MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 1

Total Repeats: 76836

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_012029	ACG	2	6	130290	130295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478562
3502	NC_012029	CAA	2	6	130303	130308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222478562
3503	NC_012029	GACGCC	2	12	130316	130327	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	222478562
3504	NC_012029	GCG	2	6	130413	130418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478562
3505	NC_012029	CAA	2	6	130483	130488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222478562
3506	NC_012029	CGC	2	6	130500	130505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478562
3507	NC_012029	CTGA	2	8	130511	130518	25 %	25 %	25 %	25 %	222478562
3508	NC_012029	GAC	2	6	130526	130531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478562
3509	NC_012029	GTC	2	6	130643	130648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478562
3510	NC_012029	CGGCGA	2	12	130651	130662	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	222478562
3511	NC_012029	GCG	2	6	130682	130687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478562
3512	NC_012029	TCGGCG	2	12	130716	130727	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	222478562
3513	NC_012029	CGA	2	6	130771	130776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478562
3514	NC_012029	TTC	2	6	130784	130789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222478562
3515	NC_012029	CGA	2	6	130795	130800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478562
3516	NC_012029	GAG	2	6	130853	130858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478562
3517	NC_012029	TCGC	2	8	130874	130881	0 %	25 %	25 %	50 %	222478562
3518	NC_012029	GGC	2	6	130958	130963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478562
3519	NC_012029	GTG	2	6	130987	130992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222478562
3520	NC_012029	CTGC	2	8	130994	131001	0 %	25 %	25 %	50 %	222478562
3521	NC_012029	ACG	2	6	131076	131081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478562
3522	NC_012029	AACGG	2	10	131099	131108	40 %	0 %	40 %	20 %	222478562
3523	NC_012029	GGC	2	6	131219	131224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3524	NC_012029	CGG	2	6	131230	131235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3525	NC_012029	GAT	2	6	131268	131273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_012029	ACG	2	6	131283	131288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478563
3527	NC_012029	CGGT	2	8	131334	131341	0 %	25 %	50 %	25 %	222478563
3528	NC_012029	ACG	2	6	131369	131374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478563
3529	NC_012029	ACA	2	6	131406	131411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222478563
3530	NC_012029	CGGC	2	8	131418	131425	0 %	0 %	50 %	50 %	222478563
3531	NC_012029	ACT	2	6	131451	131456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478563
3532	NC_012029	CGT	2	6	131518	131523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478563
3533	NC_012029	GCG	2	6	131526	131531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478563
3534	NC_012029	GGCGAG	2	12	131585	131596	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	222478563
3535	NC_012029	TCG	2	6	131610	131615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478563
3536	NC_012029	TG	3	6	131637	131642	0 %	50 %	50 %	0 %	222478563
3537	NC_012029	AAC	2	6	131657	131662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222478563
3538	NC_012029	CGG	2	6	131704	131709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478563
3539	NC_012029	CGA	3	9	131773	131781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478563
3540	NC_012029	GAG	2	6	131801	131806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478563
3541	NC_012029	TGA	2	6	131832	131837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222478563
3542	NC_012029	GC	3	6	131838	131843	0 %	0 %	50 %	50 %	222478563
3543	NC_012029	CGGCGA	2	12	131866	131877	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	222478563
3544	NC_012029	CG	3	6	131900	131905	0 %	0 %	50 %	50 %	222478563
3545	NC_012029	ACG	2	6	132069	132074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478563
3546	NC_012029	GC	3	6	132167	132172	0 %	0 %	50 %	50 %	222478563
3547	NC_012029	CGG	2	6	132175	132180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478563
3548	NC_012029	CGA	2	6	132208	132213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478563
3549	NC_012029	CCG	2	6	132231	132236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478563
3550	NC_012029	CGG	2	6	132247	132252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478563
3551	NC_012029	CAG	2	6	132253	132258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478563
3552	NC_012029	ACG	2	6	132285	132290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478563
3553	NC_012029	ACC	3	9	132329	132337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222478563
3554	NC_012029	CGC	2	6	132361	132366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478563
3555	NC_012029	TCG	2	6	132384	132389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478563
3556	NC_012029	CG	4	8	132388	132395	0 %	0 %	50 %	50 %	222478563
3557	NC_012029	TC	4	8	132495	132502	0 %	50 %	0 %	50 %	222478563
3558	NC_012029	CGA	3	9	132568	132576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478563
3559	NC_012029	CG	3	6	132687	132692	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3560	NC_012029	GGC	2	6	132693	132698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3561	NC_012029	GAC	2	6	132702	132707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3562	NC_012029	GACAAC	2	12	132758	132769	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	222478564
3563	NC_012029	GCT	2	6	132799	132804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478564
3564	NC_012029	GAC	2	6	132853	132858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478564
3565	NC_012029	AAC	2	6	132890	132895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222478564
3566	NC_012029	CCG	2	6	132903	132908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478564
3567	NC_012029	TCG	2	6	132924	132929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478564
3568	NC_012029	GCA	2	6	132934	132939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478564
3569	NC_012029	GC	3	6	132975	132980	0 %	0 %	50 %	50 %	222478564
3570	NC_012029	ACG	2	6	132990	132995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478564
3571	NC_012029	CGC	2	6	133015	133020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478564
3572	NC_012029	ACG	2	6	133026	133031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478564
3573	NC_012029	GA	3	6	133035	133040	50 %	0 %	50 %	0 %	222478564
3574	NC_012029	GAC	2	6	133061	133066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478564
3575	NC_012029	CGC	2	6	133122	133127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478564
3576	NC_012029	GAG	2	6	133166	133171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478564
3577	NC_012029	GCG	2	6	133296	133301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478564
3578	NC_012029	CGC	2	6	133339	133344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478564
3579	NC_012029	ACG	2	6	133380	133385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478564
3580	NC_012029	ACG	3	9	133404	133412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478564
3581	NC_012029	CAT	2	6	133426	133431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478564
3582	NC_012029	CGG	2	6	133474	133479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478564
3583	NC_012029	GTG	2	6	133481	133486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222478564
3584	NC_012029	GAC	2	6	133528	133533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478564
3585	NC_012029	TCG	2	6	133545	133550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478564
3586	NC_012029	CGT	2	6	133612	133617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478564
3587	NC_012029	GCG	2	6	133638	133643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478564
3588	NC_012029	CGG	2	6	133692	133697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478564
3589	NC_012029	ACG	2	6	133776	133781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478564
3590	NC_012029	CGA	2	6	133846	133851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478564
3591	NC_012029	CGAG	2	8	133880	133887	25 %	0 %	50 %	25 %	222478564
3592	NC_012029	CGC	2	6	133956	133961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478564
3593	NC_012029	CGC	2	6	133987	133992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478564
3594	NC_012029	CGAC	2	8	134007	134014	25 %	0 %	25 %	50 %	222478564
3595	NC_012029	TCAACG	2	12	134025	134036	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	222478564
3596	NC_012029	GGCC	2	8	134062	134069	0 %	0 %	50 %	50 %	222478564
3597	NC_012029	CGGC	2	8	134070	134077	0 %	0 %	50 %	50 %	222478564
3598	NC_012029	GCG	2	6	134085	134090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478564
3599	NC_012029	TTC	2	6	134099	134104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222478564
3600	NC_012029	CGC	2	6	134152	134157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478564
3601	NC_012029	TCA	2	6	134178	134183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478564
3602	NC_012029	GGA	2	6	134185	134190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478564
3603	NC_012029	ACG	2	6	134265	134270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478564
3604	NC_012029	CGA	2	6	134278	134283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478564
3605	NC_012029	GC	3	6	134426	134431	0 %	0 %	50 %	50 %	222478564
3606	NC_012029	ACG	2	6	134436	134441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478564
3607	NC_012029	CCG	2	6	134570	134575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3608	NC_012029	CGG	2	6	134579	134584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3609	NC_012029	CATA	2	8	134596	134603	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3610	NC_012029	CGA	2	6	134631	134636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3611	NC_012029	AC	3	6	134660	134665	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3612	NC_012029	AGAA	2	8	134674	134681	75 %	0 %	25 %	0 %	222478565
3613	NC_012029	CGG	2	6	134694	134699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478565
3614	NC_012029	GCC	2	6	134745	134750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478565
3615	NC_012029	ACGG	2	8	134769	134776	25 %	0 %	50 %	25 %	222478565
3616	NC_012029	GGC	2	6	134842	134847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478565
3617	NC_012029	GTC	2	6	134865	134870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478565
3618	NC_012029	CGAT	2	8	134881	134888	25 %	25 %	25 %	25 %	222478565
3619	NC_012029	CGT	2	6	134891	134896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478565
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3621	NC_012029	TCG	2	6	134923	134928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478565
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3862	NC_012029	CTC	2	6	143540	143545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478573
3863	NC_012029	GGT	2	6	143596	143601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222478573
3864	NC_012029	CGT	2	6	143623	143628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478573
3865	NC_012029	CGC	2	6	143656	143661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478573
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3867	NC_012029	CGA	2	6	143722	143727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478573
3868	NC_012029	TCGGCG	2	12	143742	143753	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	222478573
3869	NC_012029	CGC	3	9	143756	143764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478573
3870	NC_012029	TCC	2	6	143781	143786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478573
3871	NC_012029	CGT	2	6	143822	143827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478573
3872	NC_012029	TGA	2	6	143929	143934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222478573
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3874	NC_012029	CCG	2	6	143950	143955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478573
3875	NC_012029	TCG	2	6	143967	143972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478573
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3881	NC_012029	CCG	2	6	144134	144139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3882	NC_012029	CGA	2	6	144152	144157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478574
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3889	NC_012029	TCG	3	9	144292	144300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478574
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3892	NC_012029	GTC	2	6	144435	144440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478574
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3894	NC_012029	CGGGA	2	10	144487	144496	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3895	NC_012029	GC	3	6	144501	144506	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3896	NC_012029	TCG	2	6	144508	144513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3897	NC_012029	GTC	2	6	144524	144529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3898	NC_012029	ACG	2	6	144595	144600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3899	NC_012029	TGAC	2	8	144609	144616	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3900	NC_012029	GCT	2	6	144641	144646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3901	NC_012029	TTCACT	2	12	144705	144716	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3902	NC_012029	CA	3	6	144722	144727	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3903	NC_012029	AACC	2	8	144746	144753	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3904	NC_012029	GGAAGC	2	12	144816	144827	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	222478575
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3955	NC_012029	CGA	2	6	146500	146505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3966	NC_012029	CGC	2	6	146970	146975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3969	NC_012029	TC	3	6	147110	147115	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3970	NC_012029	CCT	2	6	147141	147146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3971	NC_012029	TAA	2	6	147162	147167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3972	NC_012029	ATA	2	6	147184	147189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3973	NC_012029	ACG	2	6	147255	147260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478578
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3982	NC_012029	CGA	2	6	147469	147474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478578
3983	NC_012029	GAC	2	6	147476	147481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478578
3984	NC_012029	CGGCG	2	10	147508	147517	0 %	0 %	60 %	40 %	222478578
3985	NC_012029	TCGT	2	8	147519	147526	0 %	50 %	25 %	25 %	222478578
3986	NC_012029	CTACT	2	10	147548	147557	20 %	40 %	0 %	40 %	222478578
3987	NC_012029	GCG	2	6	147653	147658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478578
3988	NC_012029	ACG	2	6	147684	147689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478578
3989	NC_012029	TCT	3	9	147780	147788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222478578
3990	NC_012029	AAC	3	9	147791	147799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222478578
3991	NC_012029	GACC	3	12	147961	147972	25 %	0 %	25 %	50 %	222478578
3992	NC_012029	GC	3	6	148011	148016	0 %	0 %	50 %	50 %	222478578
3993	NC_012029	CCG	2	6	148023	148028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478578
3994	NC_012029	CGA	4	12	148048	148059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478578
3995	NC_012029	CGA	3	9	148129	148137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478578
3996	NC_012029	CCG	2	6	148158	148163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478578
3997	NC_012029	GGC	2	6	148192	148197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478578
3998	NC_012029	GAG	2	6	148280	148285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478578
3999	NC_012029	CGA	2	6	148312	148317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478578
4000	NC_012029	GGA	2	6	148327	148332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478578

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