MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorhabdus utahensis DSM 12940 chromosome

Total Repeats: 74047

< Previous12345678910111213...148149Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_013158	GTC	2	6	85042	85047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051173
2003	NC_013158	CGA	2	6	85060	85065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051173
2004	NC_013158	CGA	2	6	85114	85119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051173
2005	NC_013158	TTC	2	6	85181	85186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257051173
2006	NC_013158	ACA	2	6	85289	85294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257051174
2007	NC_013158	GAC	2	6	85314	85319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051174
2008	NC_013158	ACG	2	6	85358	85363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051174
2009	NC_013158	GACG	2	8	85383	85390	25 %	0 %	50 %	25 %	257051174
2010	NC_013158	CGA	2	6	85397	85402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051174
2011	NC_013158	GAC	2	6	85440	85445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051174
2012	NC_013158	CCGA	2	8	85468	85475	25 %	0 %	25 %	50 %	257051174
2013	NC_013158	CGC	2	6	85482	85487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051174
2014	NC_013158	ATC	2	6	85509	85514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051174
2015	NC_013158	GGA	2	6	85516	85521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051174
2016	NC_013158	CGC	2	6	85536	85541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051174
2017	NC_013158	GCC	2	6	85597	85602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051174
2018	NC_013158	GAG	2	6	85711	85716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051174
2019	NC_013158	CGC	2	6	85740	85745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051174
2020	NC_013158	CGA	2	6	85749	85754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051174
2021	NC_013158	CGA	2	6	85763	85768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051174
2022	NC_013158	GCA	2	6	85837	85842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051174
2023	NC_013158	CGA	2	6	85899	85904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051174
2024	NC_013158	CGT	2	6	85908	85913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051174
2025	NC_013158	CGA	2	6	85935	85940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051174
2026	NC_013158	GTCG	2	8	85983	85990	0 %	25 %	50 %	25 %	257051174
2027	NC_013158	CTA	2	6	86007	86012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051174
2028	NC_013158	CG	3	6	86046	86051	0 %	0 %	50 %	50 %	257051174
2029	NC_013158	GAG	2	6	86104	86109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051174
2030	NC_013158	GAG	2	6	86125	86130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051174
2031	NC_013158	GAG	2	6	86140	86145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051174
2032	NC_013158	GCG	2	6	86151	86156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051174
2033	NC_013158	CTG	2	6	86161	86166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051174
2034	NC_013158	TAC	2	6	86203	86208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051174
2035	NC_013158	CG	3	6	86227	86232	0 %	0 %	50 %	50 %	257051174
2036	NC_013158	CGA	2	6	86288	86293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051174
2037	NC_013158	CCG	2	6	86302	86307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051174
2038	NC_013158	ACG	2	6	86365	86370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051174
2039	NC_013158	GC	3	6	86472	86477	0 %	0 %	50 %	50 %	257051174
2040	NC_013158	GATT	2	8	86521	86528	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2041	NC_013158	CGG	2	6	86529	86534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2042	NC_013158	AC	3	6	86568	86573	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2043	NC_013158	CTATA	2	10	86579	86588	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2044	NC_013158	TGA	2	6	86600	86605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2045	NC_013158	TAC	2	6	86629	86634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051175
2046	NC_013158	GCG	2	6	86682	86687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051175
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2048	NC_013158	CGAA	2	8	86811	86818	50 %	0 %	25 %	25 %	257051175
2049	NC_013158	GAACG	2	10	86911	86920	40 %	0 %	40 %	20 %	257051175
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2052	NC_013158	GACG	2	8	87170	87177	25 %	0 %	50 %	25 %	257051176
2053	NC_013158	AACG	2	8	87189	87196	50 %	0 %	25 %	25 %	257051176
2054	NC_013158	GCG	2	6	87210	87215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051176
2055	NC_013158	TCG	2	6	87226	87231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051176
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2057	NC_013158	GCA	2	6	87280	87285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051176
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2085	NC_013158	CGCA	2	8	88883	88890	25 %	0 %	25 %	50 %	257051178
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2090	NC_013158	TGG	2	6	88993	88998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2092	NC_013158	GTGAC	2	10	89058	89067	20 %	20 %	40 %	20 %	257051179
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2096	NC_013158	AC	3	6	89268	89273	50 %	0 %	0 %	50 %	257051179
2097	NC_013158	CA	3	6	89279	89284	50 %	0 %	0 %	50 %	257051179
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2102	NC_013158	GCCGTC	2	12	89542	89553	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	257051180
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2109	NC_013158	ATC	3	9	89917	89925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051180
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2111	NC_013158	ACG	2	6	89942	89947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051180
2112	NC_013158	TCG	2	6	89981	89986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051180
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2120	NC_013158	TCG	2	6	90241	90246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051181
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2124	NC_013158	GTG	2	6	90368	90373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257051181
2125	NC_013158	GAC	2	6	90381	90386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051181
2126	NC_013158	GC	3	6	90415	90420	0 %	0 %	50 %	50 %	257051181
2127	NC_013158	GC	3	6	90526	90531	0 %	0 %	50 %	50 %	257051181
2128	NC_013158	CAC	2	6	90672	90677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051181
2129	NC_013158	CG	3	6	90694	90699	0 %	0 %	50 %	50 %	257051181
2130	NC_013158	TG	3	6	90703	90708	0 %	50 %	50 %	0 %	257051181
2131	NC_013158	CGG	2	6	90801	90806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051181
2132	NC_013158	CGT	2	6	90824	90829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051181
2133	NC_013158	CG	3	6	90872	90877	0 %	0 %	50 %	50 %	257051181
2134	NC_013158	GTCGA	2	10	90955	90964	20 %	20 %	40 %	20 %	257051181
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2138	NC_013158	GGC	2	6	91265	91270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2139	NC_013158	GCG	3	9	91298	91306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2140	NC_013158	CGAAC	2	10	91309	91318	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
2141	NC_013158	TGA	2	6	91348	91353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2142	NC_013158	CCT	2	6	91417	91422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2143	NC_013158	GCT	2	6	91463	91468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2144	NC_013158	TCGGC	2	10	91710	91719	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2145	NC_013158	CGG	2	6	91730	91735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2146	NC_013158	TGC	2	6	91792	91797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051182
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2153	NC_013158	GACA	2	8	92075	92082	50 %	0 %	25 %	25 %	257051182
2154	NC_013158	CCG	3	9	92139	92147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2165	NC_013158	GGC	2	6	92656	92661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051184
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2175	NC_013158	T	6	6	93097	93102	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2188	NC_013158	GTCT	2	8	93952	93959	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2189	NC_013158	CGA	2	6	93970	93975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2221	NC_013158	ACT	2	6	95665	95670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2222	NC_013158	CT	3	6	95675	95680	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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2242	NC_013158	TG	3	6	96515	96520	0 %	50 %	50 %	0 %	257051189
2243	NC_013158	CTT	2	6	96552	96557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257051189
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2247	NC_013158	TCG	2	6	96639	96644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051190
2248	NC_013158	TCGT	2	8	96720	96727	0 %	50 %	25 %	25 %	257051190
2249	NC_013158	GTC	2	6	96758	96763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051190
2250	NC_013158	AG	3	6	96809	96814	50 %	0 %	50 %	0 %	257051190
2251	NC_013158	CTC	2	6	96827	96832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051190
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2253	NC_013158	CCT	3	9	96886	96894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051190
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2372	NC_013158	CGG	2	6	101902	101907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051192
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2374	NC_013158	TCG	2	6	101966	101971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051192
2375	NC_013158	CGT	2	6	102024	102029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051192
2376	NC_013158	CGT	2	6	102054	102059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051192
2377	NC_013158	TCG	2	6	102068	102073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051192
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2379	NC_013158	CGT	2	6	102132	102137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051192
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2387	NC_013158	CCG	2	6	102466	102471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2388	NC_013158	TCG	2	6	102515	102520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051193
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2432	NC_013158	TGG	2	6	104641	104646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2433	NC_013158	TCTGAT	2	12	104667	104678	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	257051195
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2481	NC_013158	GAG	2	6	107328	107333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2490	NC_013158	TGCCG	2	10	107760	107769	0 %	20 %	40 %	40 %	257051201
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2496	NC_013158	CGC	2	6	107933	107938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2497	NC_013158	CGT	2	6	108013	108018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2498	NC_013158	TCG	2	6	108135	108140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051202
2499	NC_013158	TAC	2	6	108161	108166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051202
2500	NC_013158	CCG	2	6	108231	108236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051202

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