MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Hirschia baltica ATCC 49814 chromosome

Total Repeats: 66690

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_012982	GTT	2	6	54004	54009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254292429
1002	NC_012982	AAT	2	6	54022	54027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_012982	GAAA	2	8	54066	54073	75 %	0 %	25 %	0 %	254292430
1004	NC_012982	TCCT	2	8	54139	54146	0 %	50 %	0 %	50 %	254292430
1005	NC_012982	GC	3	6	54277	54282	0 %	0 %	50 %	50 %	254292430
1006	NC_012982	TGA	2	6	54294	54299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254292430
1007	NC_012982	CG	3	6	54317	54322	0 %	0 %	50 %	50 %	254292430
1008	NC_012982	GTTTGG	2	12	54377	54388	0 %	50 %	50 %	0 %	254292430
1009	NC_012982	AGA	2	6	54478	54483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254292430
1010	NC_012982	TG	3	6	54578	54583	0 %	50 %	50 %	0 %	254292430
1011	NC_012982	TCG	2	6	54623	54628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292430
1012	NC_012982	GAT	2	6	54670	54675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254292430
1013	NC_012982	ATGG	2	8	54680	54687	25 %	25 %	50 %	0 %	254292430
1014	NC_012982	AT	3	6	54709	54714	50 %	50 %	0 %	0 %	254292430
1015	NC_012982	AAT	2	6	54810	54815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254292431
1016	NC_012982	GCTT	2	8	54832	54839	0 %	50 %	25 %	25 %	254292431
1017	NC_012982	GATA	2	8	54853	54860	50 %	25 %	25 %	0 %	254292431
1018	NC_012982	CTG	2	6	54879	54884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292431
1019	NC_012982	TTG	2	6	54921	54926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254292431
1020	NC_012982	GCG	2	6	54939	54944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254292431
1021	NC_012982	TTA	2	6	55001	55006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254292431
1022	NC_012982	TTC	2	6	55024	55029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254292431
1023	NC_012982	TTC	2	6	55204	55209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254292431
1024	NC_012982	GTTT	2	8	55230	55237	0 %	75 %	25 %	0 %	254292431
1025	NC_012982	AAG	2	6	55268	55273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254292431
1026	NC_012982	AGAA	2	8	55356	55363	75 %	0 %	25 %	0 %	254292431
1027	NC_012982	A	6	6	55397	55402	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_012982	CGC	2	6	55405	55410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1029	NC_012982	TTC	2	6	55436	55441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_012982	AGC	2	6	55466	55471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292432
1031	NC_012982	TGC	2	6	55499	55504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292432
1032	NC_012982	CAGA	2	8	55525	55532	50 %	0 %	25 %	25 %	254292432
1033	NC_012982	TGA	2	6	55573	55578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254292432
1034	NC_012982	AGT	2	6	55585	55590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254292432
1035	NC_012982	CAG	2	6	55615	55620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292432
1036	NC_012982	GC	3	6	55653	55658	0 %	0 %	50 %	50 %	254292432
1037	NC_012982	GCCT	2	8	55691	55698	0 %	25 %	25 %	50 %	254292432
1038	NC_012982	TAA	2	6	55746	55751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254292432
1039	NC_012982	T	6	6	55772	55777	0 %	100 %	0 %	0 %	254292432
1040	NC_012982	GGAA	2	8	55880	55887	50 %	0 %	50 %	0 %	254292433
1041	NC_012982	GTT	2	6	55925	55930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254292433
1042	NC_012982	GTT	2	6	55935	55940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254292433
1043	NC_012982	GTTT	2	8	55980	55987	0 %	75 %	25 %	0 %	254292433
1044	NC_012982	TTTAC	2	10	56000	56009	20 %	60 %	0 %	20 %	254292433
1045	NC_012982	T	6	6	56033	56038	0 %	100 %	0 %	0 %	254292433
1046	NC_012982	A	6	6	56250	56255	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_012982	GCC	2	6	56256	56261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1048	NC_012982	TTG	2	6	56296	56301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254292434
1049	NC_012982	AAG	2	6	56328	56333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254292434
1050	NC_012982	GCA	2	6	56433	56438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292434
1051	NC_012982	CA	4	8	56437	56444	50 %	0 %	0 %	50 %	254292434
1052	NC_012982	TGCT	2	8	56447	56454	0 %	50 %	25 %	25 %	254292434
1053	NC_012982	TCA	2	6	56457	56462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292434
1054	NC_012982	CCAT	2	8	56514	56521	25 %	25 %	0 %	50 %	254292434
1055	NC_012982	CAA	2	6	56533	56538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254292434
1056	NC_012982	TTGG	2	8	56552	56559	0 %	50 %	50 %	0 %	254292434
1057	NC_012982	TTC	2	6	56603	56608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254292434
1058	NC_012982	TTTGC	2	10	56679	56688	0 %	60 %	20 %	20 %	254292434
1059	NC_012982	AAG	2	6	56793	56798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254292434
1060	NC_012982	CGT	2	6	56806	56811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292434
1061	NC_012982	CTGG	2	8	56825	56832	0 %	25 %	50 %	25 %	254292434
1062	NC_012982	TTG	2	6	56842	56847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254292434
1063	NC_012982	GCTG	2	8	56852	56859	0 %	25 %	50 %	25 %	254292434
1064	NC_012982	T	6	6	56920	56925	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_012982	GTT	2	6	56972	56977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_012982	AGC	2	6	56990	56995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_012982	ATT	2	6	57016	57021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_012982	TTTA	2	8	57022	57029	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_012982	TAT	2	6	57033	57038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_012982	A	6	6	57086	57091	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_012982	TCA	3	9	57313	57321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292435
1072	NC_012982	CAT	2	6	57350	57355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292435
1073	NC_012982	TAAA	2	8	57417	57424	75 %	25 %	0 %	0 %	254292435
1074	NC_012982	ACCA	2	8	57485	57492	50 %	0 %	0 %	50 %	254292435
1075	NC_012982	TAA	2	6	57524	57529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254292435
1076	NC_012982	TCA	2	6	57599	57604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292436
1077	NC_012982	GCG	2	6	57698	57703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254292436
1078	NC_012982	GCG	2	6	57729	57734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254292436
1079	NC_012982	CAC	2	6	57738	57743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254292436
1080	NC_012982	TGT	2	6	57829	57834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254292436
1081	NC_012982	GAAA	2	8	57942	57949	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_012982	GTG	2	6	58005	58010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254292437
1083	NC_012982	TCT	2	6	58079	58084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254292437
1084	NC_012982	TTG	2	6	58114	58119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254292437
1085	NC_012982	CAT	2	6	58170	58175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292437
1086	NC_012982	TCT	2	6	58197	58202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254292437
1087	NC_012982	GCA	2	6	58280	58285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292437
1088	NC_012982	TTC	2	6	58300	58305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254292437
1089	NC_012982	GGTT	2	8	58342	58349	0 %	50 %	50 %	0 %	254292437
1090	NC_012982	TCA	2	6	58445	58450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292437
1091	NC_012982	GCT	3	9	58514	58522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292437
1092	NC_012982	TGT	2	6	58551	58556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_012982	CAG	2	6	58698	58703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292438
1094	NC_012982	GAT	2	6	58711	58716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254292438
1095	NC_012982	GCTT	2	8	58777	58784	0 %	50 %	25 %	25 %	254292438
1096	NC_012982	TCT	2	6	58787	58792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254292438
1097	NC_012982	ACAAT	2	10	58812	58821	60 %	20 %	0 %	20 %	254292438
1098	NC_012982	CGC	2	6	58840	58845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254292438
1099	NC_012982	CCA	2	6	58868	58873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254292438
1100	NC_012982	A	6	6	58876	58881	100 %	0 %	0 %	0 %	254292438
1101	NC_012982	GATA	2	8	58897	58904	50 %	25 %	25 %	0 %	254292438
1102	NC_012982	GAAA	2	8	58911	58918	75 %	0 %	25 %	0 %	254292438
1103	NC_012982	TCT	2	6	58965	58970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254292438
1104	NC_012982	AGC	2	6	58972	58977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292438
1105	NC_012982	CGA	2	6	58998	59003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292438
1106	NC_012982	GCG	2	6	59058	59063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254292438
1107	NC_012982	GCTT	2	8	59068	59075	0 %	50 %	25 %	25 %	254292438
1108	NC_012982	ATG	2	6	59102	59107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254292438
1109	NC_012982	CCA	2	6	59231	59236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254292438
1110	NC_012982	TGC	2	6	59242	59247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292438
1111	NC_012982	AAT	2	6	59261	59266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254292438
1112	NC_012982	CTTT	2	8	59384	59391	0 %	75 %	0 %	25 %	254292438
1113	NC_012982	T	6	6	59438	59443	0 %	100 %	0 %	0 %	254292438
1114	NC_012982	CGT	2	6	59481	59486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292438
1115	NC_012982	TCAG	2	8	59528	59535	25 %	25 %	25 %	25 %	254292438
1116	NC_012982	TGCG	2	8	59558	59565	0 %	25 %	50 %	25 %	254292438
1117	NC_012982	GGC	2	6	59581	59586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254292438
1118	NC_012982	AAC	2	6	59601	59606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254292438
1119	NC_012982	GAT	2	6	59623	59628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254292438
1120	NC_012982	CGT	2	6	59689	59694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292438
1121	NC_012982	TTGA	2	8	59729	59736	25 %	50 %	25 %	0 %	254292439
1122	NC_012982	CGT	2	6	59781	59786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292439
1123	NC_012982	TGC	2	6	59808	59813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292439
1124	NC_012982	T	6	6	59814	59819	0 %	100 %	0 %	0 %	254292439
1125	NC_012982	GTT	2	6	59834	59839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254292439
1126	NC_012982	CAG	2	6	59990	59995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292439
1127	NC_012982	CTT	2	6	60017	60022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254292439
1128	NC_012982	CGA	2	6	60083	60088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292439
1129	NC_012982	ATC	2	6	60162	60167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292439
1130	NC_012982	T	6	6	60236	60241	0 %	100 %	0 %	0 %	254292439
1131	NC_012982	GGC	2	6	60260	60265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254292439
1132	NC_012982	AAT	2	6	60276	60281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254292439
1133	NC_012982	AAT	2	6	60318	60323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254292439
1134	NC_012982	GAC	2	6	60393	60398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292439
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1136	NC_012982	AATG	2	8	60441	60448	50 %	25 %	25 %	0 %	254292439
1137	NC_012982	CCG	2	6	60751	60756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254292439
1138	NC_012982	GCC	2	6	60828	60833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254292439
1139	NC_012982	GCT	2	6	60835	60840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292439
1140	NC_012982	ATG	2	6	60902	60907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254292439
1141	NC_012982	CTCG	2	8	60948	60955	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1142	NC_012982	TGA	2	6	60993	60998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1143	NC_012982	AT	3	6	61002	61007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1144	NC_012982	A	7	7	61130	61136	100 %	0 %	0 %	0 %	254292440
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1151	NC_012982	TGA	2	6	61325	61330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254292440
1152	NC_012982	GGGT	2	8	61374	61381	0 %	25 %	75 %	0 %	254292440
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1154	NC_012982	GA	3	6	61401	61406	50 %	0 %	50 %	0 %	254292440
1155	NC_012982	GTG	2	6	61416	61421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254292440
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1159	NC_012982	GAT	2	6	61656	61661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254292440
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1162	NC_012982	GGGT	2	8	61979	61986	0 %	25 %	75 %	0 %	254292441
1163	NC_012982	CAT	2	6	62041	62046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292441
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1166	NC_012982	GC	3	6	62090	62095	0 %	0 %	50 %	50 %	254292441
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1169	NC_012982	ATA	2	6	62151	62156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254292441
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1172	NC_012982	T	6	6	62274	62279	0 %	100 %	0 %	0 %	254292441
1173	NC_012982	TTC	2	6	62309	62314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254292441
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1192	NC_012982	AAAG	2	8	63420	63427	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1193	NC_012982	GCC	2	6	63443	63448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1194	NC_012982	T	6	6	63449	63454	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1195	NC_012982	CAT	2	6	63589	63594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292443
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1221	NC_012982	GA	3	6	64888	64893	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1222	NC_012982	ATTCT	2	10	64908	64917	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1223	NC_012982	GTG	2	6	64949	64954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254292444
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1240	NC_012982	CGA	2	6	65681	65686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292444
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1242	NC_012982	CTT	2	6	65723	65728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254292444
1243	NC_012982	CG	4	8	65741	65748	0 %	0 %	50 %	50 %	254292444
1244	NC_012982	GGA	2	6	65780	65785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254292444
1245	NC_012982	GCA	2	6	65875	65880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292444
1246	NC_012982	CGA	2	6	65921	65926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292444
1247	NC_012982	T	6	6	65934	65939	0 %	100 %	0 %	0 %	254292444
1248	NC_012982	GC	3	6	65972	65977	0 %	0 %	50 %	50 %	254292444
1249	NC_012982	AGC	2	6	65991	65996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292444
1250	NC_012982	GCGT	2	8	66074	66081	0 %	25 %	50 %	25 %	254292444
1251	NC_012982	TTCA	2	8	66153	66160	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1252	NC_012982	TGT	2	6	66232	66237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1253	NC_012982	ACG	2	6	66353	66358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292445
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