MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorhabdus utahensis DSM 12940 chromosome

Total Repeats: 74047

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013158	GAC	2	6	22779	22784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051111
502	NC_013158	CGA	2	6	22836	22841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051111
503	NC_013158	ACA	2	6	22871	22876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257051111
504	NC_013158	CGATCC	2	12	22886	22897	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	257051111
505	NC_013158	CGC	2	6	22911	22916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051111
506	NC_013158	CGG	2	6	22926	22931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051111
507	NC_013158	CTTCC	2	10	22935	22944	0 %	40 %	0 %	60 %	257051111
508	NC_013158	AC	3	6	23046	23051	50 %	0 %	0 %	50 %	257051111
509	NC_013158	GAC	2	6	23068	23073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051111
510	NC_013158	CCG	2	6	23096	23101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051111
511	NC_013158	GCC	3	9	23104	23112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051111
512	NC_013158	GAC	2	6	23143	23148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051111
513	NC_013158	CGT	3	9	23151	23159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051111
514	NC_013158	CGT	2	6	23199	23204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051111
515	NC_013158	CTT	2	6	23205	23210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257051111
516	NC_013158	AAC	2	6	23281	23286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257051111
517	NC_013158	CGT	2	6	23360	23365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051111
518	NC_013158	CGAC	2	8	23469	23476	25 %	0 %	25 %	50 %	257051111
519	NC_013158	CGT	2	6	23547	23552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051111
520	NC_013158	AAC	2	6	23584	23589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257051111
521	NC_013158	CTG	2	6	23590	23595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051111
522	NC_013158	GAC	3	9	23610	23618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051111
523	NC_013158	GAT	2	6	23649	23654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051111
524	NC_013158	GTC	2	6	23680	23685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051111
525	NC_013158	GAC	2	6	23709	23714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051111
526	NC_013158	GAC	2	6	23743	23748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051111
527	NC_013158	CGA	2	6	23772	23777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051111
528	NC_013158	TGAG	2	8	23778	23785	25 %	25 %	50 %	0 %	257051111
529	NC_013158	CGGA	2	8	23803	23810	25 %	0 %	50 %	25 %	257051112
530	NC_013158	CGG	2	6	23842	23847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051112
531	NC_013158	CGA	2	6	23883	23888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051112
532	NC_013158	GCC	2	6	23891	23896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051112
533	NC_013158	TCG	2	6	23907	23912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051112
534	NC_013158	CGA	2	6	23979	23984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051113
535	NC_013158	CTG	2	6	24016	24021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051113
536	NC_013158	CGGC	2	8	24032	24039	0 %	0 %	50 %	50 %	257051113
537	NC_013158	CGA	2	6	24099	24104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051113
538	NC_013158	GGA	2	6	24135	24140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051113
539	NC_013158	GAG	2	6	24151	24156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051113
540	NC_013158	AAC	2	6	24254	24259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257051113
541	NC_013158	CGA	2	6	24282	24287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051113
542	NC_013158	GAG	2	6	24463	24468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051113
543	NC_013158	ACG	2	6	24485	24490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051113
544	NC_013158	CGG	2	6	24567	24572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051113
545	NC_013158	TC	3	6	24575	24580	0 %	50 %	0 %	50 %	257051113
546	NC_013158	CCG	2	6	24610	24615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051113
547	NC_013158	CAT	2	6	24684	24689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051113
548	NC_013158	TCT	2	6	24779	24784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257051113
549	NC_013158	CGA	2	6	24813	24818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051113
550	NC_013158	TCG	2	6	24878	24883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051113
551	NC_013158	AGG	2	6	24884	24889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051113
552	NC_013158	ACG	2	6	24896	24901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051113
553	NC_013158	TCC	2	6	24962	24967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051113
554	NC_013158	GCGA	2	8	24970	24977	25 %	0 %	50 %	25 %	257051113
555	NC_013158	CGA	2	6	25002	25007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051113
556	NC_013158	GGTCAT	2	12	25017	25028	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	257051113
557	NC_013158	TGC	2	6	25053	25058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051113
558	NC_013158	ACG	2	6	25091	25096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051113
559	NC_013158	TCGA	2	8	25105	25112	25 %	25 %	25 %	25 %	257051113
560	NC_013158	GAC	2	6	25155	25160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051113
561	NC_013158	AAC	2	6	25192	25197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257051113
562	NC_013158	GGA	2	6	25203	25208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051113
563	NC_013158	CGA	2	6	25239	25244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051113
564	NC_013158	AGA	2	6	25271	25276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257051113
565	NC_013158	ATC	2	6	25312	25317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051113
566	NC_013158	TCCG	2	8	25492	25499	0 %	25 %	25 %	50 %	257051113
567	NC_013158	CGA	2	6	25508	25513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051113
568	NC_013158	CTA	2	6	25524	25529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051113
569	NC_013158	CCG	2	6	25566	25571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051113
570	NC_013158	GAG	2	6	25579	25584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051113
571	NC_013158	GAG	2	6	25618	25623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051113
572	NC_013158	ACCCG	2	10	25636	25645	20 %	0 %	20 %	60 %	257051113
573	NC_013158	CGA	2	6	25652	25657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051113
574	NC_013158	CTT	2	6	25677	25682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257051113
575	NC_013158	GAG	2	6	25711	25716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051113
576	NC_013158	TCG	2	6	25739	25744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051113
577	NC_013158	GCCG	2	8	25797	25804	0 %	0 %	50 %	50 %	257051113
578	NC_013158	CGA	2	6	25974	25979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051113
579	NC_013158	ACG	2	6	26018	26023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051113
580	NC_013158	CGA	2	6	26046	26051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051113
581	NC_013158	GGC	2	6	26076	26081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051113
582	NC_013158	GAC	2	6	26122	26127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051113
583	NC_013158	GGC	2	6	26128	26133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051113
584	NC_013158	ACGGC	2	10	26213	26222	20 %	0 %	40 %	40 %	257051113
585	NC_013158	CAG	2	6	26284	26289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051113
586	NC_013158	TAC	2	6	26290	26295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051113
587	NC_013158	CGA	2	6	26322	26327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051113
588	NC_013158	ACA	2	6	26390	26395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257051113
589	NC_013158	CGGT	2	8	26403	26410	0 %	25 %	50 %	25 %	257051113
590	NC_013158	A	6	6	26441	26446	100 %	0 %	0 %	0 %	257051113
591	NC_013158	GGT	2	6	26472	26477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257051113
592	NC_013158	TTCA	2	8	26479	26486	25 %	50 %	0 %	25 %	257051113
593	NC_013158	CGA	2	6	26552	26557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051113
594	NC_013158	AAC	2	6	26647	26652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257051113
595	NC_013158	ACCC	2	8	26682	26689	25 %	0 %	0 %	75 %	257051113
596	NC_013158	TTC	2	6	26731	26736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257051113
597	NC_013158	AAG	2	6	26795	26800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257051113
598	NC_013158	GAC	2	6	26806	26811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051113
599	NC_013158	ACG	2	6	26821	26826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051114
600	NC_013158	ACC	2	6	26851	26856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051114
601	NC_013158	CAA	2	6	26879	26884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257051114
602	NC_013158	AAC	2	6	26964	26969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257051114
603	NC_013158	GAG	2	6	27009	27014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051114
604	NC_013158	GGC	3	9	27018	27026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051114
605	NC_013158	TCCC	2	8	27068	27075	0 %	25 %	0 %	75 %	257051114
606	NC_013158	AGG	2	6	27124	27129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051114
607	NC_013158	CAA	2	6	27215	27220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257051114
608	NC_013158	CTA	2	6	27221	27226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051114
609	NC_013158	CACC	2	8	27257	27264	25 %	0 %	0 %	75 %	257051114
610	NC_013158	CCT	2	6	27265	27270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051114
611	NC_013158	TCG	2	6	27328	27333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051114
612	NC_013158	AAG	2	6	27384	27389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257051114
613	NC_013158	CTA	2	6	27392	27397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051114
614	NC_013158	TCT	2	6	27430	27435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257051114
615	NC_013158	CGA	3	9	27464	27472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051114
616	NC_013158	CCG	2	6	27480	27485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051114
617	NC_013158	TGG	2	6	27520	27525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257051114
618	NC_013158	CGA	2	6	27533	27538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051114
619	NC_013158	TCG	2	6	27562	27567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051114
620	NC_013158	CCCTGC	2	12	27583	27594	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	257051114
621	NC_013158	GAC	2	6	27608	27613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051114
622	NC_013158	CTA	2	6	27623	27628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051114
623	NC_013158	CCG	2	6	27633	27638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051114
624	NC_013158	GGATC	2	10	27683	27692	20 %	20 %	40 %	20 %	257051114
625	NC_013158	CG	3	6	27762	27767	0 %	0 %	50 %	50 %	257051114
626	NC_013158	CGG	2	6	27779	27784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051114
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646	NC_013158	GAC	3	9	28407	28415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051115
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721	NC_013158	CGAT	2	8	31224	31231	25 %	25 %	25 %	25 %	257051119
722	NC_013158	TCG	2	6	31279	31284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051119
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747	NC_013158	GTCA	2	8	32400	32407	25 %	25 %	25 %	25 %	257051120
748	NC_013158	TCC	2	6	32434	32439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051120
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752	NC_013158	TCGC	2	8	32579	32586	0 %	25 %	25 %	50 %	257051120
753	NC_013158	GCGA	2	8	32616	32623	25 %	0 %	50 %	25 %	257051120
754	NC_013158	ACG	2	6	32653	32658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051120
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756	NC_013158	GT	3	6	32715	32720	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
757	NC_013158	CTT	2	6	32751	32756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257051121
758	NC_013158	CGA	2	6	32768	32773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051121
759	NC_013158	TGA	2	6	32873	32878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051121
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816	NC_013158	CGG	2	6	35391	35396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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861	NC_013158	TC	3	6	36995	37000	0 %	50 %	0 %	50 %	257051125
862	NC_013158	GGCT	2	8	37169	37176	0 %	25 %	50 %	25 %	257051125
863	NC_013158	TTCGAG	2	12	37191	37202	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	257051125
864	NC_013158	TCG	2	6	37211	37216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051125
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870	NC_013158	GCGAAC	2	12	37421	37432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051126
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875	NC_013158	GCC	2	6	37718	37723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051126
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997	NC_013158	GCG	2	6	43140	43145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
998	NC_013158	ACTC	2	8	43189	43196	25 %	25 %	0 %	50 %	257051132
999	NC_013158	ACG	2	6	43210	43215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051132
1000	NC_013158	CGG	2	6	43218	43223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051132

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