MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Hirschia baltica ATCC 49814 chromosome

Total Repeats: 66690

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_012982	CTTGG	2	10	233702	233711	0 %	40 %	40 %	20 %	254292589
4502	NC_012982	CTG	2	6	233763	233768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292589
4503	NC_012982	GTT	2	6	233781	233786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254292589
4504	NC_012982	TTG	2	6	233811	233816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254292589
4505	NC_012982	TCT	2	6	233888	233893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254292589
4506	NC_012982	GAATG	2	10	233984	233993	40 %	20 %	40 %	0 %	254292589
4507	NC_012982	AGA	2	6	233998	234003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254292589
4508	NC_012982	ACG	2	6	234008	234013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292589
4509	NC_012982	A	7	7	234038	234044	100 %	0 %	0 %	0 %	254292589
4510	NC_012982	TGTC	3	12	234085	234096	0 %	50 %	25 %	25 %	254292589
4511	NC_012982	TGG	2	6	234144	234149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254292589
4512	NC_012982	CAAC	2	8	234161	234168	50 %	0 %	0 %	50 %	254292589
4513	NC_012982	GCT	2	6	234227	234232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292589
4514	NC_012982	ATA	2	6	234243	234248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254292589
4515	NC_012982	CTG	2	6	234249	234254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292589
4516	NC_012982	TGC	2	6	234292	234297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292589
4517	NC_012982	AAG	2	6	234381	234386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254292589
4518	NC_012982	ATGG	2	8	234455	234462	25 %	25 %	50 %	0 %	254292589
4519	NC_012982	CGT	2	6	234476	234481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292589
4520	NC_012982	CG	3	6	234499	234504	0 %	0 %	50 %	50 %	254292589
4521	NC_012982	TTG	2	6	234528	234533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254292589
4522	NC_012982	AAG	2	6	234663	234668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254292589
4523	NC_012982	TGT	2	6	234697	234702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254292589
4524	NC_012982	TCT	2	6	234773	234778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254292589
4525	NC_012982	GCCT	2	8	234829	234836	0 %	25 %	25 %	50 %	254292589
4526	NC_012982	CG	3	6	234944	234949	0 %	0 %	50 %	50 %	254292589
4527	NC_012982	CAG	2	6	234978	234983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292589
4528	NC_012982	GAA	2	6	234998	235003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254292589
4529	NC_012982	ATC	2	6	235013	235018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292589
4530	NC_012982	AGCAA	2	10	235037	235046	60 %	0 %	20 %	20 %	254292589
4531	NC_012982	GAA	2	6	235061	235066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254292589
4532	NC_012982	TTG	2	6	235197	235202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254292590
4533	NC_012982	AAT	2	6	235253	235258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254292590
4534	NC_012982	TCCA	2	8	235260	235267	25 %	25 %	0 %	50 %	254292590
4535	NC_012982	GAA	2	6	235300	235305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254292590
4536	NC_012982	ATA	2	6	235312	235317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254292590
4537	NC_012982	ATA	2	6	235435	235440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254292590
4538	NC_012982	AGAT	2	8	235460	235467	50 %	25 %	25 %	0 %	254292590
4539	NC_012982	TTG	2	6	235473	235478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254292590
4540	NC_012982	TCA	2	6	235503	235508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292590
4541	NC_012982	AGAA	2	8	235546	235553	75 %	0 %	25 %	0 %	254292590
4542	NC_012982	GCC	2	6	235631	235636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254292590
4543	NC_012982	AAGCAA	2	12	235775	235786	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	254292590
4544	NC_012982	CAG	2	6	235832	235837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292590
4545	NC_012982	CAT	2	6	235838	235843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292590
4546	NC_012982	T	6	6	235954	235959	0 %	100 %	0 %	0 %	254292590
4547	NC_012982	GGCAA	2	10	235994	236003	40 %	0 %	40 %	20 %	254292590
4548	NC_012982	GC	4	8	236043	236050	0 %	0 %	50 %	50 %	254292590
4549	NC_012982	T	6	6	236056	236061	0 %	100 %	0 %	0 %	254292590
4550	NC_012982	CGC	2	6	236080	236085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254292590
4551	NC_012982	GCG	2	6	236148	236153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254292590
4552	NC_012982	TGA	2	6	236212	236217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254292590
4553	NC_012982	GGA	2	6	236283	236288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254292590
4554	NC_012982	GTG	2	6	236293	236298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254292590
4555	NC_012982	TCA	2	6	236374	236379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292591
4556	NC_012982	TTC	2	6	236397	236402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254292591
4557	NC_012982	CATCA	2	10	236436	236445	40 %	20 %	0 %	40 %	254292591
4558	NC_012982	TGA	2	6	236525	236530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254292591
4559	NC_012982	GAA	2	6	236536	236541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254292591
4560	NC_012982	CCA	2	6	236637	236642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254292591
4561	NC_012982	GCC	2	6	236823	236828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254292591
4562	NC_012982	GTAA	2	8	236848	236855	50 %	25 %	25 %	0 %	254292591
4563	NC_012982	CAATAC	2	12	236892	236903	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	254292591
4564	NC_012982	AAT	2	6	236975	236980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254292591
4565	NC_012982	AAT	2	6	237009	237014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254292591
4566	NC_012982	GTC	2	6	237094	237099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292591
4567	NC_012982	TAT	2	6	237174	237179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254292591
4568	NC_012982	CTT	2	6	237191	237196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254292591
4569	NC_012982	ATA	2	6	237248	237253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254292591
4570	NC_012982	TGC	2	6	237255	237260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292591
4571	NC_012982	GCC	2	6	237288	237293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254292591
4572	NC_012982	AGG	2	6	237297	237302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254292591
4573	NC_012982	GT	3	6	237345	237350	0 %	50 %	50 %	0 %	254292591
4574	NC_012982	GGC	2	6	237438	237443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254292591
4575	NC_012982	ACCAA	2	10	237459	237468	60 %	0 %	0 %	40 %	254292591
4576	NC_012982	CG	4	8	237472	237479	0 %	0 %	50 %	50 %	254292591
4577	NC_012982	TGC	2	6	237603	237608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292591
4578	NC_012982	T	6	6	237645	237650	0 %	100 %	0 %	0 %	254292591
4579	NC_012982	TTG	2	6	237658	237663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254292591
4580	NC_012982	CGT	2	6	237667	237672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292591
4581	NC_012982	TTC	2	6	237729	237734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254292591
4582	NC_012982	A	6	6	237783	237788	100 %	0 %	0 %	0 %	254292591
4583	NC_012982	GCG	2	6	237826	237831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254292591
4584	NC_012982	TAA	3	9	237903	237911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254292591
4585	NC_012982	ATT	2	6	237936	237941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254292591
4586	NC_012982	GCC	2	6	237954	237959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254292591
4587	NC_012982	AAG	2	6	238005	238010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254292591
4588	NC_012982	A	6	6	238050	238055	100 %	0 %	0 %	0 %	254292591
4589	NC_012982	ATAA	2	8	238126	238133	75 %	25 %	0 %	0 %	254292591
4590	NC_012982	ATAC	2	8	238195	238202	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4591	NC_012982	TTTA	2	8	238223	238230	25 %	75 %	0 %	0 %	254292592
4592	NC_012982	GCA	2	6	238243	238248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292592
4593	NC_012982	GAT	2	6	238261	238266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254292592
4594	NC_012982	ACG	2	6	238269	238274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292592
4595	NC_012982	ACG	3	9	238278	238286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292592
4596	NC_012982	ATG	2	6	238527	238532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254292593
4597	NC_012982	ATTA	2	8	238558	238565	50 %	50 %	0 %	0 %	254292593
4598	NC_012982	ACG	2	6	238622	238627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292593
4599	NC_012982	GT	3	6	238638	238643	0 %	50 %	50 %	0 %	254292593
4600	NC_012982	C	6	6	238791	238796	0 %	0 %	0 %	100 %	254292593
4601	NC_012982	CAA	2	6	238902	238907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254292593
4602	NC_012982	CCA	2	6	238944	238949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254292593
4603	NC_012982	GTTT	2	8	239038	239045	0 %	75 %	25 %	0 %	254292593
4604	NC_012982	TCG	2	6	239099	239104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292593
4605	NC_012982	ATC	2	6	239158	239163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292593
4606	NC_012982	GGCG	2	8	239220	239227	0 %	0 %	75 %	25 %	254292593
4607	NC_012982	CAT	2	6	239229	239234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292593
4608	NC_012982	TTG	2	6	239349	239354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254292593
4609	NC_012982	TCT	2	6	239357	239362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254292593
4610	NC_012982	TTC	2	6	239401	239406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254292593
4611	NC_012982	CAG	3	9	239409	239417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292593
4612	NC_012982	TTG	2	6	239531	239536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254292593
4613	NC_012982	TAAA	2	8	239615	239622	75 %	25 %	0 %	0 %	254292593
4614	NC_012982	ACC	2	6	239698	239703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254292593
4615	NC_012982	TGC	2	6	239796	239801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292593
4616	NC_012982	AAT	2	6	239804	239809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254292593
4617	NC_012982	ATC	2	6	239972	239977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292593
4618	NC_012982	GAG	2	6	240111	240116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_012982	GT	4	8	240134	240141	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_012982	GTT	2	6	240145	240150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_012982	GTT	2	6	240169	240174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_012982	TCC	2	6	240217	240222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4623	NC_012982	GAA	2	6	240255	240260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4624	NC_012982	GAA	2	6	240330	240335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4625	NC_012982	TGC	2	6	240423	240428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4626	NC_012982	T	6	6	240430	240435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4627	NC_012982	AAG	2	6	240444	240449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4628	NC_012982	AC	4	8	240466	240473	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4629	NC_012982	CG	3	6	240498	240503	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4630	NC_012982	TCT	2	6	240516	240521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4631	NC_012982	AT	4	8	240555	240562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4739	NC_012982	A	6	6	246495	246500	100 %	0 %	0 %	0 %	254292600
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4870	NC_012982	AGC	2	6	253084	253089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292608
4871	NC_012982	TCG	2	6	253147	253152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292608
4872	NC_012982	GC	3	6	253219	253224	0 %	0 %	50 %	50 %	254292608
4873	NC_012982	GCC	2	6	253271	253276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254292608
4874	NC_012982	CAGAC	2	10	253338	253347	40 %	0 %	20 %	40 %	254292608
4875	NC_012982	ATC	2	6	253354	253359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292608
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4877	NC_012982	TTC	2	6	253507	253512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254292608
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4880	NC_012982	CAT	2	6	253632	253637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292608
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4894	NC_012982	CAT	2	6	254111	254116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292609
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4899	NC_012982	GCA	2	6	254303	254308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292609
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4902	NC_012982	GT	3	6	254555	254560	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4907	NC_012982	CGT	2	6	254835	254840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292610
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4928	NC_012982	ATG	2	6	255947	255952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254292611
4929	NC_012982	ATT	2	6	256001	256006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4930	NC_012982	TCA	3	9	256064	256072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292612
4931	NC_012982	TGA	2	6	256087	256092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254292612
4932	NC_012982	TCG	2	6	256160	256165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292612
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4934	NC_012982	CAG	2	6	256275	256280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292612
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4946	NC_012982	T	6	6	256887	256892	0 %	100 %	0 %	0 %	254292612
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4973	NC_012982	GATG	2	8	258175	258182	25 %	25 %	50 %	0 %	254292612
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4976	NC_012982	GCGGG	2	10	258359	258368	0 %	0 %	80 %	20 %	254292612
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4978	NC_012982	GAAT	2	8	258549	258556	50 %	25 %	25 %	0 %	254292612
4979	NC_012982	ACC	2	6	258562	258567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254292612
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4982	NC_012982	CATT	2	8	258642	258649	25 %	50 %	0 %	25 %	254292612
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4990	NC_012982	CCAA	2	8	258927	258934	50 %	0 %	0 %	50 %	254292613
4991	NC_012982	GCGGG	2	10	259008	259017	0 %	0 %	80 %	20 %	254292613
4992	NC_012982	GCC	2	6	259478	259483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254292613
4993	NC_012982	GT	3	6	259628	259633	0 %	50 %	50 %	0 %	254292613
4994	NC_012982	T	6	6	259657	259662	0 %	100 %	0 %	0 %	254292613
4995	NC_012982	CTG	2	6	259663	259668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292613
4996	NC_012982	CCA	2	6	259701	259706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254292613
4997	NC_012982	GAC	2	6	259709	259714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292613
4998	NC_012982	TTGG	2	8	259880	259887	0 %	50 %	50 %	0 %	254292613
4999	NC_012982	TTGTG	2	10	260022	260031	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
5000	NC_012982	GCC	2	6	260045	260050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254292614

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