MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 1

Total Repeats: 2179

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012029	CTATA	2	10	311	320	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_012029	ACGAA	2	10	362	371	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_012029	CGGCG	2	10	2768	2777	0 %	0 %	60 %	40 %	222478441
4	NC_012029	TCGGT	2	10	3321	3330	0 %	40 %	40 %	20 %	222478441
5	NC_012029	CGATC	2	10	3385	3394	20 %	20 %	20 %	40 %	222478441
6	NC_012029	CGGCT	2	10	3976	3985	0 %	20 %	40 %	40 %	222478442
7	NC_012029	CGGCT	2	10	3997	4006	0 %	20 %	40 %	40 %	222478442
8	NC_012029	AGCCG	2	10	5906	5915	20 %	0 %	40 %	40 %	222478443
9	NC_012029	GCCTC	2	10	6215	6224	0 %	20 %	20 %	60 %	222478444
10	NC_012029	TCGCC	2	10	7605	7614	0 %	20 %	20 %	60 %	222478446
11	NC_012029	CGCCC	2	10	8546	8555	0 %	0 %	20 %	80 %	222478447
12	NC_012029	CCGAT	2	10	10400	10409	20 %	20 %	20 %	40 %	222478450
13	NC_012029	AGCGA	2	10	14252	14261	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_012029	GGCCC	2	10	18236	18245	0 %	0 %	40 %	60 %	222478458
15	NC_012029	CCGGT	2	10	20335	20344	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
16	NC_012029	GGCTC	2	10	22598	22607	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
17	NC_012029	CGCTT	2	10	27058	27067	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
18	NC_012029	GTTCA	2	10	27434	27443	20 %	40 %	20 %	20 %	222478463
19	NC_012029	CGAGT	2	10	27604	27613	20 %	20 %	40 %	20 %	222478463
20	NC_012029	GCCGC	2	10	31762	31771	0 %	0 %	40 %	60 %	222478468
21	NC_012029	CGGCG	2	10	32374	32383	0 %	0 %	60 %	40 %	222478469
22	NC_012029	TCCGT	2	10	33758	33767	0 %	40 %	20 %	40 %	222478470
23	NC_012029	TCGTC	2	10	35657	35666	0 %	40 %	20 %	40 %	222478470
24	NC_012029	CGCTC	2	10	36111	36120	0 %	20 %	20 %	60 %	222478471
25	NC_012029	TCGTC	2	10	39495	39504	0 %	40 %	20 %	40 %	222478473
26	NC_012029	AGGCG	2	10	40021	40030	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
27	NC_012029	TCGAC	2	10	40209	40218	20 %	20 %	20 %	40 %	222478474
28	NC_012029	AGGGG	2	10	40937	40946	20 %	0 %	80 %	0 %	222478476
29	NC_012029	TCGCC	2	10	42785	42794	0 %	20 %	20 %	60 %	222478479
30	NC_012029	CCGGA	2	10	43428	43437	20 %	0 %	40 %	40 %	222478479
31	NC_012029	CCGTC	2	10	43565	43574	0 %	20 %	20 %	60 %	222478479
32	NC_012029	GGTCG	2	10	46260	46269	0 %	20 %	60 %	20 %	222478482
33	NC_012029	TCGCG	2	10	47224	47233	0 %	20 %	40 %	40 %	222478484
34	NC_012029	CGCGC	2	10	48104	48113	0 %	0 %	40 %	60 %	222478485
35	NC_012029	ATCGG	2	10	49483	49492	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_012029	TGAAT	2	10	53133	53142	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012029	GTCGC	2	10	54840	54849	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
38	NC_012029	CGCTC	2	10	56120	56129	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
39	NC_012029	CGGTC	2	10	57198	57207	0 %	20 %	40 %	40 %	222478495
40	NC_012029	CCGTG	2	10	61469	61478	0 %	20 %	40 %	40 %	222478498
41	NC_012029	CGACT	2	10	63733	63742	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
42	NC_012029	GGATC	2	10	69600	69609	20 %	20 %	40 %	20 %	222478505
43	NC_012029	CACCG	2	10	70929	70938	20 %	0 %	20 %	60 %	222478506
44	NC_012029	AGTTC	2	10	72123	72132	20 %	40 %	20 %	20 %	222478507
45	NC_012029	CGGAT	2	10	72309	72318	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_012029	TCGCG	2	10	76472	76481	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
47	NC_012029	GCGTC	2	10	76683	76692	0 %	20 %	40 %	40 %	222478510
48	NC_012029	CGGCG	2	10	77884	77893	0 %	0 %	60 %	40 %	222478511
49	NC_012029	TGCGG	2	10	78608	78617	0 %	20 %	60 %	20 %	222478511
50	NC_012029	GCTCC	2	10	79291	79300	0 %	20 %	20 %	60 %	222478512
51	NC_012029	CGTCG	2	10	79465	79474	0 %	20 %	40 %	40 %	222478513
52	NC_012029	GCGCG	2	10	80737	80746	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
53	NC_012029	ACGAT	2	10	82239	82248	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_012029	CGACC	2	10	85329	85338	20 %	0 %	20 %	60 %	222478519
55	NC_012029	GCGCG	2	10	89480	89489	0 %	0 %	60 %	40 %	222478523
56	NC_012029	TCGCT	2	10	91051	91060	0 %	40 %	20 %	40 %	222478525
57	NC_012029	TCGCG	2	10	91217	91226	0 %	20 %	40 %	40 %	222478525
58	NC_012029	CCCGA	2	10	92357	92366	20 %	0 %	20 %	60 %	222478527
59	NC_012029	GCGCT	2	10	93773	93782	0 %	20 %	40 %	40 %	222478529
60	NC_012029	GTCGA	2	10	94391	94400	20 %	20 %	40 %	20 %	222478529
61	NC_012029	CGCTG	2	10	94806	94815	0 %	20 %	40 %	40 %	222478530
62	NC_012029	GCGCC	2	10	94922	94931	0 %	0 %	40 %	60 %	222478530
63	NC_012029	GCGTC	2	10	95187	95196	0 %	20 %	40 %	40 %	222478531
64	NC_012029	ACACC	2	10	95347	95356	40 %	0 %	0 %	60 %	222478531
65	NC_012029	CCGTC	2	10	95580	95589	0 %	20 %	20 %	60 %	222478531
66	NC_012029	TCGGC	2	10	95993	96002	0 %	20 %	40 %	40 %	222478532
67	NC_012029	GCCCG	2	10	96379	96388	0 %	0 %	40 %	60 %	222478533
68	NC_012029	GATCG	2	10	97040	97049	20 %	20 %	40 %	20 %	222478533
69	NC_012029	CGTCG	2	10	97545	97554	0 %	20 %	40 %	40 %	222478534
70	NC_012029	CGCTT	2	10	99368	99377	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
71	NC_012029	CCCGG	2	10	100627	100636	0 %	0 %	40 %	60 %	222478537
72	NC_012029	CGGCG	2	10	102311	102320	0 %	0 %	60 %	40 %	222478537
73	NC_012029	CCGAG	2	10	103606	103615	20 %	0 %	40 %	40 %	222478538
74	NC_012029	TCCGA	2	10	103628	103637	20 %	20 %	20 %	40 %	222478538
75	NC_012029	GGCTC	2	10	105716	105725	0 %	20 %	40 %	40 %	222478541
76	NC_012029	GCGCC	2	10	106380	106389	0 %	0 %	40 %	60 %	222478542
77	NC_012029	ATCGA	2	10	106623	106632	40 %	20 %	20 %	20 %	222478543
78	NC_012029	TCGTC	2	10	106720	106729	0 %	40 %	20 %	40 %	222478543
79	NC_012029	GCTCG	2	10	106979	106988	0 %	20 %	40 %	40 %	222478543
80	NC_012029	CTTCG	2	10	112350	112359	0 %	40 %	20 %	40 %	222478545
81	NC_012029	GAGCG	2	10	114760	114769	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
82	NC_012029	GGCGT	2	10	115903	115912	0 %	20 %	60 %	20 %	222478549
83	NC_012029	GGTAG	2	10	118235	118244	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012029	CGCTC	2	10	118420	118429	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
85	NC_012029	CGCGC	2	10	118998	119007	0 %	0 %	40 %	60 %	222478551
86	NC_012029	GTCCG	2	10	123482	123491	0 %	20 %	40 %	40 %	222478557
87	NC_012029	GTGAC	2	10	125173	125182	20 %	20 %	40 %	20 %	222478558
88	NC_012029	TTACC	2	10	127222	127231	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
89	NC_012029	GACGC	2	10	127788	127797	20 %	0 %	40 %	40 %	222478560
90	NC_012029	CCTGC	2	10	128013	128022	0 %	20 %	20 %	60 %	222478560
91	NC_012029	GAGTT	2	10	129376	129385	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012029	AACGG	2	10	131099	131108	40 %	0 %	40 %	20 %	222478562
93	NC_012029	CCTCG	2	10	135039	135048	0 %	20 %	20 %	60 %	222478565
94	NC_012029	GGACC	2	10	136873	136882	20 %	0 %	40 %	40 %	222478567
95	NC_012029	GGGGA	2	10	137584	137593	20 %	0 %	80 %	0 %	222478567
96	NC_012029	ACGGG	2	10	137797	137806	20 %	0 %	60 %	20 %	222478568
97	NC_012029	CCCTT	2	10	138414	138423	0 %	40 %	0 %	60 %	222478569
98	NC_012029	TGGTG	2	10	138882	138891	0 %	40 %	60 %	0 %	222478569
99	NC_012029	GACCG	2	10	139238	139247	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
100	NC_012029	CGCGG	2	10	139801	139810	0 %	0 %	60 %	40 %	222478570
101	NC_012029	CGAGC	2	10	141087	141096	20 %	0 %	40 %	40 %	222478572
102	NC_012029	CACGA	2	10	142905	142914	40 %	0 %	20 %	40 %	222478573
103	NC_012029	CGGGA	2	10	144487	144496	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
104	NC_012029	CGGCG	2	10	147508	147517	0 %	0 %	60 %	40 %	222478578
105	NC_012029	CTACT	2	10	147548	147557	20 %	40 %	0 %	40 %	222478578
106	NC_012029	ACGCC	2	10	150728	150737	20 %	0 %	20 %	60 %	222478580
107	NC_012029	CCCGC	3	15	153578	153592	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
108	NC_012029	TCGCT	2	10	153632	153641	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
109	NC_012029	AGTCG	2	10	155590	155599	20 %	20 %	40 %	20 %	222478587
110	NC_012029	GCACA	2	10	156627	156636	40 %	0 %	20 %	40 %	222478588
111	NC_012029	CCGTC	2	10	157043	157052	0 %	20 %	20 %	60 %	222478588
112	NC_012029	CACGA	2	10	159657	159666	40 %	0 %	20 %	40 %	222478588
113	NC_012029	CCCCG	2	10	160378	160387	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
114	NC_012029	GTACC	2	10	160392	160401	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
115	NC_012029	TCGAT	2	10	163996	164005	20 %	40 %	20 %	20 %	222478591
116	NC_012029	CCGTC	2	10	164534	164543	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
117	NC_012029	GGCGA	2	10	166010	166019	20 %	0 %	60 %	20 %	222478593
118	NC_012029	TCGCT	2	10	166206	166215	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
119	NC_012029	CCGGA	2	10	169441	169450	20 %	0 %	40 %	40 %	222478598
120	NC_012029	CGGTG	2	10	172493	172502	0 %	20 %	60 %	20 %	222478600
121	NC_012029	CGGGA	2	10	174920	174929	20 %	0 %	60 %	20 %	222478601
122	NC_012029	CCCGC	2	10	175183	175192	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
123	NC_012029	GTCCG	2	10	175973	175982	0 %	20 %	40 %	40 %	222478602
124	NC_012029	GTCGG	2	10	176885	176894	0 %	20 %	60 %	20 %	222478603
125	NC_012029	CGTCG	2	10	177192	177201	0 %	20 %	40 %	40 %	222478603
126	NC_012029	CGTCC	2	10	178010	178019	0 %	20 %	20 %	60 %	222478604
127	NC_012029	CCTTC	2	10	178792	178801	0 %	40 %	0 %	60 %	222478605
128	NC_012029	CTCGC	2	10	181680	181689	0 %	20 %	20 %	60 %	222478607
129	NC_012029	GACGC	2	10	181740	181749	20 %	0 %	40 %	40 %	222478607
130	NC_012029	CCGGT	2	10	182011	182020	0 %	20 %	40 %	40 %	222478607
131	NC_012029	ACCAC	2	10	183698	183707	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
132	NC_012029	TCTCG	2	10	186961	186970	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
133	NC_012029	CACGC	2	10	187581	187590	20 %	0 %	20 %	60 %	222478612
134	NC_012029	CGAAC	2	10	187632	187641	40 %	0 %	20 %	40 %	222478612
135	NC_012029	TGTCC	2	10	188664	188673	0 %	40 %	20 %	40 %	222478613
136	NC_012029	ATCCC	2	10	191725	191734	20 %	20 %	0 %	60 %	222478615
137	NC_012029	CGGTC	2	10	194192	194201	0 %	20 %	40 %	40 %	222478617
138	NC_012029	GCGGG	2	10	194786	194795	0 %	0 %	80 %	20 %	222478618
139	NC_012029	GCGCC	2	10	195374	195383	0 %	0 %	40 %	60 %	222478619
140	NC_012029	CAGCG	2	10	195418	195427	20 %	0 %	40 %	40 %	222478619
141	NC_012029	CGGCG	2	10	196859	196868	0 %	0 %	60 %	40 %	222478619
142	NC_012029	GGCGT	2	10	197368	197377	0 %	20 %	60 %	20 %	222478619
143	NC_012029	CGCGC	2	10	198354	198363	0 %	0 %	40 %	60 %	222478620
144	NC_012029	GCGGA	2	10	199166	199175	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
145	NC_012029	GATCG	2	10	199410	199419	20 %	20 %	40 %	20 %	222478621
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147	NC_012029	CCGTC	2	10	201771	201780	0 %	20 %	20 %	60 %	222478625
148	NC_012029	CGTCG	2	10	202444	202453	0 %	20 %	40 %	40 %	222478625
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152	NC_012029	CGCGT	2	10	206058	206067	0 %	20 %	40 %	40 %	222478628
153	NC_012029	TCCGC	2	10	207006	207015	0 %	20 %	20 %	60 %	222478628
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157	NC_012029	CCCGC	2	10	209436	209445	0 %	0 %	20 %	80 %	222478632
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160	NC_012029	CGTAT	2	10	213010	213019	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
161	NC_012029	CCGCG	2	10	213265	213274	0 %	0 %	40 %	60 %	222478634
162	NC_012029	TCCCG	2	10	213628	213637	0 %	20 %	20 %	60 %	222478635
163	NC_012029	CGGCG	2	10	213864	213873	0 %	0 %	60 %	40 %	222478635
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197	NC_012029	CCGGA	2	10	258283	258292	20 %	0 %	40 %	40 %	222478677
198	NC_012029	GCGAC	2	10	258676	258685	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
199	NC_012029	CGACG	2	10	258854	258863	20 %	0 %	40 %	40 %	222478678
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202	NC_012029	CCGCC	2	10	259545	259554	0 %	0 %	20 %	80 %	222478679
203	NC_012029	GGGTC	2	10	260320	260329	0 %	20 %	60 %	20 %	222478680
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252	NC_012029	GCCGA	2	10	335220	335229	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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402	NC_012029	CAGAG	2	10	508754	508763	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
403	NC_012029	CGCGG	2	10	510353	510362	0 %	0 %	60 %	40 %	222478926
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405	NC_012029	GAGCG	2	10	514178	514187	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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441	NC_012029	GTCGA	2	10	546317	546326	20 %	20 %	40 %	20 %	222478960
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