MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori B38 chromosome

Total Repeats: 809

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012973	AAAGCG	2	12	382	393	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	254778739
2	NC_012973	TTGCAA	2	12	961	972	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	254778740
3	NC_012973	ATTATA	2	12	1889	1900	50 %	50 %	0 %	0 %	254778742
4	NC_012973	GCGATA	2	12	3818	3829	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	254778744
5	NC_012973	GCTTGC	2	12	6148	6159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254778745
6	NC_012973	GAAACC	2	12	7596	7607	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	254778746
7	NC_012973	ACTATA	2	12	9615	9626	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_012973	ATTTGA	2	12	12804	12815	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	254778750
9	NC_012973	AGCTTG	2	12	15840	15851	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	254778753
10	NC_012973	AAACAC	2	12	18172	18183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_012973	GATAAA	2	12	22078	22089	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	254778758
12	NC_012973	TTTCTT	2	12	22802	22813	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_012973	GAGTCC	2	12	27784	27795	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	254778762
14	NC_012973	TATCAA	2	12	29992	30003	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	254778765
15	NC_012973	CTTTTA	2	12	30300	30311	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	254778765
16	NC_012973	GCGTGG	2	12	32674	32685	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	254778768
17	NC_012973	TTGGAT	2	12	32784	32795	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	254778768
18	NC_012973	TAATGA	2	12	32819	32830	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	254778768
19	NC_012973	TTGAAT	2	12	33870	33881	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	254778768
20	NC_012973	TAAGGA	2	12	34169	34180	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	254778768
21	NC_012973	TAGGGG	2	12	35685	35696	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	254778771
22	NC_012973	AAAGAA	2	12	37197	37208	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	254778772
23	NC_012973	AAAGAA	2	12	38788	38799	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	254778774
24	NC_012973	CAAAAT	2	12	41129	41140	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	254778776
25	NC_012973	GACTTA	2	12	44134	44145	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_012973	GCTTTA	2	12	44201	44212	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	254778779
27	NC_012973	CGCAAA	2	12	44992	45003	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	254778779
28	NC_012973	GTTTGA	2	12	48092	48103	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	254778781
29	NC_012973	GGCTAG	2	12	49244	49255	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_012973	TAAAAA	2	12	51758	51769	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	254778783
31	NC_012973	CCACGC	2	12	53513	53524	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	254778784
32	NC_012973	CTAAAG	2	12	54800	54811	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	254778784
33	NC_012973	AATTTT	2	12	56921	56932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254778786
34	NC_012973	AAGAGA	2	12	57541	57552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254778787
35	NC_012973	AGAAAA	2	12	57748	57759	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	254778787
36	NC_012973	GTGGAT	2	12	58446	58457	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012973	AGCCAA	2	12	58521	58532	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_012973	CCAACA	2	12	60371	60382	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_012973	TTTTGT	2	12	60709	60720	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	254778788
40	NC_012973	AAAGAG	2	12	60988	60999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254778788
41	NC_012973	AGAAAA	2	12	62727	62738	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	254778790
42	NC_012973	GAATAC	2	12	63389	63400	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	254778791
43	NC_012973	AGCGGG	2	12	64888	64899	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_012973	ACGCCC	2	12	72680	72691	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	254778800
45	NC_012973	AAGGGC	2	12	75411	75422	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	254778803
46	NC_012973	CGCCCA	2	12	75947	75958	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	254778803
47	NC_012973	AGGATA	2	12	76777	76788	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012973	AGCGTG	2	12	77001	77012	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_012973	CAACGA	2	12	77350	77361	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_012973	GCGCAT	2	12	78566	78577	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	254778804
51	NC_012973	GGCATG	2	12	78869	78880	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	254778804
52	NC_012973	GATATT	2	12	80656	80667	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	254778805
53	NC_012973	AACAGG	2	12	88583	88594	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	254778811
54	NC_012973	TACAAA	2	12	91002	91013	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_012973	AAAAAT	2	12	91205	91216	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012973	AAGCAT	2	12	92409	92420	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	254778814
57	NC_012973	ATTAGA	2	12	92708	92719	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	254778814
58	NC_012973	GCTAAA	2	12	94179	94190	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	254778816
59	NC_012973	GATTTT	2	12	94478	94489	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	254778817
60	NC_012973	AAACTC	2	12	94595	94606	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	254778817
61	NC_012973	TCAAAA	2	12	95946	95957	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	254778818
62	NC_012973	GCGGTG	2	12	96638	96649	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	254778819
63	NC_012973	TTAAGG	2	12	98184	98195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254778820
64	NC_012973	CAATAT	2	12	99844	99855	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	254778820
65	NC_012973	CGTATT	2	12	105675	105686	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	254778825
66	NC_012973	GATAAC	2	12	109321	109332	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_012973	TGGAGC	2	12	110725	110736	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	254778829
68	NC_012973	TTTTCT	2	12	112226	112237	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	254778830
69	NC_012973	GCAAGC	2	12	112633	112644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254778830
70	NC_012973	CGCTCG	2	12	117219	117230	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	254778835
71	NC_012973	TAGGCA	2	12	119756	119767	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	254778836
72	NC_012973	TTCTAT	2	12	122094	122105	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_012973	GTTCTA	2	12	122383	122394	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_012973	GTTCTA	2	12	122446	122457	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_012973	CTAAAG	2	12	123756	123767	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	254778838
76	NC_012973	TGAATT	2	12	124290	124301	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	254778838
77	NC_012973	TTTCAA	2	12	124449	124460	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	254778838
78	NC_012973	CTTTGG	2	12	125851	125862	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	254778840
79	NC_012973	AGCAAA	2	12	127794	127805	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	254778841
80	NC_012973	GTTTTA	2	12	128804	128815	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012973	AAAAAT	2	12	137088	137099	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	254778851
82	NC_012973	TAGCGA	2	12	139232	139243	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	254778854
83	NC_012973	ACGATT	2	12	141759	141770	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	254778856
84	NC_012973	TTAGCG	2	12	142128	142139	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	254778856
85	NC_012973	TATCGC	2	12	142340	142351	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	254778856
86	NC_012973	TATCGC	2	12	144048	144059	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	254778857
87	NC_012973	AGCCTA	2	12	146270	146281	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	254778859
88	NC_012973	TTCTAT	2	12	147432	147443	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	254778860
89	NC_012973	TTGTTT	2	12	150420	150431	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012973	CTTGGG	2	12	151082	151093	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	254778866
91	NC_012973	TTGGGT	2	12	155860	155871	0 %	50 %	50 %	0 %	254778871
92	NC_012973	GATTTT	2	12	156373	156384	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	254778872
93	NC_012973	AATTGA	2	12	156632	156643	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	254778872
94	NC_012973	ACCCTT	2	12	157515	157526	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	254778874
95	NC_012973	GATGGC	2	12	159586	159597	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	254778876
96	NC_012973	GATGGC	2	12	159694	159705	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	254778876
97	NC_012973	CTTTCT	2	12	159838	159849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254778876
98	NC_012973	CCGCTC	2	12	161596	161607	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	254778878
99	NC_012973	GCTCTC	2	12	164022	164033	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	254778880
100	NC_012973	TAAAAA	2	12	164680	164691	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012973	TAGTGG	2	12	165804	165815	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	254778883
102	NC_012973	TTCTAA	2	12	166357	166368	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	254778883
103	NC_012973	ATCGTT	2	12	168468	168479	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	254778885
104	NC_012973	AATTTC	2	12	168819	168830	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	254778886
105	NC_012973	TAAAAT	2	12	170343	170354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254778887
106	NC_012973	ATTTTG	2	12	172147	172158	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	254778889
107	NC_012973	CGCTTT	2	12	172625	172636	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	254778889
108	NC_012973	ACTTAT	2	12	172722	172733	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	254778889
109	NC_012973	GTTTAA	2	12	173409	173420	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	254778890
110	NC_012973	CCGCTC	2	12	176436	176447	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	254778893
111	NC_012973	AATAAA	2	12	178605	178616	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	254778895
112	NC_012973	AGGCAT	2	12	180149	180160	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	254778896
113	NC_012973	GCATTT	2	12	181862	181873	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	254778898
114	NC_012973	TCAAAC	2	12	182429	182440	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	254778899
115	NC_012973	ATAAAG	2	12	182590	182601	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	254778899
116	NC_012973	CACGCT	2	12	183262	183273	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
117	NC_012973	TTAAAG	2	12	185468	185479	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	254778900
118	NC_012973	GGTATT	2	12	186369	186380	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	254778901
119	NC_012973	TCTAAA	2	12	186599	186610	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	254778901
120	NC_012973	TGGGCA	2	12	187668	187679	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	254778902
121	NC_012973	TTCTAA	2	12	188147	188158	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	254778903
122	NC_012973	ATTTTC	2	12	190092	190103	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	254778903
123	NC_012973	TGGGGC	2	12	197495	197506	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	254778913
124	NC_012973	CTATGG	2	12	197884	197895	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	254778913
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127	NC_012973	AATTTT	2	12	201916	201927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012973	AATTTT	2	12	209439	209450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012973	CAAAAA	2	12	209474	209485	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_012973	ATTCTA	2	12	209927	209938	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	254778921
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134	NC_012973	ACTTTA	2	12	216726	216737	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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136	NC_012973	CCCTAA	2	12	224425	224436	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_012973	AATGCC	2	12	224630	224641	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	254778932
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142	NC_012973	TCAATA	2	12	229305	229316	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	254778935
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148	NC_012973	TCCCGC	2	12	249994	250005	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	254778956
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233	NC_012973	AAAATC	2	12	403960	403971	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	254779097
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236	NC_012973	ATTGCG	2	12	409151	409162	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	254779101
237	NC_012973	TTATGG	2	12	410279	410290	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	254779102
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349	NC_012973	CTTATT	2	12	633090	633101	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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351	NC_012973	ATCTAA	2	12	634768	634779	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	254779307
352	NC_012973	CATTTT	2	12	636006	636017	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	254779308
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470	NC_012973	TTGTGT	2	12	854078	854089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
471	NC_012973	TTGCCA	2	12	856308	856319	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	254779491
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