC_013158	TCG	2	6	155923	155928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051244
3563	NC_013158	GATCG	2	10	155946	155955	20 %	20 %	40 %	20 %	257051244
3564	NC_013158	TCG	2	6	155974	155979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051244
3565	NC_013158	TCC	2	6	156025	156030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051244
3566	NC_013158	CGGA	2	8	156114	156121	25 %	0 %	50 %	25 %	257051244
3567	NC_013158	CGC	2	6	156161	156166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051244
3568	NC_013158	GTCC	2	8	156168	156175	0 %	25 %	25 %	50 %	257051244
3569	NC_013158	AGT	2	6	156191	156196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051244
3570	NC_013158	CGT	2	6	156224	156229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051244
3571	NC_013158	GAC	2	6	156231	156236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051244
3572	NC_013158	TGG	2	6	156239	156244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257051244
3573	NC_013158	CGA	3	9	156317	156325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051244
3574	NC_013158	GCCGC	2	10	156343	156352	0 %	0 %	40 %	60 %	257051244
3575	NC_013158	TCG	2	6	156407	156412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051244
3576	NC_013158	CCG	2	6	156455	156460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051244
3577	NC_013158	CT	3	6	156524	156529	0 %	50 %	0 %	50 %	257051245
3578	NC_013158	GTG	2	6	156562	156567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257051245
3579	NC_013158	CAG	2	6	156625	156630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051245
3580	NC_013158	GTC	2	6	156631	156636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051245
3581	NC_013158	CAA	2	6	156697	156702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257051245
3582	NC_013158	GCCG	2	8	156705	156712	0 %	0 %	50 %	50 %	257051245
3583	NC_013158	TCG	2	6	156740	156745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051245
3584	NC_013158	GTC	2	6	156754	156759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051245
3585	NC_013158	TCG	2	6	156812	156817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051245
3586	NC_013158	CGA	2	6	156873	156878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051245
3587	NC_013158	CGG	2	6	156906	156911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051245
3588	NC_013158	CTC	2	6	156940	156945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051245
3589	NC_013158	GAA	2	6	156946	156951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257051245
3590	NC_013158	CGA	2	6	157095	157100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051245
3591	NC_013158	CGC	2	6	157128	157133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051245
3592	NC_013158	GTC	2	6	157175	157180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051245
3593	NC_013158	TCG	2	6	157193	157198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051245
3594	NC_013158	TCGAAG	2	12	157208	157219	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	257051245
3595	NC_013158	GTA	2	6	157279	157284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051245
3596	NC_013158	GCC	2	6	157292	157297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051245
3597	NC_013158	GGC	2	6	157414	157419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051245
3598	NC_013158	CGA	2	6	157455	157460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051245
3599	NC_013158	GCTC	2	8	157464	157471	0 %	25 %	25 %	50 %	257051245
3600	NC_013158	CCGT	2	8	157506	157513	0 %	25 %	25 %	50 %	257051245
3601	NC_013158	GGT	2	6	157536	157541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257051245
3602	NC_013158	CGA	2	6	157551	157556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051245
3603	NC_013158	CCT	2	6	157572	157577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051245
3604	NC_013158	CCGGT	2	10	157625	157634	0 %	20 %	40 %	40 %	257051245
3605	NC_013158	CGG	2	6	157755	157760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051245
3606	NC_013158	TCG	2	6	157761	157766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051245
3607	NC_013158	CGT	2	6	157908	157913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051245
3608	NC_013158	TCGT	2	8	157954	157961	0 %	50 %	25 %	25 %	257051245
3609	NC_013158	CGGC	2	8	157971	157978	0 %	0 %	50 %	50 %	257051245
3610	NC_013158	CGTC	2	8	157998	158005	0 %	25 %	25 %	50 %	257051245
3611	NC_013158	TCA	2	6	158044	158049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3612	NC_013158	CGA	2	6	158142	158147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051246
3613	NC_013158	CCT	2	6	158154	158159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051246
3614	NC_013158	GAGACG	2	12	158161	158172	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	257051246
3615	NC_013158	GTC	2	6	158245	158250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051246
3616	NC_013158	ACG	2	6	158255	158260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051246
3617	NC_013158	GCG	2	6	158327	158332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051246
3618	NC_013158	GAG	2	6	158338	158343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051246
3619	NC_013158	GAG	2	6	158494	158499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051246
3620	NC_013158	CCT	2	6	158520	158525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051246
3621	NC_013158	CTC	2	6	158554	158559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051246
3622	NC_013158	CGAC	2	8	158588	158595	25 %	0 %	25 %	50 %	257051246
3623	NC_013158	GGC	2	6	158669	158674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051246
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3625	NC_013158	TCG	2	6	158717	158722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051246
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3644	NC_013158	TGCT	2	8	159565	159572	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3645	NC_013158	TG	3	6	159574	159579	0 %	50 %	50 %	0 %	257051247
3646	NC_013158	TCG	2	6	159625	159630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051247
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3650	NC_013158	GACC	2	8	159665	159672	25 %	0 %	25 %	50 %	257051247
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3653	NC_013158	CCGTC	2	10	159805	159814	0 %	20 %	20 %	60 %	257051247
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3705	NC_013158	ACGG	2	8	162552	162559	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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3724	NC_013158	CGATC	2	10	163154	163163	20 %	20 %	20 %	40 %	257051249
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3730	NC_013158	C	6	6	163320	163325	0 %	0 %	0 %	100 %	257051249
3731	NC_013158	GA	3	6	163357	163362	50 %	0 %	50 %	0 %	257051249
3732	NC_013158	CGC	2	6	163400	163405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051250
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3739	NC_013158	CGA	2	6	163608	163613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051250
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3863	NC_013158	TCG	2	6	168345	168350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051256
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3870	NC_013158	GGA	2	6	168638	168643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3883	NC_013158	GAC	2	6	169272	169277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051257
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3985	NC_013158	TTC	2	6	173945	173950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257051263
3986	NC_013158	ATC	2	6	173965	173970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051263
3987	NC_013158	AACG	2	8	174007	174014	50 %	0 %	25 %	25 %	257051263
3988	NC_013158	ATC	2	6	174046	174051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051263
3989	NC_013158	GTC	2	6	174058	174063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051263
3990	NC_013158	AGCGA	2	10	174070	174079	40 %	0 %	40 %	20 %	257051263
3991	NC_013158	GAC	2	6	174099	174104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051263
3992	NC_013158	CTC	2	6	174166	174171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051263
3993	NC_013158	CCG	2	6	174254	174259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051263
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3995	NC_013158	CGA	2	6	174318	174323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051263
3996	NC_013158	ACG	2	6	174427	174432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051263
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3998	NC_013158	AGA	2	6	174479	174484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3999	NC_013158	TCGCT	2	10	174493	174502	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4000	NC_013158	TGA	2	6	174506	174511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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