MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorhabdus utahensis DSM 12940 chromosome

Total Repeats: 74047

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_013158	GTG	2	6	263654	263659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257051361
6002	NC_013158	CCA	2	6	263664	263669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051361
6003	NC_013158	CGA	3	9	263706	263714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051361
6004	NC_013158	ATA	2	6	263788	263793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_013158	G	7	7	263887	263893	0 %	0 %	100 %	0 %	257051362
6006	NC_013158	GTC	2	6	263901	263906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051362
6007	NC_013158	ACT	2	6	263928	263933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051362
6008	NC_013158	CGG	2	6	263959	263964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051362
6009	NC_013158	CGACGT	2	12	263987	263998	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	257051362
6010	NC_013158	CGA	2	6	264016	264021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051362
6011	NC_013158	TCG	2	6	264046	264051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051362
6012	NC_013158	CCGC	2	8	264086	264093	0 %	0 %	25 %	75 %	257051362
6013	NC_013158	GCCA	2	8	264123	264130	25 %	0 %	25 %	50 %	257051362
6014	NC_013158	ACG	2	6	264214	264219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051362
6015	NC_013158	CGA	2	6	264284	264289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051362
6016	NC_013158	CGC	2	6	264335	264340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051362
6017	NC_013158	GAG	2	6	264369	264374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051362
6018	NC_013158	CGG	2	6	264379	264384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051362
6019	NC_013158	GCCG	2	8	264527	264534	0 %	0 %	50 %	50 %	257051362
6020	NC_013158	TCGAGA	2	12	264565	264576	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	257051362
6021	NC_013158	GAA	2	6	264640	264645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257051363
6022	NC_013158	AGG	2	6	264704	264709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051363
6023	NC_013158	CGC	2	6	264818	264823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051363
6024	NC_013158	CAG	2	6	264889	264894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6025	NC_013158	CTGT	2	8	264899	264906	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6026	NC_013158	GAC	2	6	265036	265041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051364
6027	NC_013158	GC	3	6	265051	265056	0 %	0 %	50 %	50 %	257051364
6028	NC_013158	TCGA	2	8	265111	265118	25 %	25 %	25 %	25 %	257051364
6029	NC_013158	CGC	2	6	265119	265124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051364
6030	NC_013158	GGC	2	6	265209	265214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051364
6031	NC_013158	CGA	2	6	265241	265246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051364
6032	NC_013158	CGG	2	6	265302	265307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051364
6033	NC_013158	CGT	2	6	265479	265484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051364
6034	NC_013158	TCC	2	6	265499	265504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051364
6035	NC_013158	GGC	2	6	265563	265568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051364
6036	NC_013158	TGG	2	6	265604	265609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257051364
6037	NC_013158	CGG	2	6	265643	265648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051364
6038	NC_013158	CTTC	2	8	265695	265702	0 %	50 %	0 %	50 %	257051364
6039	NC_013158	CGA	2	6	265704	265709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051364
6040	NC_013158	TCG	2	6	265712	265717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051364
6041	NC_013158	GAA	2	6	265767	265772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257051364
6042	NC_013158	GTC	2	6	265873	265878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051364
6043	NC_013158	CGG	2	6	265968	265973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051364
6044	NC_013158	TGG	3	9	266025	266033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257051364
6045	NC_013158	CGA	2	6	266078	266083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051364
6046	NC_013158	CTGG	2	8	266089	266096	0 %	25 %	50 %	25 %	257051364
6047	NC_013158	GAA	2	6	266149	266154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257051364
6048	NC_013158	TCGG	2	8	266156	266163	0 %	25 %	50 %	25 %	257051364
6049	NC_013158	TCG	2	6	266220	266225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051365
6050	NC_013158	TCG	2	6	266250	266255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051365
6051	NC_013158	ACG	2	6	266259	266264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051365
6052	NC_013158	AGG	2	6	266337	266342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051365
6053	NC_013158	GA	4	8	266394	266401	50 %	0 %	50 %	0 %	257051365
6054	NC_013158	GACG	2	8	266509	266516	25 %	0 %	50 %	25 %	257051365
6055	NC_013158	CGA	2	6	266530	266535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051365
6056	NC_013158	CGG	2	6	266539	266544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051365
6057	NC_013158	CCG	2	6	266574	266579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051365
6058	NC_013158	AC	3	6	266637	266642	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6059	NC_013158	CA	3	6	266679	266684	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6060	NC_013158	GGA	2	6	266719	266724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_013158	CGG	2	6	266789	266794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6062	NC_013158	GAC	2	6	266845	266850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051366
6063	NC_013158	CCAT	2	8	266851	266858	25 %	25 %	0 %	50 %	257051366
6064	NC_013158	CGCA	2	8	266862	266869	25 %	0 %	25 %	50 %	257051366
6065	NC_013158	TCA	2	6	266888	266893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051366
6066	NC_013158	TTGC	2	8	266914	266921	0 %	50 %	25 %	25 %	257051366
6067	NC_013158	AGACG	2	10	266963	266972	40 %	0 %	40 %	20 %	257051367
6068	NC_013158	TCG	2	6	267027	267032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051367
6069	NC_013158	CGA	2	6	267071	267076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051367
6070	NC_013158	ATC	2	6	267093	267098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051367
6071	NC_013158	CGA	2	6	267104	267109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051367
6072	NC_013158	CCG	2	6	267145	267150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051367
6073	NC_013158	CG	3	6	267162	267167	0 %	0 %	50 %	50 %	257051367
6074	NC_013158	CGG	2	6	267179	267184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051367
6075	NC_013158	TTCGA	2	10	267205	267214	20 %	40 %	20 %	20 %	257051367
6076	NC_013158	TCG	4	12	267220	267231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051367
6077	NC_013158	CCG	2	6	267248	267253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051367
6078	NC_013158	CGCGG	2	10	267321	267330	0 %	0 %	60 %	40 %	257051367
6079	NC_013158	GCG	2	6	267340	267345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051367
6080	NC_013158	AGG	2	6	267376	267381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051367
6081	NC_013158	GC	3	6	267449	267454	0 %	0 %	50 %	50 %	257051367
6082	NC_013158	ACC	2	6	267472	267477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051367
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6084	NC_013158	CGTG	2	8	267550	267557	0 %	25 %	50 %	25 %	257051368
6085	NC_013158	CCT	2	6	267565	267570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051368
6086	NC_013158	TCG	2	6	267576	267581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051368
6087	NC_013158	CGA	2	6	267616	267621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051368
6088	NC_013158	GTC	2	6	267661	267666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051368
6089	NC_013158	CGCGC	2	10	267780	267789	0 %	0 %	40 %	60 %	257051368
6090	NC_013158	CGA	2	6	267814	267819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051368
6091	NC_013158	TCG	2	6	267843	267848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051368
6092	NC_013158	CTC	2	6	267875	267880	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051368
6093	NC_013158	CGT	2	6	267901	267906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051368
6094	NC_013158	GCGTT	2	10	267997	268006	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6095	NC_013158	GGCC	2	8	268024	268031	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6096	NC_013158	CAA	2	6	268069	268074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257051369
6097	NC_013158	CTC	2	6	268088	268093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051369
6098	NC_013158	ATC	2	6	268239	268244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051369
6099	NC_013158	GC	3	6	268272	268277	0 %	0 %	50 %	50 %	257051369
6100	NC_013158	CGG	2	6	268369	268374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051369
6101	NC_013158	TCG	2	6	268425	268430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051369
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6103	NC_013158	CCT	2	6	268549	268554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051369
6104	NC_013158	CTC	3	9	268565	268573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051369
6105	NC_013158	ATG	2	6	268620	268625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051369
6106	NC_013158	GATGCC	2	12	268727	268738	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	257051369
6107	NC_013158	CGT	2	6	268747	268752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051369
6108	NC_013158	TCGTC	2	10	268756	268765	0 %	40 %	20 %	40 %	257051369
6109	NC_013158	CGA	2	6	268783	268788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051369
6110	NC_013158	TCG	2	6	268809	268814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051369
6111	NC_013158	TCC	2	6	268821	268826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051369
6112	NC_013158	GAGC	2	8	268979	268986	25 %	0 %	50 %	25 %	257051369
6113	NC_013158	CGT	2	6	269006	269011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051369
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6117	NC_013158	GCG	2	6	269172	269177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051369
6118	NC_013158	GAT	2	6	269210	269215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051369
6119	NC_013158	TCG	2	6	269259	269264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051369
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6121	NC_013158	CGG	2	6	269431	269436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051370
6122	NC_013158	GAC	2	6	269468	269473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051370
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6243	NC_013158	CGG	2	6	274918	274923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051378
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6347	NC_013158	TAA	2	6	279795	279800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6348	NC_013158	CGG	2	6	279932	279937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051384
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6357	NC_013158	CG	4	8	280320	280327	0 %	0 %	50 %	50 %	257051384
6358	NC_013158	CGCC	2	8	280329	280336	0 %	0 %	25 %	75 %	257051384
6359	NC_013158	GCG	2	6	280352	280357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051384
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6362	NC_013158	CGA	2	6	280406	280411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051384
6363	NC_013158	CAC	2	6	280422	280427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051384
6364	NC_013158	CGG	2	6	280443	280448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051384
6365	NC_013158	GC	3	6	280472	280477	0 %	0 %	50 %	50 %	257051384
6366	NC_013158	GAT	2	6	280491	280496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051384
6367	NC_013158	CGGG	2	8	280592	280599	0 %	0 %	75 %	25 %	257051384
6368	NC_013158	CTC	2	6	280684	280689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051384
6369	NC_013158	CTC	2	6	280696	280701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051384
6370	NC_013158	TCCG	2	8	280705	280712	0 %	25 %	25 %	50 %	257051384
6371	NC_013158	GGCC	2	8	280776	280783	0 %	0 %	50 %	50 %	257051384
6372	NC_013158	CAC	2	6	280840	280845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051384
6373	NC_013158	CAC	2	6	280875	280880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051384
6374	NC_013158	ACGG	2	8	280897	280904	25 %	0 %	50 %	25 %	257051384
6375	NC_013158	TCG	2	6	280913	280918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051384
6376	NC_013158	CTC	2	6	280933	280938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051384
6377	NC_013158	GC	3	6	280955	280960	0 %	0 %	50 %	50 %	257051384
6378	NC_013158	CGG	2	6	280998	281003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051384
6379	NC_013158	CTCGTG	2	12	281005	281016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051384
6380	NC_013158	GAC	2	6	281031	281036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051384
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6382	NC_013158	GC	3	6	281062	281067	0 %	0 %	50 %	50 %	257051384
6383	NC_013158	CGT	2	6	281208	281213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051384
6384	NC_013158	CGT	3	9	281217	281225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051384
6385	NC_013158	CGC	2	6	281226	281231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051384
6386	NC_013158	TCG	2	6	281237	281242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051384
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6388	NC_013158	CG	3	6	281325	281330	0 %	0 %	50 %	50 %	257051384
6389	NC_013158	GGA	2	6	281349	281354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051384
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6392	NC_013158	CGG	2	6	281515	281520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051385
6393	NC_013158	GCC	2	6	281552	281557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051385
6394	NC_013158	CGA	2	6	281560	281565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051385
6395	NC_013158	CGG	2	6	281619	281624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051385
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6397	NC_013158	CGA	2	6	281749	281754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051385
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6399	NC_013158	AC	3	6	281829	281834	50 %	0 %	0 %	50 %	257051385
6400	NC_013158	TCG	2	6	281853	281858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051385
6401	NC_013158	ACG	2	6	281880	281885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051385
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6403	NC_013158	TCA	2	6	281976	281981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051385
6404	NC_013158	TCGA	2	8	282095	282102	25 %	25 %	25 %	25 %	257051385
6405	NC_013158	ACG	2	6	282126	282131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051385
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6412	NC_013158	TCG	2	6	282408	282413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051385
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6425	NC_013158	TTCGTC	2	12	282797	282808	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	257051385
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6434	NC_013158	CGA	2	6	283027	283032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051385
6435	NC_013158	GCC	3	9	283103	283111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051385
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6439	NC_013158	ACGA	2	8	283250	283257	50 %	0 %	25 %	25 %	257051385
6440	NC_013158	ACG	2	6	283301	283306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051385
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6442	NC_013158	TAC	2	6	283379	283384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051385
6443	NC_013158	CGG	2	6	283471	283476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051385
6444	NC_013158	TGA	2	6	283482	283487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051385
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6447	NC_013158	ACC	2	6	283533	283538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051385
6448	NC_013158	GTC	2	6	283559	283564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051385
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6451	NC_013158	ACC	2	6	283671	283676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051385
6452	NC_013158	ACG	2	6	283689	283694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051385
6453	NC_013158	ACCGA	2	10	283718	283727	40 %	0 %	20 %	40 %	257051385
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6468	NC_013158	GTC	2	6	284348	284353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051386
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6475	NC_013158	CAG	3	9	284545	284553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051387
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6478	NC_013158	CGT	2	6	284653	284658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051387
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6480	NC_013158	AG	3	6	284780	284785	50 %	0 %	50 %	0 %	257051387
6481	NC_013158	GCG	2	6	284825	284830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051387
6482	NC_013158	AAC	2	6	284834	284839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257051387
6483	NC_013158	CGC	2	6	284938	284943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051387
6484	NC_013158	ACG	2	6	285110	285115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051387
6485	NC_013158	CCG	2	6	285117	285122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051387
6486	NC_013158	GCGT	2	8	285138	285145	0 %	25 %	50 %	25 %	257051387
6487	NC_013158	CTC	2	6	285174	285179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051388
6488	NC_013158	CCG	2	6	285332	285337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051388
6489	NC_013158	GACGTG	2	12	285447	285458	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	257051388
6490	NC_013158	TCA	2	6	285500	285505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051388
6491	NC_013158	CGA	3	9	285521	285529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051388
6492	NC_013158	CGA	2	6	285653	285658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051388
6493	NC_013158	TCG	2	6	285787	285792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051388
6494	NC_013158	CGA	2	6	285818	285823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051388
6495	NC_013158	ACG	2	6	285856	285861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051388
6496	NC_013158	TCA	2	6	285886	285891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051388
6497	NC_013158	A	6	6	285998	286003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6498	NC_013158	ACG	2	6	286130	286135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6499	NC_013158	CCA	2	6	286159	286164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6500	NC_013158	CGA	2	6	286227	286232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051389

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