MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 plasmid pHLAC01

Total Repeats: 1250

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012030	TCGC	2	8	309	316	0 %	25 %	25 %	50 %	222481152
2	NC_012030	GGAT	2	8	2138	2145	25 %	25 %	50 %	0 %	222481154
3	NC_012030	CGAC	2	8	2187	2194	25 %	0 %	25 %	50 %	222481154
4	NC_012030	CCGA	2	8	2677	2684	25 %	0 %	25 %	50 %	222481154
5	NC_012030	ACGC	2	8	2699	2706	25 %	0 %	25 %	50 %	222481154
6	NC_012030	TCCA	2	8	2822	2829	25 %	25 %	0 %	50 %	222481154
7	NC_012030	CACG	2	8	2873	2880	25 %	0 %	25 %	50 %	222481154
8	NC_012030	TTCG	2	8	3268	3275	0 %	50 %	25 %	25 %	222481155
9	NC_012030	ACCT	2	8	3615	3622	25 %	25 %	0 %	50 %	222481155
10	NC_012030	CTCG	2	8	3641	3648	0 %	25 %	25 %	50 %	222481155
11	NC_012030	ACGA	2	8	4002	4009	50 %	0 %	25 %	25 %	222481155
12	NC_012030	GCAG	2	8	4147	4154	25 %	0 %	50 %	25 %	222481156
13	NC_012030	TCTG	2	8	4619	4626	0 %	50 %	25 %	25 %	222481156
14	NC_012030	TGAC	2	8	4635	4642	25 %	25 %	25 %	25 %	222481156
15	NC_012030	ACGC	2	8	4686	4693	25 %	0 %	25 %	50 %	222481156
16	NC_012030	ACTG	2	8	4748	4755	25 %	25 %	25 %	25 %	222481156
17	NC_012030	GTTC	2	8	5043	5050	0 %	50 %	25 %	25 %	222481156
18	NC_012030	TCAA	2	8	5100	5107	50 %	25 %	0 %	25 %	222481156
19	NC_012030	CGGT	2	8	5193	5200	0 %	25 %	50 %	25 %	222481156
20	NC_012030	GACC	2	8	5973	5980	25 %	0 %	25 %	50 %	222481157
21	NC_012030	GTAC	2	8	6425	6432	25 %	25 %	25 %	25 %	222481157
22	NC_012030	CAAA	2	8	7073	7080	75 %	0 %	0 %	25 %	222481158
23	NC_012030	CGTA	2	8	7262	7269	25 %	25 %	25 %	25 %	222481159
24	NC_012030	AGAT	2	8	7302	7309	50 %	25 %	25 %	0 %	222481159
25	NC_012030	GACG	2	8	7801	7808	25 %	0 %	50 %	25 %	222481159
26	NC_012030	CTCG	2	8	8044	8051	0 %	25 %	25 %	50 %	222481159
27	NC_012030	ATTA	2	8	8401	8408	50 %	50 %	0 %	0 %	222481160
28	NC_012030	GAAG	2	8	8638	8645	50 %	0 %	50 %	0 %	222481160
29	NC_012030	GGTG	2	8	8666	8673	0 %	25 %	75 %	0 %	222481160
30	NC_012030	CCGA	2	8	8755	8762	25 %	0 %	25 %	50 %	222481160
31	NC_012030	GCCG	2	8	8918	8925	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_012030	CGTG	2	8	9382	9389	0 %	25 %	50 %	25 %	222481161
33	NC_012030	TCGA	2	8	9505	9512	25 %	25 %	25 %	25 %	222481161
34	NC_012030	CCCA	2	8	9910	9917	25 %	0 %	0 %	75 %	222481161
35	NC_012030	GGGT	2	8	9995	10002	0 %	25 %	75 %	0 %	222481161
36	NC_012030	GTCG	2	8	11231	11238	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_012030	TTGG	2	8	11878	11885	0 %	50 %	50 %	0 %	222481162
38	NC_012030	GGTT	2	8	11894	11901	0 %	50 %	50 %	0 %	222481162
39	NC_012030	CACC	2	8	12624	12631	25 %	0 %	0 %	75 %	222481162
40	NC_012030	GTTG	2	8	12993	13000	0 %	50 %	50 %	0 %	222481162
41	NC_012030	ATCT	2	8	13394	13401	25 %	50 %	0 %	25 %	222481163
42	NC_012030	GGCG	2	8	13437	13444	0 %	0 %	75 %	25 %	222481163
43	NC_012030	GTCG	2	8	13542	13549	0 %	25 %	50 %	25 %	222481163
44	NC_012030	ACTC	2	8	13967	13974	25 %	25 %	0 %	50 %	222481163
45	NC_012030	GCAA	2	8	14293	14300	50 %	0 %	25 %	25 %	222481163
46	NC_012030	GCCA	2	8	14398	14405	25 %	0 %	25 %	50 %	222481163
47	NC_012030	AAAT	2	8	14870	14877	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012030	AGGG	2	8	15182	15189	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012030	CGAC	2	8	15750	15757	25 %	0 %	25 %	50 %	222481164
50	NC_012030	TGCT	2	8	15880	15887	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_012030	GCTG	2	8	15918	15925	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_012030	ACGA	2	8	16035	16042	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_012030	CGAC	2	8	16369	16376	25 %	0 %	25 %	50 %	222481165
54	NC_012030	TCGT	2	8	16557	16564	0 %	50 %	25 %	25 %	222481166
55	NC_012030	CTGT	2	8	16942	16949	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_012030	CAGC	2	8	18247	18254	25 %	0 %	25 %	50 %	222481168
57	NC_012030	TCGC	2	8	18282	18289	0 %	25 %	25 %	50 %	222481168
58	NC_012030	GACT	2	8	18933	18940	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_012030	TCGA	2	8	19408	19415	25 %	25 %	25 %	25 %	222481169
60	NC_012030	AGCA	2	8	19683	19690	50 %	0 %	25 %	25 %	222481169
61	NC_012030	CGAA	2	8	19964	19971	50 %	0 %	25 %	25 %	222481169
62	NC_012030	CACG	2	8	20028	20035	25 %	0 %	25 %	50 %	222481169
63	NC_012030	CTAA	2	8	20161	20168	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_012030	TTCC	2	8	20564	20571	0 %	50 %	0 %	50 %	222481170
65	NC_012030	GACC	2	8	21641	21648	25 %	0 %	25 %	50 %	222481172
66	NC_012030	GTTG	2	8	22617	22624	0 %	50 %	50 %	0 %	222481172
67	NC_012030	CTCG	2	8	23004	23011	0 %	25 %	25 %	50 %	222481172
68	NC_012030	TCGC	2	8	23077	23084	0 %	25 %	25 %	50 %	222481172
69	NC_012030	GGCG	2	8	23310	23317	0 %	0 %	75 %	25 %	222481172
70	NC_012030	ACTT	2	8	23545	23552	25 %	50 %	0 %	25 %	222481172
71	NC_012030	TATT	2	8	23600	23607	25 %	75 %	0 %	0 %	222481172
72	NC_012030	GGAT	2	8	24210	24217	25 %	25 %	50 %	0 %	222481172
73	NC_012030	ATGG	2	8	24319	24326	25 %	25 %	50 %	0 %	222481172
74	NC_012030	TCTG	2	8	24819	24826	0 %	50 %	25 %	25 %	222481172
75	NC_012030	GATC	2	8	24970	24977	25 %	25 %	25 %	25 %	222481172
76	NC_012030	ACTC	2	8	25196	25203	25 %	25 %	0 %	50 %	222481172
77	NC_012030	CTAA	2	8	25300	25307	50 %	25 %	0 %	25 %	222481172
78	NC_012030	TGAC	2	8	25405	25412	25 %	25 %	25 %	25 %	222481172
79	NC_012030	CCCA	2	8	25963	25970	25 %	0 %	0 %	75 %	222481173
80	NC_012030	ACGA	2	8	26031	26038	50 %	0 %	25 %	25 %	222481173
81	NC_012030	ATCG	2	8	26850	26857	25 %	25 %	25 %	25 %	222481173
82	NC_012030	GATC	2	8	27122	27129	25 %	25 %	25 %	25 %	222481173
83	NC_012030	GAAC	2	8	27162	27169	50 %	0 %	25 %	25 %	222481173
84	NC_012030	TCGG	2	8	27283	27290	0 %	25 %	50 %	25 %	222481173
85	NC_012030	TCTG	2	8	27760	27767	0 %	50 %	25 %	25 %	222481173
86	NC_012030	CGAC	2	8	27995	28002	25 %	0 %	25 %	50 %	222481173
87	NC_012030	ACGA	2	8	28589	28596	50 %	0 %	25 %	25 %	222481174
88	NC_012030	TCAA	2	8	29113	29120	50 %	25 %	0 %	25 %	222481175
89	NC_012030	AGGG	2	8	29560	29567	25 %	0 %	75 %	0 %	222481175
90	NC_012030	CGTG	2	8	29729	29736	0 %	25 %	50 %	25 %	222481175
91	NC_012030	TTCG	2	8	29961	29968	0 %	50 %	25 %	25 %	222481175
92	NC_012030	TCCT	2	8	30009	30016	0 %	50 %	0 %	50 %	222481175
93	NC_012030	TTCG	2	8	30126	30133	0 %	50 %	25 %	25 %	222481175
94	NC_012030	CTTG	2	8	30701	30708	0 %	50 %	25 %	25 %	222481175
95	NC_012030	ATGA	2	8	30730	30737	50 %	25 %	25 %	0 %	222481175
96	NC_012030	CGAC	2	8	31769	31776	25 %	0 %	25 %	50 %	222481177
97	NC_012030	TGGA	2	8	31794	31801	25 %	25 %	50 %	0 %	222481177
98	NC_012030	CGAC	2	8	32380	32387	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_012030	CGGC	2	8	32477	32484	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_012030	CAAG	2	8	32627	32634	50 %	0 %	25 %	25 %	222481178
101	NC_012030	TCCA	2	8	33098	33105	25 %	25 %	0 %	50 %	222481179
102	NC_012030	GGTC	2	8	33371	33378	0 %	25 %	50 %	25 %	222481179
103	NC_012030	AGAT	2	8	33968	33975	50 %	25 %	25 %	0 %	222481180
104	NC_012030	CCAG	2	8	34337	34344	25 %	0 %	25 %	50 %	222481180
105	NC_012030	GTCT	2	8	35781	35788	0 %	50 %	25 %	25 %	222481181
106	NC_012030	CCCA	2	8	36023	36030	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
107	NC_012030	GTAA	2	8	36172	36179	50 %	25 %	25 %	0 %	222481182
108	NC_012030	GGCT	2	8	36902	36909	0 %	25 %	50 %	25 %	222481183
109	NC_012030	CTTG	2	8	37514	37521	0 %	50 %	25 %	25 %	222481184
110	NC_012030	TGTA	2	8	38201	38208	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012030	TGAG	2	8	38287	38294	25 %	25 %	50 %	0 %	222481185
112	NC_012030	ACGG	2	8	38884	38891	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_012030	CGAA	2	8	39070	39077	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_012030	ACGG	2	8	39600	39607	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_012030	CACT	2	8	39664	39671	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_012030	TCGG	2	8	39684	39691	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_012030	CGCC	2	8	39819	39826	0 %	0 %	25 %	75 %	222481186
118	NC_012030	GTAC	2	8	40088	40095	25 %	25 %	25 %	25 %	222481186
119	NC_012030	AGCA	2	8	40868	40875	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_012030	CTAA	2	8	40882	40889	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_012030	GAAA	2	8	41642	41649	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012030	CGAC	2	8	41861	41868	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
123	NC_012030	GCCA	2	8	41967	41974	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
124	NC_012030	AGCG	2	8	42189	42196	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_012030	CAAC	2	8	42526	42533	50 %	0 %	0 %	50 %	222481187
126	NC_012030	GGTC	2	8	42646	42653	0 %	25 %	50 %	25 %	222481187
127	NC_012030	ATCA	2	8	42854	42861	50 %	25 %	0 %	25 %	222481187
128	NC_012030	CTGG	2	8	42874	42881	0 %	25 %	50 %	25 %	222481187
129	NC_012030	CGGT	2	8	43080	43087	0 %	25 %	50 %	25 %	222481187
130	NC_012030	ACTC	2	8	44126	44133	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_012030	GATG	2	8	44549	44556	25 %	25 %	50 %	0 %	222481188
132	NC_012030	GGTG	2	8	45138	45145	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012030	ATAA	2	8	45224	45231	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012030	CGAC	2	8	46020	46027	25 %	0 %	25 %	50 %	222481190
135	NC_012030	GGAC	2	8	46209	46216	25 %	0 %	50 %	25 %	222481190
136	NC_012030	GCAA	2	8	46783	46790	50 %	0 %	25 %	25 %	222481190
137	NC_012030	AGGC	2	8	47199	47206	25 %	0 %	50 %	25 %	222481190
138	NC_012030	GTCC	2	8	47287	47294	0 %	25 %	25 %	50 %	222481190
139	NC_012030	TCGC	2	8	47502	47509	0 %	25 %	25 %	50 %	222481190
140	NC_012030	CAGT	2	8	47525	47532	25 %	25 %	25 %	25 %	222481190
141	NC_012030	GGTT	2	8	47895	47902	0 %	50 %	50 %	0 %	222481190
142	NC_012030	CCGA	2	8	48224	48231	25 %	0 %	25 %	50 %	222481190
143	NC_012030	GAAA	2	8	48705	48712	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012030	CTGA	2	8	48792	48799	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_012030	TTTA	2	8	48852	48859	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_012030	GTTT	2	8	49129	49136	0 %	75 %	25 %	0 %	222481191
147	NC_012030	TACG	2	8	49163	49170	25 %	25 %	25 %	25 %	222481191
148	NC_012030	CTGT	2	8	49807	49814	0 %	50 %	25 %	25 %	222481192
149	NC_012030	GTCT	2	8	50285	50292	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_012030	GTCA	2	8	50549	50556	25 %	25 %	25 %	25 %	222481194
151	NC_012030	TCGG	2	8	50841	50848	0 %	25 %	50 %	25 %	222481194
152	NC_012030	TGTC	2	8	51589	51596	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
153	NC_012030	CCAG	2	8	52033	52040	25 %	0 %	25 %	50 %	222481196
154	NC_012030	AATA	2	8	52494	52501	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_012030	GGTC	2	8	53090	53097	0 %	25 %	50 %	25 %	222481197
156	NC_012030	AGTG	2	8	53340	53347	25 %	25 %	50 %	0 %	222481197
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158	NC_012030	GACA	2	8	54223	54230	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
159	NC_012030	CGAA	2	8	54458	54465	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
160	NC_012030	TCAA	2	8	54476	54483	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
161	NC_012030	AACT	2	8	54637	54644	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
162	NC_012030	ATAA	2	8	55101	55108	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_012030	AACT	2	8	56361	56368	50 %	25 %	0 %	25 %	222481198
164	NC_012030	GATC	2	8	56632	56639	25 %	25 %	25 %	25 %	222481198
165	NC_012030	GACT	2	8	56642	56649	25 %	25 %	25 %	25 %	222481198
166	NC_012030	GCAG	2	8	56800	56807	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
167	NC_012030	ACCA	2	8	56845	56852	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
168	NC_012030	TACA	2	8	56920	56927	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
169	NC_012030	TCAA	2	8	57112	57119	50 %	25 %	0 %	25 %	222481199
170	NC_012030	ACGG	2	8	57372	57379	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
171	NC_012030	CACT	2	8	57436	57443	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
172	NC_012030	TCGG	2	8	57456	57463	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
173	NC_012030	CGCC	2	8	57591	57598	0 %	0 %	25 %	75 %	222481200
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182	NC_012030	ACGA	2	8	61716	61723	50 %	0 %	25 %	25 %	222481203
183	NC_012030	CGTG	2	8	62045	62052	0 %	25 %	50 %	25 %	222481203
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186	NC_012030	CGAG	2	8	62853	62860	25 %	0 %	50 %	25 %	222481204
187	NC_012030	GGCG	2	8	63141	63148	0 %	0 %	75 %	25 %	222481204
188	NC_012030	AATA	2	8	63303	63310	75 %	25 %	0 %	0 %	222481204
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191	NC_012030	CGTG	2	8	64271	64278	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
192	NC_012030	TCGA	2	8	64288	64295	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
193	NC_012030	GATC	2	8	64407	64414	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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195	NC_012030	GCTC	2	8	65515	65522	0 %	25 %	25 %	50 %	222481205
196	NC_012030	TTGG	2	8	65764	65771	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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199	NC_012030	TCGG	2	8	66177	66184	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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252	NC_012030	TATC	2	8	88969	88976	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
253	NC_012030	GTTT	2	8	89123	89130	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
254	NC_012030	ATTT	2	8	89358	89365	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
255	NC_012030	GTTT	2	8	89369	89376	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
256	NC_012030	GTCT	2	8	89409	89416	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
257	NC_012030	CGGT	2	8	89867	89874	0 %	25 %	50 %	25 %	222481218
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271	NC_012030	GCAT	2	8	93396	93403	25 %	25 %	25 %	25 %	222481222
272	NC_012030	ATTA	2	8	94034	94041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
273	NC_012030	ATTC	2	8	94301	94308	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
274	NC_012030	GTAG	2	8	94436	94443	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
275	NC_012030	AATC	2	8	95058	95065	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
276	NC_012030	ACGG	2	8	95483	95490	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
277	NC_012030	AGCA	2	8	95713	95720	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
278	NC_012030	CTAA	2	8	95727	95734	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
279	NC_012030	GACA	2	8	95803	95810	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
280	NC_012030	CCAG	2	8	96052	96059	25 %	0 %	25 %	50 %	222481225
281	NC_012030	AGGT	2	8	97497	97504	25 %	25 %	50 %	0 %	222481226
282	NC_012030	GGAA	2	8	98352	98359	50 %	0 %	50 %	0 %	222481226
283	NC_012030	AATC	2	8	98470	98477	50 %	25 %	0 %	25 %	222481226
284	NC_012030	CCAT	2	8	99510	99517	25 %	25 %	0 %	50 %	222481226
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