MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 1

Total Repeats: 6469

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012029	GA	3	6	29	34	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012029	TC	3	6	123	128	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_012029	AG	3	6	624	629	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012029	GA	3	6	790	795	50 %	0 %	50 %	0 %	222478440
5	NC_012029	AC	3	6	796	801	50 %	0 %	0 %	50 %	222478440
6	NC_012029	CG	3	6	1529	1534	0 %	0 %	50 %	50 %	222478440
7	NC_012029	CT	3	6	1716	1721	0 %	50 %	0 %	50 %	222478440
8	NC_012029	CG	3	6	1980	1985	0 %	0 %	50 %	50 %	222478440
9	NC_012029	TC	3	6	2485	2490	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_012029	CG	3	6	2736	2741	0 %	0 %	50 %	50 %	222478441
11	NC_012029	CT	3	6	3257	3262	0 %	50 %	0 %	50 %	222478441
12	NC_012029	GC	3	6	3816	3821	0 %	0 %	50 %	50 %	222478442
13	NC_012029	GC	3	6	5508	5513	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_012029	GC	4	8	5796	5803	0 %	0 %	50 %	50 %	222478443
15	NC_012029	GC	4	8	6173	6180	0 %	0 %	50 %	50 %	222478444
16	NC_012029	CG	3	6	6472	6477	0 %	0 %	50 %	50 %	222478444
17	NC_012029	CG	3	6	7477	7482	0 %	0 %	50 %	50 %	222478446
18	NC_012029	CG	3	6	7635	7640	0 %	0 %	50 %	50 %	222478446
19	NC_012029	GT	3	6	8101	8106	0 %	50 %	50 %	0 %	222478446
20	NC_012029	CG	3	6	8337	8342	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_012029	GC	3	6	9013	9018	0 %	0 %	50 %	50 %	222478447
22	NC_012029	CG	3	6	9308	9313	0 %	0 %	50 %	50 %	222478447
23	NC_012029	TC	3	6	9435	9440	0 %	50 %	0 %	50 %	222478448
24	NC_012029	GC	3	6	9841	9846	0 %	0 %	50 %	50 %	222478448
25	NC_012029	CT	3	6	9860	9865	0 %	50 %	0 %	50 %	222478448
26	NC_012029	AT	3	6	10073	10078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012029	AC	3	6	10283	10288	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_012029	AT	3	6	10309	10314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012029	GC	4	8	10414	10421	0 %	0 %	50 %	50 %	222478450
30	NC_012029	GC	4	8	10447	10454	0 %	0 %	50 %	50 %	222478450
31	NC_012029	TC	3	6	10710	10715	0 %	50 %	0 %	50 %	222478450
32	NC_012029	GC	5	10	11353	11362	0 %	0 %	50 %	50 %	222478450
33	NC_012029	GC	3	6	11485	11490	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_012029	CG	3	6	11653	11658	0 %	0 %	50 %	50 %	222478451
35	NC_012029	CG	3	6	11938	11943	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_012029	AC	3	6	12240	12245	50 %	0 %	0 %	50 %	222478452
37	NC_012029	CG	3	6	12388	12393	0 %	0 %	50 %	50 %	222478452
38	NC_012029	CG	4	8	12471	12478	0 %	0 %	50 %	50 %	222478452
39	NC_012029	GC	3	6	12524	12529	0 %	0 %	50 %	50 %	222478452
40	NC_012029	GC	3	6	12627	12632	0 %	0 %	50 %	50 %	222478452
41	NC_012029	GC	3	6	12952	12957	0 %	0 %	50 %	50 %	222478453
42	NC_012029	CT	3	6	13084	13089	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_012029	CG	4	8	13426	13433	0 %	0 %	50 %	50 %	222478454
44	NC_012029	GC	3	6	13457	13462	0 %	0 %	50 %	50 %	222478454
45	NC_012029	CG	3	6	13692	13697	0 %	0 %	50 %	50 %	222478454
46	NC_012029	GC	3	6	14084	14089	0 %	0 %	50 %	50 %	222478454
47	NC_012029	GC	3	6	14189	14194	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_012029	CT	3	6	14207	14212	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_012029	CG	3	6	14973	14978	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_012029	CA	3	6	15400	15405	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_012029	GA	3	6	15671	15676	50 %	0 %	50 %	0 %	222478457
52	NC_012029	CG	3	6	15887	15892	0 %	0 %	50 %	50 %	222478457
53	NC_012029	GC	3	6	16448	16453	0 %	0 %	50 %	50 %	222478457
54	NC_012029	TC	3	6	16664	16669	0 %	50 %	0 %	50 %	222478457
55	NC_012029	CG	3	6	17212	17217	0 %	0 %	50 %	50 %	222478457
56	NC_012029	CG	3	6	17386	17391	0 %	0 %	50 %	50 %	222478457
57	NC_012029	GC	4	8	17630	17637	0 %	0 %	50 %	50 %	222478457
58	NC_012029	AG	3	6	18448	18453	50 %	0 %	50 %	0 %	222478458
59	NC_012029	TA	3	6	18713	18718	50 %	50 %	0 %	0 %	222478458
60	NC_012029	CG	3	6	18971	18976	0 %	0 %	50 %	50 %	222478458
61	NC_012029	GT	3	6	19131	19136	0 %	50 %	50 %	0 %	222478458
62	NC_012029	AT	3	6	19748	19753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012029	AT	3	6	19786	19791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012029	TG	3	6	19803	19808	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012029	AG	3	6	21575	21580	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012029	GC	3	6	21905	21910	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_012029	CA	3	6	21934	21939	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_012029	CA	3	6	22186	22191	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_012029	AC	3	6	22565	22570	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_012029	AG	3	6	23163	23168	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012029	GC	3	6	24873	24878	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_012029	TG	3	6	25294	25299	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012029	TC	4	8	25572	25579	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_012029	GA	3	6	25592	25597	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012029	AG	3	6	25820	25825	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012029	CG	3	6	26085	26090	0 %	0 %	50 %	50 %	222478462
77	NC_012029	GT	3	6	26091	26096	0 %	50 %	50 %	0 %	222478462
78	NC_012029	AG	3	6	26875	26880	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012029	GC	3	6	26890	26895	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_012029	CG	3	6	27921	27926	0 %	0 %	50 %	50 %	222478463
81	NC_012029	CT	3	6	28012	28017	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_012029	GC	3	6	28966	28971	0 %	0 %	50 %	50 %	222478466
83	NC_012029	CG	3	6	29439	29444	0 %	0 %	50 %	50 %	222478467
84	NC_012029	AG	3	6	29524	29529	50 %	0 %	50 %	0 %	222478467
85	NC_012029	TC	3	6	29538	29543	0 %	50 %	0 %	50 %	222478467
86	NC_012029	TC	4	8	30355	30362	0 %	50 %	0 %	50 %	222478468
87	NC_012029	GA	3	6	30764	30769	50 %	0 %	50 %	0 %	222478468
88	NC_012029	CG	3	6	30820	30825	0 %	0 %	50 %	50 %	222478468
89	NC_012029	CT	3	6	30897	30902	0 %	50 %	0 %	50 %	222478468
90	NC_012029	CG	3	6	31626	31631	0 %	0 %	50 %	50 %	222478468
91	NC_012029	GC	3	6	31669	31674	0 %	0 %	50 %	50 %	222478468
92	NC_012029	GC	5	10	32113	32122	0 %	0 %	50 %	50 %	222478468
93	NC_012029	GC	3	6	33013	33018	0 %	0 %	50 %	50 %	222478469
94	NC_012029	CG	4	8	33249	33256	0 %	0 %	50 %	50 %	222478469
95	NC_012029	CG	3	6	35111	35116	0 %	0 %	50 %	50 %	222478470
96	NC_012029	GT	3	6	35430	35435	0 %	50 %	50 %	0 %	222478470
97	NC_012029	CG	3	6	35851	35856	0 %	0 %	50 %	50 %	222478470
98	NC_012029	GC	4	8	36201	36208	0 %	0 %	50 %	50 %	222478471
99	NC_012029	GC	3	6	36254	36259	0 %	0 %	50 %	50 %	222478471
100	NC_012029	CG	3	6	36334	36339	0 %	0 %	50 %	50 %	222478471
101	NC_012029	GC	3	6	36494	36499	0 %	0 %	50 %	50 %	222478471
102	NC_012029	CG	3	6	37219	37224	0 %	0 %	50 %	50 %	222478471
103	NC_012029	CG	3	6	37946	37951	0 %	0 %	50 %	50 %	222478471
104	NC_012029	GT	3	6	38057	38062	0 %	50 %	50 %	0 %	222478471
105	NC_012029	CG	3	6	38129	38134	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_012029	GT	3	6	38268	38273	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012029	CG	3	6	39176	39181	0 %	0 %	50 %	50 %	222478473
108	NC_012029	GC	3	6	39579	39584	0 %	0 %	50 %	50 %	222478473
109	NC_012029	CG	3	6	40051	40056	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_012029	GC	3	6	40260	40265	0 %	0 %	50 %	50 %	222478474
111	NC_012029	GT	3	6	41280	41285	0 %	50 %	50 %	0 %	222478476
112	NC_012029	GC	3	6	43231	43236	0 %	0 %	50 %	50 %	222478479
113	NC_012029	CG	3	6	43288	43293	0 %	0 %	50 %	50 %	222478479
114	NC_012029	CG	3	6	43306	43311	0 %	0 %	50 %	50 %	222478479
115	NC_012029	GC	3	6	43676	43681	0 %	0 %	50 %	50 %	222478479
116	NC_012029	CG	4	8	43867	43874	0 %	0 %	50 %	50 %	222478480
117	NC_012029	TC	3	6	44087	44092	0 %	50 %	0 %	50 %	222478480
118	NC_012029	CG	5	10	44321	44330	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_012029	CG	3	6	44424	44429	0 %	0 %	50 %	50 %	222478481
120	NC_012029	GC	4	8	45055	45062	0 %	0 %	50 %	50 %	222478481
121	NC_012029	CG	3	6	45351	45356	0 %	0 %	50 %	50 %	222478481
122	NC_012029	CT	3	6	45417	45422	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_012029	GC	3	6	45512	45517	0 %	0 %	50 %	50 %	222478482
124	NC_012029	AC	3	6	46490	46495	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_012029	GT	3	6	46802	46807	0 %	50 %	50 %	0 %	222478483
126	NC_012029	CG	3	6	47729	47734	0 %	0 %	50 %	50 %	222478485
127	NC_012029	GC	3	6	48171	48176	0 %	0 %	50 %	50 %	222478485
128	NC_012029	CG	4	8	49515	49522	0 %	0 %	50 %	50 %	222478487
129	NC_012029	CG	3	6	49995	50000	0 %	0 %	50 %	50 %	222478488
130	NC_012029	GC	3	6	50266	50271	0 %	0 %	50 %	50 %	222478488
131	NC_012029	GC	3	6	50524	50529	0 %	0 %	50 %	50 %	222478489
132	NC_012029	CG	4	8	50585	50592	0 %	0 %	50 %	50 %	222478489
133	NC_012029	AG	3	6	50904	50909	50 %	0 %	50 %	0 %	222478490
134	NC_012029	GA	3	6	51194	51199	50 %	0 %	50 %	0 %	222478490
135	NC_012029	GC	3	6	51344	51349	0 %	0 %	50 %	50 %	222478490
136	NC_012029	CT	3	6	51858	51863	0 %	50 %	0 %	50 %	222478491
137	NC_012029	GT	3	6	52093	52098	0 %	50 %	50 %	0 %	222478491
138	NC_012029	GA	3	6	52433	52438	50 %	0 %	50 %	0 %	222478491
139	NC_012029	AG	3	6	52736	52741	50 %	0 %	50 %	0 %	222478492
140	NC_012029	TC	3	6	52845	52850	0 %	50 %	0 %	50 %	222478492
141	NC_012029	AG	3	6	52977	52982	50 %	0 %	50 %	0 %	222478492
142	NC_012029	CA	3	6	53408	53413	50 %	0 %	0 %	50 %	222478493
143	NC_012029	TC	4	8	54779	54786	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_012029	CT	3	6	54850	54855	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_012029	TC	3	6	55109	55114	0 %	50 %	0 %	50 %	222478494
146	NC_012029	CT	3	6	55329	55334	0 %	50 %	0 %	50 %	222478494
147	NC_012029	CT	3	6	55374	55379	0 %	50 %	0 %	50 %	222478494
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