MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorhabdus utahensis DSM 12940 chromosome

Total Repeats: 74047

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
53501	NC_013158	TCA	2	6	2256785	2256790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53502	NC_013158	GAT	2	6	2256802	2256807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257053271
53503	NC_013158	GTTC	2	8	2256908	2256915	0 %	50 %	25 %	25 %	257053271
53504	NC_013158	CGT	3	9	2256949	2256957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053271
53505	NC_013158	CGA	2	6	2256994	2256999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053271
53506	NC_013158	ATC	2	6	2257028	2257033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257053271
53507	NC_013158	GTC	2	6	2257034	2257039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053271
53508	NC_013158	CGG	2	6	2257068	2257073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053271
53509	NC_013158	CG	3	6	2257180	2257185	0 %	0 %	50 %	50 %	257053271
53510	NC_013158	CCG	2	6	2257240	2257245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053271
53511	NC_013158	GTG	2	6	2257271	2257276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257053271
53512	NC_013158	TCA	2	6	2257324	2257329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257053271
53513	NC_013158	CCGA	2	8	2257334	2257341	25 %	0 %	25 %	50 %	257053271
53514	NC_013158	AGC	2	6	2257440	2257445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053271
53515	NC_013158	GAC	2	6	2257492	2257497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053271
53516	NC_013158	GTC	2	6	2257529	2257534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053271
53517	NC_013158	GTCG	2	8	2257667	2257674	0 %	25 %	50 %	25 %	257053271
53518	NC_013158	GAC	2	6	2257690	2257695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053271
53519	NC_013158	TCG	2	6	2257752	2257757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053271
53520	NC_013158	ATC	2	6	2257763	2257768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257053271
53521	NC_013158	TCC	2	6	2257869	2257874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053271
53522	NC_013158	CGA	2	6	2257881	2257886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053271
53523	NC_013158	CGA	2	6	2257975	2257980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053271
53524	NC_013158	ATCACG	2	12	2257982	2257993	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	257053271
53525	NC_013158	GAC	2	6	2258009	2258014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053271
53526	NC_013158	TC	3	6	2258086	2258091	0 %	50 %	0 %	50 %	257053271
53527	NC_013158	TCG	2	6	2258124	2258129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053271
53528	NC_013158	CGA	2	6	2258176	2258181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053271
53529	NC_013158	CGG	2	6	2258235	2258240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53530	NC_013158	TGACG	2	10	2258260	2258269	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
53531	NC_013158	AC	4	8	2258337	2258344	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53532	NC_013158	AGC	2	6	2258360	2258365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053272
53533	NC_013158	CGCT	2	8	2258417	2258424	0 %	25 %	25 %	50 %	257053272
53534	NC_013158	GAC	2	6	2258476	2258481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053272
53535	NC_013158	CGG	2	6	2258491	2258496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053272
53536	NC_013158	ACC	2	6	2258501	2258506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257053272
53537	NC_013158	TCC	2	6	2258528	2258533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053272
53538	NC_013158	CGA	4	12	2258541	2258552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053272
53539	NC_013158	TCG	2	6	2258564	2258569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053272
53540	NC_013158	AAG	2	6	2258596	2258601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257053272
53541	NC_013158	CCGG	2	8	2258618	2258625	0 %	0 %	50 %	50 %	257053272
53542	NC_013158	ACC	2	6	2258652	2258657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257053272
53543	NC_013158	CGA	2	6	2258667	2258672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053272
53544	NC_013158	CT	3	6	2258677	2258682	0 %	50 %	0 %	50 %	257053272
53545	NC_013158	CGCTC	2	10	2258700	2258709	0 %	20 %	20 %	60 %	257053272
53546	NC_013158	TCG	2	6	2258717	2258722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053272
53547	NC_013158	CGG	2	6	2258737	2258742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053272
53548	NC_013158	CAG	2	6	2258755	2258760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053272
53549	NC_013158	ACGG	2	8	2258833	2258840	25 %	0 %	50 %	25 %	257053272
53550	NC_013158	GGGA	2	8	2258879	2258886	25 %	0 %	75 %	0 %	257053272
53551	NC_013158	TTC	2	6	2258941	2258946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53552	NC_013158	CTC	2	6	2259019	2259024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053273
53553	NC_013158	TGA	3	9	2259033	2259041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257053273
53554	NC_013158	GC	4	8	2259172	2259179	0 %	0 %	50 %	50 %	257053274
53555	NC_013158	CTC	2	6	2259186	2259191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053274
53556	NC_013158	AGCC	2	8	2259196	2259203	25 %	0 %	25 %	50 %	257053274
53557	NC_013158	TCG	2	6	2259265	2259270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053274
53558	NC_013158	GC	3	6	2259292	2259297	0 %	0 %	50 %	50 %	257053274
53559	NC_013158	CGT	2	6	2259359	2259364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053274
53560	NC_013158	TCG	2	6	2259376	2259381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053274
53561	NC_013158	GGA	2	6	2259398	2259403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053274
53562	NC_013158	CGA	2	6	2259425	2259430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053274
53563	NC_013158	GAC	2	6	2259444	2259449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053274
53564	NC_013158	CGA	2	6	2259452	2259457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053274
53565	NC_013158	CGA	2	6	2259467	2259472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053274
53566	NC_013158	CCT	2	6	2259473	2259478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053274
53567	NC_013158	GTA	2	6	2259519	2259524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257053274
53568	NC_013158	GAC	2	6	2259543	2259548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053274
53569	NC_013158	ACG	2	6	2259586	2259591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053274
53570	NC_013158	GAG	2	6	2259787	2259792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053275
53571	NC_013158	TCG	2	6	2259863	2259868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053275
53572	NC_013158	CGT	2	6	2259879	2259884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053275
53573	NC_013158	CGA	2	6	2259888	2259893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053275
53574	NC_013158	CGA	2	6	2259906	2259911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053275
53575	NC_013158	CGAC	2	8	2259917	2259924	25 %	0 %	25 %	50 %	257053275
53576	NC_013158	CGC	2	6	2259928	2259933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053275
53577	NC_013158	CCT	2	6	2259939	2259944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053275
53578	NC_013158	CGC	2	6	2259945	2259950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053275
53579	NC_013158	CAT	2	6	2260063	2260068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257053275
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53581	NC_013158	CA	3	6	2260178	2260183	50 %	0 %	0 %	50 %	257053276
53582	NC_013158	GACC	2	8	2260230	2260237	25 %	0 %	25 %	50 %	257053276
53583	NC_013158	GTC	2	6	2260243	2260248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053276
53584	NC_013158	TCG	2	6	2260300	2260305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053276
53585	NC_013158	CGA	2	6	2260316	2260321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053276
53586	NC_013158	CTC	2	6	2260353	2260358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053276
53587	NC_013158	G	6	6	2260366	2260371	0 %	0 %	100 %	0 %	257053276
53588	NC_013158	CGGG	2	8	2260379	2260386	0 %	0 %	75 %	25 %	257053276
53589	NC_013158	GTCCC	2	10	2260436	2260445	0 %	20 %	20 %	60 %	257053276
53590	NC_013158	CCG	2	6	2260459	2260464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053276
53591	NC_013158	TCG	2	6	2260474	2260479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053276
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53593	NC_013158	GACCG	2	10	2260504	2260513	20 %	0 %	40 %	40 %	257053276
53594	NC_013158	TCG	2	6	2260514	2260519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053276
53595	NC_013158	GCC	2	6	2260542	2260547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053276
53596	NC_013158	TCG	3	9	2260582	2260590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053276
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53598	NC_013158	GTC	2	6	2260651	2260656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053276
53599	NC_013158	CGA	2	6	2260685	2260690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053276
53600	NC_013158	TCGGCG	2	12	2260696	2260707	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	257053276
53601	NC_013158	TCC	2	6	2260720	2260725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053276
53602	NC_013158	TCC	2	6	2260735	2260740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053276
53603	NC_013158	CGA	3	9	2260898	2260906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053276
53604	NC_013158	TGT	2	6	2260907	2260912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257053276
53605	NC_013158	GAT	2	6	2260920	2260925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257053276
53606	NC_013158	TCG	2	6	2261027	2261032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053276
53607	NC_013158	CGA	2	6	2261060	2261065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053276
53608	NC_013158	CGT	2	6	2261096	2261101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053276
53609	NC_013158	CTC	2	6	2261112	2261117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053276
53610	NC_013158	CGC	2	6	2261133	2261138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053276
53611	NC_013158	CGTCG	2	10	2261166	2261175	0 %	20 %	40 %	40 %	257053276
53612	NC_013158	CGA	2	6	2261252	2261257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053276
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53614	NC_013158	CGA	2	6	2261285	2261290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053276
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53846	NC_013158	CGA	2	6	2270716	2270721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053287
53847	NC_013158	GC	3	6	2270761	2270766	0 %	0 %	50 %	50 %	257053287
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53852	NC_013158	CGCC	2	8	2270884	2270891	0 %	0 %	25 %	75 %	257053287
53853	NC_013158	AGG	2	6	2270896	2270901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053287
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53872	NC_013158	CGA	3	9	2271558	2271566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053288
53873	NC_013158	GCCG	2	8	2271607	2271614	0 %	0 %	50 %	50 %	257053288
53874	NC_013158	CGA	2	6	2271624	2271629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053288
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53905	NC_013158	TCG	2	6	2272695	2272700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053290
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53931	NC_013158	ATAC	2	8	2273887	2273894	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53932	NC_013158	CTT	2	6	2273915	2273920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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53941	NC_013158	GCG	2	6	2274209	2274214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053291
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53943	NC_013158	CGA	2	6	2274327	2274332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053291
53944	NC_013158	TCG	2	6	2274352	2274357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053291
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53949	NC_013158	GGC	2	6	2274498	2274503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053291
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53951	NC_013158	GTCG	2	8	2274630	2274637	0 %	25 %	50 %	25 %	257053292
53952	NC_013158	CGT	2	6	2274680	2274685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053292
53953	NC_013158	CGT	3	9	2274704	2274712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053292
53954	NC_013158	CGA	3	9	2274719	2274727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053292
53955	NC_013158	CG	3	6	2274849	2274854	0 %	0 %	50 %	50 %	257053292
53956	NC_013158	GAG	2	6	2274885	2274890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053292
53957	NC_013158	CGA	2	6	2274994	2274999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053293
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